13:39
Comentarii Adauga Comentariu

_ Cercetătorii găsesc element genetic criptic în intestinul uman care ar putea servi drept biomarker sensibil

_ Cercetătorii găsesc genetică criptică element din intestinul uman care ar putea servi drept biomarker sensibil

O componentă a florei intestinale umane care a fost puțin studiată până în prezent este în centrul unui nou studiu din Germania. Plasmidele sunt mici elemente genetice extracromozomiale care apar frecvent în celulele bacteriene și pot influența stilul de viață microbian – totuși diversitatea lor în habitatele naturale este puțin înțeleasă.

O echipă internațională condusă de prof. dr. A. Murat Eren de la Institutul Helmholtz pentru Biodiversitate Funcțională Marină de la Universitatea din Oldenburg (HIFMB) raportează în revista Cell că o plasmidă misterioasă este unul dintre cele mai numeroase elemente genetice din intestinul uman.

Această plasmidă ar putea servi ca un biomarker puternic pentru identificarea pericolelor pentru sănătate, cum ar fi contaminarea cu fecale a apei sau tulburări umane, cum ar fi boala inflamatorie intestinală. Conform analizelor echipei, această plasmidă este prezentă în intestinele a peste 90% dintre indivizii din țările industrializate.

Plasmidele sunt secvențe de ADN extracromozomial care sunt comune celulelor din toate domeniile vieții. Eren le descrie ca fiind „în mod obișnuit entități genetice mici care poartă gene suplimentare”. Ele pot fi schimbate între diferite celule bacteriene și chiar între diferite tipuri de bacterii. Replicarea plasmidelor depinde de celulele lor gazdă, dar ele o compensează oferind gazdelor lor, în unele cazuri, determinanți de fitness extrem de importanți.

De exemplu, unele plasmide conțin gene care codifică rezistența la antibiotice, care își ajută gazdele bacteriene să supraviețuiască antibioticelor, contribuind la una dintre cele mai presante preocupări de sănătate publică din întreaga lume.

Există și alte plasmide care, conform cercetărilor de până acum, nu conțin gene care codifică un beneficiu evident. funcții pentru gazda lor. „Aceste așa-numite „plasmide criptice” sunt adesea denumite paraziți genetici. Ele rămân un mister în ecologia microbiană, deoarece din perspectivă evolutivă nu ar trebui să existe deloc”, explică Eren, informatician și profesor de Ecosystem Data Science la Universitatea din Oldenburg.

Identificarea plasmidelor a fost o întreprindere dificilă până acum. De ceva timp, oamenii de știință au reușit să extragă material genetic direct din probele de mediu și, de exemplu, să analizeze comunitatea microbiană din intestinul uman în întregime, fără a fi nevoie să cultive organisme bacteriene individuale. Cu toate acestea, capacitatea de a distinge cu încredere ce este o plasmidă în acest conglomerat de material genetic, denumit metagenom, reprezintă o provocare considerabilă.

Pentru a rezolva această problemă, Eren și colegii săi au dezvoltat o nouă învățare automată. abordare. După cum relatează echipa într-un alt articol, acesta publicat recent în Nature Microbiology, ei au folosit această abordare pentru a identifica peste 68.000 de plasmide din flora intestinală umană și, de asemenea, au descoperit că o anumită plasmidă criptică numită pBI143 era deosebit de abundentă în setul lor de date.

În studiul publicat în Cell, echipa de cercetători a analizat mai atent această plasmidă, care constă doar din două gene care, în mod surprinzător, servesc doar pentru propria replicare și mobilizare în celulele bacteriene, fără niciun alt beneficiu clar. Pentru a înțelege mai bine ecologia pBI143, echipa a analizat 60.000 de metagenomi umani și 40.000 de mediu generați din diverse habitate.

„Am descoperit că pBI143 are o listă de caracteristici foarte interesante”, explică Eren. Echipa a descoperit că peste 90% dintre oamenii din țările industrializate poartă plasmida și că, în medie, aceasta este una dintre cele mai numeroase entități genetice din intestinul uman. „În medie, a fost de peste 10 ori mai numeros decât un genom viral, despre care se credea anterior că este cel mai abundent element extracromozomial genetic din intestinul uman”, spune cercetătorul.

Analize ulterioare au arătat că Plasmida a apărut aproape exclusiv în intestinul uman, dar a fost practic absentă în seturile de date din alte medii, cum ar fi oceanele, solurile, plantele și organele digestive ale animalelor și fecalele acestora. Singurele alte mostre în care cercetătorii au reușit să detecteze secvența genică caracteristică pentru aceste plasmide a fost în probe din medii care sunt influențate de oameni, cum ar fi apele reziduale, suprafețele spitalelor și șobolanii de laborator.

