13:39
Comentarii Adauga Comentariu

_ Cercetătorii găsesc element genetic criptic în intestinul uman care ar putea servi drept biomarker sensibil

_ Cercetătorii găsesc genetică criptică element din intestinul uman care ar putea servi drept biomarker sensibil

O componentă a florei intestinale umane care a fost puțin studiată până în prezent este în centrul unui nou studiu din Germania. Plasmidele sunt mici elemente genetice extracromozomiale care apar frecvent în celulele bacteriene și pot influența stilul de viață microbian – totuși diversitatea lor în habitatele naturale este puțin înțeleasă.

O echipă internațională condusă de prof. dr. A. Murat Eren de la Institutul Helmholtz pentru Biodiversitate Funcțională Marină de la Universitatea din Oldenburg (HIFMB) raportează în revista Cell că o plasmidă misterioasă este unul dintre cele mai numeroase elemente genetice din intestinul uman.

Această plasmidă ar putea servi ca un biomarker puternic pentru identificarea pericolelor pentru sănătate, cum ar fi contaminarea cu fecale a apei sau tulburări umane, cum ar fi boala inflamatorie intestinală. Conform analizelor echipei, această plasmidă este prezentă în intestinele a peste 90% dintre indivizii din țările industrializate.

Plasmidele sunt secvențe de ADN extracromozomial care sunt comune celulelor din toate domeniile vieții. Eren le descrie ca fiind „în mod obișnuit entități genetice mici care poartă gene suplimentare”. Ele pot fi schimbate între diferite celule bacteriene și chiar între diferite tipuri de bacterii. Replicarea plasmidelor depinde de celulele lor gazdă, dar ele o compensează oferind gazdelor lor, în unele cazuri, determinanți de fitness extrem de importanți.

De exemplu, unele plasmide conțin gene care codifică rezistența la antibiotice, care își ajută gazdele bacteriene să supraviețuiască antibioticelor, contribuind la una dintre cele mai presante preocupări de sănătate publică din întreaga lume.

Există și alte plasmide care, conform cercetărilor de până acum, nu conțin gene care codifică un beneficiu evident. funcții pentru gazda lor. „Aceste așa-numite „plasmide criptice” sunt adesea denumite paraziți genetici. Ele rămân un mister în ecologia microbiană, deoarece din perspectivă evolutivă nu ar trebui să existe deloc”, explică Eren, informatician și profesor de Ecosystem Data Science la Universitatea din Oldenburg.

Identificarea plasmidelor a fost o întreprindere dificilă până acum. De ceva timp, oamenii de știință au reușit să extragă material genetic direct din probele de mediu și, de exemplu, să analizeze comunitatea microbiană din intestinul uman în întregime, fără a fi nevoie să cultive organisme bacteriene individuale. Cu toate acestea, capacitatea de a distinge cu încredere ce este o plasmidă în acest conglomerat de material genetic, denumit metagenom, reprezintă o provocare considerabilă.

Pentru a rezolva această problemă, Eren și colegii săi au dezvoltat o nouă învățare automată. abordare. După cum relatează echipa într-un alt articol, acesta publicat recent în Nature Microbiology, ei au folosit această abordare pentru a identifica peste 68.000 de plasmide din flora intestinală umană și, de asemenea, au descoperit că o anumită plasmidă criptică numită pBI143 era deosebit de abundentă în setul lor de date.

În studiul publicat în Cell, echipa de cercetători a analizat mai atent această plasmidă, care constă doar din două gene care, în mod surprinzător, servesc doar pentru propria replicare și mobilizare în celulele bacteriene, fără niciun alt beneficiu clar. Pentru a înțelege mai bine ecologia pBI143, echipa a analizat 60.000 de metagenomi umani și 40.000 de mediu generați din diverse habitate.

„Am descoperit că pBI143 are o listă de caracteristici foarte interesante”, explică Eren. Echipa a descoperit că peste 90% dintre oamenii din țările industrializate poartă plasmida și că, în medie, aceasta este una dintre cele mai numeroase entități genetice din intestinul uman. „În medie, a fost de peste 10 ori mai numeros decât un genom viral, despre care se credea anterior că este cel mai abundent element extracromozomial genetic din intestinul uman”, spune cercetătorul.

Analize ulterioare au arătat că Plasmida a apărut aproape exclusiv în intestinul uman, dar a fost practic absentă în seturile de date din alte medii, cum ar fi oceanele, solurile, plantele și organele digestive ale animalelor și fecalele acestora. Singurele alte mostre în care cercetătorii au reușit să detecteze secvența genică caracteristică pentru aceste plasmide a fost în probe din medii care sunt influențate de oameni, cum ar fi apele reziduale, suprafețele spitalelor și șobolanii de laborator.

