16:01
Comentarii Adauga Comentariu

_ Enzimă veche de 2 miliarde de ani reconstruită: munca de detectiv realizată de biologi moleculari și cercetători în bioinformatică

_ 2- Enzimă veche de miliarde de ani reconstruită: Lucrări detective ale biologilor moleculari și cercetătorilor în bioinformatică

Cercetătorii de la Universitatea Leipzig au rezolvat un puzzle în evoluția enzimelor bacteriene. Reconstituind un candidat pentru o ARN polimerază specială, așa cum exista cu aproximativ 2 miliarde de ani în urmă, ei au reușit să explice o proprietate uluitoare până acum a enzimelor moderne corespunzătoare.

Spre deosebire de strămoșii lor, ei nu funcționează continuu și sunt astfel semnificativ mai eficiente — aceste pauze în activitate constituie progres evolutiv. Reconstituirea proteinei din timpurile preistorice a fost posibilă datorită cooperării interdisciplinare dintre biochimia moleculară și bioinformatică.

Descoperirile cercetării au fost publicate în revista Molecular Biology and Evolution. Enzimele studiate sunt ARNt nucleotidiltransferaze: enzime care atașează trei blocuri de construcție nucleotide din secvența C-C-A la ARN-uri mici din celulă (așa-numitele ARN de transfer), astfel încât acestea să poată furniza ulterior aminoacizi pentru sinteza proteinelor.

Prin reconstrucții filogenetice, o echipă de cercetători condusă de profesorul Mario Mörl (Biochimie) și profesorul Sonja Prohaska (Bioinformatică) a reconstruit un candidat pentru o astfel de enzimă ancestrală așa cum a existat în bacterii cu aproximativ 2 miliarde de ani în urmă. Echipa de cercetare a comparat apoi proprietățile ARN polimerazei reconstruite cu cele ale unei enzime bacteriene moderne.

Ambele enzime funcționează cu o precizie similară, dar prezintă diferențe clare în ceea ce privește reacția. Până acum, nu a fost posibil să se recunoască tendința enzimelor moderne de a-și întrerupe activitatea în mod repetat ca un avantaj evolutiv. Acest fenomen i-a nedumerit pe biochimiști de zeci de ani. Numai în comparație cu modul de activitate al enzimei reconstruite, misterul a fost acum rezolvat.

Enzima ancestrală este procesivă, adică funcționează fără întrerupere, dar din când în când elimină nucleotidele. blocuri de construcție care au fost deja adăugate corect. Rezultatele arată că se pot învăța multe despre evoluția și proprietățile enzimelor moderne din reconstrucțiile enzimatice și că multe întrebări pot fi rezolvate doar prin interacțiunea dintre bioinformatică și biochimie — într-un dus și înapoi între calculele computerizate și experimentele de laborator.

În trecut prin urmărirea relațiilor

Folosind secvențe de gene, arbori filogenetici evolutivi pot fi, de asemenea, creați din bacterii. Pornind de la marea diversitate de organisme de astăzi dintr-un arbore de specii, calea evolutivă a genelor individuale poate fi reconstruită de-a lungul relațiilor și ramurilor și poate fi urmărită cu minuțiozitate înapoi la o origine comună.

Reconstituirea este, în esență, în trei etape. proces. În primul rând, bazele de date sunt căutate pentru enzimele moderne corespunzătoare pentru a putea examina secvența blocurilor de construcție a aminoacizilor. Secvențele obținute pot fi apoi folosite pentru a calcula cum ar fi trebuit să arate secvența originală. Secvența de genă corespunzătoare care codifică vechea enzimă este apoi introdusă în bacteriile de laborator, astfel încât acestea să formeze proteina dorită. Enzima poate fi apoi studiată în detaliu pentru a-i determina proprietățile și comparată cu enzimele moderne.

„Când a venit știrea din laborator că enzima reconstruită efectuează adăugarea C-C-A și o face chiar și într-un mod mai larg. interval de temperatură decât enzimele de astăzi, acesta a fost descoperirea”, își amintește Sonja Prohaska.

