17:12 2022-06-29
science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu
_ Strălucește puțină lumină asupra unui proteom obscur
_ Luminează un proteom obscur< /h3>
Proteomica bazată pe spectrometrie de masă este știința de date mari a proteinelor care permite monitorizarea abundenței a mii de proteine dintr-o probă simultan. Prin urmare, este o citire deosebit de potrivită pentru a descoperi care proteine sunt vizate de orice moleculă mică. O echipă internațională de cercetare a investigat acest lucru folosind proteomica chimică.
Inhibitorii histonei deacetilazei (HDAC) sunt o clasă de medicamente utilizate în oncologie. O echipă internațională de cercetare care implică oameni de știință de la Universitatea Tehnică din München (TUM), Universitatea Cornell din Ithaca (S.U.A.), Centrul German de Cercetare a Cancerului (DKFZ) din Heidelberg și Universitatea Martin Luther din Halle-Wittenberg a investigat acum efectele unor HDAC droguri mai detaliat. Oamenii de știință au cercetat dacă acele epidroguri afectează alte proteine decât HDAC-urile pe care sunt proiectate să le inhibe.
„Pentru a face acest lucru, metoda de alegere este deconvoluția țintă prin proteomica chimică. Prin urmare, am creat mai întâi noi instrumente chimice — așa-numitele matrici de afinitate — care ne-ar permite să profilăm sistematic HDAC-urile”, explică dr. Guillaume Médard, lider de grup pentru proteomică chimică la catedra TUM de Proteomică și Bioanalitică condusă de prof. Bernhard Küster.
Profilarea medicamentelor HDAC prin proteomică chimică
„Am analizat 53 de medicamente și cele mai multe dintre ele, dar nu toate, și-au atins ținta HDAC intenționată”, a declarat Severin Lechner, doctorand la Școala de Științe Vieții TUM. „Au existat, totuși, câteva surprize. Medicamentele folosite în sute de studii științifice nu au fost atât de selective pe cât se presupunea. Multe aveau ținte suplimentare care nu erau cunoscute anterior.”
Aceste rezultate evidențiază puterea abordări proteomice, deoarece pot sonda legarea la mii de proteine simultan. În cele din urmă, echipa a identificat mai multe molecule cu o selectivitate remarcabilă, făcându-le inhibitorii de alegere pentru studii științifice viitoare.
Peisajul țintă al medicamentelor HDAC
„Cea mai neașteptată descoperire a fost că MBLAC2 este în afara țintei pentru jumătate din moleculele profilate”, continuă Lechner. Această proteină nu este bine caracterizată. Întâmplător, echipa prof. Maurine Linder din Cornell a cercetat în același timp. Cele două grupuri au colaborat și au confirmat că proteina este într-adevăr împiedicată în îndeplinirea funcției sale în prezența medicamentelor.
Lucând cu grupul Prof. Michael Pfaffl de la TUM, Lechner a examinat efectele fenotipice inexplicabile sugerate ale unora. medicamente și a demonstrat că inhibarea sau knock-down-ul MBLAC2 duce la o acumulare de vezicule extracelulare în spațiul extracelular. Veziculele extracelulare sunt particule mici delimitate de membrană secretate de celule și transportate prin întregul corp pentru a transmite biomolecule și informații între celule și țesuturi.
Cercetare fundamentală pentru a face epimedicamentele de mâine
„Suntem încântați pentru că am descoperit un nou jucător în acest domeniu al biologiei, care cuprinde în special exozomi, care joacă roluri cruciale în neurologie, imunologie și oncologie", explică Médard. „Acum proiectăm molecule care lovesc doar MBLAC2, astfel încât să putem sonda această proteină obscure într-o serie de sisteme model.”
Acest studiu va fi util celor care doresc să utilizeze inhibitori HDAC pentru a cerceta biologia sau pentru uz terapeutic. Ajută la alegerea instrumentului chimic potrivit. Este, de asemenea, un set valoros de date pentru chimiștii medicinali care trebuie să înțeleagă modul în care structurile chimice se leagă de potență și selectivitate pentru a produce epidrogurile de mâine.
Cercetarea a fost publicată în Nature Chemical Biology.
Comentarii:
Adauga Comentariu