20:04
Comentarii Adauga Comentariu

_ Genomes OnLine Database introduce noi caracteristici

_ Genomes OnLine Baza de date introduce funcții noi

De la lansarea sa, acum 25 de ani, baza de date Genomes OnLine (GOLD) s-a maturizat de la șase proiecte pe o foaie de calcul într-un depozit de metadate genomice emblematice, făcând disponibile gratuit metadatele microbiomului care urmează standardele comunității. și să permită inițiative de analiză genomică comparativă la scară largă.

GOLD nu numai că organizează proiecte de secvențiere desfășurate la Joint Genome Institute (JGI) al Departamentului de Energie al Statelor Unite ale Americii (DOE), o facilitate pentru utilizatori DOE Office of Science situată la Lawrence Berkeley National Laboratory (Berkeley Lab), dar și cele importate din arhivele publice, precum și datele de proiect introduse de utilizatori externi.

Impact

Una dintre provocările semnificative în maximizarea utilizării datelor genomice înseamnă a avea informațiile contextuale adecvate, sau metadatele, stocate împreună cu acestea. GOLD oferă resurse de metadate selectate manual pentru organisme și mostre de mediu. Baza de date reunește metadate relevante din diverse surse și aplică o schemă de etichetare standardizată pentru a defini mai bine informațiile genomice și ecosistemele.

Aceste date selectate sunt accesibile pe portalurile de date JGI, inclusiv Integrated Microbial Genomes & Microbiomes (IMG/M). ), îmbunătățind adnotările genomului și promovând analizele comparative ale genomului. GOLD își propune să urmeze principiile datelor FAIR pentru a se asigura că activele digitale sunt găsibile, accesibile, interoperabile și reutilizabile.

Rezumat

GOLD preia mostre procesate la JGI, introduse de utilizatori externi și cele importate. din depozitele publice și tratează informațiile prin aplicarea standardelor dezvoltate de comunitate. GOLD sprijină, de asemenea, o gamă largă de activități, de la primirea de propuneri până la publicare. Informațiile sunt, de asemenea, obținute și verificate încrucișat cu resurse publice, inclusiv NCBI Taxonomy și diverse colecții de cultură, cum ar fi Colecția Americană de Cultură de Tip și Institutul Leibniz DSMZ. GOLD își aplică denumirea standardizată pentru toate mostrele de mediu și este singura resursă din lume cu aproape 200.000 de mostre de mediu curate cu nume canonice.

De la lansarea sa în 1997, utilizatorii activi GOLD au stimulat creșterea sa și dezvoltarea continuă de noi componente și capacități. Cele mai recente îmbunătățiri includ funcții noi, cum ar fi un API public și o pagină de destinație a ecosistemului, precum și creșterea diferitelor entități, prezentate în continuare în revista Nucleic Acids Research.

Unul dintre punctele forte ale GOLD a fost implementarea standardelor de metadate. pentru toate entitățile din sistem. Grupul de standarde genomice al JGI, care gestionează GOLD, comunică personal cu cei care au solicitat pentru a rezolva orice neconcordanțe. În timp ce în trecut, GOLD se baza pe câmpuri de text liber, acum folosește vocabulare controlate cu câmpuri bazate pe unități, cum ar fi adâncimea și altitudinea înregistrate în unități fixe de metri, temperatura în centigrade și multe altele.

Cele patru niveluri. Sistemul de organizare a proiectelor implementat în GOLD este alcătuit din: Studii, Bioproba/Organisme, Proiecte de secvențiere și Proiecte de analiză. Fiecare dintre aceste entități este organizată cu o gamă largă de metadate. GOLD aplică o clasificare a ecosistemelor pe cinci niveluri tuturor probelor de mediu și organismelor ale căror informații de izolare sunt disponibile, permițând descoperiri științifice bazate pe metadate. Interfața publică de programare a aplicațiilor GOLD permite utilizatorilor să acceseze metadatele organizate în mod programatic, într-o manieră sigură și fiabilă.

