08:25
Comentarii Adauga Comentariu

_ Un nou instrument de urmărire a arborelui genealogic al celulelor

_ Un nou instrument pentru urmărirea arborilor genealogici ai celulelor

Cercetătorii EPFL au dezvoltat GEMLI, un instrument de pionierat care ar putea democratiza și îmbunătăți considerabil modul în care studiem călătoria celulelor de la starea lor embrionară până la roluri specializate în organism, precum și modificările lor în cancer și alte boli. Avansul este raportat în Nature Communications.

În dansul complicat al vieții, în care celulele se înmulțesc și se diversifică pentru a forma diferite părți ale organismelor, înțelegerea originii fiecărei celule poate fi crucială. Aceasta este ceea ce biologii se referă ca „filiație celulară” – un arbore genealogic, dar pentru celule. Așa cum vă puteți urmări descendența până la bunici și nu numai, oamenii de știință pot urmări modul în care celulele se divid și evoluează dintr-o singură celulă „părinte” în diferite celule „descendenți”, fiecare având propriul rol în organism.

< Urmărirea liniilor celulare ne ajută să înțelegem cum organismele complexe, cum ar fi oamenii, se pot dezvolta dintr-un singur ou fertilizat în ființe cu trilioane de celule specializate și cum întreruperile acestui proces pot duce la boli precum cancerul. Cu toate acestea, domeniul s-a confruntat cu unele obstacole semnificative, mai ales pentru că urmărirea descendenței necesită tehnici complexe și intensive în muncă.

Acum, oamenii de știință conduși de Almut Eisele și David Suter de la EPFL au dezvoltat un instrument de calcul care poate stabiliți relațiile de descendență dintre celule fără a fi nevoie de metode experimentale specializate de urmărire a descendenței.

Instrumentul, Gene Expression Memory-based Lineage Inference (GEMLI), necesită doar secvențierea ARN cu o singură celulă (scRNA-seq. ), o tehnică utilizată pe scară largă care captează „instantanee” ale genelor care sunt exprimate de o celulă individuală la un moment dat.

GEMLI valorifică fenomenul fascinant al memoriei expresiei genelor. La fel cum vă amintiți o rețetă după ce ați făcut-o de mai multe ori, unele gene mențin intensitatea la care sunt exprimate pe parcursul mai multor generații de celule. Deci, valorificând aceste „gene de memorie” în seturile de date scRNA-seq, GEMLI poate reuni relațiile de descendență dintre diferite celule, reconstruindu-și eficient arborele genealogic pe baza exclusiv modelelor de expresie a genelor.

Oamenii de știință au testat riguros GEMLI în întreaga lume. diverse tipuri de celule și afecțiuni, inclusiv celule stem embrionare, fibroblaste, celule sanguine, celule intestinale și diferite tipuri de celule canceroase, atât in vitro, cât și in vivo. În toate testele, GEMLI s-a dovedit a fi atât robust, cât și versatil.

Echipa a aplicat, de asemenea, GEMLI probelor primare de cancer de sân uman, unde nu pot fi utilizate metode alternative de identificare a descendenței. „GEMLI funcționează cel mai bine la reconstrucția liniilor mici și mijlocii (aproximativ 30-50 de celule), permițând să măriți punctele de ramificare în timpul progresiei cancerului”, spune David Suter. „Prin identificarea celulelor la punctul de tranziție de la un fenotip in situ la un fenotip invaziv, se pot recupera gene care pot conduce la progresia cancerului.

În rezumat, GEMLI funcționează prin identificarea și valorificarea genelor de memorie într-o mare vastă de informații genetice, folosindu-le ca pesmet pentru a urmări descendența celulelor. Prin analizarea nuanțelor subtile ale expresiei genelor, GEMLI dezvăluie modul în care celulele se relaționează între ele.