Optimizare evolutivă: pauzele în activitate cresc eficiența

Ca și organismele, enzimele sunt, de asemenea, optimizate prin evoluție. Lucrarea (cataliza) efectuată de o enzimă se desfășoară, de obicei, mai repede și mai bine, cu atât mai puternică își poate lega substratul. Enzima ancestrală reconstruită face exact asta, se ține de substrat, ARNt, și atașează cele trei nucleotide C-C-A una după alta, fără a renunța.

Nucleotidiltransferazele moderne de ARNt, pe de altă parte, sunt distributive. , adică lucrează în etape cu pauze în timpul cărora își eliberează în mod repetat substratul. Cu toate acestea, ei sunt mai eficienți și mai rapidi decât predecesorii lor ancestrali. Acest lucru i-a nedumerit pe cercetători. De ce enzimele moderne continuă să renunțe la substratul lor?

Explicația constă în fenomenul reacției inverse, în care nucleotidele încorporate sunt îndepărtate din nou de enzimă. În timp ce legarea puternică a enzimei ancestrale de substrat are ca rezultat îndepărtarea ulterioară, reacția inversă în enzimele moderne este aproape complet împiedicată prin eliberarea substratului. Acest lucru le permite să lucreze mai eficient decât predecesorii lor.

„Am reușit în sfârșit să explicăm de ce nucleotidiltransferazele moderne de ARNt funcționează atât de eficient în ciuda naturii lor distributive”, spune Mario Mörl. "Descoperirea ne-a luat complet prin surprindere în echipă. Nu ne așteptam la așa ceva. Am avut întrebarea în urmă cu 20 de ani și acum îi putem răspunde în sfârșit folosind metode de reconstrucție bioinformatică. Această cooperare strânsă între bioinformatică și biochimie a existat în Leipzig de câțiva ani și s-a dovedit, nu pentru prima dată, a fi un mare avantaj pentru ambele părți.”


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ EPHRAIM HARDCASTLE: Întrebare de încoronare pentru Dominic Raab

_ Super Bowl LVII: Cele 10 mari puncte de discuție pe măsură ce crește entuziasmul pentru confruntarea din Arizona

_ Azerbaidjanul poate livra Europei energie pentru un secol

_ Olivia Attwood pune un ecran elegant într-un trenci alb clar la Institutul Regenerativ

_ Prestigioasa organizație liberală de pază condamnă reportajul Russiagate al New York Times

_ AMD se adună după bataile de top și de jos, prognoză în linie

_ Ivermectina: Distribuția la nivel de populație ar fi putut împiedica recenta epidemie de COVID în masă din China?

_ Putin nu va îndrăzni să folosească arme nucleare asupra Ucrainei, susține consilierul Zelensky

_ Kamala Harris, oficiali seniori Biden, vor participa miercuri la funeraliile Tire Nichols; Gazda MSNBC Al Sharpton va face elogii

_ Nottingham Forest finalizează semnarea portarului Paris Saint-Germain Keylor Navas

_ Graham Arnold dezvăluie singurul lucru care l-ar fi convins să renunțe din funcția de antrenor Socceroos

_ Review ASRock Z790 Livemixer: unic și accesibil

_ Tyson Fury susține că Tommy trebuie să devină antrenorul personal al lui Cristiano Ronaldo dacă pierde în fața lui Jake Paul

_ Keanu Reeves dezvăluie că Constantine 2 s-a întâmplat în sfârșit, după ce a „pătruns” Warner Bros.

_ SUA acuză încă patru pentru asasinarea președintelui haitian

_ Mijlocașul de la Sydney FC, Anthony Caceres, îi laudă pe fani pentru că au stabilit un nou record și se deschide despre jocul „ciudat”

_ Tickets for 2023 edition of Enescu Festival on sale as of February 1

_ Southampton mutări complete pentru extrema Rennes Kamaldeen Sulemana și atacantul Genk Paul Onuachu

_ Artistul de machiaj lansează cel mai bine vândut produs de curățat perii, care scapă de murdăria și murdăria de ANI.

