_ Descoperirea unui subset de introni umani scurti care sunt îmbinați printr-un mecanism nou

15:38 2024-02-14 science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu

_ Descoperirea unui subset de introni umani scurti care sunt desprinși printr-un mecanism nou

Bien-cunoscutul heterodimer U2AF esențial de pre-mRNA de splicing (U2AF2–U2AF1) a fost identificat ca mediator al reacțiilor de splicing timpurie la toți intronii de diferite lungimi . Cu toate acestea, dr. Kazuhiro Fukumura din laboratorul Akila Mayeda de la Universitatea de Sănătate Fujita a descoperit că un subset de introni scurti cu tracturi de polipirimidină trunchiate sunt îmbinați de complexul RBM17-SAP30BP în loc de heterodimer U2AF. Echipa Dr. Fukumura a propus un mecanism unic în care SAP30BP ghidează RBM17 către spliceozomi activi timpurii.

La om, lungimea pre-ARNm variază foarte mult (de la 30 la 1.160.411 de nucleotide după studii recente). Mecanismul fundamental al splicing-ului a fost studiat cu modele de pre-mARN, inclusiv introni de 158 și 231-nt, de exemplu, care sunt splicing foarte eficient in vitro și in vivo.

Un astfel de pre-mARN ideal conține secvențe semnal de îmbinare bune, adică site-ul de îmbinare 5′, secvența locului de ramificare (BS) și tractul polipirimidinic (PPT) urmat de situsul de îmbinare 3′ care sunt recunoscute de U1 snRNP, U2 snRNP și U2AF2–U2AF1, respectiv. Prof. Mayeda spune: „Având în vedere lungimile diverse ale intronilor umani, este probabil să existe mai mult de un mecanism. Aceasta este motivația noastră de a iniția studiul nostru de îmbinare axat pe intronii umani scurti.”

Dr. Fukumura explică: „Cercetarea noastră anterioară asupra procesului de îmbinare pe intronul scurt a dezvăluit că factorul de îmbinare autentic U2AF2 nu se poate lega de PPT trunchiat și apoi RBM17 este înlocuit cu U2AF pentru a promova îmbinarea. Știi, acest lucru este rezonabil, deoarece intronii scurti sunt adesea prea mult. strâns pentru lungimea suficientă a PPT. Am publicat această constatare în 2021.

„Cu toate acestea, RBM17 nu se poate lega de PPT-ul trunchiat in vitro, așa că nu știam cum PPT-ul trunchiat și următoarea îmbinare de 3′ site-ul sunt recunoscute de RRM17. Prin urmare, am emis ipoteza că un alt factor proteic este implicat în splicing-ul dependent de RBM17.”

Grupul Mayeda a identificat în cele din urmă acest cofactor proteic din spatele splicing-ului dependent de RBM17, care este SAP30BP. Studiul lor a fost publicat în revista jurnalul Cell Reports din 7 decembrie 2023.

Dr. Fukumura afirmă: „A fost esențial să investighem referințele anterioare. Din trei lucrări, am fost convins că SAP30BP este cel mai puternic candidat pentru cofactorul RBM17." Ei au arătat că existența SAP30BP în complexul uman de îmbinare timpurie, musca fructelor SAP30BP și RBM17 au fost detectate în spliceosome de muscă format pe un intron scurt. , iar legarea dintre SAP30BP și RBM17 a fost într-adevăr detectată prin analiza cu doi hibride a drojdiei.

„În zilele noastre, epuizarea SAPBP mediată de siRNA în linia celulară umană este modalitatea simplă și simplă de a verifica reprimarea RBM17- îmbinare dependentă. Și a fost bingo!” spune dr. Fukumura.

Transcrierile din celulele umane epuizate de SAP30BP au fost analizate cu un secvențior de generație următoare (analiza ARN-Seq) și mulți introni dependenți de RBM17 și SAP30BP. Acești introni au fost distribuiți în intervalul mai scurt și PPT-ul trunchiat a fost într-adevăr un determinant critic al dependenței RBM17/SAP30BP. Astfel, RBM17 și SAP30BP sunt factorii generali de îmbinare.

Prof. Mayeda remarcă , „A fost o coincidență norocoasă că Prof. Michael Sattler, care este un expert în analize structurale, a fost profund interesat de studiul nostru și am putea începe o colaborare productivă.”

Interacțiuni proteine-proteine prin UHM (Motivul de omologie U2AF) – Legarea ULM (motivul UHM-ligand) joacă roluri esențiale în reacțiile generale de splicing.Laboratorul Sattler a găsit o secvență ULM ascunsă în SAP30BP și a demonstrat că acest lucru este esențial pentru a interacționa cu UHM în RBM17 prin RMN (magnetic nuclear). rezonanță) și analize ITC (calorimetrie de titrare izotermă).

