01:55
Comentarii Adauga Comentariu

_ Descoperirea microbilor unici simplificată cu noua platformă software

_ Descoperirea microbilor unici simplificată cu noua platformă software

Microbii sunt esențiali pentru viața pe Pământ. Aceste organisme minuscule joacă un rol major în orice, de la transformarea luminii solare în moleculele fundamentale ale vieții. Ele ajută la producerea multor oxigen din atmosfera noastră. Ei chiar ciclează nutrienții între aer și sol. Oamenii de știință găsesc în mod constant interacțiuni între microbi și plante, animale și alte forme de viață macroscopice.

Pe măsură ce secvențierea genomică a avansat, cercetătorii pot investiga nu numai microbii izolați, ci și comunitățile întregi de microorganisme, cunoscute sub numele de microbiomi. asupra ADN-ului găsit într-un mediu. Genoamele extrase din aceste comunități (secvențe metagenomice) pot identifica organismele care desfășoară procese biogeochimice, contribuie la sănătate sau boli în microbiomii gastrointestinali umani sau interacționează cu rădăcinile plantelor din rizosferă.

Departamentul de Energie. Systems Biology Knowledgebase (KBase) a lansat recent o suită de caracteristici și un protocol pentru efectuarea unei analize sofisticate a microbiomului care poate accelera cercetarea în ecologia microbiană.

Adoptarea pe scară largă a secvențierii ADN în microbiologie a generat cantități uriașe de date genomice. . Cercetătorii au nevoie de instrumente de calcul pentru a recupera genomi de înaltă calitate din probe de mediu pentru a înțelege ce organisme trăiesc într-un mediu și cum ar putea interacționa. Combinația de instrumente de utilizare, date și bioinformatică într-o resursă online publică face din KBase o platformă web unică puternică pentru îndeplinirea acestei sarcini.

Aceste noi caracteristici ale KBase vor permite biologilor să obțină genomuri din secvențe de microbiom cu ușurință. -software de utilizare alimentat de resursele de calcul ale Departamentului de Energie. Acest lucru va reduce timpul necesar procesării datelor de secvențiere și caracterizarii genomilor. Oamenii de știință pot folosi KBase pentru a analiza în colaborare datele genomice și pentru a construi comunități de cercetare pentru a rezolva probleme comune în ecologia microbiană.

Obținerea genomilor microbilor necultivați direct din mediu folosind secvențierea ADN-ului este un progres recent care permite oamenilor de știință să descopere și caracterizează organisme noi. Secvențierea ADN-ului tuturor microbilor dintr-un mediu dat produce un „metagenom”. Efectuarea analizei genetice a metagenomului a apărut ca o modalitate de a explora trăsăturile și comportamentele microbiene și interacțiunile comunității într-un context de mediu.

Metodele de obținere a genomilor asamblați în metagenom (MAG) au grade diferite de succes, în funcție de tehnici folosite. Un număr tot mai mare de cercetători generează secvențe de microbiom, dar mulți nu au acces imediat la expertiza, instrumentele și resursele computaționale necesare pentru extragerea, evaluarea și analiza genomului lor.

Echipa KBase a adăugat și a actualizat mai multe instrumente de analiză a metagenomului, tipuri de date și capacități de execuție pentru a oferi cercetătorilor instrumentele care accelerează descoperirea genomurilor microbiene și descoperă potențialul genetic al comunităților microbiene.

Recenta lor lucrare din Nature Protocols prezintă o serie de pași de analiză. , folosind aplicații KBase și produse de date pentru extragerea MAG-urilor de înaltă calitate din metagenom. Aceste capabilități, inclusiv calcularea, stocarea datelor și partajarea datelor și analizelor, sunt oferite publicului gratuit prin intermediul platformei web KBase. Acest protocol permite oamenilor de știință să genereze genomi presupusi din organisme care se găsesc numai în mediu și să le analizeze cu instrumente pentru a înțelege cine sunt, ce fac, cu cine interacționează și rolul lor în ecosistem.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Procesul Gwyneth Paltrow REZUMAT: Antrenorul de schi al actriței susține că „nimeni nu era inconștient” după accidentul din 2016

_ Jameela Jamil îmbracă un ansamblu PVC negru cu iubitul James Blake

_ Chelsea „se confruntă cu o uriașă liberă de vară pentru a echilibra registrele financiare”

_ Gemenii Cavinder din Miami dezvăluie că au jucat prin „problemele de sănătate ale familiei” în timpul nebuniei din martie

_ Franţa şi Serbia câştigă în deplasare în preliminariile EURO 2024

_ Sfaturile de curse ale lui Robin Goodfellow: Cele mai bune pariuri pentru marți, 28 martie

_ Audrey Hale, împușcatoarea școlii din Nashville, este o fostă elevă transgender care a complotat masacrul în detaliu

_ Mijlocașul lui Man City, Rodri, se pregătește să reaprindă lupta cu Scott McTominay când Spania se confruntă cu Scoția

_ Cumpărătorul Coles a plecat zgâriindu-se din cauza crizei legate de costul vieții „pâine care se micșorează”.

