19:32
Comentarii Adauga Comentariu

_ Oamenii de știință cartografiază ARN-ul solului la genomurile fungice pentru a înțelege ecosistemele forestiere

_ Oamenii de știință cartografiază ARN-ul solului la genomul ciupercilor pentru a înțelege ecosistemele forestiere

Dacă un copac cade în pădure – indiferent dacă cineva înregistrează sau nu sunetul – un lucru este sigur: există o mulțime de ciuperci în jur. În solul unei păduri, sute de specii descompun resturile, mobilizează nutrienții din acea degradare și furnizează acești nutrienți rădăcinilor copacilor și solului. Aceste ciuperci ajută la modelarea ecologiei unei păduri. Ele stochează carbonul și ciclează nutrienții cheie, cum ar fi azotul și fosforul.

În acest fel, ciupercile din solurile pădurii dețin cheia sănătății copacilor și stocării carbonului - abilități care contează din ce în ce mai mult pe măsură ce clima se încălzește. Cu toate acestea, acestea sunt interacțiuni complicate de descurcat. Ciupercile lucrează în cooperare pentru a susține o pădure, iar speciile variază de-a lungul ecosistemelor Pământului.

Recent, în lucrările publicate în New Phytologist, cercetătorii au descoperit o nouă înțelegere a ciupercilor care îndeplinesc anumite funcții la nivelul pădurii. Pentru prima dată, au comparat trei bresle de ciuperci diferite într-o serie de locații diferite. Ei au prelevat probe de sol din patru ecosisteme forestiere, au extras ARN pentru a înțelege expresia genelor și au dezvoltat noi instrumente pentru a mapa acel ARN din sol la genomi fungici.

Institutul comun al genomului (JGI) al Departamentului Energiei din SUA (DOE), un birou al DOE pentru știință, situat la Laboratorul Național Lawrence Berkeley (Berkeley Lab) a secvențiat 1 trilion de baze - o terabază - de ARN din sol pentru acest proiect și a produs genomii de referință care au permis cartografierea acestor citiri de ARN. „În prezent, acesta este cel mai mare metatranscriptom fungic secvențial JGI de până acum”, a spus Igor Grigoriev, șeful programului de genomică fungică la JGI.

Împreună cu o înțelegere îmbunătățită a sistemelor forestiere multiple, această lucrare stabilește protocoale și conducte pe care alte echipe le pot folosi din întreaga lume.

Aceste instrumente oferă cercetătorilor o modalitate de a accesa mult mai multe informații despre ciupercile din aceste medii. „Acum, cu aceste noi instrumente – metatranscriptomica, secvențierea ARN a ARN-ului din sol – putem accesa – „Ce fac ei? Cum interacționează?”, a spus autorul principal Francis Martin, director de cercetare emerit la Institutul Național de Cercetare pentru Agricultură, Alimentație și Mediu (INRAE).

Pentru acest studiu, cercetătorii au colectat mostre de sol din patru situri. : Aspurz, Spania; Lamborn, Suedia, Canada. Aceste situri reprezintă, respectiv, pădurile mediteraneene, temperate și boreale pădurile împărtășesc doar aproximativ 20% din speciile lor de ciuperci Pentru a face comparații utile, cercetătorii au trebuit să lucreze în afara taxonomiei. inginer cercetător la INRAE ​​și unul dintre primii autori ai acestei lucrări.

Pentru a compara aceste bresle trofice, această echipă s-a concentrat pe trei grupuri principale de ciuperci care au apărut în toate pădurile pe care le-au eșantionat. Aceste bresle sunt comune pădurilor din întreaga lume, precum și pajiști și pășuni: saprotrofe dezasambla resturile și organismele moarte pentru a-și elibera nutrienții; simbiontii micorizali transporta apa si nutrientii catre copaci; agenții patogeni ai plantelor colonizează plantele vii pentru a se hrăni cu ele.

Din toate tipurile de pădure, Martin și echipa sa au pieptănat mostre de sol pentru a vedea ce gene au folosit aceste trei bresle de ciuperci pentru a crește și a metaboliza nutrienții. Ei au secvențiat tot ARN-ul găsit în probele de sol și au asamblat acele transcripte de ARN într-un metatranscriptom.

În general, au descoperit că, în ciuda diversității mari de specii, fiecare breaslă a îndeplinit funcții remarcabil de similare în diferite păduri. Metabolismul primar, activitatea celulară și dezvoltarea ciupercilor arătau destul de asemănătoare pentru fiecare breaslă de saprotrofi, simbioți micorizali și agenți patogeni, indiferent dacă o probă provenea din solul de sub un pin sau un stejar, în Suedia sau Quebec.

