22:05
Comentarii Adauga Comentariu

_ Faceți cunoștință cu vecinii (de proteine): o nouă metodă permite cercetătorilor să detecteze proteinele în imediata apropiere în celulele individuale

_ Faceți cunoștință cu (proteina ) vecini: o nouă metodă permite cercetătorilor să detecteze proteine ​​în imediata apropiere în celule individuale

Astăzi, majoritatea metodelor de determinare a proteinelor din interiorul unei celule se bazează pe un recensământ brut — oamenii de știință de obicei macină un grup mare de celule înainte de a caracteriza materialul lor genetic. Dar, așa cum o populație de 100 de persoane singure diferă în multe privințe de o populație de 20 de gospodării de cinci persoane, acest tip de descriere nu reușește să capteze informații despre modul în care proteinele interacționează și se adună împreună în grupuri funcționale.

Acum, cercetătorii de la Școala Pritzker de Inginerie Moleculară (PME) de la Universitatea din Chicago au dezvoltat o abordare care le permite să studieze mai ușor dacă proteinele sunt situate în imediata apropiere unele de altele în interiorul unei celule. Tehnologia, care poate fi realizată în același timp cu secvențierea genelor de rutină, este descrisă în jurnalul Nature Methods.

„Acesta este o modalitate raționalizată și de mare capacitate de a analiza funcțiile proteinelor în interiorul individului. celule”, a spus Savas Tay, profesor de inginerie moleculară și autor principal al noii lucrări. „Cred că această metodă va fi o resursă majoră pentru comunitatea de biologie moleculară.”

Concentrat pe funcție

În ultimii ani, odată cu apariția tehnologiilor de secvențiere genetică rapide și ieftine , oamenii de știință au apelat la secvențierea ARNm cu o singură celulă pentru a obține instantanee ale stărilor interne ale celulei. Prin secvențierea tuturor moleculelor de ARNm ale unei celule - care codifică proteine ​​- își pot face o idee despre proteinele pe care o celulă le-ar putea folosi în mod activ. Dar acest tip de proxy pentru abundența proteinelor nu transmite întreaga poveste.

„Doar cunoașterea abundenței anumitor proteine ​​nu vă oferă întotdeauna informații despre modul în care funcționează o celulă”, a spus Tay. „Adesea, dacă proteinele sunt sau nu active funcțional are de-a face nu doar cu faptul că sunt prezente, ci și cu faptul că formează complexe.”

Tay a vrut să surprindă dacă proteinele sunt fizic aproape una de cealaltă – și face acest lucru într-un mod rapid, de mare capacitate, nu bazându-se pe microscopie pentru a le vizualiza locațiile sau izolarea câtorva proteine ​​la un moment dat pentru o inspecție mai atentă.

El și colegii săi au dezvoltat sonde moleculare care se atașează la proteinele de interes și au etichete ADN care se extind spre exterior. Dacă două proteine ​​sunt fizic aproape una de cealaltă, acele sonde ADN se lipesc împreună ca Velcro. Cercetătorii pot pune la punct experimente care sonda simultan sute de proteine ​​în acest fel. Apoi, folosesc metode de secvențiere de rutină pentru a citi înapoi orice sonde ADN care s-au legat între ele și pentru a determina care proteine ​​au fost împerecheate.

„În spațiul vast din interiorul unei celule, este foarte puțin probabil ca două sonde să găsească. unul pe altul, cu excepția cazului în care sunt legați de proteinele din apropiere”, a spus Tay. „Deci, atunci când sondele se leagă, asta ne spune că aceste proteine ​​sunt foarte apropiate între ele.”

Deoarece abordarea, numită Prox-seq, folosește secvențierea standard, cercetătorii pot analiza mARN-ul unei celule în același timp cu proteine ​​de interes, pentru a ajuta la răspunsul la întrebările despre corelația dintre ARNm și abundența și funcția proteinelor.

Studii de probă de concept

Pentru a ilustra utilitatea Prox-seq, echipa lui Tay l-a testat mai întâi pe celulele B și celulele T, două subseturi de celule imunitare umane. Tehnica, au descoperit ei, ar putea diferenția celulele exclusiv pe baza interacțiunilor proteină-proteină prezente în fiecare tip de celulă. De asemenea, ar putea identifica subseturi necunoscute anterior de celule pe baza unor mici diferențe în modul în care grupurile de proteine ​​au fost organizate în celule. Folosind celule mononucleare din sângele periferic uman, au măsurat simultan 38 de proteine ​​individuale, 741 de complexe proteice și mii de ARNm pe fiecare celulă individuală și au descoperit un nou complex proteic care definește celulele T naive.

