19:33
Comentarii Adauga Comentariu

_ AI ajută la furnizarea celei mai complete hărți a interacțiunilor cheie pentru supraviețuirea bacteriilor

_ AI ajută la furnizarea celei mai complete hărți a interacțiunilor cheie pentru supraviețuirea bacteriilor

Cercetătorii UAB au produs cea mai completă hartă a interactomului esențial bacterian, adică modul în care proteinele se combină și interacționează pentru a îndeplini funcții esențiale pentru supraviețuirea lor. Cercetarea, publicată în jurnalul eLife, a folosit instrumentul de inteligență artificială AlphaFold pentru a prezice și modela peste 1.400 de interacțiuni. Rezultatele au dezvăluit detalii necunoscute anterior ale acestor mecanisme și oferă ținte potențiale pentru dezvoltarea de noi antibiotice.

Bacterii îndeplinesc multe funcții care sunt cheie pentru supraviețuirea lor, cum ar fi producerea energiei de care au nevoie, Replicarea ADN-ului și diviziunea celulară pentru a se reproduce, sau sinteza membranei lor celulare pentru a se proteja și a interacționa cu mediul, printre altele. Toate aceste procese implică complexe care necesită acțiunea coordonată a unui set de proteine ​​care sunt esențiale: fără ele, procesele nu au loc și bacteriile mor.

De aceea, cunoscând în detaliu cum sunt aceste procese de bază. reglementate, care proteine ​​sunt implicate și modul în care acestea interacționează este esențială pentru înțelegerea mecanismelor de creștere, reproducere și supraviețuire a bacteriilor.

Tehnicile experimentale întreprinse până acum au permis identificarea a milioane de interacțiuni între proteine ​​și mii de structuri. dintre aceste proteine, dar acestea sunt date brute care dau un număr mare de fals pozitive; interacțiuni care, în realitate, nu au nicio valoare.

Cu modelele de inteligență artificială dezvoltate recent, cum ar fi AlphaFold2, a fost posibil să se obțină structuri de proteine ​​cu o acuratețe similară metodelor experimentale și să se facă diferența între proteinele autentice- interacțiunile proteinelor și interacțiunile false (false pozitive).

Cercetătorii de la Departamentul de Biochimie și Biologie Moleculară de la Universitat Autònoma de Barcelona au folosit modelul de inteligență artificială AlphaFold2 pentru a prezice setul de interacțiuni proteină-proteină care sunt esențiale pentru supraviețuirea bacteriilor, un total de 1.402 de interacțiuni posibile care alcătuiesc cea mai completă hartă a ceea ce se numește interactom esențial bacterian.

Toate aceste interacțiuni ne extind cunoștințele despre mecanismele de acțiune de care au nevoie bacteriile. să supraviețuiască și să ne permită să identificăm care interacțiuni proteină-proteină pot fi ținte pentru dezvoltarea de noi antibiotice.

„Am obținut o hartă a interactomului esențial bacterian în care toate interacțiunile care sunt esențiale pentru bacterii. a trăi și a se înmulți sunt adunate. Am caracterizat structural aceste interacțiuni folosind noi instrumente de inteligență artificială, în special AlphaFold", explică lectorul UAB Marc Torrent, directorul cercetării. „Credem că aceste structuri sunt o referință pentru dezvoltarea de noi antibiotice, deoarece moleculele care pot inhiba aceste interacțiuni. s-ar comporta ca antibioticele cu mecanisme de acțiune neobișnuite.”

Activitatea bacteriană implică între 4.000 și 5.000 de proteine. Acest set se numește proteom bacterian, dând naștere unui interatom care ar putea avea până la 20 de milioane de interacțiuni posibile. Dar se estimează că interacțiunile care au loc la o specie, de exemplu, în bacteria Escherichia coli, sunt limitate la aproximativ 12 000. Și nu toate aceste interacțiuni sunt esențiale pentru supraviețuirea bacteriei.

