15:06
Comentarii Adauga Comentariu

_ Noua tehnică sensibilă și robustă de secvențiere a ARN-ului unicelular depășește concurența

_ Nou sensibil și robust Tehnica de secvențiere a ARN-ului unicelular depășește concurența

Apariția secvențierii ARN-ului unicelular (scRNA-seq) a revoluționat domeniile medicinei și biologiei, oferind capacitatea de a studia funcționarea interioară a mii de celule la o singura data. Dar metodele scRNA-seq sunt limitate de potențialele inexactități în determinarea compoziției celulelor și de amplificarea ineficientă a ADN-ului complementar complementar (ADNc) - un proces prin care un ADN dublu catenar care „completează” ARN-ul monocatenar este generat și replicat de milioane de ori – prin reacția de schimbare a șablonului folosită în mod obișnuit.

Recent, o echipă de cercetare din Japonia, condusă de prof. asistent Shigeyuki Shichino și prof. Kouji Matsushima de la Universitatea de Științe din Tokyo, a dezvoltat o tehnică nouă și îmbunătățită pentru scARN-seq. Noua metodă, amplificarea și secvențierea ADNc în fază solidă asistată de terminator (TAS-Seq), folosește materiale și echipamente simple pentru a furniza date scRNA-seq de mai mare precizie decât tehnologiile actuale utilizate pe scară largă.

„Noastre. tehnica, TAS-Seq, combină sensibilitatea de detectare genetică, robustețea eficienței reacției și acuratețea compoziției celulare pentru a ne permite să captăm informații celulare importante”, spune prof. asistent Shichino. Studiul a fost publicat în Communications Biology pe 27 iunie 2022. Echipa de cercetare a inclus și prof. asociat Satoshi Ueha de la Universitatea de Științe din Tokyo, prof. Taka-aki Sato de la Universitatea din Tsukuba și prof. Shinichi Hashimoto de la Universitatea de Medicină Wakayama .

TAS-Seq folosește o enzimă independentă șablon pentru amplificarea cADN numită transferază terminală (TdT). Dar TdT este greu de manevrat. Pentru a depăși această provocare, echipa de cercetare a inclus fosfatul dideoxinucleotid (ddNTP) ca „terminator” pentru reacția de amplificare a ADNc. „DdNTP spike-in, în special dideoxicitidină fosfat (ddCTP), oprește extinderea excesivă a cozii polyN de către TdT într-o manieră stocastică și reduce foarte mult dificultățile tehnice ale reacției TdT”, explică prof. asistent Shichino.

TAS-Seq folosește, de asemenea, o platformă scRNA-seq bazată pe nanowell/bead-based, care permite izolarea celulelor individuale în probele de țesut, scăzând astfel prejudecățile de eșantionare celulară și îmbunătățind acuratețea datelor despre compoziția celulelor. Echipa de cercetare a verificat apoi eficiența TAS-Seq și a comparat-o cu tehnicile actuale, utilizate pe scară largă, scRNA-seq, 10X Chromium V2 și Smart-seq2, folosind mostre de țesut pulmonar murin și uman. Ei au descoperit că TAS-Seq ar putea nu numai să detecteze mai multe gene în general, ci și să identifice gene mai variabile, în comparație cu platformele majore de scRNA-seq.

Prof. asistent Shichino spune: „Am descoperit că TAS- Seq poate depăși 10X Chromium V2 și Smart-seq2 în ceea ce privește sensibilitatea de detectare a genelor și ratele de abandon al genelor, ceea ce indică faptul că TAS-Seq ar putea fi una dintre cele mai sensibile metode de ARNc de mare debit. Putem detecta gene într-o gamă largă de nivelurile de expresie mai uniform și detectează, de asemenea, factorul de creștere și genele interleukinei mai robust.”

Un avantaj suplimentar al noii metode este că TAS-Seq este mai puțin susceptibil la efectele lotului. Datele TAS-Seq au fost, de asemenea, foarte corelate cu datele citometrice în flux de pe probele de țesut, ceea ce indică faptul că pot genera date de compoziție celulară extrem de precise.

