15:57 2024-04-23
science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu
_ Cercetătorii raportează mecanismele divergenței de reglare a genelor între specii
_ Cercetătorii raportează despre mecanisme a divergenței de reglementare a genelor între specii
Specia de animale strâns înrudite pot arăta diferit din punct de vedere fizic, dar ați putea fi surprins să aflați că acele diferențe pot rezulta nu numai din modificările secvenței ADN care modifică structura sau funcția proteinelor, ci și deoarece modificările ADN-ului afectează modul în care respectivele proteine sunt exprimate. În plus, nu toate diferențele dintre specii pot fi explicate numai prin modificările secvenței ADN.
Biologul molecular Emily Hodges, profesor asistent de biochimie, studiază elementele de reglementare ale genomului nostru și este interesată să analizeze modul în care se schimbă. în secvența ADN-ului afectează reglarea genelor.
Expresia genelor este controlată de elementele de reglare a secvenței ADN, cum ar fi potențiatorii de gene, care ajută la creșterea expresiei unei gene țintă.
Specifica speciei modificări ale funcției de amplificator pot rezulta din modificările secvenței ADN care apar direct într-un singur amplificator (cis) sau în mediul celular într-un mod care poate afecta mii de amplificatori (trans). De exemplu, un factor de transcripție – o proteină mobilă care determină expresia unei gene țintă – este un element de reglementare trans care poate lega și controla potențiatorii de pe diferiți cromozomi.
Din punct de vedere istoric, oamenii de știință au avut probleme în a determina contribuțiile individuale. dintre aceste două mecanisme de divergență a expresiei genelor.
Laboratoarele lui Hodges și fostul coleg Tony Capra, care este acum profesor asociat de epidemiologie și biostatistică la Universitatea din California, San Francisco, au folosit ATAC-STARR- seq - o tehnică de raportare la scară genomică dezvoltată de laboratorul Hodges - pentru a dezlega contribuțiile relative ale mecanismelor de reglare cis și trans la divergența de reglare a genelor între oamenii strâns înrudiți și macacii rhesus. Lucrarea, „Evoluția de reglementare a genelor umane este condusă de divergența funcției elementului de reglare atât în cis, cât și în trans”, a fost publicată în Cell Genomics în aprilie 2024.
Cu ATAC-STARR-seq, cercetătorii— condus de recentul absolvent al laboratorului Hodges Tyler Hansen și recent absolvent al laboratorului Capra Sarah Fong — s-au uitat la efectele diferitelor secvențe ADN (modificări cis) în contextul diferitelor medii celulare (modificări trans) și invers și au găsit un număr substanțial mai mare de trans modificări ale activității de reglare a genelor decât cele observate anterior.
Diferentele dintre specii sunt adesea atribuite variației secvenței (cis), dar laboratoarele Hodges și Capra au descoperit un rol substanțial pentru diferențele din mediul celular (trans) în reglarea genelor. divergenta intre specii. Această lucrare provoacă gândirea actuală conform căreia schimbările de reglementare cis stau la baza celei mai multe divergențe în activitatea de reglementare și susține un rol critic pentru schimbările de reglementare trans în conducerea evoluției de reglementare a genelor.
Analizarea contribuțiilor relative ale mecanismelor cis și trans ale divergenței de reglementare a genelor. are implicații pentru domeniile reglării genelor, geneticii populației umane și evoluția primatelor.
În continuare, Hodges caută să extindă descoperirile dincolo de evoluția umană pentru a înțelege modul în care mecanismele cis și trans de reglare a genelor contribuie la diferențe. în riscul de îmbolnăvire umană. Aceste întrebări sunt esențiale pentru înțelegerea bolilor precum cancerul în care interacțiunea dintre schimbările de secvență, epigenetică și mediul celular are un impact puternic asupra rezultatelor bolii.
Un articol preliminar care discută această cercetare a fost publicat în același număr al revistei Cell Genomics.
Comentarii:
Adauga Comentariu