19:32
Comentarii Adauga Comentariu

_ Oamenii de știință cartografiază ARN-ul solului la genomurile fungice pentru a înțelege ecosistemele forestiere

_ Oamenii de știință cartografiază ARN-ul solului la genomul ciupercilor pentru a înțelege ecosistemele forestiere

Dacă un copac cade în pădure – indiferent dacă cineva înregistrează sau nu sunetul – un lucru este sigur: există o mulțime de ciuperci în jur. În solul unei păduri, sute de specii descompun resturile, mobilizează nutrienții din acea degradare și furnizează acești nutrienți rădăcinilor copacilor și solului. Aceste ciuperci ajută la modelarea ecologiei unei păduri. Ele stochează carbonul și ciclează nutrienții cheie, cum ar fi azotul și fosforul.

În acest fel, ciupercile din solurile pădurii dețin cheia sănătății copacilor și stocării carbonului - abilități care contează din ce în ce mai mult pe măsură ce clima se încălzește. Cu toate acestea, acestea sunt interacțiuni complicate de descurcat. Ciupercile lucrează în cooperare pentru a susține o pădure, iar speciile variază de-a lungul ecosistemelor Pământului.

Recent, în lucrările publicate în New Phytologist, cercetătorii au descoperit o nouă înțelegere a ciupercilor care îndeplinesc anumite funcții la nivelul pădurii. Pentru prima dată, au comparat trei bresle de ciuperci diferite într-o serie de locații diferite. Ei au prelevat probe de sol din patru ecosisteme forestiere, au extras ARN pentru a înțelege expresia genelor și au dezvoltat noi instrumente pentru a mapa acel ARN din sol la genomi fungici.

Institutul comun al genomului (JGI) al Departamentului Energiei din SUA (DOE), un birou al DOE pentru știință, situat la Laboratorul Național Lawrence Berkeley (Berkeley Lab) a secvențiat 1 trilion de baze - o terabază - de ARN din sol pentru acest proiect și a produs genomii de referință care au permis cartografierea acestor citiri de ARN. „În prezent, acesta este cel mai mare metatranscriptom fungic secvențial JGI de până acum”, a spus Igor Grigoriev, șeful programului de genomică fungică la JGI.

Împreună cu o înțelegere îmbunătățită a sistemelor forestiere multiple, această lucrare stabilește protocoale și conducte pe care alte echipe le pot folosi din întreaga lume.

Aceste instrumente oferă cercetătorilor o modalitate de a accesa mult mai multe informații despre ciupercile din aceste medii. „Acum, cu aceste noi instrumente – metatranscriptomica, secvențierea ARN a ARN-ului din sol – putem accesa – „Ce fac ei? Cum interacționează?”, a spus autorul principal Francis Martin, director de cercetare emerit la Institutul Național de Cercetare pentru Agricultură, Alimentație și Mediu (INRAE).

Pentru acest studiu, cercetătorii au colectat mostre de sol din patru situri. : Aspurz, Spania; Lamborn, Suedia, Canada. Aceste situri reprezintă, respectiv, pădurile mediteraneene, temperate și boreale pădurile împărtășesc doar aproximativ 20% din speciile lor de ciuperci Pentru a face comparații utile, cercetătorii au trebuit să lucreze în afara taxonomiei. inginer cercetător la INRAE ​​și unul dintre primii autori ai acestei lucrări.

Pentru a compara aceste bresle trofice, această echipă s-a concentrat pe trei grupuri principale de ciuperci care au apărut în toate pădurile pe care le-au eșantionat. Aceste bresle sunt comune pădurilor din întreaga lume, precum și pajiști și pășuni: saprotrofe dezasambla resturile și organismele moarte pentru a-și elibera nutrienții; simbiontii micorizali transporta apa si nutrientii catre copaci; agenții patogeni ai plantelor colonizează plantele vii pentru a se hrăni cu ele.

Din toate tipurile de pădure, Martin și echipa sa au pieptănat mostre de sol pentru a vedea ce gene au folosit aceste trei bresle de ciuperci pentru a crește și a metaboliza nutrienții. Ei au secvențiat tot ARN-ul găsit în probele de sol și au asamblat acele transcripte de ARN într-un metatranscriptom.

