19:33
Comentarii Adauga Comentariu

_ AI ajută la furnizarea celei mai complete hărți a interacțiunilor cheie pentru supraviețuirea bacteriilor

_ AI ajută la furnizarea celei mai complete hărți a interacțiunilor cheie pentru supraviețuirea bacteriilor

Cercetătorii UAB au produs cea mai completă hartă a interactomului esențial bacterian, adică modul în care proteinele se combină și interacționează pentru a îndeplini funcții esențiale pentru supraviețuirea lor. Cercetarea, publicată în jurnalul eLife, a folosit instrumentul de inteligență artificială AlphaFold pentru a prezice și modela peste 1.400 de interacțiuni. Rezultatele au dezvăluit detalii necunoscute anterior ale acestor mecanisme și oferă ținte potențiale pentru dezvoltarea de noi antibiotice.

Bacterii îndeplinesc multe funcții care sunt cheie pentru supraviețuirea lor, cum ar fi producerea energiei de care au nevoie, Replicarea ADN-ului și diviziunea celulară pentru a se reproduce, sau sinteza membranei lor celulare pentru a se proteja și a interacționa cu mediul, printre altele. Toate aceste procese implică complexe care necesită acțiunea coordonată a unui set de proteine ​​care sunt esențiale: fără ele, procesele nu au loc și bacteriile mor.

De aceea, cunoscând în detaliu cum sunt aceste procese de bază. reglementate, care proteine ​​sunt implicate și modul în care acestea interacționează este esențială pentru înțelegerea mecanismelor de creștere, reproducere și supraviețuire a bacteriilor.

Tehnicile experimentale întreprinse până acum au permis identificarea a milioane de interacțiuni între proteine ​​și mii de structuri. dintre aceste proteine, dar acestea sunt date brute care dau un număr mare de fals pozitive; interacțiuni care, în realitate, nu au nicio valoare.

Cu modelele de inteligență artificială dezvoltate recent, cum ar fi AlphaFold2, a fost posibil să se obțină structuri de proteine ​​cu o acuratețe similară metodelor experimentale și să se facă diferența între proteinele autentice- interacțiunile proteinelor și interacțiunile false (false pozitive).

Cercetătorii de la Departamentul de Biochimie și Biologie Moleculară de la Universitat Autònoma de Barcelona au folosit modelul de inteligență artificială AlphaFold2 pentru a prezice setul de interacțiuni proteină-proteină care sunt esențiale pentru supraviețuirea bacteriilor, un total de 1.402 de interacțiuni posibile care alcătuiesc cea mai completă hartă a ceea ce se numește interactom esențial bacterian.

Toate aceste interacțiuni ne extind cunoștințele despre mecanismele de acțiune de care au nevoie bacteriile. să supraviețuiască și să ne permită să identificăm care interacțiuni proteină-proteină pot fi ținte pentru dezvoltarea de noi antibiotice.

„Am obținut o hartă a interactomului esențial bacterian în care toate interacțiunile care sunt esențiale pentru bacterii. a trăi și a se înmulți sunt adunate. Am caracterizat structural aceste interacțiuni folosind noi instrumente de inteligență artificială, în special AlphaFold", explică lectorul UAB Marc Torrent, directorul cercetării. „Credem că aceste structuri sunt o referință pentru dezvoltarea de noi antibiotice, deoarece moleculele care pot inhiba aceste interacțiuni. s-ar comporta ca antibioticele cu mecanisme de acțiune neobișnuite.”

Activitatea bacteriană implică între 4.000 și 5.000 de proteine. Acest set se numește proteom bacterian, dând naștere unui interatom care ar putea avea până la 20 de milioane de interacțiuni posibile. Dar se estimează că interacțiunile care au loc la o specie, de exemplu, în bacteria Escherichia coli, sunt limitate la aproximativ 12 000. Și nu toate aceste interacțiuni sunt esențiale pentru supraviețuirea bacteriei.

< Pentru a distinge interacțiunile esențiale, cercetătorii au considerat doar acelea în care cele două proteine ​​care interacționează pentru a forma complexul sunt prezente în cel puțin două specii bacteriene diferite. Cu aceste filtre și cu ajutorul modelului de inteligență artificială AlphaFold2, cercetătorii au obținut un set de 1.402 de interacțiuni proteine-proteine ​​esențiale.

Pentru a testa fiabilitatea AlphaFold2, echipa de cercetare a comparat predicțiile sale cu 140 de interacțiuni proteină-proteină care au fost obținute experimental în prealabil. Rezultatul a fost o putere predictivă pe care autorii o descriu drept excelentă, deoarece 113 dintre aceste interacțiuni experimentale (81%) au fost prezise de AI foarte precis.

