19:47
Comentarii Adauga Comentariu

_ Un cadru de învățare automată pentru a prezice și cuantifica dificultățile de sinteză pentru cromozomii de proiectare

_ Un cadru de învățare automată pentru a prezice și cuantificarea dificultăților de sinteză pentru cromozomii de proiectare

Sintetizarea artificială a genomilor are perspective largi în domenii precum cercetarea medicală și dezvoltarea tulpinilor industriale. De la sinteza vieții artificiale JCVI-syn1.0 de către echipa lui Craig Venter în 2010, până la rescrierea și sinteza genomului procariot de E. coli și până la sinteza artificială a genomului drojdiei din proiectul Sc2.0, cercetătorii avansează constant. în profunzimea și lățimea proiectării și sintezei genomului.

Cu toate acestea, există încă dificultăți în sintetizarea anumitor segmente de gene, ducând în cele din urmă la incapacitatea de a completa cromozomi artificiali, ceea ce limitează aplicarea și promovarea tehnologiei de sinteză a genomului artificial. Pentru a aborda această problemă, echipa profesorului Yingjin Yuan de la Universitatea Tianjin a dezvoltat un cadru interpretabil de învățare automată care poate prezice și cuantifica dificultatea sintezei cromozomilor, oferind îndrumări pentru optimizarea proceselor de proiectare și sinteză a cromozomilor.

The Echipa de cercetare a proiectat o metodă eficientă de selecție a caracteristicilor analizând datele unui număr mare de fragmente de cromozomi cunoscute și a identificat șase caracteristici cheie ale secvenței care acoperă energia și informațiile structurale în timpul sintezei și asamblării chimice a ADN-ului. Pe baza acestor rezultate, echipa a dezvoltat un model eXtreme Gradient Boosting (XGBoost) care poate prezice eficient dificultățile de sinteză ale fragmentelor de cromozomi.

Modelul a atins o AUC (aria sub curbele caracteristice de funcționare a receptorului) de 0,895. în validare încrucișată și un AUC de 0,885 pe un set de teste independent în colaborare cu o companie de sinteză ADN, care demonstrează o acuratețe ridicată și o capacitate de predicție.

Echipa de cercetare a propus un Indice de dificultate a sintezei (S-index) bazat pe algoritmul SHAP pentru evaluarea și interpretarea dificultăților de sinteză ale cromozomilor. Studiul a constatat că au existat diferențe semnificative în dificultățile de sinteză ale diferiților cromozomi, iar indicele S ar putea explica cantitativ cauzele dificultăților de sinteză pentru unele fragmente de gene, oferind o bază pentru proiectarea și sinteza secvenței cromozomilor și îmbunătățind eficiența și rata de succes. de sinteză cromozomală de proiectant.

Această realizare oferă un instrument practic pentru cercetătorii în inginerie cromozomală și rescrierea genomului și se așteaptă să ofere îndrumări și sprijin mai cuprinzătoare pentru proiectarea și sinteza cromozomilor.

Lucrarea este publicată în revista Science China Life Sciences.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

Porcăriile progresiste Continuă. Destrăbălare în direct pe canalele TV englezești. Am ajutat la crearea primei scene de sex de 15 persoane de la TV la Open House de la Channel 4 - nu m-a deranjat deloc

Războiul vine la ușa lui Putin: Regiunea bogată a Moscovei este lovită de drone kamikaze

Vă amintiți cum vă explicau trădătorii de neam și țară cât de bine e să ai datorii? Statul plăteşte în 2023 dobânzi la credite de aproape 8 miliarde de euro

Oamenii care iau nedicamentul pentru slăbit Ozempic spun că își fac nevoile în pat din cauza simptomelor dure ale medicamentului care afectează până la 30% dintre consumatori

_ Banii păstrați în Venmo, PayPal și CashApp pot fi nesiguri, avertizează agenția guvernamentală

_ Ike Turner și Tina Turner: În interiorul căsniciei abuzive

_ Emmerdale: Adevăratele identități ale lui Caleb și Nicky sunt în sfârșit dezvăluite într-o întorsătură șoc

_ Tatăl a doi copii britanic retrăiește încercarea de a fi spitalizat cu „intoxicație alimentară” la hotelul Tui

_ Ivanka Trump este văzută discutând cu Prințul William la nunta regală din Iordania

_ Heidi Klum primește o palmă obraznică pe fund de la soțul cochet Tom Kaulitz

_ Reforma teritorial-administrativă a României. Un deputat a depus în Parlament un proiect de lege care stabileşte 12 judeţe

_ Se anunță haos în București: protestarii din Educație mărșăluiesc și se duc la ușa lui Iohannis

_ Pe viitor, după ce Senatul a adoptat acordul pentru datorii, China plănuiește un nou pachet de stimulare

_ Mamei din Sydney mușcate de păianjen cu coadă albă i-a fost amputat piciorul la Spitalul Nepean

_ Cum să pariezi pe Epsom Derby-ul din acest an

_ Minoritatea evazivă: genul non-binar în Europa preistorică

_ Arhiepiscopul de Canterbury, Justin Welby, promite că va continua să lupte împotriva reformelor guvernului în materie de imigrație

