18:09 2023-02-06
science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu
_ Genomul cheie al tilapiei oferă un impuls pentru securitatea alimentară globală
_ Tilapia cheie genomul oferă un impuls pentru securitatea alimentară globală
Primul genom de referință complet, de înaltă calitate, pentru o tulpină de tilapia îmbunătățită genetic, a fost publicat, oferind potențialul de a îmbunătăți securitatea alimentară pentru miliarde dintre cei mai săraci oameni din lume.
O colaborare între Institutul Earlham, Institutul Roslin și WorldFish a produs această resursă fundamentală pentru crescătorii de pești care doresc să dezvolte tulpini care să crească mai mari, să crească rapid și să aibă rezistență îmbunătățită la provocările de mediu ale unei planete care se încălzește.
În mod important, ea dezvăluie variații genetice substanțiale și unice la tulpinile de tilapia cultivate, subliniind necesitatea de a folosi această resursă specifică tulpinii pentru a informa viitoarele programe de reproducere.
Apetitul nostru pentru alimente acvatice a făcut ca multe populații de pești sălbatici din întreaga lume să fie amenințate din cauza pescuitului excesiv. Pentru miliarde de oameni, totuși, proteinele din pește și crustacee nu reprezintă un simplu lux - este o sursă esențială de proteine și alți nutrienți.
Pentru a satisface cererea, acvacultura - creșterea peștelui și crustaceelor în zonele de coastă. și apele interioare — a proliferat rapid în ultimii 25 de ani.
Tilapia de Nil, Oreochromis niloticus, este a treia specie de pește ca mărime de crescătorie din lume. Succesul său se datorează în mare măsură eforturilor continue de a reproduce tulpini care pot crește și crește rapid în greutate.
Programul de tilapia de fermă îmbunătățită genetic (GIFT), condus de instituția de cercetare WorldFish (CGIAR), a dat naștere la una dintre tulpinile de elită găsite astăzi și distribuite în întreaga lume. Dar toate acestea au fost realizate prin reproducere selectivă fără un genom de referință complet.
Dr. Wilfried Haerty, autorul studiului și lider de grup la Institutul Earlham, a declarat: „Un genom de referință oferă un catalog complet, adnotat, al tuturor genelor dintr-un organism. Această resursă crucială stă la baza programelor moderne de reproducere.
„WorldFish, care conduce la dezvoltarea ulterioară a GIFT, poate folosi acum genomul de referință ca bază de lucru atunci când caută să reproducă trăsături benefice.”
Pentru a accelera dezvoltarea tulpinilor GIFT îmbunătățite prin genomic. de selecție, cercetătorii de la Institutul Earlham și Institutul Roslin au făcut echipă pentru a genera un genom de referință aproape complet și de înaltă calitate.
WorldFish a furnizat țesuturi cercetătorilor de la Institutul Earlham, care au folosit o combinație de citire scurtă și lungă. tehnici de secvențiere pentru a crea un ansamblu de genom la nivel de cromozom pentru GIFT. Acest lucru a fost susținut de o hartă de legătură dezvoltată la Institutul Roslin, bazată pe munca de la WorldFish pentru a dezvolta un cip SNP.
Genomul a fost apoi adnotat, folosind o abordare de ultimă oră ch dezvoltat de Swabreck Group la Institutul Earlham.
Dr. John Benzie, director interimar WorldFish al Aquatic Foods Biosciences, a declarat: „Această colaborare a pus o bază solidă pentru ca noi să producem noi tulpini de GIFT care sunt mai rezistente la schimbările climatice – reducând riscurile de producție pentru crescătorii de pește și crescând randamentul pentru hrana hrănitoare. proteine animale la o populație globală în creștere.”
Tulpina GIFT a fost dezvoltată inițial dintr-un amestec de tulpini comerciale și sălbatice de tilapia Nile, precum și încrucișări cu alte specii. Folosind genomurile unor specii strâns înrudite, inclusiv Oreochromis mossambicus și Oreochromis aureus, au reușit să dezvăluie măsura în care materialul genetic ar fi putut fi trecut între specii în trecut și să identifice regiunile specifice din genomul GIFT.
Ei au găsit peste 11 milioane de baze de material genomic O. mossambicus în genomul GIFT, inclusiv gene asociate cu imunitatea și rata de creștere. Descoperirea va ajuta la ghidarea viitoarelor programe de reproducere și la îmbunătățirea înțelegerii genelor asociate cu trăsăturile benefice la speciile de pești de crescătorie.
„Am generat un ansamblu la nivel de cromozom al tulpinii GIFT”, explică dr. Haerty, „care caracterizează originile sale mixte și contribuțiile potențiale ale regiunilor introgresate la trăsăturile selectate. Acest lucru oferă crescătorilor informațiile de care au nevoie. pentru a dezvolta noi programe cu încredere.
„Din cauza istoriei de reproducere a tulpinilor de elită, ne dăm seama acum că genomurile de referință disponibile în prezent ar putea să nu fie potrivite pentru a sprijini studii ulterioare asupra tulpinilor de elită.”
< Dr. Diego Robledo, autorul studiului la Institutul Roslin, a spus: „Perspectivele oferite de dezvoltarea întregului genom al acestei specii cheie de pește vor permite cercetarea în vederea asigurării unor provizii produse în mod durabil, pentru a sprijini o sursă sănătoasă de nutriție pentru populațiile în creștere. .”Lucrarea, „Secvența genomului la nivel de cromozom a Tilapiei de fermă îmbunătățite genetic (GIFT, Oreochromis niloticus) evidențiază regiunile de introgresie cu O. mossambicus”, este publicată în revista BMC Genomics.
p>
Comentarii:
Adauga Comentariu