22:05
Comentarii Adauga Comentariu

_ Faceți cunoștință cu vecinii (de proteine): o nouă metodă permite cercetătorilor să detecteze proteinele în imediata apropiere în celulele individuale

_ Faceți cunoștință cu (proteina ) vecini: o nouă metodă permite cercetătorilor să detecteze proteine ​​în imediata apropiere în celule individuale

Astăzi, majoritatea metodelor de determinare a proteinelor din interiorul unei celule se bazează pe un recensământ brut — oamenii de știință de obicei macină un grup mare de celule înainte de a caracteriza materialul lor genetic. Dar, așa cum o populație de 100 de persoane singure diferă în multe privințe de o populație de 20 de gospodării de cinci persoane, acest tip de descriere nu reușește să capteze informații despre modul în care proteinele interacționează și se adună împreună în grupuri funcționale.

Acum, cercetătorii de la Școala Pritzker de Inginerie Moleculară (PME) de la Universitatea din Chicago au dezvoltat o abordare care le permite să studieze mai ușor dacă proteinele sunt situate în imediata apropiere unele de altele în interiorul unei celule. Tehnologia, care poate fi realizată în același timp cu secvențierea genelor de rutină, este descrisă în jurnalul Nature Methods.

„Acesta este o modalitate raționalizată și de mare capacitate de a analiza funcțiile proteinelor în interiorul individului. celule”, a spus Savas Tay, profesor de inginerie moleculară și autor principal al noii lucrări. „Cred că această metodă va fi o resursă majoră pentru comunitatea de biologie moleculară.”

Concentrat pe funcție

În ultimii ani, odată cu apariția tehnologiilor de secvențiere genetică rapide și ieftine , oamenii de știință au apelat la secvențierea ARNm cu o singură celulă pentru a obține instantanee ale stărilor interne ale celulei. Prin secvențierea tuturor moleculelor de ARNm ale unei celule - care codifică proteine ​​- își pot face o idee despre proteinele pe care o celulă le-ar putea folosi în mod activ. Dar acest tip de proxy pentru abundența proteinelor nu transmite întreaga poveste.

„Doar cunoașterea abundenței anumitor proteine ​​nu vă oferă întotdeauna informații despre modul în care funcționează o celulă”, a spus Tay. „Adesea, dacă proteinele sunt sau nu active funcțional are de-a face nu doar cu faptul că sunt prezente, ci și cu faptul că formează complexe.”

Tay a vrut să surprindă dacă proteinele sunt fizic aproape una de cealaltă – și face acest lucru într-un mod rapid, de mare capacitate, nu bazându-se pe microscopie pentru a le vizualiza locațiile sau izolarea câtorva proteine ​​la un moment dat pentru o inspecție mai atentă.

El și colegii săi au dezvoltat sonde moleculare care se atașează la proteinele de interes și au etichete ADN care se extind spre exterior. Dacă două proteine ​​sunt fizic aproape una de cealaltă, acele sonde ADN se lipesc împreună ca Velcro. Cercetătorii pot pune la punct experimente care sonda simultan sute de proteine ​​în acest fel. Apoi, folosesc metode de secvențiere de rutină pentru a citi înapoi orice sonde ADN care s-au legat între ele și pentru a determina care proteine ​​au fost împerecheate.

„În spațiul vast din interiorul unei celule, este foarte puțin probabil ca două sonde să găsească. unul pe altul, cu excepția cazului în care sunt legați de proteinele din apropiere”, a spus Tay. „Deci, atunci când sondele se leagă, asta ne spune că aceste proteine ​​sunt foarte apropiate între ele.”

Deoarece abordarea, numită Prox-seq, folosește secvențierea standard, cercetătorii pot analiza mARN-ul unei celule în același timp cu proteine ​​de interes, pentru a ajuta la răspunsul la întrebările despre corelația dintre ARNm și abundența și funcția proteinelor.

