16:01
Comentarii Adauga Comentariu

_ Enzimă veche de 2 miliarde de ani reconstruită: munca de detectiv realizată de biologi moleculari și cercetători în bioinformatică

_ 2- Enzimă veche de miliarde de ani reconstruită: Lucrări detective ale biologilor moleculari și cercetătorilor în bioinformatică

Cercetătorii de la Universitatea Leipzig au rezolvat un puzzle în evoluția enzimelor bacteriene. Reconstituind un candidat pentru o ARN polimerază specială, așa cum exista cu aproximativ 2 miliarde de ani în urmă, ei au reușit să explice o proprietate uluitoare până acum a enzimelor moderne corespunzătoare.

Spre deosebire de strămoșii lor, ei nu funcționează continuu și sunt astfel semnificativ mai eficiente — aceste pauze în activitate constituie progres evolutiv. Reconstituirea proteinei din timpurile preistorice a fost posibilă datorită cooperării interdisciplinare dintre biochimia moleculară și bioinformatică.

Descoperirile cercetării au fost publicate în revista Molecular Biology and Evolution. Enzimele studiate sunt ARNt nucleotidiltransferaze: enzime care atașează trei blocuri de construcție nucleotide din secvența C-C-A la ARN-uri mici din celulă (așa-numitele ARN de transfer), astfel încât acestea să poată furniza ulterior aminoacizi pentru sinteza proteinelor.

Prin reconstrucții filogenetice, o echipă de cercetători condusă de profesorul Mario Mörl (Biochimie) și profesorul Sonja Prohaska (Bioinformatică) a reconstruit un candidat pentru o astfel de enzimă ancestrală așa cum a existat în bacterii cu aproximativ 2 miliarde de ani în urmă. Echipa de cercetare a comparat apoi proprietățile ARN polimerazei reconstruite cu cele ale unei enzime bacteriene moderne.

Ambele enzime funcționează cu o precizie similară, dar prezintă diferențe clare în ceea ce privește reacția. Până acum, nu a fost posibil să se recunoască tendința enzimelor moderne de a-și întrerupe activitatea în mod repetat ca un avantaj evolutiv. Acest fenomen i-a nedumerit pe biochimiști de zeci de ani. Numai în comparație cu modul de activitate al enzimei reconstruite, misterul a fost acum rezolvat.

Enzima ancestrală este procesivă, adică funcționează fără întrerupere, dar din când în când elimină nucleotidele. blocuri de construcție care au fost deja adăugate corect. Rezultatele arată că se pot învăța multe despre evoluția și proprietățile enzimelor moderne din reconstrucțiile enzimatice și că multe întrebări pot fi rezolvate doar prin interacțiunea dintre bioinformatică și biochimie — într-un dus și înapoi între calculele computerizate și experimentele de laborator.

În trecut prin urmărirea relațiilor

Folosind secvențe de gene, arbori filogenetici evolutivi pot fi, de asemenea, creați din bacterii. Pornind de la marea diversitate de organisme de astăzi dintr-un arbore de specii, calea evolutivă a genelor individuale poate fi reconstruită de-a lungul relațiilor și ramurilor și poate fi urmărită cu minuțiozitate înapoi la o origine comună.

Reconstituirea este, în esență, în trei etape. proces. În primul rând, bazele de date sunt căutate pentru enzimele moderne corespunzătoare pentru a putea examina secvența blocurilor de construcție a aminoacizilor. Secvențele obținute pot fi apoi folosite pentru a calcula cum ar fi trebuit să arate secvența originală. Secvența de genă corespunzătoare care codifică vechea enzimă este apoi introdusă în bacteriile de laborator, astfel încât acestea să formeze proteina dorită. Enzima poate fi apoi studiată în detaliu pentru a-i determina proprietățile și comparată cu enzimele moderne.

„Când a venit știrea din laborator că enzima reconstruită efectuează adăugarea C-C-A și o face chiar și într-un mod mai larg. interval de temperatură decât enzimele de astăzi, acesta a fost descoperirea”, își amintește Sonja Prohaska.

Optimizare evolutivă: pauzele în activitate cresc eficiența

Ca și organismele, enzimele sunt, de asemenea, optimizate prin evoluție. Lucrarea (cataliza) efectuată de o enzimă se desfășoară, de obicei, mai repede și mai bine, cu atât mai puternică își poate lega substratul. Enzima ancestrală reconstruită face exact asta, se ține de substrat, ARNt, și atașează cele trei nucleotide C-C-A una după alta, fără a renunța.

Nucleotidiltransferazele moderne de ARNt, pe de altă parte, sunt distributive. , adică lucrează în etape cu pauze în timpul cărora își eliberează în mod repetat substratul. Cu toate acestea, ei sunt mai eficienți și mai rapidi decât predecesorii lor ancestrali. Acest lucru i-a nedumerit pe cercetători. De ce enzimele moderne continuă să renunțe la substratul lor?

