16:01
Comentarii Adauga Comentariu

_ De ce mutațiile sinonime nu sunt întotdeauna tăcute

_ De ce mutațiile sinonime nu sunt întotdeauna silențios

Noua modelare arată cum mutațiile sinonime - cele care modifică secvența ADN-ului unei gene, dar nu și secvența proteinei codificate - pot încă influența producția și funcționarea proteinei. O echipă de cercetători condusă de chimiștii Penn State a modelat modul în care modificările genetice care modifică viteza sintezei proteinelor, dar nu și secvența de aminoacizi care cuprind proteina, pot duce la plierea greșită care modifică nivelul de activitate al proteinei și apoi și-au coroborat modelele experimental. . Rezultatele demonstrează importanța cineticii – rata sintezei proteinelor – în plus față de secvența pentru determinarea structurii și funcției proteinelor și ar putea avea implicații în domenii precum biofarmaceutica pentru reglarea fină a activității proteinelor sintetizate.

Proteine. sunt compuse din șiruri lungi de aminoacizi care apoi se pliază în structuri funcționale tridimensionale. Fiecare aminoacid este codificat de un triplet de litere din alfabetul ADN-ului A, T, C și G numit codon, dar există o redundanță încorporată în sistem, astfel încât mai mult de un codon poate corespunde aceluiași aminoacid. Prin urmare, o mutație care modifică secvența ADN a unei gene nu va schimba neapărat secvența proteinei codificate dacă mutația are ca rezultat un „codon sinonim”. Pentru a face o proteină, ADN-ul din nucleul unei celule este mai întâi transcris într-un ARN mesager (ARNm). ARNm este apoi transportat din nucleu, unde este tradus într-o proteină în curs de dezvoltare de către un organel celular numit ribozom. După traducere, proteina este pliată în forma sa funcțională finală.

„Obișnuiam să folosim „sinonim” și „silențios” în mod interschimbabil pentru a descrie mutațiile care nu modifică secvența unei proteine, deoarece se credea că nu ar „Nu modifică funcția proteinei”, a spus Ed O'Brien, profesor de chimie și membru al Institutului pentru Științe Computaționale și Date de la Penn State și unul dintre liderii echipei de cercetare. „Dar, știm de ceva vreme că nu toate mutațiile sinonime sunt tăcute. Cu peste două decenii în urmă, s-a demonstrat că mutațiile sinonime ar putea reduce activitatea proteinelor, dar încă nu se știa ce se întâmplă la nivel molecular provoacă această schimbare.”

Echipa de cercetare a folosit o abordare de modelare pe mai multe scari, folosind teoria și calculul pentru a simula ceea ce se întâmplă la nivel molecular în timpul sintezei proteinelor, pentru a prezice schimbările în structura proteinelor care ar putea rezulta din mutații sinonime și, prin urmare, modifică activitatea proteinei. O lucrare care descrie cercetarea apare pe 5 decembrie 2022 în revista Nature Chemistry.

„Din diverse motive, unii codoni sunt traduși la viteze diferite de către ribozom”, a spus Yang Jiang, profesor asistent de cercetare la chimie la Penn State și primul autor al lucrării. „Pentru trei enzime diferite – proteine ​​specializate care catalizează reacțiile biochimice – am simulat o versiune a ARNm compusă din codoni cu traducere rapidă și o versiune compusă din codoni cu traducere lentă și apoi am modelat producția proteinei în curs de dezvoltare, modul în care este pliată post-translațional. , și activitatea acesteia.”

Predicțiile echipei pentru modificările activității proteinelor s-au potrivit cu rezultatele experimentale care au fost măsurate anterior pentru una dintre enzime. Au fost apoi efectuate experimente pentru celelalte două enzime care se potriveau, de asemenea, cu modificările de activitate prezise de modelarea lor. Ei au examinat apoi structurile de proteine ​​​​prevăzute și căile de pliere din modelele lor pentru a încerca să identifice modificări la nivel molecular care ar fi putut duce la modificări ale activității.

„În modelele noastre am găsit o nouă clasă de pliere greșită a proteinelor pe care o numim „încurcăre lazo non-covalentă”, a spus Jiang. „În esență, o parte a proteinei formează o buclă închisă, iar un capăt al proteinei trece incorect prin buclă și rămâne prinsă pentru perioade lungi de timp.”