Studii de probă de concept

Pentru a ilustra utilitatea Prox-seq, echipa lui Tay l-a testat mai întâi pe celulele B și celulele T, două subseturi de celule imunitare umane. Tehnica, au descoperit ei, ar putea diferenția celulele exclusiv pe baza interacțiunilor proteină-proteină prezente în fiecare tip de celulă. De asemenea, ar putea identifica subseturi necunoscute anterior de celule pe baza unor mici diferențe în modul în care grupurile de proteine ​​au fost organizate în celule. Folosind celule mononucleare din sângele periferic uman, au măsurat simultan 38 de proteine ​​individuale, 741 de complexe proteice și mii de ARNm pe fiecare celulă individuală și au descoperit un nou complex proteic care definește celulele T naive.

Apoi, grupul a folosit Prox-seq pentru a studia modul în care proteinele își schimbă aranjamentul în macrofage, un alt tip de celulă imunitară, atunci când celulele devin activate ca răspuns la un agent patogen. Încă o dată, au identificat atât perechi cunoscute de proteine ​​care interacționează, cât și noi grupuri de proteine ​​care pot fi folosite pentru a identifica nu numai dacă un macrofag a fost activat, ci și la ce tip de agent patogen a fost expus.

„Acest lucru a arătat că metoda noastră nu numai că poate verifica complexe proteină-proteină despre care știam deja, dar poate găsi noi interacțiuni între proteine”, a spus Tay.

Până acum, cercetătorii au testat doar metoda asupra proteinelor găsite pe suprafața celulelor; acum lucrează pentru a-l extinde la mai multe tipuri de proteine, pe măsură ce dezvoltă modalități de a rezolva exact unde interacționează proteinele din interiorul unei celule.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Ce să știți despre marele cutremur care a lovit Turcia și Siria

_ Oamenii de știință găsesc noi indicatori ai dezghețului permafrostului din Alaska

_ Și acum Deflația alimentelor? Gigantul alimentar american Tyson se prăbușește în scăderea cărnii de vită, a prețurilor la pui, în scăderea cererii de carne de porc

_ Marea Britanie urmează să găzduiască una dintre grupele finale ale Cupei Davis în septembrie

_ Larsa Pippen, 48 de ani, și Marcus Jordan, 32 de ani, CONFIRMĂ dragostea în timp ce împărtășesc un sărut pasional

_ Leonardo DiCaprio, 48 de ani, petreceri cu o grămadă de frumuseți pe fondul unei noi relații de dragoste cu Victoria Lamas, 23 de ani

_ Bucanciosul TikTok din Las Vegas strânge zeci de mii de dolari pentru restaurantele cu probleme

_ Bine ați venit în Spirala Morții

_ Boeing 737 se prăbușește în timp ce lupta împotriva incendiilor în Australia

_ Leonardo DiCaprio își arată mișcările de dans într-un lounge într-o excursie la Miami în TikTok viral

_ Larsa Pippen arată curbe într-un top cu corset în timpul cinei cu Marcus Jordan și prietenii din Miami

_ Am o amendă pentru Dart Charge de 13.000 lire sterline - ce pot face?

_ Show - George Simion a cerut moment de reculegere, la moțiunea împotriva lui Bode: Pentru anii în care era decență (Video)

_ Un cutremur puternic de 7.8 grade a zguduit centrul Turciei şi Siria. LIVE UPDATE: Peste 1.500 de persoane au decedat. Nou cutremur de 7.7 grade. 13 ţări membre UE trimit echipe de căutare şi salvare în Turcia

_ Kelly Rowland emană farmec într-o minirochie albă uluitoare în noi fotografii de la brunch-ul Roc Nation

_ Germania ia în considerare redirecționarea subvențiilor „verzi” împotriva cărbunelui către producția de arme

_ Phoenix Suns 'sunt gata să-l urmărească pe Kevin Durant dacă va deveni disponibil' după ce Nets l-a schimbat pe Irving

_ Site-ul de producție de drone proiectat de Iran va fi construit în interiorul Rusiei

_ Cum au reușit „nevaccinatul“

_ Insula Iubirii 2023: Telespectatorii sunt isteric în timp ce concurenții se luptă cu vânturile puternice în vilă

_ FTX cere ca banii trimiși donatorilor politici să fie returnați � dar suma reală de bani spălați politicienilor este �ncă necunoscută

_Norizo Ro - 06 Feb 2023 12:59:02

_ EXCLUSIV: Aceeași persoană care a dezamăgit că Obama �l spiona pe Trump este aceeași persoană care a supravegheat unitatea DoD care a trimis 23 de milioane de dolari către Hunter�s Metabiota

_4 Media Info - 06 Feb 2023 15:43:29

_Gold FM Romania - 06 Feb 2023 11:47:23

_ Dan Evans debutează la dublu ca loc de carte al Marii Britanii în finala Cupei Davis

Ce să mai zici? Papa Francisc: 'Oamenii cu înclinații homosexuale sunt copii ai lui Dumnezeu. Dumnezeu îi iubește și îi însoțește!'