Din punct de vedere ecologic, Martin sugerează că această redundanță este protectoare, un pic ca diversificarea unui portofoliu de investiții. Dacă un stres precum incendiul sau seceta amenință unele specii de ciuperci, alte ciuperci vor completa funcționalitățile necesare.

Această lucrare arată, de asemenea, o nouă suprapunere între funcțiile diferitelor bresle de ciuperci. Saprotrofii și simbioții micorizali au fost împărțiți istoric în nișe ecologice separate - reciclatori și respectiv transportatori. Cu toate acestea, echipa lui Martin a descoperit că ambele bresle exprimă gene similare pentru degradarea pereților celulelor fungice, așa-numita necromasă fungică, sugerând că aceste bresle împărtășesc responsabilitatea reciclării materialului fungic mort.

Acest proiect provine dintr-o știință comunitară. Propunerea de program pe care Martin a înaintat-o ​​în 2012. La acel moment, domeniul cercetase multe comunități diferite de sol pentru diversitatea taxonomică. Aceste studii ar putea identifica populațiile, dar au spus puțin despre speciile care făceau ce.

Pentru a înțelege modul în care comunitățile fungice și-au împărțit sarcinile, Martin și echipa sa au optat pentru a profila ARN, pentru o vedere a expresiei genelor fungice. Ei ar avea nevoie de genomi fungici existenți pentru a mapa expresia genelor la funcții și specii de ciuperci. Inițial, cartografierea secvențelor de ARN în acest fel a fost o provocare, potrivit lui Martin. „În urmă cu 12 ani, când am cartografiat primul ARN secvențial din sol, doar 10% dintre aceștia se mapau la genomurile fungice de la JGI”, a spus Martin.

Un efort numit proiectul 1000 de genomi fungici. a schimbat asta. Acesta este un proiect de mai mulți ani, în colaborare cu JGI, pentru a secvența 1.000 de genomi de referință din întregul arbore al vieții fungice. Martin este unul dintre liderii proiectului. După ce a început cu aproximativ 200 de genomi fungici, în doar câțiva ani, a spus el, proiectul 1000 de genomi fungici, împreună cu alte proiecte CSP, a secvențiat peste 2.000 de genomi fungici.

JGI a secvențiat, asamblat și adnotat. aceste genomi în colaborare cu zeci de parteneri. „Acesta a fost un efort extraordinar al comunității, cu peste 100 de cercetători care au nominalizat specii pentru secvențiere și apoi au trimis mostre de ADN și ARN la JGI”, a spus Grigoriev. Toți acești genomi sunt disponibile la MycoCosm.

Dacă inițial, sarcina de a mapa ARN-ul fungic în secvențe a fost un drum accidentat și întortocheat, acest nou aflux de genomi a deschis o autostradă pe aceeași rută. „A fost cu adevărat uimitor cum s-a îmbunătățit calitatea datelor datorită acelei cantități masive de noi genomi”, a spus Martin.

Proiectul 1000 de genomi fungici se îndreaptă mai departe, pentru a permite mai multe studii ca acesta. Martin spune că și mai multe genome se vor traduce într-o înțelegere și mai mare, pe măsură ce alți cercetători analizează ARN-ul din comunitățile de sol din toată America de Sud, China, Europa și Statele Unite.

„În următorii câțiva ani, cred că vom va avea un fel de hartă globală a diversității fungice, dar încă ne lipsesc funcțiile”, a spus Martin. „Așadar, datorită tipului de program pe care l-am dezvoltat împreună cu JGI, avem instrumentele necesare pentru a obține cu adevărat informații despre funcțiile acestei comunități fungice, de la poli la tropice.”