GEMLI nu necesită echipament specializat sau nicio modificare a standardului. practici de laborator, este disponibil gratuit pe GitHub și permite identificarea descendenței din aproape orice set de date standard scRNA-seq. „Suntem încântați de potențialul GEMLI de a valorifica numărul mare de seturi de date scRNA-seq despre cancer uman disponibile public pentru a diseca alte tipuri de cancere. trece la un fenotip invaziv”, spune Suter.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Majoritatea copiilor sunt antrenați doar de bărbați în sportul pentru juniori — și femeile trebuie să facă parte din imagine, spun cercetătorii

_ În imagine: Rechin taur mortal care a atacat un turist britanic la doar 10 metri de țărmul Tobago, în timp ce un bărbat de 64 de ani se luptă pentru viață, iar medicii luptă să-i atașeze din nou degetele și să-i salveze piciorul mutilat.

_ În timp ce Congresul abandonează granița, 3,5 miliarde de dolari au alunecat în proiectul de lege israelian pentru „migranți și refugiați”

_ Casa mizerabilă a unei femei din Florida din Lakeland, unde polițiștii au găsit unul dintre cele mai grave cazuri de cruzime împotriva animalelor din ultimii ani

_ Un „atacator cu acid” a capturat un autobuz din Londra și ține ostatici șoferul și pasagerii: Teroare în timp ce un bărbat de 30 de ani care pretinde că are substanțe corozive deturnează vehiculul - înainte de a fi prins de poliție și dezbrăcat pe stradă

_ Mama lui Scarlett Jenkinson nu și-a deschis draperiile de la arestare, dar nimeni de aici nu o învinuiește. De la o mamă ai cărei copii au mers la aceeași școală cu ucigașii Briannei, o perspectivă surprinzătoare asupra modului în care a reacționat satul

_ Crește presiunea asupra Angelei Rayner să demisioneze din funcția de lider adjunct laburist din cauza anchetei poliției, deoarece Keir Starmer refuză de trei ori să spună dacă ar trebui să demisioneze dacă se constată că a încălcat legile electorale

_ Prietenii din copilărie ai unui băiat de 12 ani care a fost înjunghiat până la moarte de un bărbat fără adăpost spun că pedepsele pentru ucigașii de copii ar trebui să fie mai lungi, deoarece bărbatul de 76 de ani riscă eliberarea condiționată

_ Gazda LBC, Nick Ferrari, stârnește dezbateri furioase, deoarece susține că „întotdeauna” este vina cuiva dacă este obez și nu se datorează „abuzului asupra copiilor” sau „probleme genetice”: „Nu fac mișcare și îmi place vinul roșu deci sunt gras'

_ Orașul fantomă de construcție nouă: Peste 30 de proprietăți noi-nouțe sunt lăsate abandonate și blocate pe fondul unui rând de planificare „după ce dezvoltatorul a rămas fără bani pentru a finaliza lucrările din cauza întârzierilor consiliului”

_ Irina Rimes, şedinţă foto realizată în Dubai. În ce ipostaze a fost surprinsă artista şi de cine?

_ Josef Fritzl „aproape de lacrimi” când i s-a acordat transferul din închisoare pentru bolnavii mintal, în primul pas al cererii sale de eliberare condiționată - deoarece monstrul incestului este văzut în afara închisorii pentru prima dată în 15 ani

_ Oficialii ruși ai spațiului spun că scurgerea de aer de la Stația Spațială Internațională nu prezintă niciun pericol pentru echipajul său

_ URIAȘĂ – Supraveghere judiciară: CIA a fost implicată în răspunsul din 6 ianuarie – Tehnici de bombă desfășurate, echipe de câini, texte dezvăluite

_ Alan Brazilia nu se prezintă la emisiunea de mic dejun talkSPORT, un prezentator de urgență obligat să intervină după o zi petrecută în baruri la Cheltenham

_ Tesla are o scădere cu 7% după ce a înregistrat primul scădere a vânzărilor de la pandemie: experții spun că căderea este un „dezastru neatenuat”

_ Mercedes-Simplex 60 CP cumpărat de fondatorul Daily Mail, Alfred Harmsworth, urmează să devină cea mai scumpă mașină antică vândută vreodată la licitație

_ Poliția arestează o femeie de 23 de ani și bărbați de 30 și 32 de ani pentru crimă, după ce o femeie a intrat în stop cardiac și moare


Pag.1
Nr. de articole la aceasta sectiune: 18, afisate in 1 pagina.