12:43
Comentarii Adauga Comentariu

_ O mai bună înțelegere a metabolismului celular cu ajutorul AI

_ O mai bună înțelegere a metabolismului celular cu ajutorul AI

Metabolismul este esențial pentru toate organismele vii, iar modelarea reacțiilor chimice care susțin viața nu este o sarcină ușoară. Acum, oamenii de știință de la EPFL au lansat REKINDLE, un proces de învățare profundă care deschide calea pentru o modelare mai eficientă și mai precisă a proceselor metabolice.

Modul în care un organism metabolizează nutrienții este un proces complex. În literatura de specialitate, procesul poate fi modelat printr-un set de ecuații matematice cu parametri specifici fiecărui organism.

Parametrii pe care s-ar măsura pentru un om ar fi diferiți de cei ai unui șoarece, bacterii, drojdie, sau orice organism viu de studiu. Dacă am avea acces la acești parametri pentru un anumit organism viu, atunci modelul său corespunzător ar fi complet, s-ar potrivi cu observația din lumea reală și ar fi posibile studii in silico pentru o mai bună proiectare a studiilor in vitro și in vivo.

La nivel practic, însă, determinarea acelor parametri este o chestiune complicată, din cauza lipsei datelor experimentale. De obicei, cercetătorii au nevoie de cantități mari de date experimentale și resurse de calcul pentru a determina acești parametri. Dar ce se întâmplă dacă ai putea eluda nevoia de date extinse și totuși să produci un model care să corespundă observației și măsurării experimentale? Oamenii de știință de la EPFL propun tocmai asta cu REKINDLE, un cadru computațional bazat pe învățarea profundă care reproduce proprietățile metabolice dinamice observate în celule. Rezultatele sunt publicate în Nature Machine Intelligence.

„REKINDLE va permite comunității de cercetare să reducă eforturile de calcul în generarea de modele cinetice cu mai multe ordine de mărime. De asemenea, va ajuta la postularea de noi ipoteze prin integrarea datelor biochimice în aceste modele, elucidând observațiile experimentale și conducând noi descoperiri terapeutice și proiecte de biotehnologie", spune Ljubisa Miskovic de la Laboratorul de Biotehnologie a Sistemelor Computaționale al EPFL și co-PI al studiului.

"Scopul principal al modelării metabolice este pentru a descrie comportamentul metabolic celular într-o asemenea măsură încât înțelegerea și prezicerea efectelor variațiilor stărilor celulare și condițiilor de mediu pot fi testate în mod fiabil pentru o gamă largă de studii în sănătate, biotehnologie și sisteme și biologie sintetică", explică Subham Choudhury, primul autor al studiului. „Sperăm că REKINDLE facilitează construirea de modele metabolice pentru comunitatea mai largă.”

Metoda are aplicații biotehnologice directe, deoarece modelele cinetice sunt instrumente importante pentru diferite studii, inclusiv bioproducția, țintirea medicamentelor, interacțiunile microbiomului și bioremedierea. .

Oamenii de știință de la EPFL sunt deosebit de dornici de modul în care REKINDLE ar putea fi utilizat pentru a optimiza rețeaua metabolică a microbilor pentru a produce compuși chimici la scară industrială, de exemplu, înlocuirea industriei tradiționale petrochimice cu fabrici pe bază de celule.

O provocare majoră care împiedică utilizarea pe scară largă a modelării cinetice în comunitatea de cercetare este cerințele de calcul extinse și lipsa unui software de calcul standardizat. Oamenii de știință EPFL speră că cadrul lor bazat pe învățarea profundă va unifica eforturile din comunitatea științifică.

„REKINDLE folosește biblioteci Python standard, utilizate pe scară largă, care îl fac accesibil și ușor de utilizat”, continuă Choudhury. „Scopul nostru principal cu acest studiu este de a deschide calea pentru a face acest tip de eforturi de modelare open source și accesibile, astfel încât oricine din comunitățile de biologie sintetică și de sisteme să le poată folosi pentru propriul obiectiv de cercetare, oricare ar fi ele.”

(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

Cum i-au mai cenzurat neomarxiștii progresiști de la Twitter pe conservatori: Twitter „a păstrat o listă neagră secretă de conturi și subiecte pentru a le opri în tendințe”

Televiziunea de stat nord-coreeană difuzează primul său meci de fotbal din Coreea de Sud

SUA. Whitehead: Constituția a fost deja aruncată la coș. Progresiștii au distrus libertățile individuale și propagă totalitarismul în întreaga lume

Prețurile mașinilor rulate se prăbușesc cu un procent cel mai mare înregistrat vreodata

China. Xi încheie zeci de miliarde de tranzacții cu saudiții, de la cloud-computing Huawei până la extinderea legăturilor militare

Prognoza pentru următoarele săptămâni: meteorologii anunţă cum va fi vremea de Crăciun şi Anul Nou

China lansează în liniște relaxarea cantitativă (QE): Beijingul ordonă marilor asigurători să cumpere obligațiuni pentru a limita panica de vânzare

O fi de la vaccinuri? Apel pentru investigații asupra ratelor mortalității, deoarece Australia vede o creștere a ratei de deces

UMFST va finaliza, în 2023, o serie de investiții unice în țară: Centrul de Simulare şi Abilităţi Practice şi primul Centru Naţional de Realitate Virtuală

_ Seful lui Liverpool, Jurgen Klopp, „se întâlnește cu reprezentanții starului marocan Sofyan Amrabat”

_ Aston Villa, Man United, Wolves și Liverpool schimbă temperaturile înghețate din Anglia cu locuri mai calde

Previziuni economice sumbre pentru 2023: Contracție economică majoră în 2023... urmată de și mai multă inflație

Nimănui nu îi pasă de greva New York Times, în timp ce zeci de oameni urmăresc fluxul live

Cum TFIIH folosește XPG pentru a localiza ADN-ul deteriorat

_ Sferturile de finală dintre Argentina și Olanda din 1998 a fost unul dintre ultimele meciuri emblematice ale Cupei Mondiale.

