19:32
Comentarii Adauga Comentariu

_ Oamenii de știință cartografiază ARN-ul solului la genomurile fungice pentru a înțelege ecosistemele forestiere

_ Oamenii de știință cartografiază ARN-ul solului la genomul ciupercilor pentru a înțelege ecosistemele forestiere

Dacă un copac cade în pădure – indiferent dacă cineva înregistrează sau nu sunetul – un lucru este sigur: există o mulțime de ciuperci în jur. În solul unei păduri, sute de specii descompun resturile, mobilizează nutrienții din acea degradare și furnizează acești nutrienți rădăcinilor copacilor și solului. Aceste ciuperci ajută la modelarea ecologiei unei păduri. Ele stochează carbonul și ciclează nutrienții cheie, cum ar fi azotul și fosforul.

În acest fel, ciupercile din solurile pădurii dețin cheia sănătății copacilor și stocării carbonului - abilități care contează din ce în ce mai mult pe măsură ce clima se încălzește. Cu toate acestea, acestea sunt interacțiuni complicate de descurcat. Ciupercile lucrează în cooperare pentru a susține o pădure, iar speciile variază de-a lungul ecosistemelor Pământului.

Recent, în lucrările publicate în New Phytologist, cercetătorii au descoperit o nouă înțelegere a ciupercilor care îndeplinesc anumite funcții la nivelul pădurii. Pentru prima dată, au comparat trei bresle de ciuperci diferite într-o serie de locații diferite. Ei au prelevat probe de sol din patru ecosisteme forestiere, au extras ARN pentru a înțelege expresia genelor și au dezvoltat noi instrumente pentru a mapa acel ARN din sol la genomi fungici.

Institutul comun al genomului (JGI) al Departamentului Energiei din SUA (DOE), un birou al DOE pentru știință, situat la Laboratorul Național Lawrence Berkeley (Berkeley Lab) a secvențiat 1 trilion de baze - o terabază - de ARN din sol pentru acest proiect și a produs genomii de referință care au permis cartografierea acestor citiri de ARN. „În prezent, acesta este cel mai mare metatranscriptom fungic secvențial JGI de până acum”, a spus Igor Grigoriev, șeful programului de genomică fungică la JGI.

Împreună cu o înțelegere îmbunătățită a sistemelor forestiere multiple, această lucrare stabilește protocoale și conducte pe care alte echipe le pot folosi din întreaga lume.

Aceste instrumente oferă cercetătorilor o modalitate de a accesa mult mai multe informații despre ciupercile din aceste medii. „Acum, cu aceste noi instrumente – metatranscriptomica, secvențierea ARN a ARN-ului din sol – putem accesa – „Ce fac ei? Cum interacționează?”, a spus autorul principal Francis Martin, director de cercetare emerit la Institutul Național de Cercetare pentru Agricultură, Alimentație și Mediu (INRAE).

Pentru acest studiu, cercetătorii au colectat mostre de sol din patru situri. : Aspurz, Spania; Lamborn, Suedia, Canada. Aceste situri reprezintă, respectiv, pădurile mediteraneene, temperate și boreale pădurile împărtășesc doar aproximativ 20% din speciile lor de ciuperci Pentru a face comparații utile, cercetătorii au trebuit să lucreze în afara taxonomiei. inginer cercetător la INRAE ​​și unul dintre primii autori ai acestei lucrări.

Pentru a compara aceste bresle trofice, această echipă s-a concentrat pe trei grupuri principale de ciuperci care au apărut în toate pădurile pe care le-au eșantionat. Aceste bresle sunt comune pădurilor din întreaga lume, precum și pajiști și pășuni: saprotrofe dezasambla resturile și organismele moarte pentru a-și elibera nutrienții; simbiontii micorizali transporta apa si nutrientii catre copaci; agenții patogeni ai plantelor colonizează plantele vii pentru a se hrăni cu ele.

Din toate tipurile de pădure, Martin și echipa sa au pieptănat mostre de sol pentru a vedea ce gene au folosit aceste trei bresle de ciuperci pentru a crește și a metaboliza nutrienții. Ei au secvențiat tot ARN-ul găsit în probele de sol și au asamblat acele transcripte de ARN într-un metatranscriptom.