Cercetătorii sugerează două motive potențiale pentru care această formă de pliere greșită. poate reduce activitatea proteinei. În primul rând, plierea greșită are loc în apropierea locului activ al enzimelor, ceea ce îi poate perturba activitatea. În al doilea rând, în timp ce celulele au mecanisme numite însoțitori care pot replia sau elimina proteinele pliate greșit, aceste structuri particulare pliate greșit pot fi suficient de subtile pentru a nu fi recunoscute de sistemul de însoțitori și pot persista în celulă, deoarece modificările observate ar necesita o mare parte de proteine. să fie desfășurate pentru a le corecta.

„Deci, întrebarea este „Cum se întâmplă asta?” și putem folosi modelele noastre pentru a urmări calea de pliere a proteinei pentru a aborda acest lucru”, a spus O'Brien. „Vedem puncte de inflexiune în timpul plierii, unde proteina poate fie să călătorească pe o cale care duce la o proteină pliată corect, fie poate lua o cale care duce la încurcarea lassoului. Numim aceasta „partițiune cinetică”. Cât de repede sau lent este tradusă proteina - cinetica procesului - pare să influențeze calea pe care o va lua proteina.”

Aceste noi perspective asupra modului în care cinetica sintezei proteinelor poate influența proteinele. structura și funcția ar putea avea repercusiuni în domenii variind de la biochimie la biotehnologie și la medicină.

„Paradigma predominantă în domeniul plierii proteinelor a fost aceea că secvența determină structura”, a spus O'Brien. „Rezultatele noastre oferă o explicație și o ilustrare a modului în care cinetica poate controla, de asemenea, structura și funcția proteinelor. Acest lucru are implicații pentru orice domeniu care implică sinteza proteinelor. Plierea greșită a proteinelor contribuie, de asemenea, la unele boli umane, așa că munca noastră indică o clasă complet nouă de ținte de medicamente. există pentru dezvoltarea viitoarelor medicamente.”

Pe lângă O'Brien și Jiang, echipa include Syam Sundar Neti, Ian Sitarik, Priya Pradhan și Squire J. Booker de la Penn State; și Philip To, Yingzi Xia și Stephen D. Fried de la Universitatea Johns Hopkins.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Zeci de școli și universități din SUA se mută pentru a interzice TikTok

Fostul ministru al Apărării din Regatul Unit spune că NATO ar putea avea nevoie să trimită forțe terestre în Ucraina

_ Oamenii de știință găsesc noi indicatori ai dezghețului permafrostului din Alaska

Infractorii trans care au violat femei sunt femei, spune liderul scoțian

_ Sondajul arată că mai mulți americani cred că ajutorul „prea mult” este destinat Ucraina

_ Georgia Toffolo prezintă un ecran care întoarce capul în timp ce își arată sutienul sub costumul de catifea roșie

_ AMD Radeon 780M integrat cu 25% mai rapid decât predecesorul RDNA 2

_ Sfârșitul hedonismului monetar

_ Cele mai bune coolere AIO 2023

_ Linia Galaxy Book 3 de la Samsung primește ecrane OLED de 120 Hz

_ Cele mai bune PC-uri pentru jocuri din 2023

_ Luați unul dintre cele mai bune monitoare de jocuri 4K pentru doar 499 USD: Oferte reale

_Gold FM Romania - 01 Feb 2023 14:50:59

_ Intel va reduce prețul procesorului Alder Lake cu 20%: Raport

_ Cold snap chic (schiuri opționale)

_ „Disneyland s-a terminat” pentru investitorii „Mickey Mouse”: Fed are încă „Mama tuturor bombelor” să renunțe

_ Cele mai rele patru moduri de a ataca Bitcoin

_ Va efectua ATF „Verificări de conformitate” cu un registru extins?

