14:56
Comentarii Adauga Comentariu

_ Genomul nou secvențial dezvăluie povestea originii preistorice a cafelei și viitorul acesteia sub schimbările climatice

_ Genomul nou secvențial dezvăluie preistoricul cafelei povestea originii și viitorul său sub schimbările climatice

Cheia pentru cultivarea plantelor de cafea care pot rezista mai bine schimbărilor climatice în deceniile următoare ar putea fi în trecutul antic.

Cercetătorii co- conduși de Universitatea din Buffalo, au creat ceea ce ei spun că este genomul de referință de cea mai înaltă calitate până în prezent al celei mai populare specii de cafea din lume, Arabica, dezvăluind secrete despre descendența sa care acoperă milenii și continente.

Descoperirile lor, publicate în Nature Genetics, sugerează că Coffea arabica s-a dezvoltat acum mai bine de 600.000 de ani în pădurile din Etiopia prin împerechere naturală între alte două specii de cafea. Populația Arabica a crescut și a scăzut pe parcursul perioadelor de încălzire și răcire a Pământului de-a lungul a mii de ani, a constatat studiul, înainte de a fi în cele din urmă cultivată în Etiopia și Yemen, și apoi răspândită pe glob.

„Am folosit informațiile genomice. în plantele care trăiesc astăzi, pentru a reveni în timp și pentru a picta cea mai precisă imagine posibilă a istoriei lungi a Arabica, precum și pentru a determina modul în care soiurile moderne cultivate sunt legate între ele", spune autorul corespondent al studiului, Victor Albert, Ph.D. ., Empire Innovation Professor la Departamentul de Științe Biologice UB, din cadrul Colegiului de Arte și Științe.

Giantii cafelei precum Starbucks și Tim Hortons folosesc exclusiv boabe de la plante Arabica pentru a prepara milioanele de cești de cafea pe care le ei servește zilnic, totuși, parțial datorită unei diversități genetice scăzute care decurge dintr-o istorie de consangvinizare și dintr-o populație mică, Arabica este susceptibilă la mulți dăunători și boli și poate fi cultivată doar în câteva locuri din lume, unde amenințările patogenilor sunt mai mici și Condițiile climatice sunt mai favorabile.

„O înțelegere detaliată a originilor și a istoriei de reproducere a soiurilor contemporane este crucială pentru dezvoltarea de noi soiuri de Arabica mai bine adaptate la schimbările climatice”, spune Albert.

Din noul lor genom de referință, realizat folosind tehnologia de ultimă oră de secvențiere a ADN-ului și știința avansată a datelor, echipa a reușit să secvențeze 39 de soiuri de Arabica și chiar un exemplar din secolul al XVIII-lea folosit de naturalistul suedez Carl Linnaeus pentru a denumi specia.


p>Genomul de referință este acum disponibil într-o bază de date digitală disponibilă publicului.

„În timp ce există alte referințe publice pentru cafeaua Arabica, calitatea muncii echipei noastre este extrem de ridicată”, spune unul dintre membrii studiului. -lideri, Patrick Descombes, expert senior în genomică la Nestlé Research. „Am folosit abordări genomice de ultimă generație, inclusiv secvențierea ADN-ului cu lectură lungă și scurtă, pentru a crea cel mai avansat, complet și continuu genom de referință Arabica de până acum.”

Arabica este sursa a aproximativ 60% din totalul produselor de cafea din lume, cu semințele sale ajutând milioane de oameni să-și înceapă ziua sau să rămână treaz până târziu. Cu toate acestea, încrucișarea inițială care a creat-o s-a făcut fără nicio intervenție din partea oamenilor.

Arabica s-a format ca o hibridizare naturală între Coffea canephora și Coffea eugenioides, după care a primit două seturi de cromozomi de la fiecare părinte. Oamenii de știință au avut dificultăți în a identifica exact când și unde a avut loc acest eveniment de alopoliploidizare, cu estimări variind peste tot între 10.000 și 1 milion de ani în urmă.

Pentru a găsi dovezi pentru evenimentul inițial, cercetătorii de la UB și lor. partenerii și-au condus diferitele genomuri Arabica printr-un program de modelare computațională pentru a căuta semnături ale fundației speciei.

Modelele arată trei blocaje ale populației din istoria Arabica, cea mai veche având loc aproximativ 29.000 de generații – sau 610.000 de ani – în urmă. Acest lucru sugerează că Arabica s-a format cu ceva timp înainte, oriunde între 610.000 și 1 milion de ani în urmă, spun cercetătorii.