Datorită lor. Numărul absolut, prevalența la om și conservarea acesteia în rândul populațiilor umane, echipa de cercetători a emis ipoteza că pBI143 ar putea fi, de exemplu, utilizat ca biomarker în testarea contaminării fecale. „De fapt, am reușit să arătăm că această plasmidă este un marker mai sensibil pentru detectarea contaminării fecale în apa potabilă, în comparație cu biomarkerii de ultimă generație, bazați pe secvențe specifice de gene ale bacteriilor intestinale umane”, spune Eren.

Echipa a identificat, de asemenea, o altă aplicație potențială a acestei entități genetice predominante în contextul tulburărilor umane, cum ar fi boala inflamatorie intestinală (IBD), o afecțiune care afectează 3 milioane de oameni numai în Europa. Ei au reușit să demonstreze că numărul relativ de copii ale acestei plasmide criptice a crescut de aproape patru ori în intestinele persoanelor care suferă de IBD în comparație cu intestinele persoanelor sănătoase, sugerând că modificările numărului de copii ale plasmidei pot servi ca un -metoda invazivă pentru a cuantifica progresul sau severitatea bolii.

La HIFMB, echipa lui Eren dezvoltă noi instrumente la intersecția dintre informatică și microbiologie pentru a identifica și caracteriza plasmidele naturale și alte elemente genetice mobile din bacterii care trăiesc în ocean. Ei se străduiesc să înțeleagă mai bine ecologia și evoluția microbilor și strategiile care le permit să răspundă la mediile lor în continuă schimbare pentru noi aplicații biotehnologice care pot ameliora crizele cu care ne confruntăm.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Tot ce poate merge prost cu sânii tăi - și ce să faci în privința asta: ghidul definitiv al DR PHILIPPA KAYE

_ În interiorul secretului murdar al pornografiei: cât de multe vedete adulte suferă decese de groază, când actrița Kagney Linn Karter devine cea mai recentă care și-a luat viața

_ Kenya a avut vreme neobișnuit de caldă – un expert despachetează ce ar putea fi cauza

_ Urmăriți discursul de inaugurare uimitor al lui Jerry Seinfeld de la Universitatea Duke, la care au ieșit protestatarii studenți proști (VIDEO)

_ România, vizată în mega frauda din PNRR-ul Italiei: Anchetă EPPO pentru 600 milioane de euro

_ Vasile Panaite (PUSL) și-a depus candidatura pentru funcția de primar al municipiului Piatra Neamț

_ Dezvăluit: Cele mai bune chipsuri din Marea Britanie, conform AI - deci, ești de acord cu alegerile sale?

_ Glumele unei molecule altfel netoxice inhibă enzimele de scindare a ADN-ului streptococilor, descoperă cercetătorii

_ Fostul director al CDC spune că este timpul să recunoaștem „efectele secundare semnificative” ale vaccinurilor împotriva COVID-19

_ Canada se îndreaptă spre eutanasia bolnavilor mintal: Țara încetează planurile de extindere a morții asistate la persoanele cu depresie „pentru că nu există destui medici care să le evalueze”

_ Fareed Zakaria de la CNN le spune democraților să se confrunte cu „realitatea” pe care probabil că Biden o va pierde în fața lui Trump în noiembrie (VIDEO)

_ Marcel Ciolacu, despre 'taxa pe boală': 'Nu înțeleg care este supra-impozitarea. Și eu, și toată lumea plătim 10% la CASS'

_ Știința în vremuri de criză: Lecții de la Fukushima și al Doilea Război Mondial

_ Acţiune de ecologizare, sâmbătă, în Delta Văcăreşti

_ Bacteriile mortale arată sete de sânge uman: cercetările subliniază fenomenul vampirismului bacterian

_ NOU RAPORT: Fani Willis a conspirat cu Comitetul Faux J6 al lui Liz Cheney – Comitetul J6 a partajat înregistrări video cu Fani Willis, dar apoi a șters videoclipul pentru a împiedica parlamentarii republicani să aibă acces la el

_ Viperele au ieşit mai devreme din hibernare, atenţionează salvamontiştii din Hunedoara

_ Romanian students have a strong sense of European belonging (study)

_ Premierul îl critică pe șeful Statului Major al Armatei: 'Din punctul meu de vedere, ca prim-ministru, a greșit' (VIDEO)

_ Bucureştiul va avea un muzeu dedicat jocurilor video

_ VEZI: Bunul samaritean se ocupă de afaceri împotriva unui interlocutor care încearcă să jefuiască o femeie nevinovată din San Francisco

