19:21
Comentarii Adauga Comentariu

_ Echipa de cercetare dezvoltă un proces rapid pentru îmbunătățirea genetică a trăsăturilor plantelor

_ Echipa de cercetare se dezvoltă rapid -urmărirea procesului pentru îmbunătățirea genetică a trăsăturilor plantelor

Cercetătorii interesați de îmbunătățirea unei anumite trăsături la plante pot identifica acum genele care reglează expresia trăsăturii fără a face niciun experiment.

Kranthi de la Universitatea Purdue. Varala și 10 coautori au publicat detaliile noului instrument de descoperire a genelor de reglementare bazat pe web în Proceedings of the National Academy of Sciences. Varala are un brevet în așteptare privind rezultatele care se referă la biosinteza uleiului de semințe de importanță economică.

Echipa Purdue-USDA a căutat să construiască o resursă care să învețe, din cantități mari de date disponibile public, să identifice rapid ce special genele numite factori de transcripție reglează expresia unei anumite trăsături la diferite specii de plante.

„Fiecare studiu se concentrează pe o mână dintre ele”, a spus Varala, profesor asistent de horticultură și arhitectură peisagistică. „Premisa noastră a fost că, dacă le putem pune pe toate într-o singură analiză, atunci putem folosi aceste date pentru a construi ceva global.”

Arabidopsis a servit ca plantă model a studiului PNAS, „dar această abordare a nimic specific Arabidopsis”, a spus Varala. „Abordarea este suficient de generală încât ați putea începe cu un set de date despre porumb. O puteți face cu orez, cu roșii, indiferent de cultură la care lucrați, atâta timp cât aveți mii de măsurători ale expresiei genelor pe care le-au făcut oamenii. Și există peste o duzină de specii acum în care avem zeci de mii de studii de exprimare a genelor.”

Pentru a dovedi că sistemul funcționează, echipa sa concentrat pe o cale genetică care reglează modul în care plantele produc și stochează ulei în semințele lor. Echipa a ales această trăsătură din cauza importanței sale în producția de alimente și biocombustibili și pentru că mai mult de 300 dintre genele implicate sunt deja cunoscute.

Prin manipularea genetică a factorilor de transcripție ai unei plante, cercetătorii pot crește sau reduce cantitatea de ulei produs în semințele sale.

La fel ca alți cercetători, Varala a urmat multe proiecte de-a lungul anilor în care scopul său a fost să identifice genele și regulatorii implicați în rezolvarea unei probleme. Aceasta a însemnat efectuarea de experimente atente, care consumau timp. Dar datele generate nu au oferit toate răspunsurile pe care le căuta. El a comparat-o cu lucrul unei ecuații cunoscând doar trei dintre cei 10 factori implicați.

„Nu poți rezolva ecuația”, a spus el. La fel, Varala a vrut adesea sa puna mai multe intrebari decat puteau raspunde datele. Asta l-a motivat să construiască un cadru care să folosească toate datele posibile pentru a pune acele întrebări fără a fi nevoie să facă toate experimentele relevante pentru a obține o listă de candidați care au nevoie apoi de validare genetică.

„Încerc să scurtez. -circuitează faza inițială de colectare a datelor”, a spus Varala, astfel încât oamenii de știință să se poată concentra pe efectuarea validărilor genetice. Dar pentru a face acest lucru, echipa sa a trebuit să înceapă cu un set de date bazat pe 18.000 de studii individuale.

Varala și echipa sa au analizat acest set masiv de date utilizând Bell și supercalculatoarele Brown, acum pensionate, de la Rosen Center for Advanced din Purdue. Tehnica de calcul. Echipa a creat un cadru de învățare automată pentru a accelera procesul pentru alții.

Ar fi imposibil ca o persoană să facă acest lucru manual. O echipă ar putea face acest lucru, dar asta ar introduce părtiniri în modul în care membrii grupului procesează datele. Clasificatorul de învățare automată funcționează fără părtinire.

Noutatea abordării este că, în loc să extragă date referitoare la toate organele, se concentrează pe seturi de date specifice organelor. Rețele genetice independente reglează aceste organe — frunze, rădăcini, lăstari, flori și semințe.

„În loc să folosim toate organele, am spus, în experimentele cu semințe pe care oamenii le-au făcut de-a lungul anilor, putem folosi toate datele pentru a învăța ceva ce se întâmplă în sămânță și nu neapărat rădăcină sau frunză sau floare. Asta ne-a îmbunătățit foarte mult abordarea”, a spus Varala.

Echipa a folosit o metodă de calcul numită abordarea inferenței pentru a prezice factorii de transcripție care vor regla procesul de biosinteză a uleiului de semințe în Arabidopsis.

„Cele pe care îi cunoaștem ne ajută să validăm abordarea noastră. funcționează corect, cei pe care nu îi cunoaștem sunt buni candidați pentru a descoperi o nouă biologie”, a spus Varala. „Această abordare pur computațională nu știe nimic despre semințe sau ulei sau ceva asemănător. I-am dat o listă de gene și a reușit să le redescopere pe cele cunoscute fără a cunoaște vreun context biologic.”

