14:56
Comentarii Adauga Comentariu

_ Genomul nou secvențial dezvăluie povestea originii preistorice a cafelei și viitorul acesteia sub schimbările climatice

_ Genomul nou secvențial dezvăluie preistoricul cafelei povestea originii și viitorul său sub schimbările climatice

Cheia pentru cultivarea plantelor de cafea care pot rezista mai bine schimbărilor climatice în deceniile următoare ar putea fi în trecutul antic.

Cercetătorii co- conduși de Universitatea din Buffalo, au creat ceea ce ei spun că este genomul de referință de cea mai înaltă calitate până în prezent al celei mai populare specii de cafea din lume, Arabica, dezvăluind secrete despre descendența sa care acoperă milenii și continente.

Descoperirile lor, publicate în Nature Genetics, sugerează că Coffea arabica s-a dezvoltat acum mai bine de 600.000 de ani în pădurile din Etiopia prin împerechere naturală între alte două specii de cafea. Populația Arabica a crescut și a scăzut pe parcursul perioadelor de încălzire și răcire a Pământului de-a lungul a mii de ani, a constatat studiul, înainte de a fi în cele din urmă cultivată în Etiopia și Yemen, și apoi răspândită pe glob.

„Am folosit informațiile genomice. în plantele care trăiesc astăzi, pentru a reveni în timp și pentru a picta cea mai precisă imagine posibilă a istoriei lungi a Arabica, precum și pentru a determina modul în care soiurile moderne cultivate sunt legate între ele", spune autorul corespondent al studiului, Victor Albert, Ph.D. ., Empire Innovation Professor la Departamentul de Științe Biologice UB, din cadrul Colegiului de Arte și Științe.

Giantii cafelei precum Starbucks și Tim Hortons folosesc exclusiv boabe de la plante Arabica pentru a prepara milioanele de cești de cafea pe care le ei servește zilnic, totuși, parțial datorită unei diversități genetice scăzute care decurge dintr-o istorie de consangvinizare și dintr-o populație mică, Arabica este susceptibilă la mulți dăunători și boli și poate fi cultivată doar în câteva locuri din lume, unde amenințările patogenilor sunt mai mici și Condițiile climatice sunt mai favorabile.

„O înțelegere detaliată a originilor și a istoriei de reproducere a soiurilor contemporane este crucială pentru dezvoltarea de noi soiuri de Arabica mai bine adaptate la schimbările climatice”, spune Albert.

Din noul lor genom de referință, realizat folosind tehnologia de ultimă oră de secvențiere a ADN-ului și știința avansată a datelor, echipa a reușit să secvențeze 39 de soiuri de Arabica și chiar un exemplar din secolul al XVIII-lea folosit de naturalistul suedez Carl Linnaeus pentru a denumi specia.


p>Genomul de referință este acum disponibil într-o bază de date digitală disponibilă publicului.

„În timp ce există alte referințe publice pentru cafeaua Arabica, calitatea muncii echipei noastre este extrem de ridicată”, spune unul dintre membrii studiului. -lideri, Patrick Descombes, expert senior în genomică la Nestlé Research. „Am folosit abordări genomice de ultimă generație, inclusiv secvențierea ADN-ului cu lectură lungă și scurtă, pentru a crea cel mai avansat, complet și continuu genom de referință Arabica de până acum.”

Arabica este sursa a aproximativ 60% din totalul produselor de cafea din lume, cu semințele sale ajutând milioane de oameni să-și înceapă ziua sau să rămână treaz până târziu. Cu toate acestea, încrucișarea inițială care a creat-o s-a făcut fără nicio intervenție din partea oamenilor.

Arabica s-a format ca o hibridizare naturală între Coffea canephora și Coffea eugenioides, după care a primit două seturi de cromozomi de la fiecare părinte. Oamenii de știință au avut dificultăți în a identifica exact când și unde a avut loc acest eveniment de alopoliploidizare, cu estimări variind peste tot între 10.000 și 1 milion de ani în urmă.

Pentru a găsi dovezi pentru evenimentul inițial, cercetătorii de la UB și lor. partenerii și-au condus diferitele genomuri Arabica printr-un program de modelare computațională pentru a căuta semnături ale fundației speciei.

Modelele arată trei blocaje ale populației din istoria Arabica, cea mai veche având loc aproximativ 29.000 de generații – sau 610.000 de ani – în urmă. Acest lucru sugerează că Arabica s-a format cu ceva timp înainte, oriunde între 610.000 și 1 milion de ani în urmă, spun cercetătorii.

