19:33
Comentarii Adauga Comentariu

_ AI ajută la furnizarea celei mai complete hărți a interacțiunilor cheie pentru supraviețuirea bacteriilor

_ AI ajută la furnizarea celei mai complete hărți a interacțiunilor cheie pentru supraviețuirea bacteriilor

Cercetătorii UAB au produs cea mai completă hartă a interactomului esențial bacterian, adică modul în care proteinele se combină și interacționează pentru a îndeplini funcții esențiale pentru supraviețuirea lor. Cercetarea, publicată în jurnalul eLife, a folosit instrumentul de inteligență artificială AlphaFold pentru a prezice și modela peste 1.400 de interacțiuni. Rezultatele au dezvăluit detalii necunoscute anterior ale acestor mecanisme și oferă ținte potențiale pentru dezvoltarea de noi antibiotice.

Bacterii îndeplinesc multe funcții care sunt cheie pentru supraviețuirea lor, cum ar fi producerea energiei de care au nevoie, Replicarea ADN-ului și diviziunea celulară pentru a se reproduce, sau sinteza membranei lor celulare pentru a se proteja și a interacționa cu mediul, printre altele. Toate aceste procese implică complexe care necesită acțiunea coordonată a unui set de proteine ​​care sunt esențiale: fără ele, procesele nu au loc și bacteriile mor.

De aceea, cunoscând în detaliu cum sunt aceste procese de bază. reglementate, care proteine ​​sunt implicate și modul în care acestea interacționează este esențială pentru înțelegerea mecanismelor de creștere, reproducere și supraviețuire a bacteriilor.

Tehnicile experimentale întreprinse până acum au permis identificarea a milioane de interacțiuni între proteine ​​și mii de structuri. dintre aceste proteine, dar acestea sunt date brute care dau un număr mare de fals pozitive; interacțiuni care, în realitate, nu au nicio valoare.

Cu modelele de inteligență artificială dezvoltate recent, cum ar fi AlphaFold2, a fost posibil să se obțină structuri de proteine ​​cu o acuratețe similară metodelor experimentale și să se facă diferența între proteinele autentice- interacțiunile proteinelor și interacțiunile false (false pozitive).

Cercetătorii de la Departamentul de Biochimie și Biologie Moleculară de la Universitat Autònoma de Barcelona au folosit modelul de inteligență artificială AlphaFold2 pentru a prezice setul de interacțiuni proteină-proteină care sunt esențiale pentru supraviețuirea bacteriilor, un total de 1.402 de interacțiuni posibile care alcătuiesc cea mai completă hartă a ceea ce se numește interactom esențial bacterian.

Toate aceste interacțiuni ne extind cunoștințele despre mecanismele de acțiune de care au nevoie bacteriile. să supraviețuiască și să ne permită să identificăm care interacțiuni proteină-proteină pot fi ținte pentru dezvoltarea de noi antibiotice.

„Am obținut o hartă a interactomului esențial bacterian în care toate interacțiunile care sunt esențiale pentru bacterii. a trăi și a se înmulți sunt adunate. Am caracterizat structural aceste interacțiuni folosind noi instrumente de inteligență artificială, în special AlphaFold", explică lectorul UAB Marc Torrent, directorul cercetării. „Credem că aceste structuri sunt o referință pentru dezvoltarea de noi antibiotice, deoarece moleculele care pot inhiba aceste interacțiuni. s-ar comporta ca antibioticele cu mecanisme de acțiune neobișnuite.”

Activitatea bacteriană implică între 4.000 și 5.000 de proteine. Acest set se numește proteom bacterian, dând naștere unui interatom care ar putea avea până la 20 de milioane de interacțiuni posibile. Dar se estimează că interacțiunile care au loc la o specie, de exemplu, în bacteria Escherichia coli, sunt limitate la aproximativ 12 000. Și nu toate aceste interacțiuni sunt esențiale pentru supraviețuirea bacteriei.

< Pentru a distinge interacțiunile esențiale, cercetătorii au considerat doar acelea în care cele două proteine ​​care interacționează pentru a forma complexul sunt prezente în cel puțin două specii bacteriene diferite. Cu aceste filtre și cu ajutorul modelului de inteligență artificială AlphaFold2, cercetătorii au obținut un set de 1.402 de interacțiuni proteine-proteine ​​esențiale.

Pentru a testa fiabilitatea AlphaFold2, echipa de cercetare a comparat predicțiile sale cu 140 de interacțiuni proteină-proteină care au fost obținute experimental în prealabil. Rezultatul a fost o putere predictivă pe care autorii o descriu drept excelentă, deoarece 113 dintre aceste interacțiuni experimentale (81%) au fost prezise de AI foarte precis.

Cercetătorii cred că multe dintre complexele de interacțiune proteină-proteină. care pot fi găsite în bazele de date experimentale ar putea fi fals pozitive.