Ce CRIME mai fac progresiștii: Noua Zeelandă ia copilul de la părinții care cer sânge „nevaccinat” pentru operația copilului pe inimă

Cum a devenit atât de fierbinte „planeta iadului”: noi măsurători dezvăluie calea orbitală a planetei 55 Cnc e

Ignorați expertii, nu vă așteptați la scăderi mari ale prețului chiriei

_Stiri Negre - 08 Dec 2022 16:37:28

_ Licențiat de facultate dezvăluie sistemul de clasare „dezgustător” folosit de comunitatea ei pentru a nota candidații în grabă

Project Veritas: Decanul din Chicago se laudă că le oferă elevilor minori jucării sexuale în timpul lunii Mândriei

Cincisprezece copii au murit de streptococul A în Marea Britanie în această iarnă

_ Criticii furioși...

_ Jurnaliştii New York Times, alţi angajaţi în grevă pentru prima dată în decenii

_ The Price of Glee PRIMUL TRAILER: Noile documente din serialele arată blestemul

_ Dua Lipa își croiește o siluetă elegantă într-o haină roz ciudată cu blană, în timp ce iese în New York

UK. Un număr record de britanici au murit din cauze specifice alcoolului. Experții dau vina ca urmare a blocării covid

GERMANIA. Raidul masiv împotriva extremiștilor de dreapta din Germania: este mai mult spectacol decât substanță?

_ Scott Disick „va avea întotdeauna regrete” pentru modul în care a gestionat relația cu Kourtney Kardashian

_ Fenomen îngrijorător în SUA. Companiile mari şi mici continuă disponibilizările, împingând rata şomajului tot mai sus

_Călin Georgescu - 09 Dec 2022 04:07:18

_ DeSantis va întâlni donatorii în Miami...

_ Jurgen Klopp „a cerut lui Liverpool să semneze un jucător ca Sofyan Amrabat cu mult timp în urmă”

Macron a băgat în groapă economia Franței și a Europei și acum se ia de prezervative. Franța va face prezervativele gratuite în farmacii pentru persoanele cu vârsta cuprinsă între 18 și 25 de ani

_ Jurnalul lui MATT BARLOW LA CUPA MONDIALĂ: Spania renunță la penalty-uri, în ciuda faptului că a luat câte 1.000 la antrenament

_ DOJ cere judecătorului să rețină echipa Trump în dispreț pentru cazul Mar-a-Lago...

_ Oficialul chinez din domeniul sănătății admite că 80-90% din populație poate ajunge cu COVID

_ China se infiltrează tot mai adânc în Rusia: preiau tot mai agresiv locul lăsat liber de Occident

SUA. Date Biometrice pe aeroporturi. TSA planifică lansarea la nivel național a aparatelor biometrice pentru călătorii pe aeroport

După curentul electric, Republica Moldova va compensa și gazele naturale livrate consumatorilor casnici cu 50% din preț

_ Ivanka Trump, în vârstă de 41 de ani, arată fulgerător în stomac și arată o siluetă zveltă în timp ce părăsește sala de sport din Miami

_ Brittney Griner se îndreaptă spre casă, dar starul Cowboys Micah Parsons încă nu îl va vota pe Joe Biden

_ Lukoil şi o firmă americană pun la cale vânzarea rafinăriei din Sicilia

_ Zborul SpaceX pe Lună va include un DJ, un YouTuber şi un rapper K-pop

_ Baker Mayfield îi lasă pe analiștii TNF ULTIMEȚI de victorie după doar 48 de ORE cu Los Angeles Rams

_4 Media Info - 09 Dec 2022 04:53:39

_4 Media Info - 09 Dec 2022 04:49:02

_ 'Negustorul morții' a ajuns la Moscova. Primul mesaj transmis după ce a fost eliberat de SUA

_ Experții critică lipsa de „substanță” în emisiunea Netflix a lui Harry și Meghan

_ Kaia Gerber se strecoară într-un ansamblu negru în timp ce poartă o geantă de cumpărături Celine

_ Zoe Kravitz afișează o piele impecabilă în timp ce legănă cu un ruj maro lucios în campania YSL Beauty

_ Reporter Sunrise: Problemă majoră cu documentarul Netflix al lui Harry și Meghan

_ Atlasul celulelor pulmonare fetale umane descoperă 144 de stări celulare

_ James Cameron declară cu îndrăzneală efectele speciale în Avatar: The Way of Water triumfează filmele Marvel

_ Negustorul rus de arme Viktor Bout: „Comerciantul morții” a fost schimbat cu Brittney Griner

_ Un impuls în timp util pentru Anglia, deoarece Courtney Lawes urmează să se întoarcă de la o accidentare pentru Northampton Saints

_ Jude Bellingham 'va spune lui Borussia Dortmund că vrea să plece după Cupa Mondială

_ TOM LEONARD: Griner este în siguranță, dar nu același lucru se poate spune despre lume... Negustorul morții este liber

_ Antonio Banderas felicită Marocul după ce a învins Spania la Cupa Mondială din Qatar

_ Izolarea lui Don se adâncește...


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26 Pag.27 Pag.28 Pag.29 Pag.30 Pag.31
Pag.32 Pag.33 Pag.34 Pag.35 Pag.36 Pag.37 Pag.38 Pag.39
Pag.40 Pag.41 Pag.42 Pag.43 Pag.44 Pag.45 Pag.46 Pag.47

Nr. de articole la aceasta sectiune: 2793, afisate in 47 pagini.