În general, au descoperit că, în ciuda diversității mari de specii, fiecare breaslă a îndeplinit funcții remarcabil de similare în diferite păduri. Metabolismul primar, activitatea celulară și dezvoltarea ciupercilor arătau destul de asemănătoare pentru fiecare breaslă de saprotrofi, simbioți micorizali și agenți patogeni, indiferent dacă o probă provenea din solul de sub un pin sau un stejar, în Suedia sau Quebec.

Din punct de vedere ecologic, Martin sugerează că această redundanță este protectoare, un pic ca diversificarea unui portofoliu de investiții. Dacă un stres precum incendiul sau seceta amenință unele specii de ciuperci, alte ciuperci vor completa funcționalitățile necesare.

Această lucrare arată, de asemenea, o nouă suprapunere între funcțiile diferitelor bresle de ciuperci. Saprotrofii și simbioții micorizali au fost împărțiți istoric în nișe ecologice separate - reciclatori și respectiv transportatori. Cu toate acestea, echipa lui Martin a descoperit că ambele bresle exprimă gene similare pentru degradarea pereților celulelor fungice, așa-numita necromasă fungică, sugerând că aceste bresle împărtășesc responsabilitatea reciclării materialului fungic mort.

Acest proiect provine dintr-o știință comunitară. Propunerea de program pe care Martin a înaintat-o ​​în 2012. La acel moment, domeniul cercetase multe comunități diferite de sol pentru diversitatea taxonomică. Aceste studii ar putea identifica populațiile, dar au spus puțin despre speciile care făceau ce.

Pentru a înțelege modul în care comunitățile fungice și-au împărțit sarcinile, Martin și echipa sa au optat pentru a profila ARN, pentru o vedere a expresiei genelor fungice. Ei ar avea nevoie de genomi fungici existenți pentru a mapa expresia genelor la funcții și specii de ciuperci. Inițial, cartografierea secvențelor de ARN în acest fel a fost o provocare, potrivit lui Martin. „În urmă cu 12 ani, când am cartografiat primul ARN secvențial din sol, doar 10% dintre aceștia se mapau la genomurile fungice de la JGI”, a spus Martin.

Un efort numit proiectul 1000 de genomi fungici. a schimbat asta. Acesta este un proiect de mai mulți ani, în colaborare cu JGI, pentru a secvența 1.000 de genomi de referință din întregul arbore al vieții fungice. Martin este unul dintre liderii proiectului. După ce a început cu aproximativ 200 de genomi fungici, în doar câțiva ani, a spus el, proiectul 1000 de genomi fungici, împreună cu alte proiecte CSP, a secvențiat peste 2.000 de genomi fungici.

JGI a secvențiat, asamblat și adnotat. aceste genomi în colaborare cu zeci de parteneri. „Acesta a fost un efort extraordinar al comunității, cu peste 100 de cercetători care au nominalizat specii pentru secvențiere și apoi au trimis mostre de ADN și ARN la JGI”, a spus Grigoriev. Toți acești genomi sunt disponibile la MycoCosm.

Dacă inițial, sarcina de a mapa ARN-ul fungic în secvențe a fost un drum accidentat și întortocheat, acest nou aflux de genomi a deschis o autostradă pe aceeași rută. „A fost cu adevărat uimitor cum s-a îmbunătățit calitatea datelor datorită acelei cantități masive de noi genomi”, a spus Martin.

Proiectul 1000 de genomi fungici se îndreaptă mai departe, pentru a permite mai multe studii ca acesta. Martin spune că și mai multe genome se vor traduce într-o înțelegere și mai mare, pe măsură ce alți cercetători analizează ARN-ul din comunitățile de sol din toată America de Sud, China, Europa și Statele Unite.

„În următorii câțiva ani, cred că vom va avea un fel de hartă globală a diversității fungice, dar încă ne lipsesc funcțiile”, a spus Martin. „Așadar, datorită tipului de program pe care l-am dezvoltat împreună cu JGI, avem instrumentele necesare pentru a obține cu adevărat informații despre funcțiile acestei comunități fungice, de la poli la tropice.”


