16:00 2022-07-06
science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu
_ Cercetătorii solicită o utilizare îmbunătățită a instrumentelor chimice pentru a îmbunătăți cercetarea biomedicală
_ Cercetătorii solicită o utilizare îmbunătățită a instrumentelor chimice pentru a îmbunătăți cercetare biomedicală
Experții în cercetarea biomedicală solicită o mai bună utilizare a sondelor chimice pentru a ne îmbunătăți înțelegerea funcției proteinelor și a bazelor pe care se bazează o mare parte din descoperirea și dezvoltarea medicamentelor moderne.
Într-un interviu în Nature Communications, profesorul Paul Workman, profesor Harrap de farmacologie și terapie la Institutul de Cercetare a Cancerului, Londra, și profesorul Cheryl Arrowsmith, om de știință șef pentru laboratoarele din Toronto Consorțiul de genomică structurală (SGC) și profesor de biofizică medicală la Universitatea din Toronto, subliniază problemele cheie cu ajutorul sondelor chimice în cercetarea biomedicală și evidențiază noi proiecte pentru a crește numărul și calitatea instrumentelor chimice disponibile cercetătorilor.
Sondele chimice sunt molecule mici care sunt utilizate pentru a testa activitatea unei proteine i într-o celulă, adesea o inhibă.
Îndrumare de specialitate privind sondele chimice
Unul dintre proiectele discutate este o versiune nouă, îmbunătățită, a unei resurse online ușor de utilizat pentru sonde chimice. Portalul Chemical Probes, relansat în 2021, se bazează pe evaluarea experților efectuată de o comunitate internațională puternică de 200 de cercetători în biologie chimică, chimie și farmacologie și este susținut de analiza datelor mari.
Portalul își propune de a aborda o problemă centrală în cercetarea biomedicală prin încurajarea utilizării în experimente de laborator a sondelor chimice de calitate superioară, mai bine alese - instrumentele moleculare, de obicei inhibitori de proteine, care facilitează înțelegerea proceselor biologice și care sunt importante pentru a susține concluziile cercetare.
O sondă pentru fiecare proteină
Target 2035 este o inițiativă a comunității de cercetare pentru a accelera dezvoltarea unei sonde chimice pentru fiecare proteină din proteomul uman până în 2035. Condus de SGC, Target 2035 reunește oameni de știință din diverse domenii ale descoperirii medicamentelor, inclusiv biochimiști, biologi structurali, chimiști medicinali, oameni de știință în analize și chimiști computaționali.
Cu accent pe știința deschisă, colaborativă, a În ceea ce privește noile tehnologii, Target 2035 își propune să accelereze dezvoltarea de noi sonde chimice de înaltă calitate pentru 90% dintre proteinele umane care nu au fost încă studiate pentru descoperirea potențială a medicamentelor.
Instrumente puternice pentru biomedical. cercetare
Sondele chimice sunt instrumente puternice utilizate în mod obișnuit pentru a determina modul în care proteinele individuale sunt implicate în sănătate și boli, inclusiv în cancer, demență și, recent, COVID-19 și, în cele din urmă, conduc la descoperirea de noi medicamente.
Dar calitatea acestor reactivi variază foarte mult, iar utilizarea instrumentelor suboptime în cercetare este larg răspândită. Utilizarea compușilor slab selectați sau prost selectați ca instrumente poate produce rezultate înșelătoare.
O mai bună utilizare a sondelor chimice ar putea economisi, de asemenea, sectorul cercetării biomedicale miliarde de lire sterline, asigurându-se că noi terapii pentru boli sunt dezvoltate din mai bune și mai robuste. înțelegerea efectelor lor biologice și, prin urmare, este mai puțin probabil să eșueze în studiile clinice costisitoare.
Furnizarea rapidă a informațiilor de specialitate
Dezvoltată de oamenii de știință de la ICR cu sprijinul unor organisme, inclusiv SGC , Wellcome and Cancer Research UK, noul Chemical Probes Portal își propune să încurajeze selecția și utilizarea pe scară largă a celor mai potrivite sonde chimice de înaltă calitate, în special în cadrul comunității academice de biologie.
