19:32
Comentarii Adauga Comentariu

_ Oamenii de știință cartografiază ARN-ul solului la genomurile fungice pentru a înțelege ecosistemele forestiere

_ Oamenii de știință cartografiază ARN-ul solului la genomul ciupercilor pentru a înțelege ecosistemele forestiere

Dacă un copac cade în pădure – indiferent dacă cineva înregistrează sau nu sunetul – un lucru este sigur: există o mulțime de ciuperci în jur. În solul unei păduri, sute de specii descompun resturile, mobilizează nutrienții din acea degradare și furnizează acești nutrienți rădăcinilor copacilor și solului. Aceste ciuperci ajută la modelarea ecologiei unei păduri. Ele stochează carbonul și ciclează nutrienții cheie, cum ar fi azotul și fosforul.

În acest fel, ciupercile din solurile pădurii dețin cheia sănătății copacilor și stocării carbonului - abilități care contează din ce în ce mai mult pe măsură ce clima se încălzește. Cu toate acestea, acestea sunt interacțiuni complicate de descurcat. Ciupercile lucrează în cooperare pentru a susține o pădure, iar speciile variază de-a lungul ecosistemelor Pământului.

Recent, în lucrările publicate în New Phytologist, cercetătorii au descoperit o nouă înțelegere a ciupercilor care îndeplinesc anumite funcții la nivelul pădurii. Pentru prima dată, au comparat trei bresle de ciuperci diferite într-o serie de locații diferite. Ei au prelevat probe de sol din patru ecosisteme forestiere, au extras ARN pentru a înțelege expresia genelor și au dezvoltat noi instrumente pentru a mapa acel ARN din sol la genomi fungici.

Institutul comun al genomului (JGI) al Departamentului Energiei din SUA (DOE), un birou al DOE pentru știință, situat la Laboratorul Național Lawrence Berkeley (Berkeley Lab) a secvențiat 1 trilion de baze - o terabază - de ARN din sol pentru acest proiect și a produs genomii de referință care au permis cartografierea acestor citiri de ARN. „În prezent, acesta este cel mai mare metatranscriptom fungic secvențial JGI de până acum”, a spus Igor Grigoriev, șeful programului de genomică fungică la JGI.

Împreună cu o înțelegere îmbunătățită a sistemelor forestiere multiple, această lucrare stabilește protocoale și conducte pe care alte echipe le pot folosi din întreaga lume.

Aceste instrumente oferă cercetătorilor o modalitate de a accesa mult mai multe informații despre ciupercile din aceste medii. „Acum, cu aceste noi instrumente – metatranscriptomica, secvențierea ARN a ARN-ului din sol – putem accesa – „Ce fac ei? Cum interacționează?”, a spus autorul principal Francis Martin, director de cercetare emerit la Institutul Național de Cercetare pentru Agricultură, Alimentație și Mediu (INRAE).

Pentru acest studiu, cercetătorii au colectat mostre de sol din patru situri. : Aspurz, Spania; Lamborn, Suedia, Canada. Aceste situri reprezintă, respectiv, pădurile mediteraneene, temperate și boreale pădurile împărtășesc doar aproximativ 20% din speciile lor de ciuperci Pentru a face comparații utile, cercetătorii au trebuit să lucreze în afara taxonomiei. inginer cercetător la INRAE ​​și unul dintre primii autori ai acestei lucrări.

Pentru a compara aceste bresle trofice, această echipă s-a concentrat pe trei grupuri principale de ciuperci care au apărut în toate pădurile pe care le-au eșantionat. Aceste bresle sunt comune pădurilor din întreaga lume, precum și pajiști și pășuni: saprotrofe dezasambla resturile și organismele moarte pentru a-și elibera nutrienții; simbiontii micorizali transporta apa si nutrientii catre copaci; agenții patogeni ai plantelor colonizează plantele vii pentru a se hrăni cu ele.

Din toate tipurile de pădure, Martin și echipa sa au pieptănat mostre de sol pentru a vedea ce gene au folosit aceste trei bresle de ciuperci pentru a crește și a metaboliza nutrienții. Ei au secvențiat tot ARN-ul găsit în probele de sol și au asamblat acele transcripte de ARN într-un metatranscriptom.

În general, au descoperit că, în ciuda diversității mari de specii, fiecare breaslă a îndeplinit funcții remarcabil de similare în diferite păduri. Metabolismul primar, activitatea celulară și dezvoltarea ciupercilor arătau destul de asemănătoare pentru fiecare breaslă de saprotrofi, simbioți micorizali și agenți patogeni, indiferent dacă o probă provenea din solul de sub un pin sau un stejar, în Suedia sau Quebec.