Cercetătorii evidențiază descoperirea, folosind această metodă, a unui set de interacțiuni protein-proteină necunoscute anterior care acționează în nouă procese esențiale: biosinteza acizilor grași în membrana celulară, sinteza lipopolizaharidelor în membrana exterioară, transportul lipidelor, transportul proteinelor și lipoproteinelor în membrana externă, diviziunea celulară, menținerea formei alungite în bacili, replicarea ADN-ului pentru reproducerea bacteriană și sinteza ubichinonei.

O înțelegere detaliată a structurii acestor complexe de proteine ​​recent descoperite oferă noi perspective asupra mecanismelor moleculare implicate în aceste procese bacteriene vitale și deschide calea pentru dezvoltarea de noi antibiotice.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Tatăl negru este refuzat să cumpere vopsea pentru proiectul de artă al fiului său de patru ani de către personalul Hobbycraft, deoarece au presupus că o va folosi la GRAFFITI

_ Căldura record putrezește boabele de cacao, amenințănd agricultura din Coasta de Fildeș

_ Ryan Gosling seamănă foarte mult cu Emmanuel Macron, spune fostul ministru francez al Culturii, sugerând că tipul Barbie și Julia Roberts ar trebui să joace rolul președintelui și al soției sale în viitorul film biografic

_ Marea Britanie renunță la Tratatul care permite companiilor petroliere să dea în judecată guvernele pentru politica climatică

_ Trei dintre foștii parteneri de dans Strictly ai lui Giovanni Pernice susțin că acesta este „de neatins”, în timp ce BBC își susține în spatele lui: „Este o lovitură în dinți”

_ Moment îngrozitor, mașina lovește pietonii evrei ultra-ortodocși într-un „atac terorist”, lăsând trei răniți înainte ca suspecții să fugă la Ierusalim

_ 2020 Biden despre Trump: �Pe măsură ce zidurile se apropie de acest om, sunt �ngrijorat că ne va duce la război �n Iran� (VIDEO)

_ Megaorașele Africii amenințate de căldură, inundații, boli – acțiuni necesare pentru a începe ecologizarea, adaptarea la schimbările climatice

_ Fost primar, arestat pentru viol într-o comună din Botoșani. Se pregătea să candideze la locale

_ Esteticiană, în vârstă de 39 de ani, a căzut la 170 de metri după ce a murit din vârful unei stânci, după ce a cățărat o barieră pentru a-și face un selfie în timpul vacanței în Georgia

_ Beattie: Pretext pentru o resurecție federală

_ Sezonul ploios din California este aici. Ce înseamnă pentru alimentarea cu apă?

_ YOLO Cheltuielile, inflația și înțelepciunea/nebunia mulțimilor

_ Cel puţin patru morţi în urma incendiului izbucnit într-un bloc cu 14 etaje din Valencia

_ Abuzuri în lanțul de aprovizionare: Legislația emblematică a UE privind moda rapidă atârnă în balanță

_ CEO ADNOC: Creșterea cererii globale de energie este nesustenabilă

_ Day of Bukovina, marked in Chernivtsi and Storozhynets, 106 years after union of Bukovina with Romania

_ Timişoara: Se reia, de vineri, transportul cu varopaşele pe Bega

_ ForMin Odobescu, Deputy PM for Reintegration of Republic of Moldova Serebrian, about Transnistrian file

_ Banca Angliei menține ratele dobânzii la 5,25%, în ciuda veștilor bune despre inflație... cu speranțe de ușurare pentru plătitorii de credite ipotecare în câteva luni

_ Șoferul care a fost amendat de o parcare de 1 lire sterline pentru că și-a plimbat câinele spune că anii de luptă cu compania i-au lăsat 733 de lire sterline din buzunar și cu un rating de credit stricat.

_ Elon Musk este prăjit din cauza unei mișcări „manipulative” și „încrezătoare” în timp ce iese cu prietenul apropiat Donald Trump

_ Fiica lui John Singleton, Dawn, numită victimă a înjunghierii Westfield Bondi Junction

_ Apple termină blocarea în magazinul de aplicații din UE pentru Fortnite-maker Epic

_ Am descoperit că soția mea era însărcinată din postarea pe Instagram a prietenei ei

_ Premiile Olivier 2024: Nicole Scherzinger se prezintă într-o rochie neagră adâncă, în timp ce se alătură glamului Cara Delevingne, Sheridan Smith, Hannah Waddingham și Sarah Snook în sosiri de top pline de stele

_ Pubul Notting Hill ai cărui obișnuiți includ Dua Lipa și Prințesa Eugenie lansează o luptă în instanță după ce plângerile de zgomot din partea vecinilor au declanșat un val de restricții

_ George Simion, în război cu toată lumea din cauza OUG 21/2024: 'Suntem martorii unei lovituri de stat în plină desfășurare'

_ Charles Spencer dezvăluie cum sora Diana i-a spus tatălui lor „dacă m-ai iubi, nu m-ai lăsa aici” când a fost trimisă la internat - în timp ce el povestește despre abuzurile suferite în timpul școlii.

