13:39
Comentarii Adauga Comentariu

_ Cercetătorii găsesc element genetic criptic în intestinul uman care ar putea servi drept biomarker sensibil

_ Cercetătorii găsesc genetică criptică element din intestinul uman care ar putea servi drept biomarker sensibil

O componentă a florei intestinale umane care a fost puțin studiată până în prezent este în centrul unui nou studiu din Germania. Plasmidele sunt mici elemente genetice extracromozomiale care apar frecvent în celulele bacteriene și pot influența stilul de viață microbian – totuși diversitatea lor în habitatele naturale este puțin înțeleasă.

O echipă internațională condusă de prof. dr. A. Murat Eren de la Institutul Helmholtz pentru Biodiversitate Funcțională Marină de la Universitatea din Oldenburg (HIFMB) raportează în revista Cell că o plasmidă misterioasă este unul dintre cele mai numeroase elemente genetice din intestinul uman.

Această plasmidă ar putea servi ca un biomarker puternic pentru identificarea pericolelor pentru sănătate, cum ar fi contaminarea cu fecale a apei sau tulburări umane, cum ar fi boala inflamatorie intestinală. Conform analizelor echipei, această plasmidă este prezentă în intestinele a peste 90% dintre indivizii din țările industrializate.

Plasmidele sunt secvențe de ADN extracromozomial care sunt comune celulelor din toate domeniile vieții. Eren le descrie ca fiind „în mod obișnuit entități genetice mici care poartă gene suplimentare”. Ele pot fi schimbate între diferite celule bacteriene și chiar între diferite tipuri de bacterii. Replicarea plasmidelor depinde de celulele lor gazdă, dar ele o compensează oferind gazdelor lor, în unele cazuri, determinanți de fitness extrem de importanți.

De exemplu, unele plasmide conțin gene care codifică rezistența la antibiotice, care își ajută gazdele bacteriene să supraviețuiască antibioticelor, contribuind la una dintre cele mai presante preocupări de sănătate publică din întreaga lume.

Există și alte plasmide care, conform cercetărilor de până acum, nu conțin gene care codifică un beneficiu evident. funcții pentru gazda lor. „Aceste așa-numite „plasmide criptice” sunt adesea denumite paraziți genetici. Ele rămân un mister în ecologia microbiană, deoarece din perspectivă evolutivă nu ar trebui să existe deloc”, explică Eren, informatician și profesor de Ecosystem Data Science la Universitatea din Oldenburg.

Identificarea plasmidelor a fost o întreprindere dificilă până acum. De ceva timp, oamenii de știință au reușit să extragă material genetic direct din probele de mediu și, de exemplu, să analizeze comunitatea microbiană din intestinul uman în întregime, fără a fi nevoie să cultive organisme bacteriene individuale. Cu toate acestea, capacitatea de a distinge cu încredere ce este o plasmidă în acest conglomerat de material genetic, denumit metagenom, reprezintă o provocare considerabilă.

Pentru a rezolva această problemă, Eren și colegii săi au dezvoltat o nouă învățare automată. abordare. După cum relatează echipa într-un alt articol, acesta publicat recent în Nature Microbiology, ei au folosit această abordare pentru a identifica peste 68.000 de plasmide din flora intestinală umană și, de asemenea, au descoperit că o anumită plasmidă criptică numită pBI143 era deosebit de abundentă în setul lor de date.

În studiul publicat în Cell, echipa de cercetători a analizat mai atent această plasmidă, care constă doar din două gene care, în mod surprinzător, servesc doar pentru propria replicare și mobilizare în celulele bacteriene, fără niciun alt beneficiu clar. Pentru a înțelege mai bine ecologia pBI143, echipa a analizat 60.000 de metagenomi umani și 40.000 de mediu generați din diverse habitate.

„Am descoperit că pBI143 are o listă de caracteristici foarte interesante”, explică Eren. Echipa a descoperit că peste 90% dintre oamenii din țările industrializate poartă plasmida și că, în medie, aceasta este una dintre cele mai numeroase entități genetice din intestinul uman. „În medie, a fost de peste 10 ori mai numeros decât un genom viral, despre care se credea anterior că este cel mai abundent element extracromozomial genetic din intestinul uman”, spune cercetătorul.

Analize ulterioare au arătat că Plasmida a apărut aproape exclusiv în intestinul uman, dar a fost practic absentă în seturile de date din alte medii, cum ar fi oceanele, solurile, plantele și organele digestive ale animalelor și fecalele acestora. Singurele alte mostre în care cercetătorii au reușit să detecteze secvența genică caracteristică pentru aceste plasmide a fost în probe din medii care sunt influențate de oameni, cum ar fi apele reziduale, suprafețele spitalelor și șobolanii de laborator.