În general, au descoperit că, în ciuda diversității mari de specii, fiecare breaslă a îndeplinit funcții remarcabil de similare în diferite păduri. Metabolismul primar, activitatea celulară și dezvoltarea ciupercilor arătau destul de asemănătoare pentru fiecare breaslă de saprotrofi, simbioți micorizali și agenți patogeni, indiferent dacă o probă provenea din solul de sub un pin sau un stejar, în Suedia sau Quebec.

Din punct de vedere ecologic, Martin sugerează că această redundanță este protectoare, un pic ca diversificarea unui portofoliu de investiții. Dacă un stres precum incendiul sau seceta amenință unele specii de ciuperci, alte ciuperci vor completa funcționalitățile necesare.

Această lucrare arată, de asemenea, o nouă suprapunere între funcțiile diferitelor bresle de ciuperci. Saprotrofii și simbioții micorizali au fost împărțiți istoric în nișe ecologice separate - reciclatori și respectiv transportatori. Cu toate acestea, echipa lui Martin a descoperit că ambele bresle exprimă gene similare pentru degradarea pereților celulelor fungice, așa-numita necromasă fungică, sugerând că aceste bresle împărtășesc responsabilitatea reciclării materialului fungic mort.

Acest proiect provine dintr-o știință comunitară. Propunerea de program pe care Martin a înaintat-o ​​în 2012. La acel moment, domeniul cercetase multe comunități diferite de sol pentru diversitatea taxonomică. Aceste studii ar putea identifica populațiile, dar au spus puțin despre speciile care făceau ce.

Pentru a înțelege modul în care comunitățile fungice și-au împărțit sarcinile, Martin și echipa sa au optat pentru a profila ARN, pentru o vedere a expresiei genelor fungice. Ei ar avea nevoie de genomi fungici existenți pentru a mapa expresia genelor la funcții și specii de ciuperci. Inițial, cartografierea secvențelor de ARN în acest fel a fost o provocare, potrivit lui Martin. „În urmă cu 12 ani, când am cartografiat primul ARN secvențial din sol, doar 10% dintre aceștia se mapau la genomurile fungice de la JGI”, a spus Martin.

Un efort numit proiectul 1000 de genomi fungici. a schimbat asta. Acesta este un proiect de mai mulți ani, în colaborare cu JGI, pentru a secvența 1.000 de genomi de referință din întregul arbore al vieții fungice. Martin este unul dintre liderii proiectului. După ce a început cu aproximativ 200 de genomi fungici, în doar câțiva ani, a spus el, proiectul 1000 de genomi fungici, împreună cu alte proiecte CSP, a secvențiat peste 2.000 de genomi fungici.

JGI a secvențiat, asamblat și adnotat. aceste genomi în colaborare cu zeci de parteneri. „Acesta a fost un efort extraordinar al comunității, cu peste 100 de cercetători care au nominalizat specii pentru secvențiere și apoi au trimis mostre de ADN și ARN la JGI”, a spus Grigoriev. Toți acești genomi sunt disponibile la MycoCosm.

Dacă inițial, sarcina de a mapa ARN-ul fungic în secvențe a fost un drum accidentat și întortocheat, acest nou aflux de genomi a deschis o autostradă pe aceeași rută. „A fost cu adevărat uimitor cum s-a îmbunătățit calitatea datelor datorită acelei cantități masive de noi genomi”, a spus Martin.

Proiectul 1000 de genomi fungici se îndreaptă mai departe, pentru a permite mai multe studii ca acesta. Martin spune că și mai multe genome se vor traduce într-o înțelegere și mai mare, pe măsură ce alți cercetători analizează ARN-ul din comunitățile de sol din toată America de Sud, China, Europa și Statele Unite.

„În următorii câțiva ani, cred că vom va avea un fel de hartă globală a diversității fungice, dar încă ne lipsesc funcțiile”, a spus Martin. „Așadar, datorită tipului de program pe care l-am dezvoltat împreună cu JGI, avem instrumentele necesare pentru a obține cu adevărat informații despre funcțiile acestei comunități fungice, de la poli la tropice.”