Autorul principal, Rajeev Ranjan, cercetător postdoctoral în cadrul Departamentului de Horticultură și Arhitectură a Peisajului de la Purdue, a luat celelalte 12 din primele 20 și a întrebat dacă acele predicții sunt adevărate. „Am reușit să generăm linii mutante pentru unsprezece dintre cei doisprezece. Cinci dintre cei unsprezece schimbă conținutul de ulei de semințe”, a spus el. „În plus, am arătat că supraexprimarea unui factor crește uleiul de semințe cu până la douăsprezece procente.”

Cele opt gene de reglementare cunoscute, adăugate celor opt noi, au arătat că abordarea inferenței a identificat cu exactitate 13 dintre gene. primii 20 candidați. Punctul forte al abordării este că, lucrând numai dintr-o listă de gene, poate prezice cu mare precizie care dintre ele vor reglementa o trăsătură de interes.

„A fost nevoie de mult timp pentru că este un lucru lung, proces complicat și nu exista nicio garanție că va funcționa”, a spus Varala despre proiectul de patru ani. „Nimic de această scară nu a mai fost încercat înainte.”


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

Fluierul Ro face un apel disperat către oamenii Sistemului care conduc România să nu repete greșelile Statului Român din anii 1939-1940 când țara s-a destrămat

Financial Times: Administrația Trump presează România să ridice restricțiile impuse fraților Andrew și Tristan Tate, care sunt hăituiți de Rețeaua Progresistă. Richard Grenell : "Îi susțin pe frații Tate"

Călin Georgescu îi cere de urgență șefului operativ al SRI, Răzvan Ionescu, (cel care a participat la anularea alegerilor cu "notele șubrede" ca să cităm din JD Vance) ori sa arate Dovezile ori să-și dea Demisia și să plece.

Georgescu: "Judecătorii CCR vor fi judecați pentru Înaltă Trădare,"

Progresista UE în degringoladă după ce JD Vance le-a arătat cu PROBE cum iși bat joc de democrație. Cine va participa la întâlnirea Sorosista de la Paris.

_ Școlile din Israel revin la programul normal, după închiderea de sâmbătă din cauza amenințărilor iraniene

JD Vance, vicepreședintele SUA, mesaj dur în apărarea lui Călin Georgescu: Alegerile din România au fost anulate pe baza unor suspiciuni nefondate ale unei agenții de informații și a presiunii UE -

_ Tot ce poate merge prost cu sânii tăi - și ce să faci în privința asta: ghidul definitiv al DR PHILIPPA KAYE

Fiasco progresist la Paris. Summitul „de urgență” al lui Macron din Ucraina de la Paris nu reușește să producă o strategie europeană unificată,

Cristi Chivu, noul antrenor al Parmei!

Hurezeanu, scula celor de la PNL PSD care au dat lovitura de stat, i-a cerut o întâlnire lui Richard Grenell la Munchen, dar a fost refuzat

_ Fanii Netflix salută noul serial înfiorător de crime adevărate „un neapărat neapărat vizionat”

_ Scandalul morților suspecte de la Spitalul Pantelimon. Director: Au fost decese care nu puteau fi evitate

_ Ambarcaţiune cu migranţi, scufundată în largul insulei greceşti Samos

_ Un nou studiu descoperă ținte potențiale la capetele cromozomilor pentru prevenirea bolilor degenerative

_ John Kirby, purtătorul de cuvânt al lui Biden, va fi promovat şi va primi un rol mai important la Casa Albă

_ „Nu am văzut atât de mult pericol din 1973”: Anthony Blinken avertizează că Orientul Mijlociu se află în cea mai mare tulburare de la războiul de la Yom Kippur, când Egiptul și Siria au atacat Israelul

_ Poliţist din Tulcea, condamnat definitiv la închisoare pentru corupţie

_ UE iese din iarnă cu niveluri record de stocare a gazelor. Comisarul pentru energie avertizează: 'Nu trebuie să ne culcăm pe lauri'

_ Se pregătește evacuarea românilor din Israel. Ședință de urgență la MAE, după atacul Iranului

_ Furtuna Renata, care face ravagii în Europa, se apropie de România. Va aduce frig, ploi şi vijelii puternice

_ O altă poveste a medicilor: Cum au salvat viața unui om, plecând de urgență din București la Brașov

_ Alegerile mamut din India: aproape un miliard de alegători, 44 de zile de votare

_ Eduard Hellvig anunță dezastrul: Cancelariile și analiștii militari occidentali se pregătesc pentru ce este mai rău

_ „Voi fi în teren” - Rafael Nadal confirmă participarea la Barcelona Open

_ Mingea de la EURO 2024 conține senzori de mișcare care trimit date în timp real

_ Oamenii de știință studiază comportamentul skyrmionilor chirali în obstacolele chirale asemănătoare florilor

_ Scandalul idilei dintre o elevă de liceu și profesorul ei ia amploare. Polițiștii au descins la bărbat acasă și l-au ridicat pentru acuzația de viol

_ Ion Cristoiu: Cum petreceau ruşii fără a ştii că venise Apocalipsa

_ Cât din atmosfera lui Venus provine de la vulcani?