_ Expertul lui Debrett în etichetă privind regulile de lucru în 2023 - de la WFH la birou

_ Nicola Peltz și Brooklyn Beckham au trecut prin trei organizatori de nuntă, dezvăluie noile documente ale curții

_ Biden promovează un Hummer EV care poluează mai mult decât sedanul alimentat cu gaz

_ Coridorul comercial „Probabil” al Rusiei către India îi frustrează pe neoconservatori

_ „Pharma, MSM, Tech, Intel, Zelensky, OMS, Deep State lucrează împreună pentru a acoperi armele biologice din Ucraina”

_George Simion - 01 Feb 2023 06:11:00

Cum se facturează consumul de energie începând cu 1 ianuarie 2023

_Gold FM Romania - 31 Jan 2023 21:23:52

_Gold FM Romania - 31 Jan 2023 21:22:16

_Gold FM Romania - 31 Jan 2023 22:12:35

_ Șefii DC Studios neagă că l-ar fi declanșat pe Henry Cavill ca Superman și spun că nu a fost niciodată ales

_ Asistenta de asistenta medicala dezvaluie ca isi impleteste servetele McDonald's intre degetele de la picioare pentru a dormi mai bine

_ Marea Britanie se va confrunta cu cea mai mare grevă din ultimii ani, deoarece profesorii, funcționarii publici, mecanicii de tren își încetează munca

_ Marea Britanie refuză Kievul: 'Nu este practic să trimitem Ucrainei avioane de luptă Typhoon şi F-35'

_ FM italian avertizează ambasadele riscând atacuri din partea anarhiștilor internaționali

_ WTI deține câștiguri după ce API-ul raportează creările de inventar la nivel global

_ Cum s-a intersectat războiul din Ucraina cu războaiele culturale (Financial Times)

_ Detaliul ascuns al etichetei de preț care vă va costa bani la Kmart

_ Big-Tech, Bitcoin și Bullion Cel mai bun ianuarie din ultimele decenii; Curba randamentului se prăbușește pentru a înregistra inversia

_ 3.000 de întreruperi de zbor au lovit SUA în timp ce furtuna de gheață mătură statele din sud

_ Criminalitatea din Chicago a crescut cu 61% în 2023, infracțiunile cu violență cresc în timp ce guvernatorul insistă ca infracțiunile să „code”

_ Leicester City îl semnează pe starul Socceroos Harry Souttar cu o afacere de 26 de milioane de dolari de la Stoke City

_ Decese mari prin boli de inimă și vene la persoanele cu vârsta între 25 și 44 de ani

_ Cererea de cutii de carton a scăzut la rate nevăzute de la Marea Recesiune

_ China intenționează să vândă drone letale Blowfish Talibanilor: raport

_ „Nu am găsit nicio utilizare abuzivă a fondurilor americane în Ucraina”, spune Trezoreria SUA (cu fața dreaptă)

_ Electric car sales gain pace despite hurdles

_ Începutul valului de faliment? Depozitele firmelor mari au ajuns la nivelurile din 2010

_ Equalution: CEO-ul Nutrition, care a pierdut 27 kg, dezvăluie ce mănâncă într-o zi pentru pierderea în greutate

_ Bucharest Court: Alexandru Piturca, Romarm director Tutu to be investigated under court supervision

_ Telespectatorii Insula Iubirii laudă „cel mai bun episod din toate timpurile” după o serie de rânduri explozive și recuplări de întrebări

_ Lunch Lady, arestată pentru că a furat aripi de pui în valoare de 1,5 milioane de dolari de la școlile din Illinois „cu venituri mici”

_ CRINGE: Kamala Harris a fost prăjită pentru descrierea ei a lansării în spațiu a astronauților (VIDEO)

_ The Last Us provoacă o creștere a fluxurilor Spotify pentru Long Long Time a Lindei Ronstadt

_ Oamenii de știință găsesc noi indicatori ai dezghețului permafrostului din Alaska

_Gold FM Romania - 31 Jan 2023 22:09:23

_ Casa comună din Sydney a starului Australia’s Got Talent, Jack Vidgen, este infestată de șobolani

_ Tottenham CONFIRMĂ semnarea de 42 de milioane de lire sterline a lateralului Pedro Porro de la Sporting Lisabona

_ Wayne Rooney spune că Everton nu l-a sunat niciodată pentru a deveni manager înainte de a-l angaja pe Sean Dyche

_ Termenul limită pentru transfer RECUPERAȚI: Enzo Fernandez finalizează mutarea la Chelsea, Man Utd îl semnează pe Marcel Sabitzer

_ Nikki Haley urmează să anunțe oferta pentru Casa Albă pentru 2024


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16

Nr. de articole la aceasta sectiune: 916, afisate in 16 pagini.