Explicația constă în fenomenul reacției inverse, în care nucleotidele încorporate sunt îndepărtate din nou de enzimă. În timp ce legarea puternică a enzimei ancestrale de substrat are ca rezultat îndepărtarea ulterioară, reacția inversă în enzimele moderne este aproape complet împiedicată prin eliberarea substratului. Acest lucru le permite să lucreze mai eficient decât predecesorii lor.

„Am reușit în sfârșit să explicăm de ce nucleotidiltransferazele moderne de ARNt funcționează atât de eficient în ciuda naturii lor distributive”, spune Mario Mörl. "Descoperirea ne-a luat complet prin surprindere în echipă. Nu ne așteptam la așa ceva. Am avut întrebarea în urmă cu 20 de ani și acum îi putem răspunde în sfârșit folosind metode de reconstrucție bioinformatică. Această cooperare strânsă între bioinformatică și biochimie a existat în Leipzig de câțiva ani și s-a dovedit, nu pentru prima dată, a fi un mare avantaj pentru ambele părți.”


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Ucraina atacă casa oligarhului Ihor Kolomoisky, care are legături cu Zelensky și Hunter Biden

_ Ucraina spune că Rusia adună 500.000 de trupe la granițe pentru o nouă ofensivă majoră

_ Salariile din ianuarie explodează la 517.000, 8-Sigma depășesc așteptările; Rata șomajului scade la un nivel record

_ Oficialii electorali locali din Oakland, CA Ignoră ordinul judecătorului – împodobiți cu buletinele de vot înainte ca auditorii să apară la fața locului pentru a o revizui

_ Hunter omite motivul principal pentru care John Paul Mac Isaac a obținut conținutul laptopului său pe primul loc

_ „Extremely Hawkish”: acțiuni, obligațiuni, aur vomita după date despre locuri de muncă „bune”; Creșterea ratelor cotelor

_ Republicanii Camerei vor să folosească fondurile necheltuite de ajutor COVID în pachetul de plafon al datoriilor

_ Sondajul NFIB sugerează că se apropie o recesiune

_ Partenerul de afaceri al lui Hunter, Eric Schwerin, a mutat documentele lui Joe Biden de la Casa Albă la UDel – nu singura dată când Schwerin s-a ocupat de documentele guvernamentale

_ În fața ta: Xi trimite un balon spion gigant peste SUA cu câteva zile înainte de călătoria lui Blinken la Beijing

Proiectul Veritas: Directorul Pfizer este îngrijorat de sănătatea reproductivă a femeilor după Covid Vax, „Există ceva neregulat despre ciclurile menstruale” (VIDEO)

_ Opoziția maghiară a primit mai multe fonduri ilegale din SUA decât s-a raportat anterior – la câteva săptămâni după ce liderul grupului Koranyi s-a întâlnit cu Alex Soros

_ Biden vrea acum să lupte împotriva schimbărilor climatice, încurajându-vă să rămâneți acasă

_ Note scrise de mână confiscate de la Casa lui Biden, Rehoboth Beach

_ Sturm Und Drang și baloane chinezești

_ Eric Swalwell retweetează o postare video de satiră de Carpe Donktum, batjocorindu-l sălbatic cu sunete de fart

_ Germania deschisă ideii de vest în spatele sabotajului Nord Stream cu „scopul de a da vina pe Rusia”

_ Ce s-a aflat în spatele raportului de locuri de muncă „Uau, uau, uau” de astăzi

_ Silvergate se confruntă cu o sondă DOJ în legătură cu tranzacțiile FTX și Alameda: raport

_ Lovitură de avertizare trasă!

_ Cea mai rece masă de aer de pe planetă va fi peste New England vineri seara

_ Blinken amână călătoria în China pe fondul acuzațiilor legate de baloane spion din Montana

_ Nordstrom acționează după ce investitorul activist Ryan Cohen și-a acționat

_ „Scandalul ar fi enorm”: directorul Pfizer este îngrijorat de neregulile menstruale induse de vax

_ O lovitură adusă dragostei frățești – RUMPARE: Republicanii îl îndepărtează pe radicalul de stânga Ilhan Omar din Comisia pentru Afaceri Externe a Camerei

_ „Cred că ofițerul de poliție și-a făcut treaba” – Kevin McCarthy îl apără pe ucigașul cu sânge rece Mike Byrd și o aruncă pe Ashli ​​Babbit sub autobuz

_ "Nu! Era deja acolo când am ajuns aici, omule!” – Biden când a fost întrebat dacă își asumă vreo vină pentru inflație (VIDEO)

_ MO Candidatul democrat la Senat are dintr-o dată un accent sudic pentru a-și pande alegătorii din Missouri