_ IAN BRADY - POVESTE NESPĂSITA: Încolțit de poliție, Brady și-a întins mâna după arma - apoi și-a dat seama de greșeala lui teribilă

_ Fiica noastră, Ella, în vârstă de 16 ani, a vrut să moară... așa am adus-o înapoi din prag

_ Fani Scrambles: Fulton DA cere judecătorului să respingă probele de la telefonul mobil

_ Egiptul a recuperat o statuie furată a lui Ramses al II-lea, veche de 3.400 de ani

_ Manchester United 'are o echipă de viitor', consideră antrenorul ten Hag

_ TOȚI VORBEȘTE DESPRE: pantalonii greșiți ai lui Alan Titchmarsh

_ Iohannis îl felicită pe Alexander Stubb pentru victoria în alegerile prezidențiale din Finlanda: 'Aştept cu nerăbdare să lucrăm împreună'

_ Procesul de incendiu al lui Trump: Moment îngrozitor, gazdele CNN urmăresc cum protestatarul își dă foc în timp ce îi descriu corpul în flăcări care tremură în timp ce „este cuprins de flăcări totale”

_ „Pride Pillar” dezvăluit de Network Rail la stația London Bridge, care celebrează „demisexualitatea și „polaritatea” care i-a costat pe contribuabili 3.500 de lire sterline este „semnalare a virtuții”, spun criticii

_ Părinții „fărâmi” ai lui Josh Baker îi omagiază starului de cricket care „și-a împlinit multe dintre visele înainte de a împlini 21 de ani” – în timp ce moartea subită a unui jucător cu diabet zaharat este investigată de medicul legist

_ Retailerul evomag a raportat vânzări mai mari cu aproximativ 10%, de Black Friday 2024

_ Chelsea 6-0 Everton - Premier League: știri live, scor și actualizări ale echipei, în timp ce Cole Palmer înscrie PATRU... dar vedetele Blues încă se ceartă între ele!

_ Am cumpărat o clădire de birouri blândă și am transformat-o în prima casă a visului meu - acum sunt pe scara proprietății Londrei și chiar am economisit 30.000 de lire sterline pentru renovari

_ Runda finală a Masters 2024 ÎN DIRECT: Scottie Scheffler, Collin Morikawa, Max Homa și începătorul Ludvig Aberg se luptă într-o luptă în patru pentru Green Jacket... după ziua dezastruoasă a lui Tiger Woods

_ Un tânăr care circula cu aproape 80 km/h pe o trotinetă electrică, mai repede decât maşinile,reţinut de poliţie

_ Jaguar Land Rover va cheltui 15 milioane de lire sterline pentru a spori securitatea mașinilor mai vechi - și va finanța poliția în porturi pentru a depista motoarele furate

_ 'Înghiți-ți mândria și adu-ți înapoi pe Boris!' Kwasi Kwarteng îl îndeamnă pe Rishi Sunak să-i ceară lui Johnson ajutor electoral

_ Pe măsură ce BYD-ul Chinei inundă Europa cu mașini electrice ieftine, tarifele de modă veche pot trânti pe frână?

_ Reptilele din sol nisipos sunt mai amenințate de schimbările climatice decât s-a presupus, arată studiul

_ Sunt un poștaș de 20 de ani - iată de ce o săptămână de trei zile ar însemna un dezastru pentru livrările de scrisori

_ Sweetie Pies: Opt buduri ușoare, de școală veche din noua carte a Benjaminei Ebuehi

_ Genele LSH asociate cu definirea formelor tulpinilor, florilor și frunzelor necesare pentru nodulii radiculari care fixează N

_ Cum oamenii bandele de contrabandă fură acum bărcile de agrement ale pensionarilor acostate pe canalele franceze... cu rezultate fatale, scrie SUE REID

_ Avertizare meteo - Ceață și ghețuș în 19 județe

_ Dezbaterea Marelui Sos Britanic este în sfârșit soluționată, deoarece mii de oameni votează în sondajul nostru pentru condimentul suprem pe care să-l pună pe chipsuri... și NU este ketchup

_ Mi-am îngropat părinții în câmpul fermierului de alături... și ne-a economisit mii de taxe

_ JULIE BURCHILL: De ce nimic nu este la fel de cool ca creionul de ochi cu kohl negru

_ De la Casualty la Holby City, Scrubs, Call The Midwife și ER, care ESTE cel mai realist serial medical TV? Am întrebat experții...

_ Katie Price dezvăluie momentul în care doctorul i-a spus că Harvey era orb și apoi a lăsat-o în „limbo”

_ Cele trei întrebări fără răspuns cu care se confruntă Angela Rayner cu privire la afacerile ei fiscale, în timp ce liderul adjunct laburist spune că va RENUNȚA dacă poliția descoperă că a încălcat legea din cauza vânzării vechii ei case de consiliu


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26 Pag.27 Pag.28 Pag.29 Pag.30 Pag.31
Pag.32 Pag.33 Pag.34 Pag.35 Pag.36 Pag.37 Pag.38 Pag.39
Pag.40 Pag.41

Nr. de articole la aceasta sectiune: 2430, afisate in 41 pagini.