Datorită lor. Numărul absolut, prevalența la om și conservarea acesteia în rândul populațiilor umane, echipa de cercetători a emis ipoteza că pBI143 ar putea fi, de exemplu, utilizat ca biomarker în testarea contaminării fecale. „De fapt, am reușit să arătăm că această plasmidă este un marker mai sensibil pentru detectarea contaminării fecale în apa potabilă, în comparație cu biomarkerii de ultimă generație, bazați pe secvențe specifice de gene ale bacteriilor intestinale umane”, spune Eren.

Echipa a identificat, de asemenea, o altă aplicație potențială a acestei entități genetice predominante în contextul tulburărilor umane, cum ar fi boala inflamatorie intestinală (IBD), o afecțiune care afectează 3 milioane de oameni numai în Europa. Ei au reușit să demonstreze că numărul relativ de copii ale acestei plasmide criptice a crescut de aproape patru ori în intestinele persoanelor care suferă de IBD în comparație cu intestinele persoanelor sănătoase, sugerând că modificările numărului de copii ale plasmidei pot servi ca un -metoda invazivă pentru a cuantifica progresul sau severitatea bolii.

La HIFMB, echipa lui Eren dezvoltă noi instrumente la intersecția dintre informatică și microbiologie pentru a identifica și caracteriza plasmidele naturale și alte elemente genetice mobile din bacterii care trăiesc în ocean. Ei se străduiesc să înțeleagă mai bine ecologia și evoluția microbilor și strategiile care le permit să răspundă la mediile lor în continuă schimbare pentru noi aplicații biotehnologice care pot ameliora crizele cu care ne confruntăm.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Cercetătorii rezolvă misterul modului în care moleculele imune ale plantelor minimaliste devin activate

_ Sistemul de apărare aeriană Iron Dome: scutul cheie antirachetă al Israelului

_ Sorana Cîrstea s-a calificat în turul al treilea la Miami

_ Jerry Seinfeld spune că mafia „de extremă stângă” politic corectă a ucis comedia

_ Eroii zilei: senatorul Eric Schmitt, guvernatorul Jeff Landry, AG Andrew Bailey și AG Liz Murrill

_ Raidul israelian asupra Damascului, o escaladare „fără precedent” a tensiunilor

_ Sarah Ferguson laudă videoclipul lui Kate Middleton despre recuperarea cancerului ca fiind „pur și simplu incredibil”, în timp ce ea vorbește despre primirea unui alt nepot

_ Ralph Fiennes face apel la avertismentele declanșatoare de trezire a sfârșitului în cinematografe și spune că spectacolele TREBUIE să lase spectatorii „șocați și deranjați” - așa cum sugerează că publicul a „s-a făcut prea moale”

_ Ciolacu, declaraţie bizară: "Buzăul nu e în Moldova şi vă rog frumos să nu mă jigniţi"

_ VEZI: Ronna McDaniel se pronunță �mpotriva promisiunii lui Trump de a elibera prizonierii pe 6 ianuarie

_ Identificarea priorităților pentru a valorifica tehnologiile digitale inteligente pentru producția durabilă a culturilor

_ Ciolacu promite clarificări prin OUG pe tema pensiilor militare

_ Gabriela Lee a ajuns pe tabloul principal la Charleston

_ VIDEO incredibil: Candidat la primărie, biciuit de fratele primarului după ce a ridicat o dronă deasupra casei sale

_ Protestele pro-palestiniene sunt deturnate de marxisti pentru a „distruge capitalismul, libertatea și democrația”?

_ Survival Food este �n creștere cu o �ntorsătură neașteptată: fondatorul companiei Prepper Beef

_ Cinci persoane reţinute în Capitală. Eliberau fişe medicale false pentru obţinerea permisului

_ Urmărirea celei mai mari furtuni solare din timpurile moderne din inelele copacilor din Laponia

_ Caz unic în Italia: Case vândute la prețul simbolic de 1 euro, dar nimeni nu le cumpără / Care este problema

_ Democratul din New York dorește moartea susținătorilor lui Trump

_ Accident rutier în județul Vâlcea. Două persoane au ajuns la spital

_ Ronnie O'Sullivan luptă de sâmbătă pentru recordul absolut de opt titluri mondiale la snooker

_ Cutremur la Digi RCS RDS. Colosul de pe piața de telecomunicații vinde!