_ Celebra coamă a Tinei Turner a fost MAI MULT decât o coafură: starul târzii a văzut perucile ca „o extensie a ei însăși”

_ Gold, silver, bronze medals grabbed by Romanian students at Int'l Asian Physics Olympiad

_ Preot, despre importanţa relaţiilor în căsnicie: A fi credincios nu înseamnă să refuzi problema trupească, plăcerile trupeşti, impulsurile trupeşti

_ Noul guvernator al autonomiei găgăuze l-a vizitat pe Șor în Israel

_ Președintele LaLiga, Javier Tebas, își cere scuze starului Real Madrid, Vinicius Jr

_ Sărbătorile zilei de 30 mai - Sfântul Isaachie Mărturisitorul

_ Atac al activiştilor într-un studio TV: au fost puşi la pământ în direct de camera manevrată din regie

_ Lungmetrajul Arsenie Viaţa de apoi, de Alexandru Solomon, în competiţia Proxima de la Karlovy Vary IFF

_ Second linear particle accelerator commissioned in Galati, in presence of HealthMin Rafila

_ Iconicul Flying Scotsman ar putea fi forțat să părăsească liniile feroviare principale pentru prima dată în 100 de ani

_ Un bărbat din Australia a supravieţuit după ce capul i-a fost prins în fălcile unui crocodil

_ Ant McPartlin pleacă de la BGT cu obrazul roșu imens umflat după ce a alunecat haotic peste live pe scenă

_ Cum vă va afecta raidul fiscal de 2 miliarde de lire sterline al Guvernului

_ Ucraina pariază tot mai mult pe drone în confruntarea cu Rusia: Parlamentul de la Kiev acordă facilităţi fiscale producătorilor

_ Jorge Mendes se deschide despre despărțirea sa de Cristiano Ronaldo după ieșirea amară de la Man United

_ Remus Pricopie, face un apel către sindicatele din educație și liderii politici: Reveniți la masa dialogului și încheiați azi un acord!

_ Marele Canal al Veneției devine verde strălucitor din cauza fluoresceinei

_ Studiu: Un simplu „Mulţumesc” îmbunătăţeşte starea de spirit la locul de muncă

_ Familia preda în cartea bibliotecii un secol a depășit data scadenței la biblioteca din California

_ Din mintea copiilor, un proiect realizat în întregime de copii, va putea fi vizionat în Bucureşti, Cluj, Iaşi şi Timişoara

_ Karpatia Pony Show 2023 - Cinci zile de competiţii ecvestre, jocuri şi distracţie pentru întreaga familie pe Domeniul Cantacuzino din Floreşti

_ După ANAF pleacă un alt şef. Ciucă: L-am demis, azi, pe şeful Autorităţii Naţionale a Vămilor

_ VDH: A fost întotdeauna doar despre puterea cu stânga

_ Fără râs: John Cleese ține cont împotriva apelurilor de a anula scena din „Life Of Brian”

_ Philadelphia Crime Valul de efracții, furturi și furturi de mașini se revarsă în suburbiile din apropiere

_ Consilierii generali PSD vor depune o plângere penală: 'Pe ordinea de zi se află un proiect furat'

_ Amintiți-vă de cei căzuți... și de cei pe care i-au lăsat în urmă

_ Peste 50.000 de magazine din SUA se vor închide până în 2027, potrivit UBS

_ Ruth Langsford este „încă în legătură” cu fostul iubit al lui Phillip Schofield

_ Doi foști ogari de curse foarte blânzi găsiți aruncați pe autostrada Hume, NSW

_ Reducere de 500 de dolari la factura de energie pentru o jumătate de milion de australiani cu reducere acordată de guvernul albanez

_ Femeie înjunghiată până la moarte în Endeavour Hills, Melbourne, cu un bărbat în custodia poliției

_ Starurile australian de cricket Lyon, Carey se unesc cu Ferguson de la Manchester United, ten Hag, Beckham

_ David Koch demisia: gazda de la Sunrise devine necinstită în direct după anunțul său șoc de părăsire

_ Copilul Tennant Creek a fost transportat de urgență la spital după ce a fost agresat de un bărbat

_ Franța va deschide prima fabrică de baterii de mașini electrice în procesul de „reindustrializare”.

_ Țara Galilor vs Iran Cupa Mondială 2022 - Știri echipe, ora de start, canal TV, stream, head-to-head

_ Gazda BBC Radio care susține că a fost agresată de Rolf Harris la 16 ani își rupe tăcerea după moartea lui

_ Papa le va permite femeilor să voteze la reuniunea mondială a episcopilor

_ USR şi Forţa Dreptei au contestat Legile Educaţiei la Curtea Constituţională

_ Sportivul trans care a „dobit” recordul feminin Parkrun a fost căsătorit până acum patru ani

_ Înfruntarea lui Tyson Fury la categoria grea cu Dillian Whyte va merge la licitații pe 11 ianuarie

_ Însărcinată, Jessie J rămâne șocată, fiind surprinsă de prieteni după ce a plecat înapoi în Marea Britanie


Pag.1 Pag.2

Nr. de articole la aceasta sectiune: 91, afisate in 2 pagini.