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Tot ce poate merge prost cu sânii tăi - și ce să faci în privința asta: ghidul definitiv al DR PHILIPPA KAYE

Ingrid Mocanu, după interzicerea bolșevico-soroșista a lui Georgescu : LEGEA a murit Suntem în DICTATURĂ

_ Ultimă oră – Valeri Zalujni a fost înlăturat de la șefia armatei ucrainene: Volodimir Zelenski a făcut anunțul

Romania - Numărul de Profesori la Numărul de Elevi

Ce este o Lovitură de Stat? A fost împiedecat Călin Georgescu să devină duminică seara pe 6 Decembrie 2024, Președintele României, printr-o lovitură de stat?

_ RUPTĂ: Tucker Carlson s-a �nt�lnit cu victima violului lui Joe Biden, Tara Reade, și cu denunțătorul NSA, Edward Snowden, �n timp ce se afla la Moscova

_ Rusia îi spune mamei lui Alexei Navalny: „Sunteți de acord în termen de trei ore cu o înmormântare privată pentru fiul dumneavoastră sau îl îngropăm în închisoare”

_ Ministerul Finanţelor propune o schemă de ajutor de stat de 2,25 miliarde lei, pentru investiţii de anvergură în regiunile mai puţin dezvoltate

_ Premier League va introduce tehnologia de detectare a ofsaidului semi-automat

_ Lipă - Europeanul nu e concludent pentru Jocurile Olimpice, dar sportivii vor scăpa de stres şi emoţii

Prăbușirea criptomonedelor TerraUS și LUNA s-a datorat unui grup restrâns de speculanți care au pariat "short"

Prăbușirea demografică a României se datorează în integralitatea partidelor sistemului care au condus România 35 de ani

_ Oamenii de știință șocați să descopere noi specii de anaconda verde, cel mai mare șarpe din lume

_ FOTO - Asasinat în stil mafiot în Ucraina: un viceprimar a fost împușcat mortal de persoane necunoscute

_ FAA predă îndatoririle Newark de control al traficului aerian către Philadelphia pentru a „aborda problemele de personal”

Fluierul.ro adreseaza o intrebare CSAT si CCR cei care au girat si au dat o adevarata Lovitura de Stat prin ANULAREA ALEGERILOR PREZIDENTIALE si INLATURAREA de la putere a Presedintelui ce urma sa fie ales. Unde e DOVADA implicarii RUSIEI?

_ „Noi nu facem asta aici”: fostul editor al NY Times o aruncă pe „Doamna cenușie” pentru părtinire și activism

_ În relația dulce a reginei Camilla cu câinele ei de salvare „foarte special” Beth, după ce „tovarășul ei mult iubit” a murit

_ Președintele PE vorbește despre adoptarea monedei euro în România, în conferință cu Iohannis/ Video

_ Cercetătorii constată că faptul că are vecini buni și puțini prădători de top face populațiile de pești răpitori mai rezistente

_ Șeful ONU anunță înființarea unui comitet independent responsabil cu evaluarea neutralității Agenției Națiunilor Unite pentru Refugiați Palestinieni

_ New York: Donald Trump depune mărturie în procesul care i-a fost intentat de cronicara de modă E. Jean Carroll

Cazul Le Pen, ineligibilitate și executare provizorie: ce spune cu adevărat legea

_ Haos în spitale din cauza atacului cibernetic! Colegiul Medicilor își exprimă îngrijorarea: 'O problemă de securitate națională'

_ Astăzi este o zi bună pentru DEI: într-un câștig uriaș pentru DeSantis, Universitatea din Florida concediază tot personalul „Diversitate, Echitate și Incluziune”

_ Pont crucial pentru trupele isreliene - O ostatică israeliană eliberată spune că s-a întâlnit cu Yehya Sinwar

Nu mai ești patriot gargaragiule? Fără pic de rușine Penibilul Crin Antonescu a ajuns pe Centura Politicii Românești și cere o alianță PNL+PSD cu Neobolșevicii Internaționaliști ai lui Soros (USR, REPER, SENS)

_ Vladimir Putin și-a trimis spionii să localizeze unitățile HIMARS și Bradley, care îi distrug armata - Video

