15:35
Comentarii Adauga Comentariu

_ Tipurile de celule învecinate influențează variabilitatea expresiei genelor într-o singură celulă

_ Tipurile de celule învecinate influențează singur- variabilitatea expresiei genelor celulare

Uneori nu știi ce cauți până nu îl găsești; și acest lucru este valabil mai ales când vine vorba de seturile uriașe de date care pot fi generate folosind tehnici moderne de secvențiere. Acum, cercetătorii din Japonia raportează dezvoltarea unui cadru statistic care poate efectua extragerea imparțială a comunicațiilor celulă-celulă relevante din punct de vedere biologic dintr-o mare de date spațiale privind expresia genelor.

Într-un studiu publicat în septembrie în Bioinformatics, cercetătorii de la Universitatea din Tsukuba au dezvăluit că o nouă metodă de analiză statistică poate identifica cu precizie comunicarea celulă-celulă care afectează expresia genelor la nivel de celule unice.

Comunicarea dintre celule reglează expresia genelor în moduri care sunt cruciale pentru normal funcția, precum și dezvoltarea bolii. În timp ce secvențierea ARN-ului unicelular și transcriptomica rezolvată spațial pot oferi o perspectivă asupra acestei comunicări, metodele actuale de analiză a acestor tipuri de date au câteva limitări importante.

„Majoritatea metodelor de analiză statistică existente nu țin cont de analiza spațială. organizarea celulelor într-un organ compus din diferite tipuri de celule”, afirmă profesorul asociat Haruka Ozaki, autor principal al studiului. „Cu toate acestea, locația celulelor, numărul de celule și tipurile de celule din vecinătate afectează expresia genelor în celulele învecinate.”

Pentru a capta această complexitate, cercetătorii au creat un cadru statistic numit CCPLS (Cell -Analiza comunicațiilor celulare prin modelare de regresie parțială cu cel mai mic pătrat) care analizează datele de exprimare a genelor spațiale la rezoluția unei singure celule. Scopul acestui sistem a fost de a identifica și cuantifica influența tipurilor de celule învecinate asupra variabilității de la celulă la celulă în expresia genelor.

„Am aplicat mai întâi CCPLS la un set de date simulate și am descoperit că a estimat cu precizie. efectele mai multor tipuri de celule învecinate asupra expresiei genelor”, spune profesorul asociat Ozaki. „Apoi am aplicat sistemul la un set de date din lumea reală și am arătat că astrocitele promovează diferențierea celulelor precursoare de oligodendrocite în oligodendrocite, ceea ce este în concordanță cu experimentele anterioare cu șoarece.”

Apoi, CCPLS a fost aplicat la un alt real. -set de date mondial care conține date despre expresia genelor de la nouă tipuri diferite de celule găsite în colon. Analiza a arătat că dezvoltarea celulelor epiteliale a celulelor B imature are loc prin comunicarea cu celulele B IgA, ceea ce nu a fost raportat anterior.

„Descoperirile noastre arată că CCPLS poate fi folosit pentru a extrage perspective biologic relevante despre celulele- comunicații celulare din seturi complexe de date”, afirmă profesorul Ozaki.

Având în vedere că CCPLS a depășit un cadru statistic existent în identificarea variabilității expresiei genelor reglementate de comunicarea celulă-celulă, este probabil că va fi un instrument extrem de util pentru analiza setului de date în viitor. Poate fi deosebit de eficient pentru explorarea țintelor medicamentoase și în cazurile în care aranjamentul celular provoacă modificări ale expresiei genelor.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

Elon Musk DEZVĂLUIE DOSARELE DE CENZURĂ puse la cale de gașca lui Biden și de Twitter . Elon Musk dezvăluie implicarea Twitter în alegerile din SUA și Cum a cenzurat Twitter orice informații care dezvăluiau porcăriile lui Hunter Biden și ale lui Joe Biden

Urmăriți „Banii reali” din spatele „Noi Agende Progresiste a Energiei Verzi” care falimentează și sărăcește populația lumii

Cum incearcă sorosistii sa minimizeze dezvăluirile lui Elon Musk despre cenzura lui Biden. MODEL DE AFACERI HAOS?

Marea Resetare - Ținta imediată a acestui cartel financiar este coloana vertebrală a economiei mondiale, sectorul petrolului, cărbunelui și gazelor naturale. Va urma apoi agricultura, apa și industria alimentara

_ CA lovit cu activitate gripală foarte mare...

_ Musk nu se lasă și sapă insistent la temelie Familia Biden/ Dezvăluiri despre cum Twitter a blocat dezvălurile despre Hunter Biden

_ Spitalul francez suspendă operațiunile după atacuri cibernetice

_ CRYPTO TEETERS Lângă abis

_ Network se desparte de Lara Trump...

_ Peste 75.000 de plângeri împotriva poliției au fost depuse anul trecut - în creștere cu 11% față de anul precedent

_ Nepoata lui Chris Christie, în vârstă de 25 de ani, a fost arestată și acuzată că a mușcat un ofițer pe zborul Spirit Airlines

_ Surpriză în Kazahstan - Kasîm-Jomart Tokaev anunță reforme democratice

_ Desenatorul brazilian Marcelo Quintanilha a fost recompensat cu marele premiu 'Fauve d'Or', la ediția Festivalului Internaţional de Benzi desenate din Angouleme

_ Jude Bellingham îl salută pe Jordan Henderson și se îndreaptă asupra criticilor mijlocașului

_ După un meci greșit împotriva lui Derek Chisora, Tyson Fury se bucură de șansa de a-l înfrunta pe Oleksandr Usyk

_ Magazinul ilegal de ciuperci magice se deschide cu nebunie pe strada aglomerată din Portland...