„Cu alte cuvinte, încrucișarea care a creat Arabica nu a fost ceva ce au făcut oamenii”, spune Albert. „Este destul de clar că acest eveniment de poliploidie a precedat oamenii moderni și cultivarea cafelei.”

Se crede de multă vreme că plantele de cafea s-au dezvoltat în Etiopia, dar soiurile pe care echipa le-a colectat în jurul Văii Marii Rift, care se întinde din Africa de Sud-Est până în Asia, a afișat o împărțire geografică clară. Soiurile sălbatice studiate au provenit toate din partea de vest, în timp ce soiurile cultivate toate provin din partea de est cea mai apropiată de strâmtoarea Bab al-Mandab care desparte Africa de Yemen.

Acest lucru ar fi aliniat cu dovezile că cultivarea cafelei. este posibil să fi început în principal în Yemen, în jurul secolului al XV-lea. Se crede că călugărul indian Baba Budan a scos clandestinele „șapte semințe” din Yemen în jurul anului 1600, creând soiuri arabe indiene și creând scena pentru răspândirea globală a cafelei astăzi.

„Se pare că diversitatea cafelei yemenite ar putea fi fondatorul tuturor soiurilor majore actuale”, spune Descombes. „Cafea nu este o cultură care a fost puternic încrucișată, cum ar fi porumbul sau grâul, pentru a crea soiuri noi. Oamenii au ales în principal un soi care le-a plăcut și apoi l-au cultivat. Așa că soiurile pe care le avem astăzi probabil există de mult timp. „

Istoria geoclimatică a Africii de Est este bine documentată datorită cercetărilor privind originile umane, astfel încât cercetătorii ar putea contrasta evenimentele climatice cu modul în care populațiile sălbatice și cultivate de Arabica au fluctuat în timp.

Modelarea arată o perioadă lungă de mărime scăzută a populației, între 20-100.000 de ani în urmă, care coincide aproximativ cu o secetă extinsă și un climat mai rece care se crede că a lovit regiunea în urmă cu 40-70.000 de ani. Populația a crescut apoi în perioada umedă africană, cu aproximativ 6–15.000 de ani în urmă, când condițiile de creștere erau probabil mai benefice.

În același timp, cu aproximativ 30.000 de ani în urmă, soiurile sălbatice și soiurile care ar fi în cele din urmă au devenit cultivate de oameni despărțiți unul de celălalt.

„Ei încă s-au reprodus ocazional unul cu celălalt, dar probabil s-au oprit la sfârșitul perioadei umede africane și lărgirea strâmtorii din cauza creșterii nivelului mării în jurul valorii de 8.000. cu 9.000 de ani în urmă”, spune Jarkko Salojärvi, profesor asistent la Universitatea Tehnologică Nanyang din Singapore și un alt autor corespondent al lucrării.

Arabica cultivată este estimată a avea o populație efectivă de numai 10.000 până la 50.000 de persoane. . Diversitatea sa genetică scăzută înseamnă că ar putea fi complet decimată, la fel ca monocultiva bananei Cavendish, de agenți patogeni, cum ar fi rugina frunzelor de cafea, care provoacă pierderi de 1-2 miliarde de dolari anual.

Genomul de referință a reușit să elimine. mai multă lumină asupra modului în care o linie de soiuri Arabica a obținut rezistență puternică la boală.

Soiul Timor s-a format în Asia de Sud-Est ca hibrid spontan între Arabica și unul dintre părinții săi, Coffea canephora. Cunoscută și sub numele de Robusta și folosită în principal pentru cafeaua instant, această specie este mai rezistentă la boli decât Arabica.

„Astfel, atunci când Robusta s-a hibridizat înapoi în Arabica pe Timor, a adus unele dintre genele sale de apărare patogenului. cu ea”, spune Albert, care a coordonat, de asemenea, secvențierea genomului Robusta în 2014. Lucrările actuale ale lui Albert și colaboratorilor prezintă, de asemenea, o versiune foarte îmbunătățită a genomului Robusta, precum și o nouă secvență a celorlalte specii progenitoare ale Arabica, Coffea eugenioides. .

În timp ce crescătorii au încercat să reproducă această încrucișare pentru a stimula apărarea patogenilor, noul genom de referință Arabica a permis cercetătorilor prezenți să identifice o regiune nouă care adăpostește membri ai familiei genelor de rezistență RPP8, precum și un regulator general al rezistenței. gene, CPR1.

„Aceste rezultate sugerează un loc țintă nou pentru potențial îmbunătățire a rezistenței la patogeni în Arabica”, spune Salojärvi.

