22:21 2023-02-08
science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu
_ O platformă chemoproteomică monitorizează ocuparea clusterului Fe-S în proteomul E. coli
_ O platformă chemoproteomică monitorizează Ocuparea clusterelor Fe-S în proteomul E. coli
Chimiștii de la Boston College au dezvoltat o strategie pentru a monitoriza prezența sau absența clusterelor de fier-sulf, care sunt esențiale pentru funcționarea diferitelor proteine, a raportat echipa. recent în revista Nature Chemical Biology.
Plataforma proteomică fier-sulf (Fe-S) dezvoltată de echipa le-a permis să obțină o perspectivă mai bună asupra dinamicii fier-sulf livrarea și legarea clusterelor, potrivit profesorului de chimie Eranthie Weerapana și asociatului senior de cercetare Daniel Bak, co-autori ai studiului.
Clusterele de fier-sulf se găsesc în proteinele esențiale pentru sănătatea umană, cum ar fi Enzimele de reparare a ADN-ului și importante în științele energetice pentru celulele biocombustibile și procesele industriale mai curate.
Cu toate acestea, studiul clusterelor de fier-sulf a fost întotdeauna o provocare. din cauza instabilității și dinamicii complexului cluster Fe-S-proteine, potrivit lui Bak.
„Ne-am propus să dezvoltăm o tehnologie care să ne permită să evaluăm la nivel global dinamica clusterului Fe-S. legarea într-un întreg proteom fără a fi nevoie de o purificare laborioasă a proteinelor, radioizotopi de fier sau sulf sau cunoștințe anterioare despre situsurile de legare a clusterelor”, a spus Bak.
Multe proteine conțin cofactori metalici, cum ar fi clusterele de fier-sulf. , a explicat. Acești cofactori anorganici permit funcții proteice unice, cum ar fi chimia redox cu un electron, care nu sunt disponibile pentru cei 20 de aminoacizi proteici canonici.
Echipa a efectuat studiul asupra bacteriei E. coli, care este un organism model cu un proteom fier-sulf bine caracterizat. Pentru a măsura legarea clusterelor Fe-S de ținte de proteine, echipa a folosit strategii proteomice avansate bazate pe spectrometrie de masă, cuplate cu sonde chimice care pot diferenția între formele legate de cluster și cele nelegate ale unei proteine, a spus Weerapana.
Echipa a observat o sensibilitate diferențială a clusterelor de fier-sulf atât la limitarea fierului, cât și la afectarea căilor pe care E. coli le folosește pentru a sintetiza clusterele Fe-S, sugerând o prioritizare a furnizării clusterelor de fier-sulf în E. coli, a spus echipa. rapoarte. Cunoașterea prioritizării clusterului fier-sulf poate oferi o perspectivă asupra modului în care diferiți microbi se pot asimila și se pot dezvolta în nișele de mediu în care fierul este limitat.
Cercetătorii au reușit, de asemenea, să diferențieze rolurile diferitelor enzime biosintetice fier-sulf. , dintre care unele sunt esențiale pentru livrarea aproape tuturor clusterelor Fe-S, în timp ce altele joacă roluri mai specifice în livrarea clusterelor către un subset specific de proteine Fe-S.
„Exploarea setului de date pe care le-am generate, am putea compila o listă cu potențial noi proteine Fe-S, dintre care două au fost validate ca proteine de legare a grupului de fier-sulf”, a spus Weerapana. „Acest lucru deschide posibilitatea de a utiliza proteomica pentru a identifica o nouă biologie a clusterului Fe-S nu numai în E. coli, ci și în alte organisme.”
Cercetătorii au spus că următorul pas este traducerea acestei lucrări în alte organisme. organisme și sisteme model, inclusiv modele de cultură celulară ale bolilor umane dependente de Fe-S, cum ar fi ataxia lui Friedrich. Noua platformă oferă un instrument puternic pentru a caracteriza mecanismele de sinteza și livrare a clusterelor Fe-S, precum și pentru a identifica noi căi celulare dependente de fier și sulf.
Comentarii:
Adauga Comentariu