_ Stațiunea Mamaia intră în rândul stațiunilor mari din Europa: Perla litoralului românesc 'se îmbracă în haine noi'

_ George Buricea a anunțat lotul naționalei de handbal masculin pentru dubla de calificare cu Cehia

_ Cercetarea hidrurilor împinge frontierele supraconductivității practice și accesibile

_ Acord între PPC şi Mytilineos pentru dezvoltarea unui portofoliu solar de 2.000 MW în 4 ţări, inclusiv România

_ Șeful Apărării Germaniei îl compară pe Putin cu Hitler

_ Tehnica avansată de microscopie oferă un nou aspect în interiorul celulelor

_ Roboţii sociali care pot ajuta pacienţii vârstnici trec de faza de testare

_ MEP Cretu: Building three regional emergency hospitals in Romania, long delayed

_ Avioanele britanice au doborât o serie de drone iraniene

_ Războiul civil din Sudan: povestea copiilor care trăiesc între foamete și moarte în Darfur

_ Povestea prieteniei neobișnuite dintreo cățelușă și o coțofana. Disputa aprinsă care a captivat Australia / FOTO

_ STENOGRAME - Vasile Blaga a bătut cu pumnul în masă: Ori se rupe hamul, ori moare calul!/ Ciucă: Absolut de acord

_ Pollard, antrenorul din Mumbai, este „bolnav și sătul” de atacul lui Pandya

_ Only 7% of organisations build diverse and inclusive culture (study)

_ Kinetoterapeut: Gadgeturile și tehnologia, cauza creșterii cazurilor de scolioză în rândul tinerilor

_ Banca Națională a Moldovei a stabilit băncile de importanță sistemică în Republica Moldova

_ Ce, fără Bitcoin? Cum „sute de miliarde” sunt spălate cu numerar în avioane

_ Oamenii cu această grupă de sânge au o abilitate unică: studiile recente confirmă o teorie din anii 1930

_ Iron Dome �n acțiune: sistemul de apărare al Israelului �ncepe să doboare drone iraniene sinucigașe peste Ierusalim

_ Băieți răi: Studiul arată că masculii bonobo agresivi atrag mai mulți parteneri

_ Serie A: Lazio Roma a învins, vineri seară, pe teren propriu, cu scorul de 4-1, echipa Salernitana

_ Mutare-surpriză la Severin. De ce aruncă liberalii un fost ministru în lupta pentru primărie

_ Record de căldură înregistrat la 80 de kilometri de Nădlac

_ Ana Loredana Predescu: Apă cu bacterii, nepotisme și salarii de 8000 de euro girate de Consiliul Județean și Primăria Brașov

_ Boeing se confruntă cu lansări critice, transportând astronauți către Stația Spațială Internațională

_ Vânzările cu amănuntul din SUA au crescut mai mult decât se aștepta în martie

Conform Legii: Nici o instituție de stat nu poate anula alegerile din Romania. Aviz celor care au dat o Lovitură de Stat anulând alegerile : Legislația din România nu permite nimănui anularea completă a alegerilor, ci doar invalidări parțiale.

_ „Trăim într-o epocă a înșelăciunii cu spectru complet”

_ Descoperă Moscheele din lemn – considerate minuni arhitecturale deţinute de Patrimoniul Mondial UNESCO şi amplasate în Anatolia

_ Volodimir Zelenski, discuție urgentă privind apărarea aeriană cu șeful NATO, Jens Stoltenberg


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26 Pag.27 Pag.28 Pag.29 Pag.30 Pag.31
Pag.32 Pag.33 Pag.34 Pag.35 Pag.36 Pag.37 Pag.38 Pag.39
Pag.40 Pag.41 Pag.42 Pag.43 Pag.44 Pag.45 Pag.46 Pag.47
Pag.48 Pag.49 Pag.50 Pag.51 Pag.52 Pag.53 Pag.54 Pag.55
Pag.56 Pag.57 Pag.58 Pag.59 Pag.60 Pag.61 Pag.62 Pag.63
Pag.64 Pag.65 Pag.66 Pag.67 Pag.68 Pag.69 Pag.70 Pag.71
Pag.72 Pag.73 Pag.74 Pag.75 Pag.76 Pag.77 Pag.78 Pag.79
Pag.80 Pag.81 Pag.82 Pag.83 Pag.84 Pag.85 Pag.86 Pag.87
Pag.88 Pag.89

Nr. de articole la aceasta sectiune: 5308, afisate in 89 pagini.