Din punct de vedere ecologic, Martin sugerează că această redundanță este protectoare, un pic ca diversificarea unui portofoliu de investiții. Dacă un stres precum incendiul sau seceta amenință unele specii de ciuperci, alte ciuperci vor completa funcționalitățile necesare.

Această lucrare arată, de asemenea, o nouă suprapunere între funcțiile diferitelor bresle de ciuperci. Saprotrofii și simbioții micorizali au fost împărțiți istoric în nișe ecologice separate - reciclatori și respectiv transportatori. Cu toate acestea, echipa lui Martin a descoperit că ambele bresle exprimă gene similare pentru degradarea pereților celulelor fungice, așa-numita necromasă fungică, sugerând că aceste bresle împărtășesc responsabilitatea reciclării materialului fungic mort.

Acest proiect provine dintr-o știință comunitară. Propunerea de program pe care Martin a înaintat-o ​​în 2012. La acel moment, domeniul cercetase multe comunități diferite de sol pentru diversitatea taxonomică. Aceste studii ar putea identifica populațiile, dar au spus puțin despre speciile care făceau ce.

Pentru a înțelege modul în care comunitățile fungice și-au împărțit sarcinile, Martin și echipa sa au optat pentru a profila ARN, pentru o vedere a expresiei genelor fungice. Ei ar avea nevoie de genomi fungici existenți pentru a mapa expresia genelor la funcții și specii de ciuperci. Inițial, cartografierea secvențelor de ARN în acest fel a fost o provocare, potrivit lui Martin. „În urmă cu 12 ani, când am cartografiat primul ARN secvențial din sol, doar 10% dintre aceștia se mapau la genomurile fungice de la JGI”, a spus Martin.

Un efort numit proiectul 1000 de genomi fungici. a schimbat asta. Acesta este un proiect de mai mulți ani, în colaborare cu JGI, pentru a secvența 1.000 de genomi de referință din întregul arbore al vieții fungice. Martin este unul dintre liderii proiectului. După ce a început cu aproximativ 200 de genomi fungici, în doar câțiva ani, a spus el, proiectul 1000 de genomi fungici, împreună cu alte proiecte CSP, a secvențiat peste 2.000 de genomi fungici.

JGI a secvențiat, asamblat și adnotat. aceste genomi în colaborare cu zeci de parteneri. „Acesta a fost un efort extraordinar al comunității, cu peste 100 de cercetători care au nominalizat specii pentru secvențiere și apoi au trimis mostre de ADN și ARN la JGI”, a spus Grigoriev. Toți acești genomi sunt disponibile la MycoCosm.

Dacă inițial, sarcina de a mapa ARN-ul fungic în secvențe a fost un drum accidentat și întortocheat, acest nou aflux de genomi a deschis o autostradă pe aceeași rută. „A fost cu adevărat uimitor cum s-a îmbunătățit calitatea datelor datorită acelei cantități masive de noi genomi”, a spus Martin.

Proiectul 1000 de genomi fungici se îndreaptă mai departe, pentru a permite mai multe studii ca acesta. Martin spune că și mai multe genome se vor traduce într-o înțelegere și mai mare, pe măsură ce alți cercetători analizează ARN-ul din comunitățile de sol din toată America de Sud, China, Europa și Statele Unite.

„În următorii câțiva ani, cred că vom va avea un fel de hartă globală a diversității fungice, dar încă ne lipsesc funcțiile”, a spus Martin. „Așadar, datorită tipului de program pe care l-am dezvoltat împreună cu JGI, avem instrumentele necesare pentru a obține cu adevărat informații despre funcțiile acestei comunități fungice, de la poli la tropice.”


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Supermodelul costumului de baie Sports Illustrated devenit antreprenor milionar, în vârstă de 60 de ani, este aproape de nerecunoscut când iese în Montecito - dar poți ghici cine este?

_ Timişoara: Se reia, de vineri, transportul cu varopaşele pe Bega

_ Șeful sindicatului agricol se îndreaptă asupra celebrităților care cumpără terenuri pentru a-și „spăla verde” stilul de viață al jet-setter-ului

_ Fostul fotomodel care și-a ucis cea mai bună prietenă într-un accident de conducere în stare de ebrietate după ce a băut 12 cocktail-uri, vinuri și Prosecco este condamnat la patru ani de închisoare

_ Day of Bukovina, marked in Chernivtsi and Storozhynets, 106 years after union of Bukovina with Romania

_ Jack Whitehall îi răspunde prințului William după ce l-a „umbrit” în timp ce spunea o „glumă cu tată” în timpul unei vizite la școală în West Midlands

_ Doar 38% dintre alegători cred că Biden va fi în viață la sfârșitul celui de-al doilea mandat și mai mult de o treime consideră că Kamala Harris va fi președinte până în ianuarie 2029 dacă bărbatul de 81 de ani va fi reales.