_ Crăpare sub presiune? Se pare că Don Lemon a țipat la co-gazdă, lăsând echipajul zguduit

_ OH NU – Agent FBI arestat recent pentru că a primit mită de la oligarhul rus, de asemenea, a condus o unitate care ar fi putut investiga activitățile lui Hunter Biden cu spionul chinez Patrick Ho

_ METOARE: japonezii au folosit baloane pentru a disemina arme chimice și biologice �n al Doilea Război Mondial

_ Adolescenți au bătut cu sălbăticie o fetiță de 9 ani în autobuzul școlar; Părinții depun acuzații după ce școala refuză să ia măsuri (VIDEO)

_ Pentagonul Spox spune că balonul spion din China este manevrabil; Nu va spune unde este acum peste SUA, le spune americanilor îngrijorați că pot merge să privească în cer

_ Biden le întoarce spatele reporterilor și refuză să răspundă la întrebări despre balonul spion chinez care își face drum prin SUA (VIDEO)

_ „Aceasta este o gaură a iadului aici, în stânga” – Dr. Naomi Wolf discută despre modul în care americanii privesc politica și cum le afectează percepțiile faptele despre vaccinul COVID

_ Hunter Biden a trimis o scrisoare către Delaware AG, care are o lungă istorie cu familia Biden Crime

_ Pe măsură ce Bed, Bath & Beyond se apropie de faliment, conservatorii își amintesc când au întrerupt MyPillow – și sugerează o remediere

_ Bărbat acuzat că a aruncat un cocktail Molotov la sinagoga din New Jersey

_ Bach respinge invitaţia lui Zelenski de a vizita linia frontului

_ Investitorii alcoolici vor continua să ignore realitatea... Până nu va fi prea târziu

_ ChatGPT scrie o poezie lăudându-l pe Hunter Biden, dar...

_ SUA rămân la teoria balonului spion: Ştim că balonul a încălcat spaţiul aerian al Statelor Unite şi legislaţia internaţională

_ Surpriză totală pentru polițiștii rutieri - La volan era copilul minor, în spate părinții beți

_ Democratul Rashida Tlaib SE TOPE în timp ce republicanii îl îndepărtează pe bigot furios Ilhan Omar din Comisia pentru Afaceri Externe a Camerei (VIDEO)

_ RUMBLINGS: Poliția din Memphis investighează legătura zvonită a lui Tire Nichol cu ​​fosta soție a polițistului din Memphis – Tatăl vitreg al lui Tire Nichols neagă zvonurile

_ Trump îl sfâșie pe Paul Ryan – „Perdantul major care acum își propune să distrugă Fox News”

_ Consilierul GOP a fost împușcat și ucis în afara casei ei din New Jersey

_ Donator mega-democrat și soț „Gospodine adevărate” acuzați pentru că ar fi deturnat milioane de la clienți

_ „Un truc... Nu avem timp pentru aceste prostii” – Steve Bannon se pronunță asupra procesului Hunter Biden (VIDEO)

_ În săptămâna trecută, TGP a descoperit crimele și corupția Hunter Biden legate de documente clasificate, spionaj, încălcări ale FARA și conexiuni la Biolabs din Ucraina

_ EPIC! Reprezentanta Anna Paulina Luna răspunde la criza democraților din cauza „Asalt Weapon Pin” – „Jimmy, nu mai încerca să te întâlnești cu mine!”

_ ESTE IMUSCAT: Joe Biden: „Mai mult de jumatate dintre femeile din administratia mea sunt femei” (VIDEO)

_ Liberal Tears: Emisiunea „Terminal List” a lui Chris Pratt este reînnoită pentru al doilea sezon – etichetată „Right-Wing Revenge Fantasy” de către Liberal Media

_ Prognoza: Curenții de aer vor lua balonul spion din China peste Heartlandul SUA, baza navală cheie; Biden refuză să-l doboare

_ „Tata era pe cale să-i trimită acel tip miliarde de dolari într-o schemă masivă de spălare a banilor” Dan Ball de la OAN cu Joe Hoft de la TGP discutând despre Zelensky și Hunter în Ucraina (VIDEO)

_ ChatGPT de la OpenAI arată părtiniri rasiale clare în răspunsuri, în timp ce revista Far Left le cere să se „trezească”

_ Build-ul Windows 11 dezumflat rulează pe 2 GB de RAM

_ „Agitatorii” de stânga în spatele scenei din NYC Ilegal Hotel Standoff

_ Newsweek Op-Ed: „Noi, în comunitatea științifică, am greșit. Și a costat vieți”

_ Senatorul brazilian propune o legislație care îi criminalizează pe cei care refuză să ia împușcătura „obligatorie” împotriva COVID-19


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8

Nr. de articole la aceasta sectiune: 473, afisate in 8 pagini.