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

Romania - Numărul de Profesori la Numărul de Elevi

_ Tot ce poate merge prost cu sânii tăi - și ce să faci în privința asta: ghidul definitiv al DR PHILIPPA KAYE

_ Record de beneficiari de ajutor social în decembrie 2023

_ Este timpul pentru o resetare a Legii de supraveghere a informațiilor externe și a secțiunii 702 de colectare a informațiilor

_ Incident. O navă de război germană a deschis, din greşeală, focul spre o dronă americană

_ Cine este soția lui Dave Myers, Liliana Orzac? Faceți cunoștință cu femeia „remarcabilă” care l-a susținut pe starul Hairy Biker în călătoria sa „teribilă” împotriva cancerului

_ Administratorul Biden se pregătește să escorteze încărcături de haitiani în Florida în timp ce țara din Caraibe implodește: raport

_ Informația pe care Putin o ține la secret din 2022, făcută publică de președintele Ucrainei. Ce nu vrea liderul rus să se știe

_ Rep. Andy Biggs privind proiectul de lege privind ajutorul Ucrainei de 60 de miliarde de dolari: Președintele Johnson „Alcătuiește o coaliție cu democrații”, am putea rezolva criza frontierei de sud „Cu doar o fracțiune din bani”

_ Prințesa de Wales „se descurcă bine” pe fondul recuperării chirurgicale, spune Palatul Kensington – după ce Prințul William se retrage din memorial din cauza „chestiunii personale”

_ Cum ar putea limita decizia Curții Supreme privind imunitatea cauzelor împotriva lui Trump

_ Clasamentul jucătorilor români U21 cu cele mai bune cote de piaţă

_ Trump și Biden fac comerț cu argumente în privința imigrației la vizitele rivale la granița dintre SUA și Mexic

_ Vânătoare urgentă pentru proprietarul „XL Bully” cu părul roșu, care „a decolat” după ce câinele ei a atacat o femeie în Northampton

_ Borell vrea să utilizeze 90% din veniturile din activele ruseşti pentru a lua arme pentru Ucraina

_ În imagine: băiat american de 15 ani, care a murit într-o avalanșă în Elveția, identificat drept adolescent din Illinois, Aleksas Beiga, fiul unui olimpic

_ Depășirea limitelor fine ale procesului cu afinitatea ionilor linker

_ Motive pentru a sărbători săptămâna aceasta – 10 lucruri pentru care să fii recunoscător!

_ „Volvo, The Anti Jaguar”

_ Se construiesc primele 'închisori eco' lângă România

_ Minaur Baia Mare s-a calificat în semifinalele European Cup

_ Mărcile folosesc glicerol în slushies pentru a evita taxa pe zahăr? Experții avertizează părinții cu vârsta sub 4 ani să evite soiurile fără zahăr ale băuturii cu gheață, care pot provoca intoxicații potențial fatale.

_ Polonia respinge întâlnirea la granița cu Ucraina pentru a pune capăt protestelor fermierilor

_ Femeie moartă după ce a fost diagnosticată cu gripă. Ea nu fusese vaccinată şi avea comorbidităţi

_ Cel mai recent deces al lui Dave Myers: starul Hairy Bikers moare la vârsta de 66 de ani la doar doi ani după diagnosticul de cancer devastator, în timp ce omagiile se adună pentru „omul strălucit inspirator și amabil”

_ Serviciile germane de informații avertizează: 'Rusia ar putea lansa un atac asupra NATO începând cu 2026'

_ Povestea adevărată emoționantă din spatele filmului Joy de la Netflix: cum trei oameni de știință hotărâți să „vindece lipsa de copii” au ajutat la producerea primului „bebeluș eprubetă” din lume

Micul Stalinist Nicușor Soros Dan ne spune că a&i lua unui om dreptul de a candida și milioanelor de români dreptul de a-l vota fără o condamnare "e o decizie corectă". Poate in URSS-ul lui Lenin, plicușor cu bani de la Soros

_ „Fata lui tati”, care se mărturisește, fiica magnatului de anvelope, cu avere de 55 de milioane de lire sterline, este „mută” că a fost îndepărtată din testamentul „secret” al defunctului ei tată

_ Patru televiziuni din România dispar din grila de programe! Anunțul a fost făcut de mai marii companiei care dețin posturile

_ Cătălin Cîrstoiu, mărturie șocantă: Eu am avut cancer și l-am învins/ VIDEO

_ Berlinala 2024/ Există o lume dincolo de perspectiva eurocentrică, a declarat regizorul filmului 'Black Tea'