_ Cum vei nota la testul nostru de ortografie a numelui celebrităților?

_ Gheață „cântând”: ascultați sunetele „extraterestre” de la polii Pământului

_ Femeia întreabă dacă sexul anal are nevoie de un acord special

_ Studiul aruncă lumină asupra filmelor Janus pe bază de carbon

_ Așteptări mari PRIMA UITARE: Olivia Colman arată de NERECONOSCĂTOARE cu părul alb și dinții galbeni

_ Numărul mic de fani ai lui Manchester United pleacă devreme în protestul lui Glazers

_ Bursa de la Bucureşti a închis în creştere şedinţa de luni

_ Stella Maxwell se alătură Lanei Del Ray și Laura Dern la petrecerea de după Grammy a lui Taylor Swift

_ Flying Motorcycle SPAC se prăbușește cu 55%

_ Adani Group reduce cheltuielile de investiții, fondatorii plătesc în avans împrumuturile, vânzarea de obligațiuni este suspendată pentru a restabili încrederea

_ Judecătorul federal stabilește că interzicerea armelor pentru consumatorii de marijuana este neconstituțională

_ Paige Thorne din Love Island „se întâlnește cu fotbalistul din Swansea City, Liam Cullen”, după despărțirea lui Adam Collard

_ Starul de reality TV Stephen Bear este dus înapoi în instanță într-un litigiu de planificare cu consiliul

_ Steve Barclay avertizează că grevele fără sfârșit ale NHS au un impact teribil asupra pacienților

_ Misiune de recuperare navală în curs de desfășurare pentru a găsi resturile de baloane de spionaj chinezești

_ Insula Iubirii: Ron insistă că „cartea este închisă” cu Lana după ce a ales-o pe Casey în ultima recuplare

_ Futures, bursele globale scade, dolarul crește din cauza tensiunilor în creștere dintre SUA și China, perspectiva Fed

_ Deputies Chamber/Motion/Catalin Drula: It's a shame that we have Lucian Bode as Minister of Interior

_ Ben Affleck devine din nou meme, pe măsură ce expresia sa dezinteresată de la Grammy îi lasă pe fani isterici

_ Turcia și-a oprit operațiunile la terminalul petrolier Ceyhan după un cutremur uriaș

_ Molly Sims, în vârstă de 49 de ani, își etalează corpul de bikini într-o piesă slăbită

_ Casa de discuri Big Hit Music a BTS depune un proces împotriva trolilor online care atacă grupul K-Pop

_ Încărcarea Man City LIVE: Ultimele deduceri de puncte în Premier League

_ Sofia Richie își îmbină logodnicul Elliot Grainge la dușul de nuntă

_ Claire Sweeney renunță la sala în favoarea de a avea floricele de porumb la cinema

_ Poți înscrie de pe bancă zilele acestea cu VAR...10 lucruri pe care le-am învățat de la LaLiga

_ Kate Middleton zâmbește în timp ce pozează cu studenții după ce a luat parte la lecția de artă

_ Cum marea inundație a Mării Nordului din 1953, acum 70 de ani, a dus astăzi la Bariera Tamisa

_ După cutremurele devastatoare, Turcia e lovită și de un val de frig: Sunt anunțate și ninsori

_ Vanessa Feltz pleacă la brunch după despărțirea de Ben Ofoedu, în timp ce acesta rupe tăcerea

_ Mic asteroid detectat „în mod întâmplător” folosind telescopul James Webb

_ Punctele fierbinți ale atacurilor de rechini din lume DEZVATE: Harta arată zonele cu cele mai multe întâlniri în 2022

_ Mama condamnată la închisoare pentru că a mințit poliția când fiul a împușcat Rhys Jones a primit nouă luni de închisoare


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9

Nr. de articole la aceasta sectiune: 540, afisate in 9 pagini.