19:33
Comentarii Adauga Comentariu

_ AI ajută la furnizarea celei mai complete hărți a interacțiunilor cheie pentru supraviețuirea bacteriilor

_ AI ajută la furnizarea celei mai complete hărți a interacțiunilor cheie pentru supraviețuirea bacteriilor

Cercetătorii UAB au produs cea mai completă hartă a interactomului esențial bacterian, adică modul în care proteinele se combină și interacționează pentru a îndeplini funcții esențiale pentru supraviețuirea lor. Cercetarea, publicată în jurnalul eLife, a folosit instrumentul de inteligență artificială AlphaFold pentru a prezice și modela peste 1.400 de interacțiuni. Rezultatele au dezvăluit detalii necunoscute anterior ale acestor mecanisme și oferă ținte potențiale pentru dezvoltarea de noi antibiotice.

Bacterii îndeplinesc multe funcții care sunt cheie pentru supraviețuirea lor, cum ar fi producerea energiei de care au nevoie, Replicarea ADN-ului și diviziunea celulară pentru a se reproduce, sau sinteza membranei lor celulare pentru a se proteja și a interacționa cu mediul, printre altele. Toate aceste procese implică complexe care necesită acțiunea coordonată a unui set de proteine ​​care sunt esențiale: fără ele, procesele nu au loc și bacteriile mor.

De aceea, cunoscând în detaliu cum sunt aceste procese de bază. reglementate, care proteine ​​sunt implicate și modul în care acestea interacționează este esențială pentru înțelegerea mecanismelor de creștere, reproducere și supraviețuire a bacteriilor.

Tehnicile experimentale întreprinse până acum au permis identificarea a milioane de interacțiuni între proteine ​​și mii de structuri. dintre aceste proteine, dar acestea sunt date brute care dau un număr mare de fals pozitive; interacțiuni care, în realitate, nu au nicio valoare.

Cu modelele de inteligență artificială dezvoltate recent, cum ar fi AlphaFold2, a fost posibil să se obțină structuri de proteine ​​cu o acuratețe similară metodelor experimentale și să se facă diferența între proteinele autentice- interacțiunile proteinelor și interacțiunile false (false pozitive).

Cercetătorii de la Departamentul de Biochimie și Biologie Moleculară de la Universitat Autònoma de Barcelona au folosit modelul de inteligență artificială AlphaFold2 pentru a prezice setul de interacțiuni proteină-proteină care sunt esențiale pentru supraviețuirea bacteriilor, un total de 1.402 de interacțiuni posibile care alcătuiesc cea mai completă hartă a ceea ce se numește interactom esențial bacterian.

Toate aceste interacțiuni ne extind cunoștințele despre mecanismele de acțiune de care au nevoie bacteriile. să supraviețuiască și să ne permită să identificăm care interacțiuni proteină-proteină pot fi ținte pentru dezvoltarea de noi antibiotice.

„Am obținut o hartă a interactomului esențial bacterian în care toate interacțiunile care sunt esențiale pentru bacterii. a trăi și a se înmulți sunt adunate. Am caracterizat structural aceste interacțiuni folosind noi instrumente de inteligență artificială, în special AlphaFold", explică lectorul UAB Marc Torrent, directorul cercetării. „Credem că aceste structuri sunt o referință pentru dezvoltarea de noi antibiotice, deoarece moleculele care pot inhiba aceste interacțiuni. s-ar comporta ca antibioticele cu mecanisme de acțiune neobișnuite.”

Activitatea bacteriană implică între 4.000 și 5.000 de proteine. Acest set se numește proteom bacterian, dând naștere unui interatom care ar putea avea până la 20 de milioane de interacțiuni posibile. Dar se estimează că interacțiunile care au loc la o specie, de exemplu, în bacteria Escherichia coli, sunt limitate la aproximativ 12 000. Și nu toate aceste interacțiuni sunt esențiale pentru supraviețuirea bacteriei.

< Pentru a distinge interacțiunile esențiale, cercetătorii au considerat doar acelea în care cele două proteine ​​care interacționează pentru a forma complexul sunt prezente în cel puțin două specii bacteriene diferite. Cu aceste filtre și cu ajutorul modelului de inteligență artificială AlphaFold2, cercetătorii au obținut un set de 1.402 de interacțiuni proteine-proteine ​​esențiale.

Pentru a testa fiabilitatea AlphaFold2, echipa de cercetare a comparat predicțiile sale cu 140 de interacțiuni proteină-proteină care au fost obținute experimental în prealabil. Rezultatul a fost o putere predictivă pe care autorii o descriu drept excelentă, deoarece 113 dintre aceste interacțiuni experimentale (81%) au fost prezise de AI foarte precis.

Cercetătorii cred că multe dintre complexele de interacțiune proteină-proteină. care pot fi găsite în bazele de date experimentale ar putea fi fals pozitive.