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Căldura record putrezește boabele de cacao, amenințănd agricultura din Coasta de Fildeș

_ Tatăl negru este refuzat să cumpere vopsea pentru proiectul de artă al fiului său de patru ani de către personalul Hobbycraft, deoarece au presupus că o va folosi la GRAFFITI

_ Banca Angliei menține ratele dobânzii la 5,25%, în ciuda veștilor bune despre inflație... cu speranțe de ușurare pentru plătitorii de credite ipotecare în câteva luni

_ Ryan Gosling seamănă foarte mult cu Emmanuel Macron, spune fostul ministru francez al Culturii, sugerând că tipul Barbie și Julia Roberts ar trebui să joace rolul președintelui și al soției sale în viitorul film biografic

_ Vedeți în interiorul Titanicului ca niciodată înainte: un videoclip incredibil dezvăluie o secțiune transversală a navei condamnate în gloria sa anterioară înainte de a se scufunda în 1912 - în timp ce un miliardar se pregătește să o recreeze

_ Este panda-monium când Coreea de Sud își ia rămas bun de la Fu Bao: mulțimi de fani plângători se adună pentru o ultimă privire la uriașul blând în timp ce ea se întoarce în China

_ Tiger Woods primește câteva sfaturi de la fiul în vârstă de 15 ani, Charlie, la Augusta, în timp ce legenda golfului se pregătește pentru runda a 100-a la Masters, după efortul său dezastruos de 10 în Ziua 3

_ În interiorul luxosului hotel al prințului Harry și al lui Meghan Markle, Palm Beach, în valoare de 8.000 de dolari pe noapte, în timp ce se bucură de weekend la Miami pentru a filma noua emisiune Netflix despre polo a lui Duke

_ Superliga - Rezultatele etapei a 29-a şi clasamentul

_ Noul instrument CRISPR orchestrează apărarea antivirală în interiorul celulelor

_ Secretul bine păstrat! Mihaela Bilic dezvăluie cum poți slăbi mâncând sarmale

_ Bibliotecara închisorii, în vârstă de 46 de ani, presupusă a fi un „prădător cochet” a plâns în acuzație în timp ce a fost scutită de atacuri sexuale asupra a doi deținuți – după ce a recunoscut că a avut o relație cu un al treilea prizonier

_ Premiile SAG 2024: Starul Barbie, Ryan Gosling, arată ca o păpușă Ken elegantă, în costum alb pur și albastru pudra

_ Este iarba cu adevărat mai verde Down Under? Britanicii care au locuit în Australia își dau verdictul asupra țării care iese pe primul loc

_ Chelsea 6-0 Everton - Premier League: știri live, scor și actualizări ale echipei, în timp ce Cole Palmer înscrie PATRU... dar vedetele Blues încă se ceartă între ele!

_ Nouă scădere a cazurilor de Covid înregistrate în România

_ FOTO | Alertă - Cutremurul din Bihor a creat haos: Se ia în calcul prăbușirea unei galerii de mină / Risc de poluare pe Crișul Repede

_ Baia de sânge din casa din Norwich a fost o sinucidere cu o triplă crimă, crede poliția: autopsia dezvăluie că fetele de 8 și 12 ani și mătușa lor, de 36 de ani, au fost toate înjunghiate până la moarte „înainte ca tatăl lor să-și taie singur gâtul”

_ Energy Ministry officially notifies Bucharest City Hall of ELCEN-Termoenergetica intended merger

_ STB: Linia de tramvai 41 va fi suspendată temporar sâmbătă

_ Runda finală a Masters 2024 ÎN DIRECT: Scottie Scheffler, Collin Morikawa, Max Homa și începătorul Ludvig Aberg se luptă într-o luptă în patru pentru Green Jacket... după ziua dezastruoasă a lui Tiger Woods

_ Un tânăr care circula cu aproape 80 km/h pe o trotinetă electrică, mai repede decât maşinile,reţinut de poliţie

_ INS rectifică creşterea economică a României din 2023 de la 2% la 2,1%

_ Fostul șef MI6 admite că Europa se află într-un „război real” cu Rusia și avertizează că „lucrurile ar putea merge prost foarte repede” – la câteva zile după ce fostul general ucrainean a insistat că „Al treilea război mondial a început”

_ Emmanuel Macron, avertisment terifiant: Rusia ar putea ataca România

_ Kremlinul monitorizează situația în privința lui Valery Zalujni

_ Criza bancară din SUA se profilează pe măsură ce fluxurile de depozite s-au accelerat săptămâna trecută, volumele de împrumuturi stagnează

_ Grand National RECUP: 7-1 favorit comun I Am Maximus furtunile spre victorie pentru Willie Mullins

_ Creierul lui OJ Simpson nu va fi donat pentru cercetarea CTE, spune purtătorul de cuvânt al familiei - ucigașul urmează să fie incinerat în Las Vegas marți

_ Amenzi aplicate de DSP Sibiu, în urma controalelor făcute după moartea unei paciente