_ Fermierul american Emma a uimit după ce a încercat o plăcintă cu carne pentru prima dată în Australia

_ Macron din Franța spune că el și Biden au fost de acord să „remedieze” problemele subvențiilor americane

_ Hai Anglia! Fanii sar pe mese și vărsă bere în timp ce Three Lions asigură victoria asupra Senegalului

_ FBI a organizat apeluri săptăm�nale cu Big Tech �nainte de alegerile din 2020 și a furnizat o listă de adrese URL care �mpinge �dezinformarea� pentru Big Tech către cenzură

_ Starul porno a spus că riscă să fie executată pentru echipa de Cupa Mondială din Qatar...

_ FUENTES FOOD FIGHT LA IN-N-OUT!

_ Sexsomniac descoperă că comportamentul său este declanșat de „smucituri de cap”

_ DOMINIC KING: Bellingham s-a ridicat cu una dintre marile meciuri individuale ale Angliei la Cupa Mondială

_Cazurile de Covid în creștere...

_ CM 2022: Programul meciurilor de luni

_ Fostul McDonald's din Rusia a înregistrat o scădere a cifrei de afaceri cu 15-20% după ce s-a deschis sub noul brand, Vkusno I Tocika

_ România se clasează înaintea Germaniei după numărul de fermieri tineri în topul UE. Pe ce loc se poziţionează ţara noastră

_ Testul de patru zile pe săptămână confirmă că munca mai puțin crește bunăstarea și productivitatea

_ Începe construcția mega-conacului de 30 de milioane de dolari al lui Jennifer Hawkins și al soțului Jake Wall din Whale Beach

_ Starul Netflix Jenna Ortega ne-a doborât cu brutalitate pe Tones și pe mine și își trântește melodia de succes Dance Monkey

_ Colts vs Cowboys, NFL LIVE: Toată acțiunea așa cum se întâmplă de la AT&T Stadium

_ Un muncitor de la Home Depot �n v�rstă de 83 de ani moare după ce a fost �mpins violent la păm�nt de un hoț � suspect �ncă �n libertate (VIDEO)

_ Blinken: SUA să lucreze cu Israelul și să sprijine soluția a două state

_ DOVADA! Secretarul de stat str�mb Katie Hobbs i-a pus pe Twitter să-și reducă la tăcere criticii �naintea alegerilor frauduloase pe care EA LE-A SUPRAVEGHAT �n Arizona

_ Jucătorii Socceroos i-au batjocorit pentru actul de după meci cu Lionel Messi

_ Formația U2, George Cloney și alte peronalități au fost premiate în prezența lui Joe Biden

_ Artistul de machiaj spune de ce australienii ar trebui să cumpere machiaj de la Space NK

_ Joe Biden �n rolul lui U2 la recepția de la Casa Albă: �150 de albume v�ndute! Printre cei mai mulți vreodată!� (VIDEO)

_ Prințul Andrew Heckler nu va fi urmărit penal: Crown Office

_ Olivia Munn se prezintă în bikini în timp ce navighează cu băiețelul Malcolm

_ DOMINIC LAWSON: Nu mă face să încep cu firmele noastre de livrare

_ Liderul nigerian emite un avertisment: armele trimise �n Ucraina ajung �n m�inile grupărilor teroriste din Africa de Nord

_ Sabrina Elba atrage atenția într-o rochie turcoaz la cina British Vogue

_ Anglia trebuie să facă față ritmului vertiginos al lui Kylian Mbappe în goana pentru Gheata de Aur

_ Expat australian care participă la Cupa Mondială FIFA din Qatar explică steagul aborigenului

_ BOOM! Elon Musk susține că CEO-ul FTX, Sam Bankman-Fried, a donat peste 1 miliard de dolari democraților

_ Trolii abuzuri rasiste directe asupra starului Socceroos, Garang Kuol, după ce a pierdut Cupa Mondială FIFA în fața Argentina

_ „Vandalismul intenționat” lasă 40.000 de persoane fără curent în NC...

_ Biden schimbă calendarul primar și se izolează de adversari...

_ Musk promite mai multe „tunuri fumante” pe TWITTER...

_ APPLE plănuiește să mute producția din China...

_ AGENDA SPORTIVE: Exodul navelor de croazieră ale WAG din Anglia condus de familiile lui Harry Maguire și Jack Grealish

_ Jurnalul lui MATT BARLOW LA CUPA MONDIALĂ: Kylian Mbappe decide în sfârșit să se prezinte la o conferință de presă

_ „Nu ne place să auzim minciuni rele”: managerul Braziliei, Tite, își apără decizia de a-l selecta pe Gabriel Jesus

_ Arsene Wenger îl critică pe Socceroos pentru că a vorbit împotriva regimului Qatar, dar și-a lăudat cursa la Cupa Mondială

_ Maya Jama se alătură elegantelor Rita Ora și Irina Shayk la cina Vogue Forces For Change

_ Olivia Munn se prezintă în bikini în timp ce navighează cu băiețelul Malcolm

_ Serviciile de informații americane: Xi Jinping refuză vaccinurile occidentale împotriva Covid-19. Știe el ceva...

_ Brittany Hockley lansează un nou concert de găzduire de radio Summer Breakfast la KIIS


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22

Nr. de articole la aceasta sectiune: 1261, afisate in 22 pagini.