Cercetătorii evidențiază descoperirea, folosind această metodă, a unui set de interacțiuni protein-proteină necunoscute anterior care acționează în nouă procese esențiale: biosinteza acizilor grași în membrana celulară, sinteza lipopolizaharidelor în membrana exterioară, transportul lipidelor, transportul proteinelor și lipoproteinelor în membrana externă, diviziunea celulară, menținerea formei alungite în bacili, replicarea ADN-ului pentru reproducerea bacteriană și sinteza ubichinonei.

O înțelegere detaliată a structurii acestor complexe de proteine ​​recent descoperite oferă noi perspective asupra mecanismelor moleculare implicate în aceste procese bacteriene vitale și deschide calea pentru dezvoltarea de noi antibiotice.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Războaiele de streaming ale TV: BBC face echipă cu radiodifuzori rivali pentru a lansa serviciul Freely în încercarea de a prelua Netflix

_ Sarah Ferguson arată sofisticată în ansamblul marinei în timp ce iese la Global Citizen Prize Awards la New York

_ VIDEO Ilie Bolojan, întrebat de față cu Nicolae Ciucă dacă-i vânează locul de președinte al PNL

_ Timişoara: Se reia, de vineri, transportul cu varopaşele pe Bega

_ Copenhaga vs Manchester City - Liga Campionilor: scor live, știri ale echipei și actualizări, în timp ce echipa lui Pep Guardiola își continuă apărarea titlului împotriva cuceritorilor lui United în optimile de finală

_ Situație ciudată la metroul din București: toți călătorii sunt nervoși

_ Putin va sosi marți în Coreea de Nord, prima vizită în 24 de ani

_ Paris asigură dragostea olimpică prin distribuirea a 220.000 de prezervative gratuite sportivilor

_ Observatorul Swift studiază o pereche de găuri negre monstruoase care produc gaze

_ Steaua a remizat cu Chindia Târgovişte, scor 1-1

_ Raportul DOD arată o propunere de cercetare a ambarcațiunilor UAP cu inginerie inversă

_ Incendiul izbucnește la hotelul „The Shining”: Flăcările străbat istoricul Timberline Lodge din Oregon, care a apărut în celebrul film de groază din 1980 al lui Jack Nicholson

SpaceX tocmai a făcut un pas mare spre reutilizarea amplificatorului Super Heavy al Starship

_ Începem Paștele cu strop! Britanicii au ajuns pe plajă în timp ce cerul mohorât lasă loc soarelui și temperaturile urcă la 13C, în timp ce milioane de oameni se îndreaptă spre vacanță

_ Creatorul Tatălui Ted, Graham Linehan, a fost justificat de raportul Cass privind tratamentul trans NHS pentru copii, susțin fanii după ce a fost anulat și denigrat din cauza opiniilor despre tranziția de gen a tinerilor.

_ Miliardarul german de supermarket care a dispărut făcând drumeții pe Matterhorn și a fost declarat mort, „locuiește cu amanta sa la Moscova”

_ Șefii FTSE 100 susțin că sunt dificili în comparație cu statele. Dar analiza noastră sugerează o poveste foarte diferită: șefii britanici sunt într-adevăr prost plătiți?

_ Sora lui Iulian Dumitrescu rămâne sub control judiciar - Instanța validează măsura DNA față de `finanțatoarea` șefului CJ Prahova

_ Guvernul australian ordonă Facebook și X să elimine videoclipul cu atacul cu cuțitul musulman

_ Germania a trecut de Canada pentru a ajunge în semifinalele Cupei Davis

_ Prins în punctul de vedere al unei crize legate de costul vieții

_ LIVE TEXT - Război în Ucraina: Rusia a lansat noaptea trecută 132 de drone, iar apărarea aeriană a distrus 88 în 11 regiuni

_ Fanii Man United care se prezintă drept suporteri cu dizabilități pentru a intra în meciuri sunt criticați de o organizație caritabilă de top... în timp ce clubul înăsprește regulile pentru a preveni repetarea înșelătoriei „daunătoare”

_ Leo Hohmann: Nașul AI spune că �roboții de luptă� vor domina �n cur�nd abilitățile de război ale națiunilor majore, reprezent�nd �amenințare existențială�

_ PARANOIA LUI ZELENSKY: Președintele Ucrainei este „emoțional și nervos”, cu „anxietate profundă” – a instruit oficialii să-l critice pe Biden pentru că a sărit peste summitul pentru pace din Elveția

_ Adrian Năstase: Ideea că România ar putea să fie o mare bază NATO este enervantă pentru Turcia

_ Cea mai adâncă gaură albastră din lume a fost descoperită în Mexic: un abis imens se extinde la cel puțin 1.380 de metri sub nivelul mării - iar oamenii de știință nu au ajuns încă la fundul acestuia