„Cu alte cuvinte, încrucișarea care a creat Arabica nu a fost ceva ce au făcut oamenii”, spune Albert. „Este destul de clar că acest eveniment de poliploidie a precedat oamenii moderni și cultivarea cafelei.”

Se crede de multă vreme că plantele de cafea s-au dezvoltat în Etiopia, dar soiurile pe care echipa le-a colectat în jurul Văii Marii Rift, care se întinde din Africa de Sud-Est până în Asia, a afișat o împărțire geografică clară. Soiurile sălbatice studiate au provenit toate din partea de vest, în timp ce soiurile cultivate toate provin din partea de est cea mai apropiată de strâmtoarea Bab al-Mandab care desparte Africa de Yemen.

Acest lucru ar fi aliniat cu dovezile că cultivarea cafelei. este posibil să fi început în principal în Yemen, în jurul secolului al XV-lea. Se crede că călugărul indian Baba Budan a scos clandestinele „șapte semințe” din Yemen în jurul anului 1600, creând soiuri arabe indiene și creând scena pentru răspândirea globală a cafelei astăzi.

„Se pare că diversitatea cafelei yemenite ar putea fi fondatorul tuturor soiurilor majore actuale”, spune Descombes. „Cafea nu este o cultură care a fost puternic încrucișată, cum ar fi porumbul sau grâul, pentru a crea soiuri noi. Oamenii au ales în principal un soi care le-a plăcut și apoi l-au cultivat. Așa că soiurile pe care le avem astăzi probabil există de mult timp. „

Istoria geoclimatică a Africii de Est este bine documentată datorită cercetărilor privind originile umane, astfel încât cercetătorii ar putea contrasta evenimentele climatice cu modul în care populațiile sălbatice și cultivate de Arabica au fluctuat în timp.

Modelarea arată o perioadă lungă de mărime scăzută a populației, între 20-100.000 de ani în urmă, care coincide aproximativ cu o secetă extinsă și un climat mai rece care se crede că a lovit regiunea în urmă cu 40-70.000 de ani. Populația a crescut apoi în perioada umedă africană, cu aproximativ 6–15.000 de ani în urmă, când condițiile de creștere erau probabil mai benefice.

În același timp, cu aproximativ 30.000 de ani în urmă, soiurile sălbatice și soiurile care ar fi în cele din urmă au devenit cultivate de oameni despărțiți unul de celălalt.

„Ei încă s-au reprodus ocazional unul cu celălalt, dar probabil s-au oprit la sfârșitul perioadei umede africane și lărgirea strâmtorii din cauza creșterii nivelului mării în jurul valorii de 8.000. cu 9.000 de ani în urmă”, spune Jarkko Salojärvi, profesor asistent la Universitatea Tehnologică Nanyang din Singapore și un alt autor corespondent al lucrării.

Arabica cultivată este estimată a avea o populație efectivă de numai 10.000 până la 50.000 de persoane. . Diversitatea sa genetică scăzută înseamnă că ar putea fi complet decimată, la fel ca monocultiva bananei Cavendish, de agenți patogeni, cum ar fi rugina frunzelor de cafea, care provoacă pierderi de 1-2 miliarde de dolari anual.

Genomul de referință a reușit să elimine. mai multă lumină asupra modului în care o linie de soiuri Arabica a obținut rezistență puternică la boală.

Soiul Timor s-a format în Asia de Sud-Est ca hibrid spontan între Arabica și unul dintre părinții săi, Coffea canephora. Cunoscută și sub numele de Robusta și folosită în principal pentru cafeaua instant, această specie este mai rezistentă la boli decât Arabica.

„Astfel, atunci când Robusta s-a hibridizat înapoi în Arabica pe Timor, a adus unele dintre genele sale de apărare patogenului. cu ea”, spune Albert, care a coordonat, de asemenea, secvențierea genomului Robusta în 2014. Lucrările actuale ale lui Albert și colaboratorilor prezintă, de asemenea, o versiune foarte îmbunătățită a genomului Robusta, precum și o nouă secvență a celorlalte specii progenitoare ale Arabica, Coffea eugenioides. .

În timp ce crescătorii au încercat să reproducă această încrucișare pentru a stimula apărarea patogenilor, noul genom de referință Arabica a permis cercetătorilor prezenți să identifice o regiune nouă care adăpostește membri ai familiei genelor de rezistență RPP8, precum și un regulator general al rezistenței. gene, CPR1.

„Aceste rezultate sugerează un loc țintă nou pentru potențial îmbunătățire a rezistenței la patogeni în Arabica”, spune Salojärvi.