Cu toate acestea, rolul interacțiunii RBM17-SAP30BP a rămas enigmatic. Deoarece RBM17 are un singur UHM, legarea RBM17-SAP30BP trebuie eliberată înainte de interacțiunea RBM17 cu SF3B1, o componentă a snRNP U2, care este esențială pentru a promova îmbinarea. Deci, care este rolul interacțiunii RBM17–SAP30BP?

Prof. Mayeda spune: „Fukumura a conceput un test de legare inteligentă folosind anticorpi anti-fosfo-SF3B1 pentru a aborda această întrebare curioasă și am putea oferi un model de lucru elegant.”

Cercetătorii propun ca intermediarul complex RBM17–SAP30BP. previne legarea RBM17 nefuncțională de SF3B nefosforilat liber, ceea ce promovează legarea RBM17 funcțională de SF3B1 fosforilat activ pe pre-ARNm.

(Fluierul)

Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

Romania - Numărul de Profesori la Numărul de Elevi

Securistoidul Pantazi un analfabet funcțional în domeniul economiei declara ritos că "distributivismul este baza marxismului". Mai dobitocule doctrina distributivista a fost creata de un Papă si dezvoltata de un alt Papă

Nimeni nu e mai presus de Lege. Nici măcar Curtean Constituțională

Motivarea judecatorului

Prăbușirea Apple demonstrează că a te gudura pe lângă Trump nu este o garanție a siguranței

Prăbușirea demografică a României se datorează în integralitatea partidelor sistemului care au condus România 35 de ani

Prăbușirea criptomonedelor TerraUS și LUNA s-a datorat unui grup restrâns de speculanți care au pariat "short"

Explicația pe scurt a Tarifelir vamale impuse de Trump și cât de mult ajută economia americană

Rezultatele sondajului Verifield

Donald Trump cere eliberarea lui Marine Le Pen și să fie lăsată să candideze. Nici un cuvânt despre anularea alegerilor și nici despre Călin Georgescu spre satisfacția sorosistilor și a slugilor lor care au dat Lovitura de Stat in România

SpaceX tocmai a făcut un pas mare spre reutilizarea amplificatorului Super Heavy al Starship

ActiveNewx - Bolojan și-a adus la Palat "societatea civilă" SOROS după modelul Iohannis pentru a discuta combaterea ”știrilor false” înainte de alegeri, adică perfecționarea cenzurii

Trăim în URSS. Procurorii CSM si seful PICCJ Alex Florenta cer cercetarea judecătoarei Boboc de la CA Constanta pentru hotararea prin care a stramutat dosarul lui Dan Diaconescu si a desfiintat condamnarea

Elon Musk a criticat vehement verdictul instanței franceze care a blocat candidatura lui Marine Le Pen la alegerile prezidențiale din 2027. Cazul Călin Georgescu a fost din nou Reamintit.

Ca și în cazul lui Călin Georgescu, Regimul Soroșist Macron o interzice pe Marine Le Pen. Le Pen găsită vinovată. Le Pen interzisă să candideze.

La fel ca și Călin Georgescu care avea peste 40% în turul întâi, Marine le Pen conduce detașat in sondaje pentru cursa prezidențială. E momentul ca regimul Neobolsevic Soroșist să o scoată din joc cum a făcut și la noi.

Viktor Orban: "Je suis Marine!". Gunoiul de Viktor Orban de interzicerea lui Călin Georgescu nu a spus nimic desi acesta nu era condamnat deloc. Ce înseamnă să fii lipsit de caracter

Un nou sondaj: Simion pe primul loc, Ponta pe doi. Sondaj Verifield comandat de Nicușor Dan.

Cazul Le Pen, ineligibilitate și executare provizorie: ce spune cu adevărat legea

Sorosistul Securistoid Bănescu noua Față Hidoase a Cenzurii Regimului UEist de la București

Ciutacu alias Saul Bruckner 2 in Scânteia 2 sau Cum sa înjuri in stil bolșevic românii doar pentru că votează cu cine vor ei? Tonomatul puterii pe nume Ciutacu care pupă poala Pucistului Ciolacu și a lui Gold Ponta înjură oribil votanții lui Georgescu

De ce sa înjuri votanții că votează cu cine vor ei? Tonomatul puterii pe nume Ciutacu care pupă la greu poala Pucistului Ciolacul și a lui Gold Corporation Ponta ii înjură oribil pe votanții lui Călin Georgescu.

De ce sa înjuri votanții că votează cu cine vor ei? Tonomatul puterii pe nume Ciutacu care pupă la greu poala Pucistului Ciolacul și a lui Gold Corporation Po ta ii înjură într-un mod oribil pe votanții lui Călin Georgescu.

De ce sa înjuri votanții că votează cu cine vor ei? Tonomatul puterii pe nume Ciutacu care pupă la greu poala Pucistului Ciolacul și a lui Gold Corporation Ponta ii înjură oribil pe votanții lui Georgescu

Ion Cristoiu: Votul din decembrie a fost moral Lumea s-a săturat de "politruceală" Da, inevitabil, ne despărțim de America (referindu-se la puciști)

Reacția Cristelei Georgescu după ce Puciștii care au dat Lovitura de Stat, l-au interzis pe soțul ei: „Nimic nu este pierdut atât timp cât credinţa este în picioare, cât sufletul nu abdică şi cât capul se ridică din nou.”