Cercetătorii cred că multe dintre complexele de interacțiune proteină-proteină. care pot fi găsite în bazele de date experimentale ar putea fi fals pozitive.

Cercetătorii evidențiază descoperirea, folosind această metodă, a unui set de interacțiuni protein-proteină necunoscute anterior care acționează în nouă procese esențiale: biosinteza acizilor grași în membrana celulară, sinteza lipopolizaharidelor în membrana exterioară, transportul lipidelor, transportul proteinelor și lipoproteinelor în membrana externă, diviziunea celulară, menținerea formei alungite în bacili, replicarea ADN-ului pentru reproducerea bacteriană și sinteza ubichinonei.

O înțelegere detaliată a structurii acestor complexe de proteine ​​recent descoperite oferă noi perspective asupra mecanismelor moleculare implicate în aceste procese bacteriene vitale și deschide calea pentru dezvoltarea de noi antibiotice.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

Ciulacu covrigarul a dus tara pe râpă. Bulgaria umilește România: Inflația a ajuns la 3% în timp ce țara noastră conduce topul exploziei în UE. Sărăcirea românilor e galopantă.

Proiecții privind populația: acestea vor fi cele mai mari șase țări din lume în 2075

Note pentru pătuț pentru „Procesul secolului”

_ Avocatul și activistul iranian-american critică protestatarii pro-Palestini pentru că „twerkează pe TikTok” și sprijină Hamas, Houthis și Hezbollah: „Ați pierdut-o complet și susțineți un regim terorist”

_ Polițiștii acuză „conducătorul” unei bande de lupte ilegale de câini după ce au găsit 120 de câini mulți răniți și doi morți într-o groapă însângerată

_ Zelenski a semnat controversata lege privind mobilizarea: urmează noi recrutări în forță în Ucraiana

_ Video | Un bărbat taie anvelopa unei autospeciale de Poliţie - Sindicatul Europol: Autorii morali, parlamentarii României care au modificat legislaţia

_ CO₂ agravează incendiile, ajutând plantele să crească, arată experimentele model

_ VIDEO În plin război cu Iranul, Israelul a ucis un comandant de top din gruparea Hezbollah: atac fulger cu drone

_ Echipa de cercetare identifică vinovatul din spatele mirosului de ou stricat al vinului din conserve

_ Steaguri Hezbollah flutură la un miting terorist din New York, protestatarii atacă un protestatar care flutură steagul american și ard drapelul american strig�nd �MOARTE AMERICII�

_ PSD: USR n-are dreptul să-i acuze pe alţii în timp ce-şi protejează penalii din partid

_ Incendiile reprezintă o amenințare tot mai mare la nivel mondial pentru interfața sălbatică-urban

_ În imagine: Fetița zâmbitoare, în vârstă de șapte ani, luptă pentru viață după ce a fost lovită de o rachetă iraniană în timpul unui atac uriaș cu drone asupra Israelului

_ Operațiunea de însămânțare a norilor din Emiratele Arabe Unite a inundat Dubaiul?

_ Supreme Defence Council: Black Sea security climate has continued to deteriorate because of Ukraine war

_ Biden călătorește în *orașul său natal* din Scranton, Pennsylvania și nimănui nu-i pasă – Linia de presă este mai lungă decât linia participanților

_ Corona Braşov, victorioasă în primul meci al finalei Campionatului Naţional

_ Livrarea prin nanoparticule a FZD4 către celulele endoteliale pulmonare inhibă progresia cancerului pulmonar și metastazele

_ Fără TVA la sutiene! Radiologii au pregătit o moțiune: 'Sunt o necesitate de bază / Femeile sunt afectate în mod disproporționat'

_ Studiul evidențiază programul de succes din Iowa pentru tinerii care ies din asistența maternală

_ Pionierat în productivitatea și durabilitatea culturilor în fața deficitului de apă

_ Sacrificiu de mamă! Cazul care a emoționat o țară întreagă. O tânără diagnosticată cu cancer și-a dat viața pentru copilul ei

_ Piața neagră a țigaretelor a avut în martie cea mai mare creștere la două luni în ultimii 11 ani

_ Oana Roman și-a ieșit din minți după ce a aflat că președintele Iohannis a ordonat începerea urmăririi penale împotriva tatălui său

_ Ministerul Muncii: Legea care reformează sistemul de asistenţă socială a fost promulgată

_ Cine va c�știga Primăria Capitalei? Problema 'celor trei corpuri' �n București(Analiză)

_ Moment șocant „copilul” fură mașina de poliție și o întoarce pe trotuar după ce un ofițer a sărit afară pentru a urmări un suspect pe jos

_ Liderul senatorilor PNL respinge scenariul Piedone: 'Cîrstoiu crește organic în sondaje'