_ Cele mai bune și cele mai proaste state pentru stagiile de vară pentru generația Z

_ Live: Înalt diplomat Josep Borrell anunță planul UE de a antrena 30.000 de soldați ucraineni

_ Filipine acordă SUA mai mult acces la bazele militare pe fondul tensiunilor din China

_ Jocuri dure în Coaliție pe Reforma Electorală. Contre dure în culise între PSD și PNL

_ Governor Gabriel Marinov on World Wetlands Day: Delta is a very different tourist destination

_ Two Romanian patients transported by military aircraft, one from Germany, the other to Italy

_ Orice acțiune militară împotriva Iranului considerată declarație de război: Misiunea ONU

_ Boeing a primit un mega-contract pentru gestionarea rachetelor cu focos nuclear Minuteman

_ CNAB: 253 flights delayed, 20 cancelled at Henri Coanda Airport last week

_Gold FM Romania - 01 Feb 2023 13:23:03

_ Tom Brady se retrage din fotbal �Pentru totdeauna� de data aceasta (VIDEO)

_ Trezoreria menține vânzările trimestriale de datorii neschimbate pe fondul eșecului limită a datoriilor, încă ia în considerare programul de răscumpărare

_ Doar inventează-te: locurile de muncă deschise cresc în mod neașteptat, deoarece Departamentul Muncii ghicește acum care este numărul

_ Urmăriți: Steaua de tenis din Belarus îi atacă pe reporterii sportivi pentru „tragerea jucătorilor în” discuții despre conflictul din Ucraina

_ Două companii de asigurări nu mai oferă acoperire pentru modelele de mașini Hyundai și Kia

_ De ce există un mandat de vaccinare COVID pentru studenți?

_ Prețurile pentru hamburger ar putea continua să crească pe măsură ce efectivul de bovine din SUA se micșorează

_ Profitul operațional SK Hynix 2022 scade cu 44% pe fondul scăderii cipurilor

_ Guvernatorul Floridei DeSantis declară război financiar universităților „trezite” din stat

_ Capsula radioactivă lipsă din Australia de Vest a fost găsită

_ Cele mai bune SSD-uri 2023: de la SATA economic la NVMe ultrarapid

Vicarul Bisericii Angliei găsit vinovat de „activitate antisemită” după ce a împărtășit un articol despre Israel din 11 septembrie

_ Un studiu masiv pe măști, evaluat de colegi, arată că „nici o diferență mică” în prevenirea infecției cu COVID, gripă

_ Testarea DirectStorage arată că SSD-urile PCIe 3 sunt practic la fel de rapide ca PCIe 5

_ Ucraina lovită de un fenomen îngrijorător - Exploatarea sexuală în Europa a ucrainencelor. OSCE trage semnalul de alarmă

_ Presupusa amantă a lui Orban dezvăluie cine a făcut fotografia de la Guvern, care a făcut ravagii în timpul pandemiei

_ Austriacul Matthias Mayer nu exclude o revenire în viitor

_ Moïse assassination: US indicts key suspects, 'a sign of the failure of the Haitian justice system'

_ Selecţionata Fiji a rămas fără selecţioner cu şapte luni înaintea Cupei Mondiale 2023

_ Întârzieri mai mari de o oră pentru peste 250 de zboruri, pe Aeroportul „Henri Coandă“

_ Cisternă GNL eșuează în canalul Suez

_ FBI caută documente clasificate în casa de lux de pe plajă a președintelui Biden

_ WTI extinde pierderile după construirea de stocuri la nivel global

_ Noua taxă pe avere ar putea fi cea mai proastă idee din California de până acum

_ ADP spune că în ianuarie, creșterea locurilor de muncă este cea mai lentă din ultimii 2 ani, dă vina pe vreme

_ „Obiectivitatea trebuie să meargă”: Liderii de știri cheamă la sfârșitul jurnalismului obiectiv

_ Inițiativa ONU vizează și îi doxxă pe medici și asistente care nu urmează narațiunea despre COVID-19

_ India se pregătește să crească puterea de cărbune pentru a satisface cererea în creștere

_ „Cele mai proaste plăți de la criza financiară”: bancherii de investiții din Asia văd reduceri de salariu cu până la 70%

_ AMD anunță prețul Ryzen 7000X3D: 449 USD până la 699 USD începând cu 28 februarie

_ LIVE TEXT Războiul din Ucraina, ziua 344. 3 morţi după atacul asupra unui bloc din Kramatorsk /Ursula von der Leyen a ajuns la Kiev / Consiliul de Securitate ONU se reuneşte pe 24 februarie / Lavrov apasă pedala: escaladarea conflictului este evidentă

_ Simulările numerice ale formării planetezimale reproduc proprietățile cheie ale asteroizilor, cometelor


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26 Pag.27

Nr. de articole la aceasta sectiune: 1576, afisate in 27 pagini.



ieri 11:43 _ ANDROID...