_ FOTO - Premieră în justiția mondială: gigantul petrolier BP a fost dat în judecată, după ce poluanții folosiți au cauzat cancer

_ Un alt actor de la Hollywood suferă de TDS: Alan Ritchson �i atacă pe creștinii care susțin �violatorul� și �escrocatorul� Trump � �El este copilul posterului lor�

_ Masacru în timpul unei petreceri: Două persoane au fost ucise şi alte opt rănite cu focuri de armă, la Memphis / VIDEO

_ Astronomii dezvăluie o nouă legătură între apă și formarea planetei

_ Henge preistoric dezvăluie un sit sacru vechi de secole din Lincolnshire

_ Viktor Orbán: Revenirea lui Trump la preşedinţia SUA este singura şansă de încheiere a războiului din Ucraina

_ Examinarea impactului reproducerii bazate pe gene asupra agriculturii și medicinei

_ UE ia în considerare relaxarea regulilor privind fuziunile companiilor de telecomunicații

_ CONFIRMAT: Guvernul federal dă formulare de înregistrare a alegătorilor refugiaților care nu sunt cetățeni

_ Guvernul francez va „lupta” listarea TotalEnergies New York

_ Surse - La Guvern se discută o nouă creștere a salariului minim pe economie

_ Un cristal lichid dimer feroelectric cu polarizare spontană uriașă și constantă dielectrică la temperaturi scăzute

_ Steven Bartlett vorbește cu psihologul care dezvăluie cele trei semne revelatoare că te întâlnești cu un narcisist

_ Lupte pe Snowdon, războaie cu mașini în Peak District și „turiști idioți” în Cornwall... Începe bătălia împotriva vacancierilor: localnicii furiosi iau măsuri împotriva familiilor, influențelor și instagramerilor care fac ravagii în hotspot-uri populare

_ GM trece într-o treaptă superioară pe măsură ce depășește rezultatele trimestriale, ridică recomandările pentru 2024

_ Cipul cu microelectrozi 3D ajută la analiza nutrienților din sol

_ Salman Rushdie dezvăluie detalii cutremurătoare despre atacul suferit în noua sa carte de memorii

_ EHF European Cup: vicecampioana României, CS Minaur Baia Mare, a suferit cel mai drastic eşec al său din acest sezon

_ Gorghiu: Procedura în cazul fugarului Arsene se apropie de final

_ Spectacolul uimitor al certificării electorale din comitatul Clark S#%T

_ Teroriştii care au complotat cu fanatici care au continuat să efectueze bombardamentele din Bali, care au ucis 30 de britanici pentru a fi eliberaţi din Guantanamo Bay în CINCI ANI după acordul de pledoarie, au acceptat că nu ştiau despre atacuri.

_ Documentarul emblematic al trupei Beatles, Let It Be, urmează să fie disponibil pe Disney+ pentru PRIMA oară în mai bine de 50 de ani, după restaurarea iubitoare a filmului lui Michael Lindsay-Hogg

_ Scientometria criminalistică — o disciplină în curs de dezvoltare pentru a proteja documentele academice

_ Momentele ȘOC care au marcat campania electorală prezidențială. De la troli la sondajele false și vila lui Iohannis, la eliminarea lui Șoșoacă și avionul Nordis

_ Selecția naturală timpurie la vertebrate: embrionii bitterling efectuează o capotaie pentru a asigura ținerea gazdei midii

_ Cercetările explorează efectele de răcire ale „scafandriilor” la șopârle

_ Concluzia MAI la finalul campaniei electorale: s-a desfăşurat în condiţii de normalitate

_ Ce se află în spatele blitz-ului de PR în stil regal al lui Meghan și Harry? Experții spun că noul site web al Sussexes, ceremoniile de premiere și angajamentele fac parte din eforturile de a trece de la distrugerea bombelor regale.

_ Austin Butler dezvăluie în sfârșit de ce a numit-o pe fosta Vanessa Hudgens „prieten” în ACEL interviu viral, în timp ce starul Elvis, care se scuză, spune: „Am învățat o lecție”

_ Acord de schimb de informații militare între SUA și Filipine

_ O ambulanţă s-a ciocnit cu un autoturism pe Șoseaua Fundeni din București. Traficul a fost parțial blocat

_ Victorie dramatică pentru Bayern Munchen în Bundesliga, în meciul împotriva lui Augsburg

_ Cercetătorii dezvoltă un instrument de detectare precoce a osteoartritei la cal

_ Fotbalistul Kevin Van Veen „l-a făcut pe fostul său să stea dezbrăcat în timpul ceartelor și a împins-o de pe pat când era însărcinată”

_ Familia rapperului Snoop Dogg a suferit durere

_ Rishi Sunak îi spune premierului israelian Benjamin Netanyahu că „capetele calme” trebuie să prevaleze pe măsură ce tensiunile din Orientul Mijlociu cresc după barajul Iranului de rachete și drone.

_ INS: Cifra de afaceri din comerţul cu ridicata, cu excepţia comerţului cu autovehicule şi motociclet, a crescut în primele două luni cu 3,2%, ca serie brută


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13

Nr. de articole la aceasta sectiune: 761, afisate in 13 pagini.