18:51 2022-06-29
science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu
_ Cercetătorii dezvoltă un portal online pentru a arăta modul în care prejudecățile din secvențele de ARN afectează expresia genelor
_ Cercetătorii dezvoltă un portal online pentru a arăta modul în care distorsiunile secvențelor de ARN afectează expresia genelor
O publicație recentă a cercetătorilor de la Universitatea din Kentucky explică importanța identificării și înțelegerii modului în care diferențele dintre țesuturi și celule modifică expresia genelor fără a modifica codul genetic subiacent.
Cursele de biologie introductivă învață că ADN-ul este transcris în ARN, care este apoi tradus în proteine. Cu toate acestea, multe procese celulare afectează cât de repede au loc transcripția și traducerea. Expresia genelor analizează diferențele dintre concentrațiile de ARN dintr-o celulă și poate ajuta oamenii de știință să știe care gene sunt active în acel țesut sau celulă.
„Schimbările în expresia genelor pot afecta în mod semnificativ diferite boli și traiectorii bolii, „, a spus Justin Miller, Ph.D., profesor asistent în cadrul Departamentului de Patologie și Medicină de Laborator al Colegiului de Medicină din Marea Britanie.
Miller, care este, de asemenea, afiliat la Centrul Sanders-Brown pentru Îmbătrânire și Informatică Biomedicală, spune că el și colegii săi au dezvoltat anterior primul algoritm pentru a identifica secvențele de rampă dintr-o singură secvență de genă. Prin lucrările lor recente, Miller și colegii colegi din Marea Britanie Mark Ebbert, Ph.D. și Matthew Hodgman au creat o versiune online a acelui algoritm și au arătat că secvențele de rampă se schimbă între țesuturi și celule fără a modifica secvența ARN.
O secvență rampă face parte din secvența de ARN care încetinește translația la începutul genei prin utilizarea codonilor (secvențe a trei nucleotide ADN sau ARN) care nu sunt traduse cu ușurință. Secvențele de rampă cresc în mod contraintuitiv expresia generală a genelor prin distanțarea uniformă a mașinilor de translație și prevenirea coliziunilor ulterioare în traducere.
În publicația lor recentă în NAR Genomics and Bioinformatics, cercetătorii prezintă prima analiză cuprinzătoare a tipului de țesut și celule. -secvențe de rampă specifice și raportează mai mult de 3.000 de gene cu secvențe de rampă care se schimbă între țesuturi și tipuri de celule, ceea ce corespunde cu o expresie crescută a genelor în acele țesuturi și celule.
„Această cercetare este prima dată când această rampă variabilă. au fost descrise secvențe. Interfața noastră web cuprinzătoare permite altor cercetători să exploreze în mod creativ secvențele rampe și expresia genelor", a spus Miller.
Echipa de cercetare spune că această muncă este importantă deoarece, deși există mai multe moduri prin care ARN-ul nostru poate codifică aceleași proteine, secvența specifică de ARN este importantă pentru reglarea nivelurilor de proteine și ARN.
„În esență, o secvență de rampă funcționează ca o rampă de acces către un autostradă, astfel încât ribozomii să nu se ciocnească unul de altul, dar lungimea și limita de viteză a acelei rampe de acces se pot schimba în funcție de celulă și de resursele disponibile în acea celulă", a explicat Miller.
El spune că i-a plăcut să lucreze la acest proiect nu numai cu colegii săi din Marea Britanie, ci și cu foștii săi colegi de la Universitatea Brigham Young și cu fratele său, Kyle Miller, de la Universitatea Utah Valley. Împreună, grupul a creat o interfață web pentru ca oamenii să vadă cum secvențele de rampă corespund cu expresia umană și a genei COVID-19 în diferite țesuturi și celule.
Miller crede că această activitate va avea un impact în cele din urmă asupra îngrijirii pacientului. „Am creat o interfață online pentru cercetători pentru a interoga toate genele umane și pentru a vedea dacă o anumită genă are o secvență rampă într-un anumit țesut și cum acea genă este exprimată în acel țesut”, a spus Miller. „De asemenea, arătăm că diverse gene COVID-19 și factori umani de intrare pentru COVID-19 au secvențe de rampă care se schimbă între diferite țesuturi. Secvențele de rampă sunt mult mai probabil să apară în țesuturile în care se știe că virusul proliferează.”
Așadar, cercetătorii cred că genele COVID-19 au părtiniri genetice (secvențe de rampă) care le permit să folosească mașinile celulare disponibile pentru a-și crește expresia. „Cercetarea noastră ne poate ajuta să anticipăm mai bine ce țesuturi și celule vor infecta noile viruși și oferă, de asemenea, o țintă terapeutică potențială pentru a regla expresia genelor specifice țesuturilor fără a modifica proteina tradusă”, a spus Miller.
Comentarii:
Adauga Comentariu