_ Prințul William poartă un costum bleumarin în timp ce întâlnește legende muzicale la Premiile Tusk Conservation - iar barba lui iubită este mai lungă ca niciodată

_ CÂȘTIGĂTOR: Tennessee desfășoară soldați ai Gărzii Naționale pentru a ajuta Texasul în timp ce statul luptă cu regimul Biden pentru a asigura granița – Mai mulți soldați voluntari decât se aștepta

_ Man City 1-1 Real Madrid (total 4-4) - Sferturile de finală ale Ligii Campionilor: scor live, știri ale echipei și actualizări, în timp ce deținătorii lui Pep Guardiola urmăresc egalarea târziu după lovitura timpurie a lui Rodrygo

_ BREAKING - Protest masiv al taximetriștilor din București: Centrul Capitalei este blocat complet /VIDEO

_ Vrei să afli cât de bun poate fi un hotel? În interiorul ultra-luxosului Four Seasons Hotel George V Paris, care are șase stele Michelin între trei restaurante (și un interior care seamănă cu un palat)

_ Fondul suveran de investiţii al Norvegiei, cel mai mare din lume, profit de 213 mld dolari în 2023

_ Cine este noul secretar general adjunct al NATO. Mark Rutte a numit o femeie pentru a doua funcţie din Alianţă

_ Adolescentul britanic dispărut cândva, Alex Batty, spune că se află la începutul unei aventuri de dragoste după ce s-a întors acasă din Europa, unde locuia cu mama sa, care l-a „răpit” la vârsta de 11 ani.

_ PPE şi Renew solicită o dezbatere în Parlamentul European despre existenţa acolo a unei reţele de influenţă ruseşti

_ Maria Zaharova intră tare peste SUA care au spus că nu văd semne că Ucraina ar fi implicată: De unde trag concluzie cu privire la nevinovăţia cuiva?

_ JONATHAN McEVOY: Rod Stewart și Gary Barlow au cântat pentru el la cea de-a 50-a aniversare, dar s-a încheiat petrecerea pentru șeful Red Bull, Christian Horner, după acuzațiile de „comportament incredibil de controlant”?

_ Războaiele de streaming ale TV: BBC face echipă cu radiodifuzori rivali pentru a lansa serviciul Freely în încercarea de a prelua Netflix

_ Sarah Ferguson arată sofisticată în ansamblul marinei în timp ce iese la Global Citizen Prize Awards la New York

_ VIDEO Ilie Bolojan, întrebat de față cu Nicolae Ciucă dacă-i vânează locul de președinte al PNL

_ Norvegia închide granițele Rusiei de teamă de acte de sabotaj

Cum și de ce a fost recrutat Friedrich Merz de Black Rock

_ Protest de amploare în Piaţa Victoriei - Sute de tineri afisează plancarde cu mesaje împotriva lui Călin Georgescu: Vrem democraţie

_ Fury, în adolescență, de 19 ani, este trimisă într-o instituție pentru tineri infractori pentru doar DOI ani din cauza accidentului care a lăsat-o pe mama tetraplegică, după ce a intrat în ea în timp ce se filma la volan.

_ Topul domeniilor cu cele mai multe joburi remote

_ 1 mai - ziua Internaţională a Muncii. Ce semnificaţie are data şi de ce este zi liberă

_ Canalul de transport temporar se redeschide în apropierea prăbușirii podului Baltimore pentru navele mici

_ Contaminarea cu mercur este răspândită în Brazilia Grup indigen: Studiu

_ China clonează o pereche de CAPRE tibetane folosind aceeași tehnică care a produs oaia Dolly în 1997

_ Exporturile de țiței din Rusia au scăzut la cel mai mic nivel din două luni

_ Şeful Mossad încearcă să obțină pacea la Doha: discuţii privind o posibilă încetare a focului în Fâşia Gaza

_ YOLO Cheltuielile, inflația și înțelepciunea/nebunia mulțimilor

_ O rachetă a căzut în apropierea unei nave în Marea Roşie. Nicio grupare nu a revendicat atacul