< Pentru a distinge interacțiunile esențiale, cercetătorii au considerat doar acelea în care cele două proteine ​​care interacționează pentru a forma complexul sunt prezente în cel puțin două specii bacteriene diferite. Cu aceste filtre și cu ajutorul modelului de inteligență artificială AlphaFold2, cercetătorii au obținut un set de 1.402 de interacțiuni proteine-proteine ​​esențiale.

Pentru a testa fiabilitatea AlphaFold2, echipa de cercetare a comparat predicțiile sale cu 140 de interacțiuni proteină-proteină care au fost obținute experimental în prealabil. Rezultatul a fost o putere predictivă pe care autorii o descriu drept excelentă, deoarece 113 dintre aceste interacțiuni experimentale (81%) au fost prezise de AI foarte precis.

Cercetătorii cred că multe dintre complexele de interacțiune proteină-proteină. care pot fi găsite în bazele de date experimentale ar putea fi fals pozitive.

Cercetătorii evidențiază descoperirea, folosind această metodă, a unui set de interacțiuni protein-proteină necunoscute anterior care acționează în nouă procese esențiale: biosinteza acizilor grași în membrana celulară, sinteza lipopolizaharidelor în membrana exterioară, transportul lipidelor, transportul proteinelor și lipoproteinelor în membrana externă, diviziunea celulară, menținerea formei alungite în bacili, replicarea ADN-ului pentru reproducerea bacteriană și sinteza ubichinonei.

O înțelegere detaliată a structurii acestor complexe de proteine ​​recent descoperite oferă noi perspective asupra mecanismelor moleculare implicate în aceste procese bacteriene vitale și deschide calea pentru dezvoltarea de noi antibiotice.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Tot ce poate merge prost cu sânii tăi - și ce să faci în privința asta: ghidul definitiv al DR PHILIPPA KAYE

Rezultatele sondajului Verifield

Motivarea judecatorului

_ Cum a crescut Tumblr o generație de feministe

Cristi Chivu, noul antrenor al Parmei!

_ Cum poate Trump să câștige New Jersey, New York

_ Răspunsurile bancare sunt în meniu?

_ Video: Noua misiune radar pentru Europa

_ Alain Delon a fost plasat sub protecție judiciară

_ Ce să știți despre incendiile vorace din Chile

_ „Violuri, jaf și împușcături” la Darién Gap, în timp ce criza la graniță a lui Biden extinde haosul

Prăbușirea Apple demonstrează că a te gudura pe lângă Trump nu este o garanție a siguranței

Nimeni nu e mai presus de Lege. Nici măcar Curtean Constituțională

_ VDH: Vinovat! ...Dar nu chiar vinovat?

_ WTI extinde pierderile în ciuda retragerilor de țiței și benzină

_ Cele mai lungi alegeri generale: Gingrich

_ Manuporturi în contextul arheologiei

_ Cenzura și Piața Publică Digitală

_ Milioane de indonezieni votează pentru noul președinte, fostul general Subianto fiind favorit

_ Şedinţa CSAT a început la Palatul Cotroceni

_ PNL announces that it is willing to ally with AUR against PSD

_ Un nou început: Astronomii caută „Tatooines” mai temperate

Prăbușirea criptomonedelor TerraUS și LUNA s-a datorat unui grup restrâns de speculanți care au pariat "short"

În sondajul Atlas Intel Soroșiștul Nicușor Dan, e pe locul doi

_ Poliția braziliană arestează suspecți în uciderea în 2018 a consilierului de la Rio Marielle Franco

_ VIDEO 'Moromeţii 3' rulează în cinematografele din întreaga ţară

România propusă de Călin Georgescu vs România puciștilor dirijați de progresista UE. Iată cum arată România Puciștilor : Șomajul în rândul tinerilor e cel mai mare din UE. La țară a ajuns peste 30%

Viktor Orbán: "Nu mai puteam să stăm cu mâinile în sân şi să privim cum lanţurile de magazine jefuiesc oamenii". Vă amintiți cum au sărit Soroșiștii pe Călin Georgescu când ne-a spus că Multinaționalele ne jefuiesc? De ce AUR și Simion TAC pe această temă?