Echipa JGI care gestionează GOLD lucrează deja îndeaproape cu alte două proiecte finanțate de DOE — National Microbiome Data Collaborative (NMDC) și DOE Systems Biology Knowledgebase (KBase) – și își propune să extindă aceste colaborări în procesul de conservare a metadatelor, stabilirea standardelor de metadate și schimbul de eșantioane de metadate.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Elon Musk NU se va alătura consiliului de administrație al Twitter: CEO-ul spune „Cred că acest lucru este cel mai bine”

_ Creșterea „mufăcăniei disociative”: influențerii poartă un aspect „cu fața moartă” pentru a părea detașați

_ William și Kate arată în formă de navă în timp ce își schimbă ținutele pentru a se îmbarca la bordul unui iaht la regata de vele

_ Inculpatul Harris � Achitat �n procesul Whitmer � A luat apărarea și a spus că credea că merge la bere �n noaptea �n care a fost arestat

_ Cum au reușit „nevaccinatul“

_ Economia SUA a pierdut de fapt 2,5 milioane de locuri de muncă �n ianuarie � Raportat ca un �c�știg� de 517.000

_ Mișcarea de secesiune face progrese în a convinge județele din estul Oregon să se separe de statul lor de trezire și să devină parte a Idaho

_ Vizualizarea marjelor de profit de neegalat ale Tesla

_ Imagini devastatoare apar după un cutremur cu magnitudinea de 7,8 în Turcia

_ Interdicția SUA asupra utilizatorilor de oală care dețin arme este considerată neconstituțională

_ Câștigătorul Grammy John Legend lansează o nouă platformă NFT pentru muzică și artă

Ce să mai zici? Papa Francisc: 'Oamenii cu înclinații homosexuale sunt copii ai lui Dumnezeu. Dumnezeu îi iubește și îi însoțește!'

_ Disney lansează emisiunea pentru copii �Proud Family� pentru copii � Radical Children�s Show �mpinge marxismul BLM, rasismul anti-alb și reparațiile (VIDEO)

_ Șapte puncte despre investiția în apele perfide

_ Carnea falsă eșuează: vânzările se prăbușesc dincolo de carne, alimente imposibile, deoarece 20% din personal au fost concediați

_ Proprietar �n v�rstă de 90 de ani al magazinului emblematic de bomboane din New York, bătut cu brutalitate de bandiți, arestați

_ Urmăriți: Hoții conduc prin mall într-un Audi negru furat după ce au jefuit un magazin de electronice

_ China reacționează cu „nemulțumire puternică” după ce SUA a doborât balonul spion

_ CIO Hedge Fund: „Balonul cu heliu al Chinei este o distragere a atenției: riscurile reale sunt în afara radarului”

_ Misiune indeplinita!

_ De ce 0DTE este atât de important și de ce VIX este acum lipsit de sens

_ O întoarcere la „Nebunia care plesnește capul”? Cântărețul miliardar al fondului speculativ avertizează că „piața ursului nu s-a încheiat încă”

_ Florence Pugh și Cate Blanchett câștigă la Critics' Circle Film Awards

_ Dale Moss spune că nu are „nimic decât dragoste” pentru fosta logodnică Clare Crawley după recenta căsătorie

_ Carnea falsă eșuează: vânzările se prăbușesc dincolo de carne, alimente imposibile, deoarece 20% din personal au fost concediați

_ „Este dezinformare”: Trump și foști oficiali reclamă raportul anonim despre baloanele spion chineze sub supravegherea lor

_ Site-ul de producție de drone proiectat de Iran va fi construit în interiorul Rusiei

_ Interviu istoric - Fostul premier al Israelului dezvăluie detaliile negocierilor Rusia-Ucraina: 'SUA, Germania și Franța au blocat acordul. Au fost 17 drafturi'

_ Premiile Grammy 2023: Anitta se prezintă într-o rochie neagră în cascadă cu texturi mixte