_ Comediantul canadian Laura Ramoso își bate joc de turiști după o călătorie în Australia și prăjește fraze australiane

_ Ultimul campion mondial al Australiei, Alan Jones, spune că Daniel Ricciardo nu va mai concura niciodată în Formula 1

_ Pink ajunge pe covorul roșu alături de copiii ei Willow Sage și Jameson Moon la Premiile iHeartRadio 2023

_ Montana Brown, însărcinată, dă o actualizare după ce a dezvăluit că a fost în spital

_ West Ham „ar putea să cumpere în sfârșit stadionul din Londra” printr-o nouă înțelegere

_ Singuraticul Paul Hogan primește o nouă închiriere pe măsură ce nepoata sa se mută în LA

_ MAFS: În interiorul „scandalului de sexting” se pregătește să zguduie evenimentul reuniunii

_ Ryan Prescott de la Coronation Street s-a întâlnit cu supraviețuitorii atacurilor cu acid înainte de a filma scene înfiorătoare

_ Proaspăt reales președinte la PMP, Eugen Tomac aruncă săgeți către PSD: Un candidat de stânga la prezidenţiale, şi dacă merge singur, va pierde

_ Nu este Robert Bruce: HENRY DEEDES urmărește discursul de victorie al lui Humza Yousaf

_ Atacantul lui Manchester City, Erling Haaland, este surprins folosind un telefon mobil în timp ce conducea Rolls-Royce-ul său

_ „Luis Enrique bifează această casetă”: Chris Sutton îl susține pe fostul șef al Spaniei să preia conducerea la Tottenham

_ Sophie Turner poartă un pulover maro cu soț Joe Jonas pentru o excursie de cumpărături la New York

_ MAFS: Hugo Armstrong este „livid” în legătură cu creșterea de 4.000 de urmăritori pe Instagram

_ Starul Love Island recunoaște că „nu se poate întoarce” la cariera ei după ce a jucat în show-ul plin de vitejie

_ BRIAN LAUDRUP: Scoția va avea nevoie de o concentrare aproape impecabilă pentru a-l anula pe Alejandro Balde

_ Kendall Jenner afișează un dormitor sexy într-o rochie tricou transparentă, promovând colaborarea cu FWRD

_ CÂȘTIGĂTORII Premiilor iHeart Radio Music Awards 2023: Doja Cat este cel mai jucat artist al anului

_ Vedeta de la OnlyFans, Anna Paul, spune că Emma Watson a refuzat să facă selfie cu ea la concertul lui Taylor Swift

_ Aproape 50 de dispăruți și 7 morți într-o alunecare de teren în sudul Ecuadorului

_ Oamenii de știință găsesc noi indicatori ai dezghețului permafrostului din Alaska

_ Kate și Camilla se bucură de prânz la Palatul Buckingham cu Charles pentru guvernatorii generali ai Commonwealth-ului

_ Biden declară dezastru în California, în timp ce ploile abundente continuă

_ Curtis Jones va începe în fața Angliei U21 împotriva Croației

_ Gareth Bale va primi o prezentare pe teren și va primi rămas bun de la fanii din Țara Galilor înainte de meciul din Letonia

_ Reporterul AFL Caroline Wilson, criticat pentru interpretarea „rușinoasă” asupra lui Alastair Clarkson din North Melbourne

_ Moment încălzitor Tones și cu mine îi facem cadou primei ei geanți de designer de ziua ei

_ Taylor Swift va juca cu cea mai mare audiență de până acum la MCG, în timp ce se blochează în turneul australian pentru începutul anului 2024

_ Întorsătura de pe Coronation Street dezvăluie o victimă șocantă a atacului cu acid al lui Justin

_ Vedeta Australian Idol, Kate DeAraugo, vorbește despre dependența ei de gheață

_ Gimnastul Shawn Johnson dezvăluie că copiii ei au trebuit să intre în izolare din cauza împușcăturii la școală din Nashville

_ Ultimul sezon al lui Succession este lăudat universal, deoarece criticii britanici aplaudă scrisul „fără cusur”.

_ Michelle Keegan arată elegantă în rolul asistentei Kate în viitoarea dramă BBC Ten Pound Poms

_ MAFS: Afacerea online a lui Adam Seed se prăbușește cu doar 722 USD în vânzări

_ Brian Cox este încântat să le spună fanilor să „f**k off” după Succession

_ Selena Gomez și Zayn Malik „au avut ceva” cu ani înainte de presupusa lor întâlnire la cină

_ Gimnastul Shawn Johnson dezvăluie că copiii ei au trebuit să intre în izolare din cauza împușcăturii la școală din Nashville

_ Ultimul sezon al lui Succession este lăudat universal, deoarece criticii britanici aplaudă scrisul „fără cusur”.

_ Mireasa MAFS Tahnee arată de nerecunoscut cu părul viu colorat

_ Nicole Scherzinger își arată fizicul incredibil

_ Astăzi, cititorul de știri Brooke Boney, în vârstă de 35 de ani, îl pierde încercând să spună „Uranus” la televizor

_ Jackie 'O' Henderson a fost zguduită de un jaf la casa ei de 13 milioane de dolari din Sydney

_ Married at First Sight Gluma șocantă a lui Harrison Boon care nu a fost difuzată la televizor

_ Bronte Schofield de la MAFS îl aruncă pe Harrison Boon înaintea reuniunii explozive

_ Taylor Swift are șapte albume clasate în primele 40 din topul Billboard 200

_ Daisy May Cooper recunoaște că a avut „orori” după gafa ei de pe scenă cu gluma cu cocaina Sugababes

_ Nicolas Cage nu a rupt niciodată personajul ca Dracula pe platourile de filmare ale noului său film Renfield

_ Vedeta Australian Idol, Kate DeAraugo, vorbește despre dependența ei de gheață

_ ONU alarmată de creșterea violenței în estul RD Congo

_ ONU alarmată de creșterea violenței în estul RD Congo

_ Israel judicial overhaul: 'Netanyahu is facing a constitutional crisis of unprecedented magnitude'


Pag.1 Pag.2 Pag.3

Nr. de articole la aceasta sectiune: 156, afisate in 3 pagini.