_ Franţa invită reprezentanţi ruşi la festivităţile dedicate debarcării aliaţilor în Normandia, dar nu şi pe Vladimir Putin

_ Dolarul și randamentele cresc în condițiile în care Fed-ul se teme de Trump al treilea război mondial

_ Scene apocaliptice în EAU, înaintea vizitei lui Marcel Ciolacu - Ploile torențiale fac ravagii iar aeroportul din Dubai a fost închis

_ Sânii albaștri masculi mai bătrâni depășesc masculii tineri când vine vorba de reproducerea extraconjugală

_ Student britanic, în vârstă de 25 de ani, este arestat după ce a făcut contrabandă cu cocaină deghizată în lapte din Columbia

_ Dovezi pentru mișcarea reversibilă a ionilor de oxigen în timpul pulsațiilor electrice: Feroelectricitate emergentă în oxizii binari

_ Nu Sharon? Nici o problemă! Simon Cowell și Amanda Holden au ultimul râs la lansarea Britain's Got Talent după ACEA ceartă de la Osbourne, deoarece el contrazice afirmația ei că renunță la vechii colegi jurând că va lucra cu Cheryl

_ Armata israelieană anunţă că a ucis un comandant al Hezbollah

_ URMĂȚI LIVE: Comisia judiciară a Camerei are o audiere intitulată �Libertate, tiranie și responsabilitate: Covid-19 și Constituție�

_ FL Chirurg General Dr. Ladapo Cheama Fauci ANIMALE POLITIC | Dincolo de Headines

_ Noua carte oferă o viziune din interior despre căutarea cosmică a vieții

_ Studiul sugerează că feedbackul în timp real în dușurile hotelurilor ar putea ajuta industria turismului să reducă utilizarea apei

_ At meeting with US diplomat, DefMin Tilvar underscores need to strengthen NATO eastern frank presence

_ UE începe procesul de extindere a sancţiunilor împotriva Iranului

_ Artificial Intelligence brings enormous benefits, but involves enormous risks and threats

_ Natalia Constantin, locul 21 în proba de spadă, la Mondialele de cadeţi

_ Alegerile prezidenţiale din R. Moldova vor avea loc la 20 octombrie, concomitent cu referendumul pentru aderarea la UE. Cu cine votează moldovenii?

_ Jucătorul de la Academia de la West Ham, 14 ani, cu tumoare pe creier i s-a spus de către medici că „a fost pe spectru”

_ NSA „La doar câteva zile de preluarea internetului” avertizează Ed Snowden

_ 'I-am fixat carcasa cu șuruburi de masă': cum au furat rușii componentele calculatorului românesc CoBra, bijuteria tehnologică a României din Epoca de Aur

_ Lege adoptată în Parlament: șoferii care vor trebui să facă ITP-ul la 6 luni. Unii șoferi scapă de tot de ITP

_ Argentina se pregăteşte pentru vremuri tulburi: a cumpărat avioane de luptă

_ Războiul din Ucraina, ziua 783. Zelenski: Aliaţii pot apăra Ucraina în acelaşi mod în care au protejat Israelul / Risc de accident nuclear la centrala nucleară Zaporojie

_ Iran, 'amenințare nucleară' la adresa Israelului: 'Nu vor mai avea la dispoziție 12 zile / Suntem pregătiţi să folosim arme neutilizate până acum'

_ Judecătorul îl avertizează pe Trump cu privire la intimidarea juraților într-un proces pe bani liniștiți

_ Bărcile de spectatori la evenimente mari de navigație ar putea avea un impact asupra vieții sălbatice marine cu poluare fonică

_ Oamenii de știință dezvoltă un cadru pentru măsurarea emisiilor de plastic și susține eforturile ONU de reducere a poluării

_ Un atlet român a terminat pe locul 20 Maratonul de la Boston

_ Barcelona 1-4 PSG (total 4-6) - Sferturile de finală ale Ligii Campionilor: scor live, știri ale echipelor și actualizări, în timp ce Kylian Mbappe încheie o victorie uimitoare în revenire pentru campionii Franței

_ Adolescentul care a ucis un pensionar și a încercat să prefacă o boală mintală pentru a scăpa de ea este închis pe viață

_ Sydney Sweeney „nu este drăguță și nu poate juca”, declară producătorul de top de la Hollywood Carol Baum, numindu-și filmul Anyone But You „nevizionabil”


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26 Pag.27 Pag.28 Pag.29 Pag.30 Pag.31
Pag.32 Pag.33 Pag.34 Pag.35 Pag.36 Pag.37

Nr. de articole la aceasta sectiune: 2173, afisate in 37 pagini.



ieri 17:57