_ Urmărirea virusul din spatele crizei cu pielea noduloasă a bovinelor din India

În mai 2022, vitele din India au început să moară din cauza unei boli misterioase. De atunci, aproximativ 1.00.000 de vaci și-au pierdut viața în urma unui izbucnire devastatoare a ceea ce oamenii de știință au identificat drept boală de piele noduloasă. Focarul a afectat grav sectorul agricol al Indiei, ducând la pierderi economice uluitoare.

„A fost o calamitate în anumite privințe... o urgență națională”, spune Utpal Tatu, profesor la Departamentul de Biochimie, Institutul Indian de Știință (IISc).

Tatu face parte dintr-o echipă multi-instituțională care a decis să cerceteze cauza focarului. Studiul lor, publicat în BMC Genomics, oferă perspective esențiale despre evoluția și originile tulpinilor de virus care îl alimentează.

O infecție virală cauzată de virusul bolii cu nodule pielii (LSDV), boala este transmisă de insecte. precum muștele și țânțarii. Provoacă febră și noduli cutanați și poate fi fatal pentru bovine. LSDV a fost găsit pentru prima dată în Zambia în 1931 și a rămas limitat în regiunea sub-africană până în 1989, după care a început să se răspândească în Orientul Mijlociu, Rusia și alte națiuni din sud-estul Europei, înainte de a se răspândi în Asia de Sud. Au existat două focare majore ale acestei boli în India, primul în 2019 și un focar mai grav în 2022, care a infectat peste 2 milioane de vaci.

Pentru a investiga focarul actual, echipa a colectat noduli de piele, sânge și tampoane nazale de la bovine infectate din diferite state, inclusiv Gujarat, Maharashtra, Rajasthan și Karnataka, în colaborare cu institutele veterinare. Ei au efectuat secvențierea avansată a întregului genom a ADN-ului extras din 22 de probe.

„Cea mai mare provocare a fost lipsa unei conducte de secvențiere și analiză a genomului LSDV. A trebuit să adaptăm tehnicile din cercetarea COVID-19.” explică Ankeet Kumar, Ph.D. student la IISc și coautor principal. „Datele au fost, de asemenea, limitate, așa că am compilat toate secvențele de genom LSDV globale disponibile pentru a face analiza noastră robustă.”

Analiza lor genomică a relevat două variante distincte de LSDV care circulă în India, una cu un număr redus de variații genetice și altul cu un număr mare de variaţii genetice. Secvența cu mai puține variații a fost similară genetic cu tulpinile Ranchi 2019 și Hyderabad 2020 care au fost secvențiate anterior. Eșantioanele cu variații mari, totuși, s-au dovedit a fi similare cu tulpinile LSDV dintr-un focar din Rusia în 2015.

Kumar spune că nu există rapoarte anterioare despre tulpinile LSDV atât de variate în India. Virușii care au ADN ca material genetic, cum ar fi LSDV, sunt în general mai stabili decât virușii ARN. Prin urmare, găsirea atât de multe variații genetice a fost destul de surprinzătoare și ar putea explica severitatea bolii, adaugă el.

Echipa a găsit un număr mare de variații genetice - mai mult de 1.800. Acestea includ deleții și inserții în diferite gene, modificări cu o singură literă în ADN (numite SNP) și variații genetice în regiunile dintre gene. Foarte important, au găsit un număr mare de variații genetice ale genelor virale critice pentru legarea de celulele gazdă, evitarea răspunsului imun și replicarea eficientă. Acest lucru a sporit probabil capacitatea virusului de a provoca boli.

„Vitele au dezvoltat simptome mai severe în zonele în care am găsit tulpini foarte diverse. Acest lucru sugerează că variațiile genetice ar putea crește virulența”, spune Kumar.

Astfel de informații pot deschide calea pentru diagnosticare, vaccinuri și intervenții îmbunătățite pentru combaterea bolilor infecțioase emergente care amenință animalele și mijloacele de trai. Grupul de cercetare al lui Tatu a efectuat studii similare asupra COVID-19 în timpul pandemiei și, mai recent, asupra virusului rabiei.

„Datele genomice se vor dovedi neprețuite pentru dezvoltarea vaccinului, dezvăluind punctele fierbinți moleculare și variațiile genetice de vizat”, notează Tatu. „Acesta este o premieră pentru caracterizarea peisajului genomic al LSDV în timpul focarului din India la scară națională.”

Studiul reprezintă un exemplu al abordării One Health în care echipe multidisciplinare, inclusiv biologi moleculari, experți în calcul și medicii veterinari se reunesc pentru a aborda probleme de relevanță națională.

Tatu subliniază, de asemenea, modul în care colaborarea dintre experții veterinari și mai multe instituții științifice a fost esențială pentru urmărirea variantelor în întreaga țară. „Am învățat multe de la medicii veterinari”, spune el. „Ei înțeleg cunoștințele din domeniu, iar percepția lor despre boală a fost foarte importantă pentru noi.”

(Fluierul)