Vorbind despre viitor, prof. asistent Shichino spune: „Avem deja finalizată dezvoltarea TAS-Seq2, o versiune îmbunătățită și optimizată pe scară largă a TAS-Seq. TAS-Seq2 are de 1,5 până la 2 ori mai multă detectare a genelor în celulele splinei de șoarece.” Echipa de cercetare a înființat, de asemenea, ImmunoGenetics, o companie de risc de la Universitatea de Știință din Tokyo, pentru a furniza servicii scRNA-seq folosind TAS-Seq și TAS-Seq2.

scRNA-seq este un instrument important pentru cercetătorii în medicină și biologie. Dezvoltarea TAS-Seq și TAS-Seq2 va duce la descoperirea de noi ținte terapeutice pentru boli și progrese în domeniul „transcriptomiei spațiale”, care se bazează, de asemenea, pe sinteza cADN-ului în fază solidă. De asemenea, va accelera dezvoltarea tehnologiei omice unicelulare, promovând astfel înțelegerea noastră a principiilor biologiei și dezvoltării și progresiei bolii.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Bodyguardul Dianei spune că ar fi încă în viață dacă el ar fi fost de serviciu în noaptea în care a murit

_ Fără gratuități! MCC se pregătește să meargă împotriva tendinței de intrare gratuită pentru ultima zi de meciuri de testare

_ MAFS: Jessica Seracino este cea mai recentă vedetă de reality care s-a alăturat OnlyFans

_ Shattered Johnathan Thurston izbucnește în lacrimi și recunoaște că este SUPARAT pentru moartea lui Paul Green

_ Națiunea Alex de licență dezvăluie trucul ei cu sex sălbatic și cum i-a câștigat o poreclă foarte grosolană

_ Războiul din Ucraina, ziua 174. Luptele continuă în apropierea centralei Zaporojie. AIEA este îngrijorată de evoluţia evenimentelor

_ Iranul răspunde la proiectul de text al UE pentru salvarea acordului nuclear din 2015 și caută flexibilitatea SUA

_ Fiica lui Kim Zolciak, Ariana Biermann, a spus că nu a băut și a folosit doar marijuana înainte de DUI

_ MARK LEATHER INSIGHT: Erik ten Hag a anulat ziua liberă pentru a trimite un mesaj jucătorilor de la Manchester United

_ Nathalie Kelly susține că albii nu ar trebui să poarte NICIODATĂ pene în păr la festivalurile de muzică

_ Olivia Frazer din Married At First Sight debutează „nouă iubire” la doar o săptămână după despărțirea de Jackson Lonie

_ NBA: Kevin Durant dezvăluie că ar prefera PENSIUNEA decât să se întoarcă la Brooklyn sezonul viitor

_ Sam Frost împărtășește semnificația din spatele inelului ei de logodnă și dezvăluie că își va păstra numele de familie

_ Planul lui Keir Starmer de a îngheța facturile la energie criticat de economiști, fostul cancelar și John McDonnell

_ Mishriff îl poate învinge pe „genial talentat” Baaeed la York, susține antrenorul Thady Gosden

_ Băiatul rău NRL Corey Norman „a încercat să-și bage degetul pe spatele unui adversar”, precum John Hopoate

_ Gary Neville alege lovitura câștigătoare a titlului lui Sergio Aguero drept cel mai emblematic moment al său în Premier League

_ Milly Alcock și Matt Smith conduc vedetele care participă la premiera Sky's House Of The Dragon

_ Nadia Bartel pare abătută când a eliberat un bilet de parcare în Melbourne după vacanța europeană

_ Federalele se opun dezigilarii declarației pe propria răspundere în spatele raidului asupra proprietății lui Trump din Florida

_ The Block renunță la Elle Ferguson și Rachel Carr, înlocuitoarea lui Joel Patfull, PĂRĂSEȘTE emisiunea

_ Gabrielle Epstein își prezintă abdomenul și decolteul cavernos într-o rochie decupată.

_ Rapperul american A$AP Rocky acuzat de filmare

_ În interiorul orașului ciudat cu 4.000 de australieni, numit noul Byron Bay

_ Florence Pugh îmbracă o salopetă roz transparent și flori în păr la un festival de muzică cu prietenii

_ Morning Joe Glume despre Russiagate, spune: �Oamenii fac greșeli� � Polițistul murdar Peter Strzok răspunde astfel: �Absolut, publicul american ar trebui să aibă �ncredere... �n FBI...� (VIDEO)

_ Kevin Durant ar prefera să SE RETIREA, decât să se întoarcă la Nets, spune „directorul echipei NBA bine conectat”

_ Amber Turner și Chloe Brockett, de la TOWIE, uimesc în parteneriate pline de buste în timp ce participă la petrecerea de lansare a seriei

_ Cititorul de știri Channel Seven s-a grăbit la spital după un accident urât în ​​timpul unui bal de caritate