_ Salariul colosal pe care îl primesc Bontea, Scărletscu și Dumitrescu la Masterchef: Suma este dublă față de cât primeau la Antena 1

_ Jesse Baird, cadavrele lui Luke Davies găsite: Actualizare dramatică în ancheta poliției din NSW, în timp ce polițiștii roiesc în Bungonia după ce Beau Lamarre-Condon a fost acuzat

_ TREBUIE SA VEZI! Stephen A. Smith se �ntoarce �mpotriva regimului Biden: �Prețul ridicat al legii anti-Trump a democraților� (VIDEO)

_ Ar putea fi arestat proprietarul Pub Al Murray din cauza noii legi din Scoția privind infracțiunile motivate de ură? Stand-up susține că legislația îi expune pe comedianți în riscul de a fi pedepsiți pentru călușuri cu limba în obraz

_ Studiul datelor cometei A117uUD sugerează că a fost pusă pe o „traiectorie hiperbolică” în timpul trecerii pe lângă Saturn

_ Franța este de acord să patruleze cerul peste plajele sale, într-o nouă represiune asupra punctelor de trecere a migranților Canalului

_ ILARIO: Guvernatorul Michigan, Gretchen Whitmer, huiduit de o mulțime record la draftul NFL din Detroit (VIDEO)

_ PPE şi Renew solicită o dezbatere în Parlamentul European despre existenţa acolo a unei reţele de influenţă ruseşti

_ Grevă în domeniul securităţii aeroportuare programată pentru joi în Germania

_ Luka Modrić și Ivan Perišić stabilesc un record european impresionant

_ Șeful sindicatului agricol se îndreaptă asupra celebrităților care cumpără terenuri pentru a-și „spăla verde” stilul de viață al jet-setter-ului

_ Moment emblematic, hardmanul UFC, Jon Jones, îi înmânează lui Donald Trump centura sa de campionat și se înclină în fața președintelui ales - dezvăluind fanii

_ VIDEO| Cine sunt Gardienii Revoluției din Iran, cei care au lansat atacul asupra Israelului

_ Fosta iubită a agentului Serviciului Secret speră că poveștile lor sexuale pe plajă cu Obama vor fi transformate într-un film

_ „Trăiesc într-o perpetuă teamă că tatăl meu va fi eliberat după ce mi-a ucis-o pe mama cu un ciocan”: fiul ucigașului Robert Brown povestește despre trauma sa, în timp ce pilotul încarcerat din BA își pierde oferta de eliberare

_ Tinerii de 16 ani din Belgia pot vota la alegerile europene. Cum stă situaţia în România

_ Pierdere record pentru Gazprom din Rusia pe măsură ce piața europeană s-a închis

_ Avansarea afișajului holografic 3D în timp real: O nouă metodă pentru holografia generată de computer

_ Producerea rapidă de spume poliuretanice biobazate, fără izocianați, la temperatura ambiantă

_ Rezolvarea unui mister vechi despre formarea cristalelor

_ Opt spectacole sold out la Festivalul Internaţional de Teatru, 21-30 iunie

_ Jocurile lui Viktor Orban și Erdogan: Klaus Iohannis a intrat în marile negocieri pentru șefia NATO

_ Ultimă oră: Operațiune a forțelor speciale în Republica Moldova

_ Se întâmplă ceva foarte straniu în Rusia: explozii verde-acid, declanșate fără nicio explicație, fac ravagii pe tărâmul lui Putin

_ Dovada că alegătorii mai în vârstă au pus-o pe Starmer's Labour? Defalcarea petiției electorale virale arată cum zonele cu rezidenți mai în vârstă domină semnatarii acuzând premierul că și-a încălcat promisiunile

_ Milei din Argentina va vizita Israelul, denunta Hamas

_ Cioloş, după acuzaţiile PSD în cazul Roşia Montană: Ciolacu, dă-l afară pe Ponta imediat din Guvern

_ Veterinarul marin cu PTSD a primit mai mult de 5 ani de închisoare, amendat cu 200.000 de dolari pe 6 ianuarie

_ VIDEO Omul care s-a transformat în câine face un anunț important despre viața sa, după ce a cheltuit o avere pentru visul său

_ Kaia Gerber dezvăluie că îi place „CRYING in the shower”, în timp ce modelul se deschide în timpul unui interviu radio bizar pentru noul serial de comedie

_ WAYNE ROOT: Nikki Haley este noua Liz Cheney

_ Atenționare de avalanșă în Munții Rodnei și Munții Maramureșului

_ O cosmeticiană și-a stropit fosta prietenă după ce a intrat în casa ei de 500.000 de lire sterline din cauza zvonurilor false despre abuz asupra copiilor


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5

Nr. de articole la aceasta sectiune: 262, afisate in 5 pagini.