06:49 2022-05-26
science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu
_ O nouă metodă de monitorizare a ADN-ului de mediu pentru identificarea speciilor de pești rare și pe cale de dispariție vândute pe piețe
_ O nouă metodă de monitorizare a ADN-ului de mediu pentru identificarea speciilor de pești rare și pe cale de dispariție vândute pe piețe
Într-o lucrare publicată recent în Methods in Ecology and Evolution, cercetătorii de la Conservation Forensics Lab de la Universitatea din Hong Kong au subliniat un nou instrument puternic pentru monitorizarea comerțului specii de pești rare și pe cale de dispariție din piețele umede din Hong Kong. Folosind ADN-ul de mediu (eDNA) prezent în apa de scurgere a piețelor de pește, cercetătorii au reușit să extragă și să secvențeze suficient ADN pentru a identifica peste 100 de specii de pești care au trecut prin piață.
Diferite tipuri de vulnerabile. sau specii pe cale de dispariție au fost detectate prin metoda eDNA în studiu, inclusiv Epinephelus fuscoguttatus, un tip de grupare marmorată marmorată care este listată ca vulnerabilă și în scădere conform Uniunii Internaționale pentru Conservarea Naturii (IUCN) și trei specii de anghilă, inclusiv Anguilla japonica și Anguilla rostrata, care sunt listate ca fiind pe cale de dispariție de către IUCN, precum și anghila europeană, Anguilla anguilla, listată CITES (Convenția privind comerțul internațional cu specii de faună și floră sălbatice pe cale de dispariție). Au fost detectate două tipuri de dorada, inclusiv dorada aurie (Nemipterus virgatus) care este listată ca vulnerabilă de IUCN și dorada de Okinawa (Acanthopagus sivicolus), listată ca vulnerabilă și în scădere de către IUCN.
Metabarcoding. permite identificarea speciilor dintr-o dată
Codificarea cu bare este o metodă comună de identificare a speciilor, în care anumite regiuni ale genomului unui organism sunt secvențiate și utilizate pentru a identifica organismul în cauză. Fiecare specie are propriul „cod de bare” unic, care poate oferi o formă mai fiabilă de identificare decât metodele tradiționale bazate pe morfologie. Această tehnică poate fi extinsă pentru a identifica mai multe specii simultan (cunoscută sub numele de metabarcoding) datorită tehnologiei avansate de secvențiere de mare debit. Chiar și cantitățile mici de ADN revărsate de plante și animale în mediu (eADN) sunt suficiente pentru metabarcoding, ceea ce permite identificarea comunităților mixte de specii care ar fi putut fi prezente în zonă.
În acest studiu, Cercetătorii din Conservation Forensics Lab și-au propus să dezvolte o metodă de identificare a speciilor de pești comercializate pe piețele din Hong Kong, care să nu se bazeze pe experții în taxonomie a peștilor să petreacă ore întregi identificând vizual fiecare pește pus în vânzare. În plus, mulți vânzători de pește sunt adesea reticenți în a permite inspecții îndelungate ale mărfurilor lor, deoarece speciile de pește pe cale de dispariție pot fi adesea găsite pentru vânzare pe piețele din Hong Kong.
Metoda prezentată în lucrare a comparat cele mai comune două tipuri. a captării eDNA: filtrare și precipitare. În metoda de filtrare, un litru de apă colectat din canalele de scurgere din trei piețe umede a fost colectat și trecut printr-un filtru fin, care a captat țesutul, sângele și alte resturi celulare care dețin suficient ADN pentru a face o identificare a speciilor de pești care l-au aruncat. . Metoda de precipitare a folosit și mai puțină apă, permițând identificarea speciilor de pești prezente prin precipitarea chimică a eADN-ului prezent în resturile celulare din 45 ml de scurgere de scurgere. După ce apa de scurgere a fost colectată, eADN a fost extras și secvențiat și au fost identificate speciile de pești prezente pe cele trei piețe umede investigate pe o perioadă de 5 zile. Pentru a confirma rezultatele, un expert taxonom pești a efectuat un sondaj vizual și au fost comparate suprapunerea detecțiilor de specii.
Fiabilitate ridicată și ușor de adaptat
Deși este imposibil să fii 100% sigur în identificarea fiecărei specii prezente cu oricare dintre metode, avantajele unei metode de cercetare bazată pe ADN sunt numeroase. În principal, ID-urile bazate pe ADN pot fi mai fiabile decât ID-urile morfologice, iar acest lucru este valabil mai ales atunci când peștii sunt vânduți măcelăriți sau aparțin anumitor genuri și familii cu aspect similar. Metoda de extracție a ADN-ului prezentată în lucrare este, de asemenea, foarte simplă și poate fi executată cu ușurință de către oricine cu pregătire de bază de laborator moleculară de câteva ore. Sondajele vizuale necesită ore și ore de muncă extinsă a mai multor taxonomi experți, ceea ce a fost un factor care a împiedicat lansarea sondajelor regulate în Hong Kong.
„Sperăm că metoda noastră nu va încuraja doar autoritățile locale să adopte mai multe soluții de înaltă tehnologie pentru monitorizarea și combaterea comerțului ilegal cu animale sălbatice în Hong Kong, dar ajută și la extinderea utilizării eDNA și a metabarcoding-ului în contexte urbane”, a declarat John L Richards, coautor al lucrării jurnalului.
Comentarii:
Adauga Comentariu