Adrian Onciu: Cine sunt, de fapt, extremiștii

CURS-ul lui Buble îl urca pe Crin Antonescu pe locul doi. Sondaj CURS pentru alegerile prezidențiale. 59% dintre români cred că direcția țării impregnată de Puciști este greșită

Ca în Botswana, fiecare Institut de sondare are un candidat preferat. SOCIOPOL-ul lui Palada îl urcă pe Ponta pe locul doi.

În sondajul Atlas Intel Soroșiștul Nicușor Dan, e pe locul doi

Pieleanu "face" sondaje "la refefon"

Ca și bolșevicii în 1946, Soroșiștii nu au stare până nu bagă Cenzura peste tot. Lasconi cere închiderea TikTok înaintea prezidenţialelor: "Fake news-ul să fie dat jos". Soroșiștii de la Funky Citizens decid ei de capul lor, ce e "fake news"

Ramurile Cominterniste directe sau prin alianță se susțin între ele. Celebrul Bombonel, alias Adrian Năstase, care a dat petrolul țării și multe alte bunuri naționale pe Nimic, îl susține pe Victor Ponta. Nu ai nenorocit destul țara asta Bombonele?

Subordonat rețelei soroșiste ca și Nicușor Dan, Bilderbergul Merz pune biciul pe germani. Germania se înarmează până în dinți și vrea să taie pensii, ajutoarele sociale și subvenția pentru energie

Viktor Orbán: "Nu mai puteam să stăm cu mâinile în sân şi să privim cum lanţurile de magazine jefuiesc oamenii". Vă amintiți cum au sărit Soroșiștii pe Călin Georgescu când ne-a spus că Multinaționalele ne jefuiesc? De ce AUR și Simion TAC pe această temă?

Calin Georgescu a avut dreptate când a arătat jaful multinaționalelor. Bulgaria înființează lanțuri de magazine cu adaos 10%, pentru a împiedeca multinaționalele să jefuiască populația. Puciștii de la noi sunt pe-o mână cu multinaționalele

Editorial Cornel Dinu. SMINTEALA clasei politice înaintea unor alegeri prezidențiale compromise din start

În 35 de ani de Soroșism, Familia Tradițională a fost distrusă. UE A AJUNS LA 700.000 DE DIVORȚURI Rata divorțurilor s-a triplat. Unu din doi copii se nasc in afara căsătoriei. Înțelegeți de ce Călin Georgescu a spus că Familia trebuie protejata?

Tăcerea democrației: strigătul unei națiuni pentru libertate<

Așadar dacă pacea se va încheia Nikolaev și Odessa vor rămâne în Ucraina, în sfera de influență Americană. Putin nu va revendica Odesa dacă americanii recunosc Crimeea, Donețk, Lugansk, Zaporojie și Herson ca părți ale Rusiei

Luptătorul din Arenă

Vă sună cunoscut? Am văzut în România. Primarul Istanbulului, progresistul Imamoglu, arestat Principalul adversar al lui Erdogan, Imamoglu își anunțase candidatura la președinție in 2028

Mișcarea Suveranistă e împărțită între "Turul Doi Inapoi" și "Sa mergem înainte cu Simion". Simion și Ana Maria Gavrilă trebuie sa sustina Rolul Important a lui Călin Georgescu în Statul Român dacă vor să castige

Micul Stalinist Nicușor Soros Dan ne spune că a&i lua unui om dreptul de a candida și milioanelor de români dreptul de a-l vota fără o condamnare "e o decizie corectă". Poate in URSS-ul lui Lenin, plicușor cu bani de la Soros

Așadar după mintea actualului Stat Soroșist și a cohortelor de sorosisti care aplaudă: Democrația înseamnă să anulezi alegerile, să-l interzicem, să-i facem dosar penal și să-l băgăm la zdup pe cel CARE A CÂȘTIGAT ALEGERILE PRIN VOT

România propusă de Călin Georgescu vs România puciștilor dirijați de progresista UE. Iată cum arată România Puciștilor : Șomajul în rândul tinerilor e cel mai mare din UE. La țară a ajuns peste 30%

Bilderbergul Macron: UE poate sprijini Ucraina fără aprobarea Rusiei trimițând mii de soldați din fiecare țară a UE.

Libertatea de exprimare a murit. Lasconi de la USR cere și mai multă CENZURĂ. Soroșismului Neobolsevic devine tot mai Totalitar. "cel puțin 2 televiziuni își fac de cap" "avem proiect de Lege" urlă Lasconi

Adrian Onciu - Active News : Continuă telenovela nord-coreeană de admitere sau respingere a candidaților la prezidențiale în funcție de cum dictează autorii loviturii de stat.

Fluierul Report