Apoi, grupul a folosit Prox-seq pentru a studia modul în care proteinele își schimbă aranjamentul în macrofage, un alt tip de celulă imunitară, atunci când celulele devin activate ca răspuns la un agent patogen. Încă o dată, au identificat atât perechi cunoscute de proteine ​​care interacționează, cât și noi grupuri de proteine ​​care pot fi folosite pentru a identifica nu numai dacă un macrofag a fost activat, ci și la ce tip de agent patogen a fost expus.

„Acest lucru a arătat că metoda noastră nu numai că poate verifica complexe proteină-proteină despre care știam deja, dar poate găsi noi interacțiuni între proteine”, a spus Tay.

Până acum, cercetătorii au testat doar metoda asupra proteinelor găsite pe suprafața celulelor; acum lucrează pentru a-l extinde la mai multe tipuri de proteine, pe măsură ce dezvoltă modalități de a rezolva exact unde interacționează proteinele din interiorul unei celule.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Ce să știți despre marele cutremur care a lovit Turcia și Siria

_ Inculpatul Harris � Achitat �n procesul Whitmer � A luat apărarea și a spus că credea că merge la bere �n noaptea �n care a fost arestat

_ William și Kate arată în formă de navă în timp ce își schimbă ținutele pentru a se îmbarca la bordul unui iaht la regata de vele

_ Elon Musk NU se va alătura consiliului de administrație al Twitter: CEO-ul spune „Cred că acest lucru este cel mai bine”

_ Câștigătorul Grammy John Legend lansează o nouă platformă NFT pentru muzică și artă

_ Creșterea „mufăcăniei disociative”: influențerii poartă un aspect „cu fața moartă” pentru a părea detașați

_ Oamenii de știință găsesc noi indicatori ai dezghețului permafrostului din Alaska

_ Comediantul Dave Chappelle sărbătorește câștigul Grammy la Coogee Beach, Sydney

_ Lottie Moss își arată silueta în două piese de scoici albe în Australia

_ FĂ CUNOAȘTE NOUL DR. MOARTE: Un medic de extremă st�ngă din Portland transformă Oregonul �n primul stat de TURISM DE DEATH din America

_ Accident cu 13 victime și trafic paralizat: Un TIR și un microbuz s-au ciocnit în Bacău

_ USR: PSD şi PNL adaugă aproape 100 de noi posturi şi creşteri salariale cu până la 50% la AFM

_ Liga 2: Poli Iaşi a ajuns în Antalya- Echipa a fost blocată mai multe ore la Istanbul din cauza viscolului

_ McDonald's lansează o ediție limitată pentru Ziua Îndrăgostiților, cutie McNugget de 10 piese

_ Yellowstone s-ar putea încheia la sfârșitul acestui sezon

_ Mama recunoaște că regretă că l-a lăsat pe fiul ei, de 4 ani, să treacă la o identitate de fată

_ Rafael Leao îi place un tweet în care îl critică pe Stefano Pioli după ce a fost luat pe bancă pentru înfrângerea lui AC Milan în derby

_ Ce cantitate de metale rare și prețioase se pot extrage dintr-un telefon

_ Arabia Saudită surprinde piețele prin creșterea prețurilor petrolului în Asia

_ RUPTĂ: Abe Hamadeh depune un răspuns �n mișcare pentru un nou proces � DEPOSARE INCLUSĂ

_ Gillian Anderson „o va interpreta pe Emily Maitlis în adaptarea Netflix a interviului prințului Andrew”

_ Serghei Şoigu anunță cucerirea a 7 localități: 'Luptele evoluează cu succes în zonele Bahmut şi Vugledar'

_ Yazmin Oukhellou de la TOWIE suferă o problemă de sănătate în timpul vacanței în Dubai și le arată fanilor IV în mână

_ G.I. Sophie! Contesa de Wessex pare pregătită pentru acțiune într-o jachetă camo

_ Managerul Man United, Erik ten Hag, REFUZĂ să comenteze acuzațiile cu care se confruntă Man City