_ Câștigătorul celor aproape 6 milioane de euro la Joker și-a revendicat premiul / Este din Cluj și joacă aceleași numere de 10 ani - FOTO

_ Americanii sunt mai dispuși să plătească pentru acțiunile climatice după vreme extremă

_ VIDEO - Tragedie daneză: una dintre cele mai vechi și impozante clădiri din Copenhaga a fost mistuită de flăcări

_ Elon Musk avertizează asupra cheltuielilor cu deficit masiv al lui Biden

_ O nouă misiune spațială: Astrobotic eyes o extindere a sediului său din North Side

_ Meciul dintre Al-Ain şi Al-Hilal, amânat din cauza condiţiilor meteo nefavorabile

_ În abis: înțelegerea formării găurilor negre prin lovituri natale și emisie de neutrini

_ Clotilde Armand a renovat pe ascuns un apartament pregătit de retrocedare. Zeci de mii de euro din bugetul primăriei, pentru că s-a spart o țeavă de apă

_ Cercetătorii descoperă cum percepem gustul amar

_ Infrastructurile energetice rusești vizate de dronele ucrainene

_ Rareș Bogdan ia în derâdere propunerea PSD-PNL pentru Primăria Capitalei: 'Am înțeles că e doctor de dinți... nu de dinți, de genunchi'

_ Actorul Constantin Cojocaru a murit la vârsta de 78 de ani

_ Navigatorii aruncă gunoiul în apele din Florida de Sud? Adolescenții se confruntă cu acuzații de infracțiune

_ Gorghiu crede că liberalii au șanse mari de câștoig: La CJ Argeș, PSD are o echipă obosită

_ Oamenii de știință urmăresc cele mai mari broaște țestoase din lume în locații necunoscute până acum

_ Rasa, sexul și partidele adversarilor influențează strângerea de fonduri în Congresul SUA?

_ Breaking - Parlamentul a votat ordinul de protecție extins! Gorghiu vine cu explicații fulger

_ Primul studiu privind eficiența profesorilor pentru elevii cu și fără dizabilități

_ Eurovision: Israel se prezintă la concurs cu melodie despre evenimentele din 7 octombrie

_ Klaus Iohannis, poziție jenantă în clasamentul european privind încrederea în șefii de state / DOCUMENT

_ VIDEO - Ambasada Rusiei la Chișinău, atacată cu cocktailuri Molotov

_ Săptămâna Internaţională a Muzicii Noi va avea loc între 19 şi 26 mai

_ Atenție! Scobitul în nas crește riscul de a dezvolta principala formă de demență din lume

_ Swiatek sărbătorește titlul Indian Wells cu Zendaya

_ Spitalul din Târgu Cărbuneşti putea fi salvat de la faliment. Rafila: 'Ar fi trebuit să facă aceste schimbări / De aia eşti manager'

_ Schimbări în lotul ”stejarilor” pentru meciul cu Belgia

_ Gala Premiilor Gopo 2024 - Cascadorul Adrian Ştefănescu, distribuit în mai mult de 60 de producţii, omagiat cu Premiul Special

_ Mijlocaşul Naby Keita (Werder Bremen), suspendat pentru restul sezonului de conducerea clubului

_ Formula 1: Lando Norris a fost felicitat de Donald Trump după victoria de la Miami: Mi-a spus că mi-a purtat noroc

_ Malta a înregistrat în 2023 cel mai bun sezon turistic

_ Ben Affleck NU a suferit o intervenție chirurgicală estetică înainte de prăjirea lui Tom Brady pe Netflix - deoarece oamenii din interior dezvăluie motivul ADEVĂRAT din spatele transformării șocante care i-a lăsat uimiți pe fani

_ Cercetările găsesc dovezi că reducerea gheții de mare ajută liniile de copaci să se răspândească spre nord

_ Texas se luptă cu unul dintre cele mai mari incendii din istoria recentă a statului

_ Letonia interzice importul de alimente şi produse piscicole ruse şi belaruse

_ Somnul şi dieta Atkins, secretul celor 60 de ani în formă ai lui Rob Lowe

_ Încălcarea statului de drept: Comisia Europeană anunţă încheierea procedurii prevăzute la articolul 7 al Tratatului UE ce viza Polonia

_ Este necesară o nouă abordare pentru a salva râurile neperene ale Australiei

_ SCANDALUL ȘMRUFILOR: Principalul cheamă poliția �mpotriva unei fete tinere pentru că a postat ștrumfii TikTok cu referință �de-a dreapta�!

_ Ce le-a spus Vladimir Putin rușilor, în primul mesaj după victoria zdrobitoare în alegerile prezidențiale


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19

Nr. de articole la aceasta sectiune: 1114, afisate in 19 pagini.