_ „Fact-Checker” de stânga este deținut de un medic strălucit din Michigan despre frauda electorală din Detroit

_ Președintele Mexic îndeamnă la „calm” după weekendul de violență declanșat de arestarea liderului cartelului

_ Gary Neville și Jamie Carragher îl critică pe Darwin Nunez de la Liverpool după cartonașul roșu la debutul în Anfield

_ Suspect arestat în fața restaurantului coreean din Oxford Street, unde „colegul” a fost înjunghiat de moarte

_ Gabby Douglas vorbește despre „iadul” pe care l-a îndurat în timp ce se antrena pentru Jocurile Olimpice din 2016

_ Marina se retrage din patrulele de imigranți și nu va prelua criza în barele din Canal, susține raportul

_ Șeful Ucas vrea să vadă mai mulți studenți din Nigeria, Ghana și Vietnam în universitățile din Marea Britanie

_ Peaky Blinders este cea mai vizionată emisiune de pe iPlayer anul acesta, depășind Jubileul de platină al Reginei

_ Ashley Roberts își arată silueta senzațională într-un bikini suplu, în timp ce trăiește în Mykonos

_ Nicole Richie își decupează o silueta elegantă în rochie de soare mov după ce a luat prânzul cu o prietenă în Malibu

_ MAFS: Jessica Seracino este cea mai recentă vedetă de reality care s-a alăturat OnlyFans

_ Fiica lui Kim Zolciak, Ariana Biermann, a spus că nu a băut și a folosit doar marijuana înainte de DUI

_ Jack Harlow și Måneskin se retrag de la festivalul Reading și Leeds pentru a cânta în SUA

_ Starul RHONJ Teresa Giudice și soțul Luis Ruelas împart un sărut în luna de miere din Mykonos

_ Helen Skelton urmărește dansatorul profesionist în timp ce se înscrie la Strictly Come Dancing

_ Mai multe minciuni: inflația magică de 0% a lui Joe Biden costă familiile americane 717 USD �n plus pe lună (video)

_ CIA încalcă dreptul la confidenţialitate al civililor prin spionaj. Agenţia de informaţii americană a fost dată în judecată

_ Fostul primar al NY Giuliani este acum o „țintă” în sondajul privind interferența electorală din Georgia

_ Kyrgios 'indisponibil' pentru Australia la Cupa Davis

_ EDEN CONFIDENTIAL: Necazurile de nunta in timp ce nepoata lui Sir Sean Connery anuleaza logodna

_ În perioada 12-15 august, prin punctele de frontieră au trecut peste 1.500.000 de persoane -Frontiera cu Ungaria, cea mai tranzitată

_ Iranul răspunde la proiectul de text al UE pentru salvarea acordului nuclear din 2015 și caută flexibilitatea SUA

_ Lansarea unui nou smartphone destinat exclusiv copiilor în Australia de către Opel Mobile

_ Anthony Taylor se pregătește să continue să arbitreze meciurile lui Chelsea

_ Lee Holmes Desi Lamb: Bucătarul Supercharged Health spune că aceasta este cea mai bună cină vreodată

_ Fosta lui Kyle Sandilands, Imogen Anthony, se dezbrăcă goală și suge un  vape într-o ședință foto neplăcută

_ Franciza Real Housewives urmează să se extindă în Africa cu noi spectacole în Nairobi și Pretoria

_ Emma Roberts arată elegant șic într-o rochie florală în timp ce iese să facă câteva comisioane în LA

_ The Block renunță la Elle Ferguson și Rachel Carr, înlocuitoarea lui Joel Patfull, PĂRĂSEȘTE emisiunea

_ Rose Ayling-Ellis dezvăluie prima păpușă Barbie cu aparate auditive

_ Cel mai recent atac al stângii Rachel Campos-Duffy asupra catolicismului și a Rozariului: „Primul lucru pe care îl fac comuniștii este să distrugă și să atace religia – trebuie să scape de ea” (VIDEO)


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13

Nr. de articole la aceasta sectiune: 755, afisate in 13 pagini.



ieri 08:57 _ PSYCHOS
ieri 08:57 _ CONTEMPORANĂ
ieri 08:57 _ POVESTI SCURTE
ieri 08:57 _ TREBUIE CITITĂ
ieri 08:56 _ IMAGINA ACESTA
ieri 08:56 _ ISTORIC
ieri 08:56 _ COPII
ieri 08:56 _ CRIMINĂ