_ Max Verstappen sosește la Melbourne pentru Marele Premiu al Australiei 2024, în timp ce proprietarii Red Bull thailandezi se îndreaptă în rândul lui Christian Horner pentru „textele sexuale”

_ Runda finală a Masters 2024 ÎN DIRECT: Scottie Scheffler, Collin Morikawa, Max Homa și începătorul Ludvig Aberg se luptă într-o luptă în patru pentru Green Jacket... după ziua dezastruoasă a lui Tiger Woods

_ Roseanne Barr nu este anulată la Mar-a-Lago: vedeta sitcom dă jos casa cu glume despre soldații de epocă, scutece pentru adulți, că este un evreu „uros” și uda patul la strângerea de fonduri de lângă piscină pentru Kari Lake

_ Emisiunea filatelică aniversară 'Avram Iancu, 200 de ani de la naştere' - de marţi, în magazinele Romfilatelia

_ Jaguar Land Rover va cheltui 15 milioane de lire sterline pentru a spori securitatea mașinilor mai vechi - și va finanța poliția în porturi pentru a depista motoarele furate

_ Hamilton și Russell lideri cu Mercedes în a doua sesiune de antrenamente libere din cadrul MP al Bahrainului

Ciolacul "Pe mine mă bucură că l-au prins" Unde e prezumția de nevinovăție măi lichea stalinistă? In România neobolsevica Primul Ministru ilegitim se bucură și jubilează că jandarmii și procurorii "l-au prins" pe cel care a câștigat alegerile prezidentiale

_ Prințul William se simte „rănit” după ce „a văzut elemente” ale urmăririi mamei sale, Prințesa Diana, în timp ce rețelele de socializare explodează cu teorii ale conspirației ciudate despre sănătatea lui Kate Middleton, susține expertul regal.

_ Care sunt cele mai mari pericole percepute ale AI?

_ Experimentul deschide calea pentru un nou set de studii de antimaterie prin răcirea cu laser a pozitroniului

_ Bine ați venit la Beggars' Junction, unde stăpânitorii profesioniști care lucrează în ture încasează mii de lire sterline prin năzuință pe șoferii buni la inimă în timp ce așteaptă la semafoare

_ Decizie istorică luată în Franţa: un orăşel a interzis utilizarea smartphone-urile în spaţii publice

_ Un judecător din SUA blochează pachetul „nepăsător” al lui Musk de 56 de miliarde de dolari Tesla

_ "Magia" reţelelor de socializare îl demască pe adevăratul Superman din Brazilia

_ Comic Relief 2024: Emoționat Sir Lenny Henry plânge în timp ce se uită înapoi la cei 39 de ani care a găzduit Ziua Nasului Roșu, în timp ce i se alătură show-ului său FINAL Julia Roberts și Paul Rudd.

_ Sosesc textele „Fără monedă”: o piață taurină atrage atenția

_ Threads testează o facilitate inspirată de la X (Twitter)

_ Disneyland Paris: preţul biletului de intrare se va modifica în funcţie de cerere

_ Argumentele finale �n Audierea de descalificare și respingere a cazului Fani Willis este stabilită pentru VINERI

_ Consiliilor li se oferă o salvare de 600 de milioane de lire sterline pentru a le ajuta să împiedice criza, după ce primăriile avertizează că sunt în pragul ruinei financiare

_ Se schimbă polii de putere din Europa: România și alte state din regiune ajung din urmă Germania

_ Femeia care și-a rupt gâtul scufundându-se într-o piscină la un club de swingers încearcă să dea în judecată NHS pentru 10 milioane de lire sterline, deoarece susține că paramedicii i-au exacerbat rănile

_ Președintele croat atacă NATO din interior: Toate deciziile cruciale sunt luate la Washingon, fără nicio participare a Croației, Ungariei sau Poloniei

_ Jaqueline Cristian trece de primul tur al calificărilor la Madrid Open

Românii nu mai au încredere în Curtea Constituțional. Și cum ar putea avea încredere dacă cei 9 de la CCR au dat o lovitură de stat pe 6 Decembrie, anuland votul a 9 milioane de români, neexistând NICI O LEGE care sa le dea dreptul să facă așa ceva

_ Cele mai bune 30 de documentare de vizionat la cerere chiar acum: de la crime adevărate la legende sportive și animale sălbatice minunate, criticii noștri cercetează sute de opțiuni, astfel încât să știți ce seriale merită transmise


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11

Nr. de articole la aceasta sectiune: 641, afisate in 11 pagini.