Datorită lor. Numărul absolut, prevalența la om și conservarea acesteia în rândul populațiilor umane, echipa de cercetători a emis ipoteza că pBI143 ar putea fi, de exemplu, utilizat ca biomarker în testarea contaminării fecale. „De fapt, am reușit să arătăm că această plasmidă este un marker mai sensibil pentru detectarea contaminării fecale în apa potabilă, în comparație cu biomarkerii de ultimă generație, bazați pe secvențe specifice de gene ale bacteriilor intestinale umane”, spune Eren.

Echipa a identificat, de asemenea, o altă aplicație potențială a acestei entități genetice predominante în contextul tulburărilor umane, cum ar fi boala inflamatorie intestinală (IBD), o afecțiune care afectează 3 milioane de oameni numai în Europa. Ei au reușit să demonstreze că numărul relativ de copii ale acestei plasmide criptice a crescut de aproape patru ori în intestinele persoanelor care suferă de IBD în comparație cu intestinele persoanelor sănătoase, sugerând că modificările numărului de copii ale plasmidei pot servi ca un -metoda invazivă pentru a cuantifica progresul sau severitatea bolii.

La HIFMB, echipa lui Eren dezvoltă noi instrumente la intersecția dintre informatică și microbiologie pentru a identifica și caracteriza plasmidele naturale și alte elemente genetice mobile din bacterii care trăiesc în ocean. Ei se străduiesc să înțeleagă mai bine ecologia și evoluția microbilor și strategiile care le permit să răspundă la mediile lor în continuă schimbare pentru noi aplicații biotehnologice care pot ameliora crizele cu care ne confruntăm.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Tot ce poate merge prost cu sânii tăi - și ce să faci în privința asta: ghidul definitiv al DR PHILIPPA KAYE

_ Asus promite să îmbunătățească claritatea cererilor de garanție și a costurilor astronomice de reparații hardware

_ Pentagon: Loviturile ucrainene au afectat 14% din capacitatea Rusiei de rafinare a petrolului

_ George Washington a avertizat împotriva unui „atașament pasional” față de Israel

_ Ploile abundente declanșează inundații în părți din Germania, Belgia și Țările de Jos

_ Gantz amenință că va părăsi cabinetul de război israelian din cauza planurilor postbelice pentru Gaza

_ Op-Ed: Când lupta împotriva rasismului se transformă într-un atac asupra unui fost președinte și a unor adevărate victime

_ Noua carte a fostului secretar de presă al WH, Jen Psaki, susține în mod fals că Biden nu s-a uitat niciodată la ceasul său în timp ce membrii morți din serviciu s-au întors din Afganistan

_ PATETIC: AMC pune un avertisment de declanșare pentru filmele clasice Goodfellas cu privire la „stereotipurile culturale”

_ Bătălia de la Monte Cassino: atât glorie, cât și dezonoare pentru armata franceză

_ Președintele Georgiei Zurabishvili pune veto pe controversata „lege rusă”

_ Revizuirea monitorului de jocuri OLED Gigabyte Aorus CO49DQ: Culoare și contrast extraordinare

_ Zelensky se așteaptă ca Rusia să intensifice ofensiva în nord-estul Ucrainei

_ „Cu cât atacurile asupra lui Trump par mai inechitabile pentru public, cu atât va crește mai sus în sondaje” Elon Musk intervine asupra tribunalului cangur al lui Alvin Bragg

_ Moment istoric în Premier League. Jurgen Klopp va sta pentru ultima dată pe banca echipei Liverpool

_ TIRANIA: Bank of America închide contul unui jurnalist conservator independent fără explicații

_ Senatorul Tim Scott � Presa liberală ignoră asocierea lui Biden cu membrul KKK Robert Byrd: �Nu joacă asta pe CNN� (VIDEO)

_ Fostul director al CDC recunoaște „Efectele secundare semnificative” ale vaccinurilor COVID la tinerii sănătoși – solicită o revizuire independentă similară Comisiei 9/11 (VIDEO)

_ Cercetător dezvoltă căști cu anulare activă a zgomotului cu infuzie de inteligență artificială — Tech poate izola sunetele din mediu specificate de utilizator în timp real

_ Campionul mondial la javelin, Kitaguchi, pune marcajul la Tokyo

_ Kenya a avut vreme neobișnuit de caldă – un expert despachetează ce ar putea fi cauza

_ Bill Gates a devenit VAX-NEBUN... Nu vei crede noua lui idee | Dincolo de titluri

_ SICK: Omul de știință a climei sugerează să „eliminați” populația umană cu o pandemie mortală pentru a rezolva „criza climatică”

_ Harrison Butker, șefii din Kansas City Chiefs, îl aruncă pe Joe Biden și pe catolicii pro-avort în discursul de începere la Benedictine College

_ România, vizată în mega frauda din PNRR-ul Italiei: Anchetă EPPO pentru 600 milioane de euro

_ Un președinte înfuriat Trump respinge inteligent ordinul de călușă a unui comerciant după ce mincinosul în serie Michael Cohen depune mărturie (VIDEO)

_ Fostul director al CDC spune că este timpul să recunoaștem „efectele secundare semnificative” ale vaccinurilor împotriva COVID-19