_ Liverpool a ajuns la un acord cu Feyenoord pentru Arne Slot

_ Fată de 15 ani, bătută cu mânerul lopeții de propriul tată pentru că vorbea cu băieți pe internet

_ Utilizarea „Arb” a fondului de salvare a băncilor crește (din nou) pe fondul ieșirilor de fonduri de pe piața monetară, a unei mari pierderi de RRP

_ Fost militar, artizan al jocului 'Balena Albastră', convingând adolescenți să se sinucidă, dă acum școlarilor lecții de patriotism

_ Sora lui Kim Jong-un entuziasmată de un cadou primit de fratele său de la Putin

_ ​Caritatea recrutează sute de voluntari în efortul de a bloca zborurile migranților ilegali către Rwanda

_ Festivalul de Benzi Desenate de la Angouleme: Premiul pentru volumul anului, câştigat de americanul Daniel Clowes

_ Trei bărbați prinși în flagrant cu un kilogram de cocaină, în Galați: Dealerii au fost reținuți

_ Variantă de candidat PSD-PNL la Primăria Capitalei, în timpul discuțiilor de la Palatul Victoria între Cîrstoiu, Ciucă și Ciolacu

_ Beatrice Borromeo a croit o figură glam într-o rochie din picioare de găin la Marele Premiu de la Monaco împreună cu soțul Pierre Casiraghi

_ Klaus Iohannis a semnat: S-a dat undă verde finanțării pentru 42,3 kilometri din A3

_ Escrocii Deepfake organizează o conferință falsă și fură 25 de milioane de dolari de la o companie multinațională din Hong Kong

_ Petrescu (ASF):Retail is the growth area with the best potential for Bucharest Stock Exchange

_ Spărgerea inimii lui James Norton în rolul actorului se desparte de logodnica lui Imogen Poots după o relație de șase ani

_ CNAIR: Oferte pentru proiectarea modernizării reţelei rutiere din proximitatea Bucureştiului

_ Iarna nu se dă dusă: Cod galben de ninsori însemnate cantitativ în 14 judeţe

_ Galeria Națională de Portret se confruntă cu reacții adverse după ce a susținut în mod greșit că comerciantul de artă a folosit sclavi pentru a-și „înființa și susține” cariera

_ Alex Jones susține „licitație coluzivă” în timpul licitației Infowars, cere judecătorului să oprească vânzarea

_ Consumul de bere a scăzut în România

_ LIVE TEXT – Război în Ucraina: Ucraina are voie să lovească în interiorul Rusiei cu armele britanice - Ministrul britanic de Externe David Cameron

_ Este drept că Bisericii îi pasă de solicitanții de azil... dar nu ar trebui să faciliteze convertirile false pentru a-i ajuta să rămână aici

Căratorul de genti al agentului KGB Sikviu Brucan, pe nume Lucian Mîndruță a făcut afirmații șocante într-o emisiune a Digi FM,

_ Motociclete şi scuterele, interzise noaptea la Paris? Propunerea unui consilier

_ Banca Angliei menţine dobânda la cel mai ridicat nivel începând din 2008

_ CEO-ul SAAB spune că riscul de război în creștere conduce cheltuielile pentru apărare; Stocuri de rachete în piața taurească

_ Fiica lui Roy Keane, Leah, și starul din Noua Anglie, Taylor Harwood-Bellis, lansează primele fotografii cu incredibila lor propunere de iaht italian, la câteva zile după ce acesta a marcat la debutul său

_ Moment terifiant, panicați, pasagerii aerieni țipă în timp ce avioanele pline se învârt în timpul unei furtuni feroce

_ Alarma de peste 200% explozie în rândul femeilor și fetelor tinere care suferă de cancer pancreatic, deoarece experții de top recunosc că sunt derutați de creșterea „înfricoșătoare” a bolilor mortale


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26 Pag.27 Pag.28 Pag.29 Pag.30 Pag.31
Pag.32 Pag.33 Pag.34 Pag.35 Pag.36 Pag.37 Pag.38 Pag.39
Pag.40 Pag.41 Pag.42

Nr. de articole la aceasta sectiune: 2507, afisate in 42 pagini.