_ Poveste emoționantă la Cluj! Cum a salvat prin telefon un dispecer la ISU Cluj viața unui bebeluș care s-a înecat

_ Marcel Ciolacu, replică după scrisoarea trimisă de Piedone: Nu răspund la ce îi trece prin cap fiecăruia/ VIDEO

_ Criminal în serie, care a îngrozit România, urmează să fie eliberat. Judecătorii i-au redus pedeapsa

Adrian Onciu: Cine sunt, de fapt, extremiștii

_ Raport: Directorul CIA, Bill Burns, le-a oferit teroriştilor Hamas o garanţie �nainte ca regimul Biden să reducă ajutorul militar acordat Israelului � Hamas este de acord cu �ncetarea focului, care nu menţionează ostatici

_ Cine este soția lui Dave Myers, Liliana Orzac? Faceți cunoștință cu femeia „remarcabilă” care l-a susținut pe starul Hairy Biker în călătoria sa „teribilă” împotriva cancerului

_ Germania rămâne fără bani, iar nivelul datoriilor explodează, avertizează ministrul de Finanțe

_ Eoliene în Marea Neagră. Burduja: În 2032 vom putea avea primul megawatt de energie eoliană produsă în Marea Neagră

_ Un străin ilegal prins la frontieră recunoaște că este un terorist Hezbollah și a spus �Voi �ncerca să fac o bombă�

_ Pluta tratată cu laser absoarbe uleiul pentru curățarea oceanelor fără emisii de carbon

Simion anunță pe Tik Tok: "Eu nu mai fac mitinguri". Dar ce faci?

_ Balerina Farm „soția tradițională” Hannah Neeleman detaliază haosul călătoriei cu opt copii

_ Tatăl radical al lui Fani Willis susține că știa dinainte că COVID-19 a venit în timp ce locuia în Africa de Sud în 2019 (VIDEO)

_ Star porno ucraineană pozează cu veterani de război mutilați pentru o ședință foto de caritate

_ Studiul aruncă o nouă lumină asupra răspândirilor de virusuri între specii care pot provoca pandemii

_ Un donator major cere președintelui Universității Cornell să demisioneze pentru că ar fi promovat DEI

_ România în concediu medical | Anomaliile unui sistem: diferențe uriașe între județe, medici cu mii de concedii eliberate

Abia acum apare la orizont “bomba demografică”: Bolojan semnează legea prin care orice refugiat asiatic sau african primește cetățenie română în 3 ani!

_ Clinica de Stomatologie SANADOR asigură pacienţilor accesul la servicii personalizate pentru prevenţia, diagnosticul şi tratamentul afecţiunilor dentare şi gingivale

_ „Viitorul luminos”: CEO-ul Woodside vede că cererea globală de GNL crește cu 50% în următorul deceniu

_ 34 de militari, sechestrați în timpul unei operațiuni împotriva infracțiunilor de mediu în sudul Columbiei, au fost eliberați cu succes

_ Fed F**kery transformă fluxul mare de depozite bancare de 98 miliarde USD (NSA) în flux de 2 miliarde USD

_ Teribila licitație de 20 de ani are a doua cea mai mare coadă, cea mai mică direcție înregistrată; Spikes Randamente

_ Scandal în Sri Lanka din cauza unei petreceri la care erau invitaţi albi îmbrăcaţi în haine albe

_ Adolescent acuzat ca adult după ce a atacat doi profesori �n școală

_ Președintele parlamentului din Africa de Sud demisionează din cauza anchetei de corupție

_ Ucrainenii pot depune cereri de despăgubire la Haga în urma invaziei Rusiei

_ Surse ucrainene, pentru Defense One: Rusia luptă în Ucraina folosind Starlink-ul lui Elon Musk

_ Conducerea Rapidului îl pune la punct pe Gheorghe Mustață, liderul fanilor FCSB: 'Atât pot ei'

_ Alec Baldwin omite premiera emoționantă a Rust, în care regizorul rănit plânge pe defuncta director de fotografiat Halyna Hutchins

_ Serviciul de spionaj extern al Rusiei susține că grupări militare private americane pregătesc o operațiune în Ucraina


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16

Nr. de articole la aceasta sectiune: 929, afisate in 16 pagini.