Genomul a oferit și alte descoperiri noi, cum ar fi soiurile sălbatice care sunt cele mai apropiate de cafeaua Arabica modernă, cultivată. De asemenea, au descoperit că soiul Typica, un soi olandez timpuriu originar fie din India, fie din Sri Lanka, este probabil părintele soiului Bourbon, cultivat în principal de francezi.

„Munca noastră nu a fost diferită de reconstrucția. arborele genealogic al unei familii foarte importante”, spune Albert.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Asus promite să îmbunătățească claritatea cererilor de garanție și a costurilor astronomice de reparații hardware

_ Enoriașii din Louisiana îl opresc pe un adolescent îmbrăcat în negru și înarmat cu pușcă când intră în biserica plină de familii (VIDEO)

_ Victor reacționează: vrea să interzică „stocurile cu muniție mare?” Senatorul democrat se umilește (VIDEO)

_ Bill Gates a devenit VAX-NEBUN... Nu vei crede noua lui idee | Dincolo de titluri

_ „Fact Checker” de stânga Snopes inversează cursul și verifică ei înșiși – Forțat să recunoască că jurnalul lui Ashley Biden este REAL

_ Revizuirea monitorului de jocuri OLED Gigabyte Aorus CO49DQ: Culoare și contrast extraordinare

_ Harrison Butker, șefii din Kansas City Chiefs, îl aruncă pe Joe Biden și pe catolicii pro-avort în discursul de începere la Benedictine College

_ Un președinte înfuriat Trump respinge inteligent ordinul de călușă a unui comerciant după ce mincinosul în serie Michael Cohen depune mărturie (VIDEO)

_ Tot ce poate merge prost cu sânii tăi - și ce să faci în privința asta: ghidul definitiv al DR PHILIPPA KAYE

_ SICK: Omul de știință a climei sugerează să „eliminați” populația umană cu o pandemie mortală pentru a rezolva „criza climatică”

_ Starul conservator „Cheers” John Ratzenberger explică de ce oamenii din clasa muncitoare îl susțin pe Trump: „El știe cum să construiască lucruri”

_ CRINGE: Joe Biden spune că „lucrează pentru Kamala Harris” în declarațiile incomode de deschidere la recepția lunii patrimoniului AANHPI (VIDEO)

_ Procesorul vechi de trei ani depășește cel mai rapid cip actual al Intel în benchmark-ul RAM — Core i9-11900K de 7 GHz depășește Core i9-14900KS de 8,3 GHz în PYPrime 32B

_ Oferte noi la pagina de reduceri Gateway Pundit de la MyPillow – inclusiv extravaganza de 25 USD!

_ Merrick Garland și Chris Wray anunță cu mândrie un aparat de cenzură guvernamental pentru a viza „campanii activate cibernetic” și pentru a cenzura americanii înaintea alegerilor din 2024

_ Noua carte a fostului secretar de presă al WH, Jen Psaki, susține în mod fals că Biden nu s-a uitat niciodată la ceasul său în timp ce membrii morți din serviciu s-au întors din Afganistan

_ Rumble dă în judecată Google pentru peste 1 miliard de dolari pentru că a abuzat de monopolul publicitar, un alt proces antitrust este de asemenea în curs

_ Cercetător dezvoltă căști cu anulare activă a zgomotului cu infuzie de inteligență artificială — Tech poate izola sunetele din mediu specificate de utilizator în timp real

_ „Cu cât atacurile asupra lui Trump par mai inechitabile pentru public, cu atât va crește mai sus în sondaje” Elon Musk intervine asupra tribunalului cangur al lui Alvin Bragg

_ Brothers acuzați că au furat 25 de milioane de dolari în Ethereum în 12 secunde — Furtul de criptomonede a exploatat procesul de validare a tranzacțiilor

_ California, condusă de democrați, impune o taxă secretă de 50 de cenți pe galon pe gaz

_ Veteranul Marine Corp acuzat că a amenințat cu uciderea oamenilor albi în împușcături în masă

_ Monitorul de gaming Aorus OLED ultrawide de 49 de inchi de la Gigabyte scade la cel mai mic preț de până acum, de 969 USD

_ Op-Ed: Când lupta împotriva rasismului se transformă într-un atac asupra unui fost președinte și a unor adevărate victime

_ Fareed Zakaria de la CNN le spune democraților să se confrunte cu „realitatea” pe care probabil că Biden o va pierde în fața lui Trump în noiembrie (VIDEO)

_ DisplayPort 2.1 are o problemă serioasă cu cablurile certificate UHBR - ar putea explica faptul că Nvidia rămâne cu DP 1.4 pe seria RTX 40