Genomul a oferit și alte descoperiri noi, cum ar fi soiurile sălbatice care sunt cele mai apropiate de cafeaua Arabica modernă, cultivată. De asemenea, au descoperit că soiul Typica, un soi olandez timpuriu originar fie din India, fie din Sri Lanka, este probabil părintele soiului Bourbon, cultivat în principal de francezi.

„Munca noastră nu a fost diferită de reconstrucția. arborele genealogic al unei familii foarte importante”, spune Albert.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Ioana Ramona Bruynseels (AUR): Sub umbrela democrației consumul de droguri a explodat. PSD și PNL nu au făcut nimic pentru a stopa acest fenomen

_ Israelul publică filmări cu drone interceptate fără precedent din Irak pe teritoriul său

_ Marcel Ciolacu își asumă eșecul pentru proiectul candidatului comun independent: 'N-a fost să fie. Care e problema'

_ Fotbalist controversat renunțat la turneu din cauza „testosteronului ridicat” câștigă Fotbalistul Femeilor Anului de la BBC

_ Alvin Bragg și arta de a nu lua legea prea în serios

_ Simona Halep, bună de plată! Trebuie să achite o sumă uriaşă. S-a aflat după procesul de la TAS

_ Premier League: Liverpool, victorie clară în meciul cu Luton, după ce adversarii au condus cu 1-0

_ Charles Michel îl contrează dur pe Donald Trump în privința ajutorului pentru Ucraina: Să restabilim adevărul. Cifrele vorbesc de la sine

_ Superliga: Rapid continuă seria înfrângerilor

_ Trump avertizează despre o „baie de sânge” dacă pierde alegerile prezidențiale

_ Italia amendează Amazon pentru opțiunea de cumpărare „recurentă”.

_ EPHRAIM HARDCASTLE: Prințul Andrew se bucură de lumina reflectoarelor la slujba de mulțumire cu regele Charles, William și Kate absenți

_ Erdogan din Turcia se îndreaptă în Irak într-o rară vizită de stat pentru a discuta despre apă, petrol, securitate

_ URMĂȚI: �Am făcut aici ceea ce cred că este lucrul potrivit� � Mike Johnson vorbește presei după votul Camerei de conducere pentru a trimite 95 de miliarde de dolari pentru a finanța conflictele �n afara oceanelor

_ Ceai, vreme și a fi la timp: oamenii de știință analizează 100 de milioane de cuvinte pentru a dezvălui despre ce vorbesc britanicii cel mai mult

_ Asociația Industriei de Vaping solicită respingerea propunerii legislative referitoare la țigările electronice

_ Întrebările directe a lui Miriam Margolyes îl lasă pe Waleed Aly cu gura căscată în The Project: „Nu a mers așa cum se prevedea!”

_ Se înfruntă Trump cu închisoare și cât va dura procesul de la Stormy Daniels? Răspunsurile la toate întrebările tale

_ Femeile nestăpânite care luptă pentru a schimba vieți în bine: The Mail primește sute de nominalizări la Premiile Inspirational Women. Acum faceți cunoștință cu cei șase câștigători incredibili...

_ În interiorul telefonului unui „ucigaș”: o femeie acuzată de infracțiunea „Nu f*** cu pisici” a stocat imagini cu ucigașe în serie și o imagine cu „kit pentru prima întâlnire”, inclusiv o armă, frânghie și bandă adezivă , judecă tribunalul

_ Procedurile care pot salva viața femeilor. Ce trebuie să facă în fiecare an?

_ Nicolae Ciucă infirmă cel mai mare zvon după ce Cătălin Cîrstoiu a fost debarcat: NU se pune problema

_ CPI se imprimă mai fierbinte decât se aștepta în ianuarie, deoarece SuperCore a crescut

_ Noul film SF înlocuiește The Shawshank Redemption ca fiind cel mai bine cotat film IMDb din toate timpurile

_ Un medic al spitalului din Gaza spune că aruncarea de ajutor a ucis cinci persoane

_ Joe Biden ține un brunch de Ziua Sf. Patrick la Casa Albă � și �ncă o dată este incoerent și zguduitor (VIDEO)

_ CTP, mesaj acid după Ziua Muncii: Unde-i omu-i și grătaru/Unde-i micu-i și muștaru - Gazetarul a reinventat imnul României

_ Trasarea cursului către oțel ecologic: planul Chinei pentru un aer mai curat și o planetă mai rece