De ce sa înjuri votanții că votează cu cine vor ei? Tonomatul puterii pe nume Ciutacu care pupă la greu poala Pucistului Ciolacul și a lui Gold Corporation Ponta ii înjură oribil pe votanții lui Georgescu

Un nou sondaj: Simion pe primul loc, Ponta pe doi. Sondaj Verifield comandat de Nicușor Dan.

SpaceX tocmai a făcut un pas mare spre reutilizarea amplificatorului Super Heavy al Starship

_ OCDE intră peste România: Cere scurtarea concediului de creștere a copilului/ Ministerul Muncii anunță planul

_ Cercetătorii explorează un vechi cluster galactic deschis

_ Povestea bună versus evaluări proaste

_ Președintele celui mai mare fond de �ngrijire a sănătății din Belgia susține eutanasia ca soluție pentru persoanele �n v�rstă care s-au săturat de viață

_ Ion Cristoiu: Ticăloşia lui Nicolae Iorga

_ Glina wastewater treatment plant, nominated for Global Water Awards

_ Cafeaua sintetică ar putea deveni o realitate

_ Danone și Nestle, decizie majoră: Ce se întâmplă cu prețurile de la raft

"Bilderberg" - "Black Rock" - "Merz" sau Cum se pune un Cancelar în Germania? Ca și Angela Merkel, Friedrich Merz a fost chemat să dea raportul la Reuniunea Grupului Bilderberg înainte de a deveni Cancelar

_ How humanitarian aid reaches war-ravaged Gaza

_ Patru muncitori morți în scufundarea unei nave din Egipt: presa de stat

_ Misterul din noaptea de 22 septembrie 1979: o explozie nucleară a zguduit întreaga planetă, iar suspiciunile au căzut asupra Israelului

_ Încălzirea globală pune piedici activităţilor de pe şantierele de construcţii

_ Spaţiul aerian israelian se redeschide

_ Ukraine says energy sector 'under massive enemy attack'

_ „Asasinatul automatizat”: Israelul lasă AI să decidă cine moare în Gaza

_ Apple, Meta şi Google vor fi investigate de UE

_ Tucker Carlson: Interviul lui Putin

_ Hochei: Egalitate în semifinalele Erste Liga, după două meciuri

_ Meteoriții marțieni oferă o mulțime de informații despre structura planetei roșii

_ Este complet legal să deții „Thermonator”

_ Nadal, învins la Madrid de Lehecka

_ Anatomia Complexului Tehno-Industrial

_ „Dinții i s-au înfipt în piele ca niște pumnale, am crezut că îmi va rupe brațul”: am fost atacat de un bătăuș XL. Așa s-a simțit - și cum spun experții în câini că ar trebui să te aperi

_ Video | Operaţiune a poliţiei române, spaniole şi germane cu Europol: A fost arestat liderul bandei de motociclişti Hell's Angels pentru tentativă de omor

_Fluierul.ro - 09 Apr 2024 10:11:15

_ Senatorul Rand Paul lansează un avertisment ferm către Trump: �Va pierde alegerile din 2024 dacă va continua să-l sprijine pe Președintele Johnson�

_ Dan Podaru anunță că va fi candidatul Partidului Ecologist Român la Primăria Sectorului 1

_ De la gripa aviară la șerpii climatici


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26 Pag.27 Pag.28 Pag.29 Pag.30 Pag.31
Pag.32 Pag.33 Pag.34 Pag.35 Pag.36 Pag.37 Pag.38 Pag.39
Pag.40 Pag.41 Pag.42 Pag.43 Pag.44 Pag.45 Pag.46 Pag.47
Pag.48 Pag.49 Pag.50 Pag.51 Pag.52 Pag.53 Pag.54 Pag.55
Pag.56 Pag.57 Pag.58 Pag.59 Pag.60 Pag.61 Pag.62 Pag.63
Pag.64 Pag.65 Pag.66 Pag.67 Pag.68 Pag.69 Pag.70 Pag.71
Pag.72 Pag.73 Pag.74 Pag.75 Pag.76 Pag.77 Pag.78 Pag.79
Pag.80 Pag.81 Pag.82

Nr. de articole la aceasta sectiune: 4877, afisate in 82 pagini.