_ Premiile Grammy 2023: Sam Smith întoarce capetele în haină roșie de teatru în timp ce Kim Petras uimește în mini roșu

_ Keke Palmer le dorește fanilor săi o „duminică fericită din partea mea și a cucuiului” în timp ce își arată stomacul

_ Șefa UFC, Dana White, uită numele lui Islam Makhachev înainte de lupta UFC 284 împotriva lui Alex Volkanovski

_ Internetul din Italia a fost restabilit după o întrerupere la nivel național; Rapoarte despre un atac global ransomware

_ Megxit 2.0: Prințesa Eugenie ar putea să-i urmeze pe Prințul Harry și Meghan Markle în California. susțin prietenii

_ Ford și-a vândut aproape toată participația la Rivian anul trecut

_ Agenda climatică a administrației Biden va deteriora două treimi din conturile de pensionare din SUA: Kobach

_ Texas: Peste 35.000 de clienți din Austin Energy �NCĂ FĂRĂ curent după furtuna de gheață de săptăm�na trecută

_ Mama a folosit o racletă de siguranță de 7 dolari de la Bunnings pentru a scăpa de reziduurile de săpun de pe paravanul ei de duș de sticlă

_ Important pentru pensionarii care au optat pentru plata pensiei pe card. Ce comisioane percep băncile din România

_ The Last Of Us: Ellie Williams îl salvează pe Joel Miller împușcându-l pe atacator după ce a fost împușcat în călătorie

_ Am numit-o pe fiica mea Bambi ca Molly-Mae Hague

_ SPOILER: „Bună”, a spus ea, în timp ce își antrena Taserul pe Tommy Lee... propria ei bucată de iad sfânt

_ ANDREW PIERCE: O farsă de la Westminster - cu Dom și Boris în rolurile principale

_ Noi solicitări pentru Regatul Unit să renunțe la legile europene privind drepturile omului pentru a prelua controlul asupra granițelor sale

_ Zece orașe fantomă redescoperite de turiști: de la metropola mongolă la satul medieval din Italia

_ Kyrie Irving este schimbat la Dallas Mavericks și își unește forțele cu Luka Doncic de la Brooklyn Nets

_ Cât de strânsă prietenie dintre Sasha Walpole și Prințul Harry a dispărut după o întâlnire ilegală pe teren

_ Ea este creierul modei din spatele Sex And The City și Emily In Paris

_ Jamie Carragher sugerează că Erling Haaland a făcut o EROARE s-a alăturat lui Man City

_ Sfaturile de curse ale lui Robin Goodfellow: Cele mai bune pariuri pentru luni, 6 februarie

_ DR MAX PEMBERTON: Conform testului, și eu am ADHD. Ridicol!

_ Zara din Insula Iubirii insistă că nu are regrete, în ciuda sărutului lui Tom

_ Megan Fox este o Jessica Rabbit modernă, în timp ce se alătură lui Machine Gun Kelly la gala pre-GRAMMY a lui Clive Davis

_ Daniel Johns și iubita DJ participă la concertul Red Hot Chilli Peppers

_ Antonio Conte îl sună pe Harry Kane pentru a-l felicita că a devenit principalul marcator al lui Tottenham

_ Peru prelungește starea de urgență după luni de proteste mortale

_ Mamici din SUA s-au lovit de bâtă de cricket în episodul Bluey al programului TV pentru copii

_ Netflix încheie un parteneriat cu GM pentru a include vehicule electrice pe titlurile sale

_ Efectele negative pe termen lung ale ESG vor fi catastrofale

_ Realitatea dură se ascunde în timp ce antrenorul Angliei Steve Borthwick se confruntă cu o operațiune uriașă de salvare


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26 Pag.27 Pag.28 Pag.29 Pag.30 Pag.31
Pag.32 Pag.33 Pag.34 Pag.35 Pag.36

Nr. de articole la aceasta sectiune: 2113, afisate in 36 pagini.



ieri 10:57