_ Studiul privind producția de ulei de palmier care dăunează climei din Indonezia arată un impuls pentru industrializare

_ Simon Jordan critică decizia lui Nike de a modifica St George's Cross pe noul echipament al Angliei, numind-o „fără sens” - și insistă că FA „de semnalare a virtuții” este „absolut complice la asta”

_ Săltat de colegi, la percheziții! Polițist reținut într-un dosar de trafic de droguri

_ (VIDEO) Directorul FBI, Chris Wray, se �ndepărtează de jurnalistul �ntreb�nd dacă dorește ca Congresul să reautorizeze FISA să spioneze din nou campania lui Trump

_ Reprezentantul RINO, Tony Gonzales, �și numește colegii republicani pe CNN �adevărați ticăloși� � �i compară cu The KKK

_ JANA HOCKING: Cele 9 reguli ale mele pentru a evita un înfiorător de Ziua Îndrăgostiților - și singura mișcare bogan care vă va garanta că nu veți face sex

_ Probleme pentru vedetele din București acuzate că se droghează, între care și Gheboasă: Au rămas fără furnizori, după acțiunile trupelor speciale

_ Bianca Mei-Rosu, Camelia Mitrofan win preliminary groups at Table Tennis European Under-21 Championships, in Skopje

_ Un bărbat înarmat își ține soția ostatică într-o mașină într-o parcare din Missouri, după „căderea unui caz în instanță” - înainte ca polițiștii să aresteze suspectul și victima să fie eliberată

_ Conducerea clubului Rapid susține decizia galeriei de a nu participa la derby-ul cu Dinamo

_ Premierul Ciolacu a avut o întâlnire cu Patriarhul Daniel

_ Casa din Richmond, care a avut un rol principal în Ted Lasso, este scoasă la vânzare pentru 4,5 milioane de lire sterline

_ Maia Sandu: Limba română în Moldova reprezintă puntea de dialog între toate comunităţile

_ Vulcanul din Indonezia: mii de persoane evacuate

_ Unele dintre cele mai valoroase plăcuțe de înmatriculare ale Marii Britanii se află pe o flotă secretă de Fiat 500 în Wolverhampton...

_ Chief Medical Board al The Wellness Company adaugă Tamiflu la trusa de contagiune pentru a combate gripa aviară

_ Controlează-ţi anxietatea: 5 exerciţii uşoare de integrat în rutina ta zilnică

_ Nishikori a învins în jocul de revenire, Wozniacki în Miami

_ O femeie în rezervă a armatei care a servit în Afganistan trăiește cu frică într-o locație secretă, după ce fostul iubit „rău” s-a furișat în casa ei când dormea ​​și a bătut-o

_ Promisiuni mari. Ciolacu: Iaşul va fi primul oraş din România care va avea acces la două autostrăzi

_ Fugi spre dealurile Shropshire! Detectorii amatori de metale își „cură praful” echipamentele și se îndreaptă spre mediul rural după ce a fost descoperită cea mai mare pepiță de aur vreodată în valoare de 30.000 de lire sterline.

_ Haller să rateze ciocnirea Atletico, Sancho să se întoarcă

_ O companie celebră, acuzată că alimentează maşina de război a lui Putin

_ Beyonce devine prima femeie de culoare care a condus topul cu melodii country

_ Bine ați venit pe Pothole Avenue: Vecinii sătui din drumul numit „cel mai rău din West Suffolk” slam consiliul după ce doar câteva dintre craterele uriașe care năpădesc strada au fost reparate

_ Seful lui Man Utd, Ten Hag, nu vrea votul de încredere al lui Ratcliffe

_ Edward Enninful spune că timpul său la Vogue s-a încheiat „cum am vrut să se termine”, pe fondul șoaptelor că a fost forțat să plece în urma unei „lupte pentru putere” cu Anna Wintour

_ Experții dezvăluie lucrările de grădinărit pe care trebuie să le faci în luna mai pentru a crea spațiul  perfect în aer liber și pentru a profita la maximum de plantele tale

_ Cât de aproape identice ARN helicaze conduc „exportul de ARNm” prin căi complexe de proteine ​​distincte

_ Valentin Florea, candidatul AUR la Primăria Sectorului 6: O singură capitală, o singură primărie, desființarea primăriei de sector!

_ UNPR și UMPMV propun introducerea serviciului militar obligatoriu, cu o durată de 6 luni

_ Ministrul Muncii, Simona Bucura-Oprescu, a ajuns de urgență la spital


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17

Nr. de articole la aceasta sectiune: 1014, afisate in 17 pagini.