_ Veste bună pentru toți posesorii de carduri Revolut! Banca digitală lansează crypto staking pentru clienții din Europa

_ F-22 care a doborât balonul spion este fotografiat decolând în timp ce se dezvăluie că avioanele spion U2 l-au urmărit

_ Kylie Jenner prezintă o piele strălucitoare într-un videoclip selfie... după ce a împărtășit fotografii uimitoare de pauză în bikini

_ Soțul înstrăinat al Erika Jayne, Tom Girardi, la ședința de judecată din LA pentru un caz de delapidare

_ Rosie Huntington-Whiteley își afișează silueta incredibilă într-un set de lenjerie din dantelă roz

_ Ben Stiller se pregătește să joace TRIPLETS în Three Identical Strangers

_ RUPTĂ: John Paul Mac Isaac cere o anchetă asupra lui Hunter Biden pentru că a susținut săptăm�na trecută că laptopul i-a fost �furat� (scrisori incluse)

_ Identitate plină de farmec pentru cursele de ogari, Adele Hobby, suspendată după o luptă pe pistă la Mandurah

_ Venus Williams șochează fanii, incluzându-l pe australianul Bernard Tomic, unul dintre jucătorii ei preferați

_ Bacteriile eructatoare: identificarea microbilor arctici care produc gaze cu efect de seră

_ Michael Douglas, în vârstă de 78 de ani, croiește o siluetă elegantă în costum negru la Ant-Man and the Wasp: Quantumania

_ Primăria Braşov a plătit, în ultimii ani, 270.000 de lei unui avocat pentru procese în care s-a judecat cu firma care a concesionat parcările publice din oraş

_ Țara Galilor urmărește Scoția în conflict cu guvernul Regatului Unit din cauza drepturilor trans

_ Fanii University Challenge se leșin de studentul UCL purtând jachetă de piele - a cărui mamă era în echipa sa!

_ Cutremur din Turcia și Siria: ultimele știri, videoclipuri și bilanțul morților

_ Nicușor Dan vrea să facă lumină pe tema PUZ-urilor zonelor protejate. Toni Greblă: 'O să vedem ce documente prezintă şi cu asta se încheie'

_ Muftiatul Cultului Musulman din România,campanie de donaţii pentru victimele cutremurului din Turcia

_ „Victima violului” a lui Armie Hammer îl cataloghează drept „manipulator” și încearcă „să trezească simpatie”

_ Olivia Molly Rogers dezvăluie lupta împotriva depresiei și anxietății

_ Dansatorul de rezervă al lui Harry Styles spune că scena pentru interpretarea de la Grammy a lui As It Was a fost rotită în sensul greșit

_ Mali: UN rights chief slams expulsion of representative

_ Tom și Sarah-Jane din The Block dezvăluie planuri interesante de familie

_ Victor Davis Hanson: Paradoxurile ucrainene

_ Ashley Graham își etalează decolteul într-un top cu leopard în picioare în timp ce stă pe un Ford Bronco de epocă

_ Spectatorii Grammy sunt șocați, deoarece Adele pare să iasă după câștigarea albumului anului al lui Harry Styles

_ Femeia care și-a părăsit bunica, în vârstă de 91 de ani, din 24.000 de lire sterline pentru JustEat, a învinuit-o că este o „mare mâncătoare”

_ Nicio zi fără un cutremur mic în zona Vrancea: judeţul Buzău, miezul acţiunii

_Gold FM Romania - 06 Feb 2023 18:08:24

_ Melanie Griffith, 65 de ani, arată tânără într-un ansamblu complet negru după ce a luat masa

_ Alunecările de teren au ucis cel puțin 15 persoane în sudul Peru

_ Recapitulare cutremurele din Turcia și Siria: ultimele știri, videoclipuri și bilanțul morților

_ „Lettie a fost perfectă din toate punctele de vedere”: personalul de la grădiniță care a avut grijă de fiica șefului Epsom îi aduce un omagiu

_ „Opriți, arătați mai prietenos... arătați motivat”: Ce i-a spus cu adevărat JLo lui Ben Affleck la premiile Grammy

_ Alertă de sănătate pentru nivelurile ridicate de zahăr ascunse în preparatele vegane

_ Rita Ora adaugă la impresionanta ei colecție de tatuaje


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26

Nr. de articole la aceasta sectiune: 1553, afisate in 26 pagini.



ieri 13:49