_ Instanța rusă a confiscat active ale băncilor germane în valoare de milioane de euro

_ Monitorul de gaming Aorus OLED ultrawide de 49 de inchi de la Gigabyte scade la cel mai mic preț de până acum, de 969 USD

_ „Fact Checker” de stânga Snopes inversează cursul și verifică ei înșiși – Forțat să recunoască că jurnalul lui Ashley Biden este REAL

_ Merrick Garland și Chris Wray anunță cu mândrie un aparat de cenzură guvernamental pentru a viza „campanii activate cibernetic” și pentru a cenzura americanii înaintea alegerilor din 2024

_ CRINGE: Joe Biden spune că „lucrează pentru Kamala Harris” în declarațiile incomode de deschidere la recepția lunii patrimoniului AANHPI (VIDEO)

_ Oferte noi la pagina de reduceri Gateway Pundit de la MyPillow – inclusiv extravaganza de 25 USD!

_ Loviturile israeliene asupra taberei Jabalia din nordul Gazei au ucis peste 10 persoane și zeci de răniți

_ Fico din Slovacia „s-a stabilizat și mai mult” după tentativa de asasinat, judecătorul hotărăște ca suspectul să rămână în arest

_ California, condusă de democrați, impune o taxă secretă de 50 de cenți pe galon pe gaz

_ Enoriașii din Louisiana îl opresc pe un adolescent îmbrăcat în negru și înarmat cu pușcă când intră în biserica plină de familii (VIDEO)

_ Starul conservator „Cheers” John Ratzenberger explică de ce oamenii din clasa muncitoare îl susțin pe Trump: „El știe cum să construiască lucruri”

_ Ciolacu l-a felicitat pe Andrej Plenkovic, pentru obţinerea celui de-al treilea mandat ca premier al Croaţiei

_ Procesorul vechi de trei ani depășește cel mai rapid cip actual al Intel în benchmark-ul RAM — Core i9-11900K de 7 GHz depășește Core i9-14900KS de 8,3 GHz în PYPrime 32B

_ Nicuşor Dan: se fac reparaţii la pavilioanele Expoflora Mediteranean şi Tropical, din parcul Regele Mihai I

_ Controversatul caz al copacului care ar merge singur prin pădure: ce au demonstrat studiile științifice

_ Donald Trump afirmă că Netanyahu ,,a fost criticat pe bună dreptate" pentru atacul din 7 octombrie

_ Faliment, accidentări la cap și uitați de joc: cum și-a eșuat Anglia eroii de la Cupa Mondială de rugby din 2003

_ Descoperirile telomerilor care provoacă dogmele pot oferi noi perspective pentru tratamentele cancerului

_ Real Sociedad a fost învinsă cu 3-1, pe teren propriu, de Villarreal, în prologul etapei a 26-a din La Liga

_ Sărbătorile zilei din 24 februarie 2024 - Întâia şi a doua aflare a capului Sf. Proroc Ioan Botezătorul

_ Stormy Daniels a purtat o vestă antiglonț la tribunal din New York – dar s-a asigurat că nu i-a acoperit decolteul pentru camere

_ Met Gala 2024 LIVE: Rita Ora se dezbră pe toate în rochii FOARTE trăsnite în timp ce conduce vedetele care sosesc la petreceri de după - în timp ce meme reacţionează la ţinutele ciudate.

_ Sinner l-a învins pe Dimitrov şi a câştigat titlul la Miami - Este al doilea său trofeu Masters 1000

_ Poliția lansează vânătoarea urgentă pentru două fete dispărute de 13 și 17 ani care au dispărut vineri

_ TOM PARKER BOWLES evaluează mâncărurile confortabile de lux la Arlington, cunoscută anterior ca Le Caprice

_ Descoperirea reglementării ARN-ului splicing oferă o perspectivă asupra bolilor osoase

_ Horoscopul zilei de 16 aprilie 2024. Capricornii sunt hotărâți să facă o schimbare

_ Buzău. Două persoane, arestate preventiv după ce au cultivat canabis într-o casă

_ EXCLUSIV: Congresmanul Jeff Van Drew vorbește cu The Gateway Pundit în timpul MASSIVE Mega Raliu al lui Trump din Wildwood, NJ: „America se va naște din nou, omule”

_ Surpriză: Portalul bizar NYC-Dublin se închide datorită modelului OnlyFans care se expune împreună cu alte incidente șocante (VIDEO)

_ Cel mai mare raliu vreodată! Cum Wildwood a catapultat MAGA la înălțimi nemaivăzute până acum în istoria americană

_ Netflix supune publicul la un penis complet erect, în timp ce telespectatorii dezgustați clamă „porno de calitate scăzută”

_ Cum împărțeau mita medicii corupţi de la 'Marius Nasta': Utilizau o aplicaţie financiară folosită de mulți români


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24

Nr. de articole la aceasta sectiune: 1416, afisate in 24 pagini.