Una dintre actualizările majore de la Iterația anterioară a Portalului este un nou proces pentru a analiza seturi masive de date, recomandând compuși interesanți de luat în considerare ca probe pentru analiza ulterioară a experților.
Cercetătorii din mediul academic și din industrie pot de asemenea trimite pro instrumente lipsă pentru Portal, care va fi revizuit de un grup extins de aproape 200 de experți înainte ca informațiile să fie publicate gratuit pentru cercetătorii din întreaga lume.
Extinderea și îmbunătățirea datelor.
Alte actualizări majore ale portalului includ informații și opinii ale experților cu privire la sute de instrumente chimice noi.
Aceste includ inhibitori ai proteinelor considerate anterior în mare parte nedrogabile, cum ar fi KRAS, agonişti ai suprafeţei celulare. moleculele receptorilor, GPCR, inclusiv receptorul de serotonină HTR2A, precum și noi instrumente chimice, cum ar fi PROTAC-urile și lipiciurile moleculare - molecule funcționale duble care ghidează proteinele către sistemul de degradare celulară care urmează să fie defalcate.
În ultima perioadă. Numai pe an, numărul de sonde enumerate pe Portal a crescut cu 60% la 520. Au fost adăugate sute de noi ținte de proteine, crescând varietatea de instrumente pe care cercetătorii le pot folosi și extinzând impactul în diferite domenii de cercetare, inclusiv neurologie și imunologie.
Sursele de date includ canSAR al ICR, cea mai mare resursă publică de descoperire a medicamentelor împotriva cancerului din lume și Probe Miner, o resursă comunitară de top pentru evaluarea sondelor chimice bazate pe chimie medicinale la scară largă. y date.
CanSAR activat de inteligența artificială conține date despre 500.000 de structuri de proteine și trei milioane de cavități de pe suprafața a aproape 110.000 de macromolecule, care sunt toate adnotate și organizate astfel încât algoritmii de învățare automată să poată analiza cu ușurință prin date, precum și date clinice și alte date.
Probe Miner a evaluat mai mult de 1,8 milioane de molecule mici pentru potențialul lor de a acționa ca sonde chimice împotriva a 2.200 de ținte de proteine umane.
Pune solide. fundamente pentru cercetare
Dr. Albert Antolin, ICR Fellow și Junior Team Leader la ICR, și unul dintre cercetătorii principali din Chemical Probes Portal, a declarat: „Chemical Probes Portal are o serie de actualizări noi, inclusiv informații detaliate despre sute de noi molecule, o soluție mai eficientă. utilizarea datelor mari și, cel mai important, sprijinul reînnoit din partea sutelor de experți internaționali de top în cea mai bună utilizare a sondelor chimice în cercetare.
„Portalul oferă toate informațiile cheie pentru a sprijini selecția de sonde chimice în un mod ușor de utilizat. Ajută la ghidarea utilizării sondelor chimice în mii de experimente, punând baze mai solide pentru cercetarea fundamentală și descoperirea de medicamente într-o gamă largă de boli, inclusiv cancerul.”
Profesor Paul Workman, profesor Harrap de farmacologie și terapie. de la ICR, și director executiv al portalului de sonde chimice, a declarat:
„Selectarea și utilizarea incorectă a sondelor chimice este larg răspândită în cercetarea biomedicală și, din păcate, duce la concluzii înșelătoare sau greșite care se trag din rezultatele experimentelor. În cazuri extreme, poate deraia descoperirea medicamentelor și studiile clinice și poate duce la risipa inutilă a sute de milioane de lire sterline de finanțare pentru cercetare.
„Cu Portalul Sondelor Chimice și interacțiunea sa strânsă cu Ținta 2035. inițiativa, scopul nostru este de a oferi comunității de cercetare o resursă accesibilă, susținută de cele mai bune date și de experți de top la nivel mondial în utilizarea celor mai bune sonde chimice pentru studiul anumitor proteine.Noile dezvoltări de pe portal vor îmbunătăți acum și mai mult selectarea și utilizarea celor mai bune instrumente disponibile pentru cercetarea experimentală și astfel crește calitatea și robustețea cercetării biomedicale.”
Comentarii:
Adauga Comentariu