12:55 2024-03-07 science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu

_ Depășirea mucegaiului: Cercetarea provoacă normele ecologice în comunitățile de drojdie

_ Spargerea formei: Cercetarea provoacă normele ecologice în comunitățile de drojdie

Kyle David, un bursier postdoctoral NSF în laboratorul Rokas, și coautorii au publicat o nouă lucrare, „Saccharomycotina yeasts defy longstanding macroecological patterns”, în Proceedings of the National Academia de Științe. Această lucrare, care analizează ecologia a 186 de specii de drojdie, oferă dovezi că nu toate formele de viață urmează regulile.

În acest caz, regulile încălcate sunt ipoteze de distribuție a speciilor, în special, că diversitatea speciilor ar trebui să crește în apropierea ecuatorului, speciile ar trebui să fie mai diverse în climatele mai calde, iar intervalele de specii ar trebui să fie mai mari mai departe de ecuator.

Echipa a descoperit că speciile de drojdie sunt cele mai abundente în habitatele pădurilor montane.

Potrivit lui David, „le plac foarte mult aceste păduri montane. Eu susțin că aceste clinuri de elevație de-a lungul unui munte creează toate aceste micro-habitate care pot găzdui mult mai multe specii.”

David's co. -mentorul, Matt Pennell de la Universitatea din California de Sud, a comentat: „Biologii au fost mult timp fascinați de generalitățile în distribuția abundenței organismelor și există un uriaș corp de teorie care a fost dezvoltat pentru a explica aceste generalități. Dar această lucrare tinde să ignore numeroasele grupuri de organisme – adesea cele ciudate și minunate, cum ar fi ciupercile.

„Prin agregarea a tot felul de înregistrări din diferite surse și folosind abordări inteligente de învățare automată, am arătat că acest grup important de drojdii se sparg. toate regulile. Va trebui să extindem teoria existentă pentru a înțelege mai bine de ce este cazul.”

Construind un studiu care a validat experimental care alimente (adică carbohidrații) sunt consumate (adică metabolizate) de către care drojdii. , echipa a descoperit, de asemenea, că speciile care metabolizează mai puțini carbohidrați au intervale limitate în comparație cu cele care metabolizează mai mult. David a fost încântat să vadă modelul specialiștilor care au intervale restrânse reieșit în acest experiment.

"Specialistul- Relația generalistă pe care am constatat-o ​​că este foarte bună", a adăugat el. "Nu a fost neașteptat, ca unele dintre celelalte rezultate, dar este plăcut să văd că acest proces biochimic are legătură cu un model macro-ecologic."

Această lucrare umple o lacună importantă în înțelegerea noastră a ecologiei drojdiei.Concret, știm destul de multe despre procesele medicale și comerciale ale interacțiunilor drojdie-om, dar foarte puține despre ecologia drojdiei în natură.David a comentat că deseori tratam drojdia. ca și cum ar exista într-un vid, dar există în lume și au ecologii cu adevărat interesante.

David a exprimat, de asemenea, că lucrarea a avut ca scop găsirea diversității în funcție de evoluție, mai degrabă decât de mișcarea dintre oameni. , de exemplu, în crame sau berării. Folosind modelul său de învățare automată, David a replicat cu exactitate predicțiile cu privire la drojdia Saccharomyces eubayanus, care a fost descoperită recent în Dublin, Irlanda.

„Această specie era cunoscută că există în Europa, deoarece este folosită pentru fabricarea berii acolo. fusese izolat doar din Tibet și Patagonia, dar în urmă cu doi ani a fost găsit în Irlanda și modelul meu, care nu avea niciunul dintre acele izolate din Dublin, încă îl identifică ca un loc în care ar putea fi găsit. acești validatori externi.”

David și Pennell vor urmări această activitate atât în ​​laboratoarele Vanderbilt, cât și în cele ale USC. Potrivit lui Pennell, „Urmărim prin investigarea dacă duplicarea genelor ar fi putut facilita inovații evolutive în tipul de surse de hrană pe care drojdia este capabilă să trăiască – ceea ce în cele din urmă va dicta locul în care pot trăi.

„Cred că experiența grupurilor mele o completează cu adevărat pe cea a grupului lui Antonis și este foarte interesant să lucrăm împreună la acest proiect mare și ambițios – și anticipez că vom continua să colaborăm înainte de asta.”

Acest proiect a fost realizat în colaborare cu proiectul Y1000. Acest proiect în curs de desfășurare își propune să secvențeze și să analizeze genomurile tuturor speciilor de drojdie cunoscute din subfilul Saccharomycotina. Această întreprindere masivă va avea ca rezultat primul catalog cuprinzător al diversității genetice și funcționale pentru orice astfel de rang taxonomic.

Prin studierea genomului a peste 1.000 de specii de drojdie, cercetătorii speră să obțină perspective asupra evoluției diverselor lor. funcții metabolice și ecologice.

(Fluierul)

Inapoi