_ Marea Britanie renunță la Tratatul care permite companiilor petroliere să dea în judecată guvernele pentru politica climatică

_ Trei dintre foștii parteneri de dans Strictly ai lui Giovanni Pernice susțin că acesta este „de neatins”, în timp ce BBC își susține în spatele lui: „Este o lovitură în dinți”

_ Moment îngrozitor, mașina lovește pietonii evrei ultra-ortodocși într-un „atac terorist”, lăsând trei răniți înainte ca suspecții să fugă la Ierusalim

_ 2020 Biden despre Trump: �Pe măsură ce zidurile se apropie de acest om, sunt �ngrijorat că ne va duce la război �n Iran� (VIDEO)

_ Megaorașele Africii amenințate de căldură, inundații, boli – acțiuni necesare pentru a începe ecologizarea, adaptarea la schimbările climatice

_ Fost primar, arestat pentru viol într-o comună din Botoșani. Se pregătea să candideze la locale

_ Esteticiană, în vârstă de 39 de ani, a căzut la 170 de metri după ce a murit din vârful unei stânci, după ce a cățărat o barieră pentru a-și face un selfie în timpul vacanței în Georgia

_ Beattie: Pretext pentru o resurecție federală

_ Sezonul ploios din California este aici. Ce înseamnă pentru alimentarea cu apă?

_ YOLO Cheltuielile, inflația și înțelepciunea/nebunia mulțimilor

_ Cel puţin patru morţi în urma incendiului izbucnit într-un bloc cu 14 etaje din Valencia

_ Abuzuri în lanțul de aprovizionare: Legislația emblematică a UE privind moda rapidă atârnă în balanță

_ CEO ADNOC: Creșterea cererii globale de energie este nesustenabilă

_ Day of Bukovina, marked in Chernivtsi and Storozhynets, 106 years after union of Bukovina with Romania

_ Timişoara: Se reia, de vineri, transportul cu varopaşele pe Bega

_ ForMin Odobescu, Deputy PM for Reintegration of Republic of Moldova Serebrian, about Transnistrian file

_ Șoferul care a fost amendat de o parcare de 1 lire sterline pentru că și-a plimbat câinele spune că anii de luptă cu compania i-au lăsat 733 de lire sterline din buzunar și cu un rating de credit stricat.

_ Elon Musk este prăjit din cauza unei mișcări „manipulative” și „încrezătoare” în timp ce iese cu prietenul apropiat Donald Trump

_ Fiica lui John Singleton, Dawn, numită victimă a înjunghierii Westfield Bondi Junction

_ Apple termină blocarea în magazinul de aplicații din UE pentru Fortnite-maker Epic

_ Am descoperit că soția mea era însărcinată din postarea pe Instagram a prietenei ei

_ Premiile Olivier 2024: Nicole Scherzinger se prezintă într-o rochie neagră adâncă, în timp ce se alătură glamului Cara Delevingne, Sheridan Smith, Hannah Waddingham și Sarah Snook în sosiri de top pline de stele

_ Pubul Notting Hill ai cărui obișnuiți includ Dua Lipa și Prințesa Eugenie lansează o luptă în instanță după ce plângerile de zgomot din partea vecinilor au declanșat un val de restricții

_ George Simion, în război cu toată lumea din cauza OUG 21/2024: 'Suntem martorii unei lovituri de stat în plină desfășurare'

_ Charles Spencer dezvăluie cum sora Diana i-a spus tatălui lor „dacă m-ai iubi, nu m-ai lăsa aici” când a fost trimisă la internat - în timp ce el povestește despre abuzurile suferite în timpul școlii.

_ IAN BRADY - POVESTE NESPĂSITA: Încolțit de poliție, Brady și-a întins mâna după arma - apoi și-a dat seama de greșeala lui teribilă

_ Fiica noastră, Ella, în vârstă de 16 ani, a vrut să moară... așa am adus-o înapoi din prag

_ Fani Scrambles: Fulton DA cere judecătorului să respingă probele de la telefonul mobil

_ Egiptul a recuperat o statuie furată a lui Ramses al II-lea, veche de 3.400 de ani


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26 Pag.27 Pag.28 Pag.29 Pag.30 Pag.31
Pag.32 Pag.33 Pag.34 Pag.35 Pag.36 Pag.37 Pag.38 Pag.39
Pag.40 Pag.41 Pag.42 Pag.43 Pag.44

Nr. de articole la aceasta sectiune: 2615, afisate in 44 pagini.