_ Noile documente dezvăluie materiale de instruire care explică non-cetățenilor și străinilor ilegali cum se pot înregistra pentru a vota la alegerile DC

_ Michael Cohen recunoaște că a plătit fosta vedetă porno Stormy Daniels din propriul său buzunar

_ Producătorii de computere portabile pentru jocuri privesc procesoarele Intel Lunar Lake ca o alternativă la Ryzen Z1 dominant

_ Două Pico-uri Raspberry Pi alimentează acest ceas dublu elegant cu o matrice LED

_ Cel mai mare raliu vreodată! Cum Wildwood a catapultat MAGA la înălțimi nemaivăzute până acum în istoria americană

_ Aici vin roboții mincinoși cu inteligență artificială: studiul avertizează că sistemele inteligenței artificiale devin abilități în a înșela oamenii

_ Curator la Muzeul American de Istorie Naturală, arestat în Turcia pentru că ar fi contrabandit păianjeni și scorpioni (VIDEO)

_ Prințul Harry l-a făcut pe regele Charles să aleagă între el și regina Camilla – zgomotul din memoriile sale „de rezervă” ar putea să le fi afectat definitiv relația

_ Western Digital lansează noi HDD-uri de 2,5 inchi pentru prima dată în șapte ani: este 6TB cântecul lebedei pentru hard disk-urile de 2,5 inchi?

_ Există un Rob Malley 2.0 în cadrul echipei Biden?

_ Breaking: Conferința pro-Israel de la Nashville a fost anulată din cauza amenințărilor din partea grupurilor Antifa și Pro-Hamas

_ „Ați votat literalmente pentru asta” – Conservatorii îl prăjesc pe liberalul David Hogg, după ce s-a plâns de costul vieții sub Bidenomics

_ Echipajele execută demolări controlate pentru a demonta suprafața rămasă a podului prăbușit Francis Scott Key din Baltimore (VIDEO)

_ JUST IN: Comisia judiciară a Camerei ia măsuri pentru a-l ține pe Merrick Garland drept dispreț față de Congres pentru că a refuzat să predea audio din interviul lui Biden cu consilierul special Robert Hur

_ George Washington a avertizat împotriva unui „atașament pasional” față de Israel

_ Kenya a avut vreme neobișnuit de caldă – un expert despachetează ce ar putea fi cauza

_ TIRANIA: Bank of America închide contul unui jurnalist conservator independent fără explicații

_ Fostul director al CDC spune că este timpul să recunoaștem „efectele secundare semnificative” ale vaccinurilor împotriva COVID-19

_ Ukraine starts conscripting younger men for war as battles continue around Kharkiv

_ Have we reached peak generative AI?

_ Israel evicting Negev Bedouins as they block planned motorway extension

_ Inginerul din Wisconsin Nicolae Miu ia atitudine la procesul de crimă pentru a descrie modul în care a înjunghiat cinci adolescenți în „autoapărare” cu un cuțit elvețian în timpul unei zile pe Apple River, după ce l-au batjocorit cu cântece „pedofile”.

_ „Adevărul” despre sexualitatea lui Cary Grant este dezvăluit în cele din urmă: a fost subiectul zvonurilor de zeci de ani, acum un prieten a povestit totul despre iubitul său de sex masculin. TOM LEONARD explorează moștenirea legendei de la Hollywood

_ Declaraţia unui ministru de externe încaieră lumea: Cel care moare de foame este un idiot

_ Zelensky se așteaptă ca Rusia să intensifice ofensiva în nord-estul Ucrainei

_ Instanța rusă a confiscat active ale băncilor germane în valoare de milioane de euro

_ South Africa begins overseas voting for general elections end of May

_ French soldiers patrol New Caledonia after six people were killed in six days of riots

_ Alexandru Rafila, mesaj pentru medicii de familie: Voi sprijini menţinerea veniturilor

_ PATETIC: AMC pune un avertisment de declanșare pentru filmele clasice Goodfellas cu privire la „stereotipurile culturale”

_ Forțele franceze lansează „operațiune majoră” pentru deschiderea rutei către capitala agitată a Noii Caledonie

_ Președintele Georgiei Zurabishvili pune veto pe controversata „lege rusă”

_ Bătălia de la Monte Cassino: atât glorie, cât și dezonoare pentru armata franceză

_ Fico din Slovacia „s-a stabilizat și mai mult” după tentativa de asasinat, judecătorul hotărăște ca suspectul să rămână în arest


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6

Nr. de articole la aceasta sectiune: 320, afisate in 6 pagini.