20:55
Comentarii Adauga Comentariu

_ CRISPRing microbiomul este chiar după colț

_ CRISPRing microbiomul este aproape colțul

Până în prezent, enzimele CRISPR au fost folosite pentru a edita genomurile unui tip de celulă la un moment dat: ele taie, șterg sau adaugă gene unui anumit tip de celulă dintr-un țesut sau organ, pt. de exemplu, sau la un fel de microb care crește într-o eprubetă.

Acum, grupul de la Universitatea din California, Berkeley, care a inventat tehnologia de editare a genomului CRISPR-Cas9 cu aproape 10 ani în urmă, a găsit o modalitate de a adăuga sau modifica simultan genele într-o comunitate de mai multe specii diferite, deschizând ușa către ceea ce s-ar putea numi „editare comunitară”.

Deși această tehnologie este încă aplicată exclusiv în setările de laborator, ar putea fi folosită atât pentru editare, cât și pentru pentru a urmări microbii editați într-o comunitate naturală, cum ar fi în intestin sau pe rădăcinile unei plante în care se adună sute sau mii de microbi diferiți. O astfel de urmărire devine necesară pe măsură ce oamenii de știință vorbesc despre modificarea genetică a populațiilor microbiene: inserarea genelor în microbi din intestin pentru a remedia problemele digestive, de exemplu, sau modificarea mediului microbian al culturilor pentru a le face mai rezistente la dăunători.

Fără o modalitate de a urmări inserțiile de gene – folosind un cod de bare, în acest caz – astfel de gene inserate ar putea ajunge oriunde, deoarece microbii împart în mod obișnuit gene între ei.

„Spărgerea și schimbarea ADN-ului în microorganismele izolate a fost esențial pentru înțelegerea a ceea ce face ADN-ul”, a spus colegul postdoctoral de la UC Berkeley, Benjamin Rubin. „Această lucrare ajută la aducerea acestei abordări fundamentale asupra comunităților microbiene, care sunt mult mai reprezentative pentru modul în care acești microbi trăiesc și funcționează în natură.”

În timp ce abilitatea de a „pusca” edita multe tipuri de celule sau microbi la o dată ar putea fi utilă în sistemele actuale la scară industrială - bioreactoare pentru cultivarea celulelor în vrac, de exemplu, aplicarea mai imediată poate fi un instrument de înțelegere a structurii comunităților complexe de bacterii, arhei și ciuperci și a fluxului de gene în cadrul acestor diverse. populațiile.

„În cele din urmă, este posibil să reușim să eliminăm genele care provoacă boli în bacteriile intestinale sau să facem plantele mai eficiente prin proiectarea partenerilor lor microbieni”, a spus colegul postdoctoral Brady Cress. „Dar probabil, înainte de a face asta, această abordare ne va oferi o mai bună înțelegere a modului în care microbii funcționează într-o comunitate.”

Rubin și Cress – ambele în laboratorul inventatorului CRISPR-Cas9 Jennifer Doudna – și Spencer Diamond, un om de știință în cadrul Innovative Genomics Institute (IGI), se numără printre co-autorii unei lucrări care descrie tehnica care a apărut astăzi (6 decembrie) în revista Nature Microbiology.

Din recensământ. la editare

Diamond lucrează în laboratorul lui Jill Banfield, un geomicrobiolog care a fost pionier în domeniul secvențierii comunitare sau al metagenomicii: Secvențierea cu pușcă a întregului ADN într-o comunitate complexă de microbi și asamblarea acestui ADN în genomul complet. dintre toate aceste organisme, dintre care unele probabil nu au mai fost văzute înainte și multe dintre ele sunt imposibil de crescut într-un vas de laborator.

Secvențierea metagenomică a avansat enorm în ultimii 15 ani. În 2019, Diamond a asamblat 10.000 de genomi individuale din aproape 800 de specii microbiene din probe de sol colectate dintr-o pajiște din California de Nord.

Dar el compară acest lucru cu realizarea unui recensământ al populației: oferă informații de neegalat despre microbii care sunt prezent în ce proporții și ce funcții ar putea îndeplini acești microbi în cadrul comunității. Și vă permite să deduceți interacțiuni complicate între organisme și modul în care acestea pot lucra împreună pentru a obține beneficii importante ale ecosistemului, cum ar fi fixarea azotului. Dar aceste observații sunt doar ipoteze; Sunt necesare noi metode pentru a testa efectiv aceste funcții și interacțiuni la nivel de comunitate, a spus Diamond.

„Există această idee a transferurilor metabolice — că niciun microb individual nu îndeplinește un șir imens de funcții metabolice, dar, în cea mai mare parte, fiecare organism individual face un singur pas dintr-un proces și că există să fie un transfer de metaboliți între organisme”, a spus el. „Aceasta este ipoteza, dar cum demonstrăm de fapt acest lucru? Cum ajungem într-un punct în care nu mai urmărim doar păsările, putem de fapt să facem câteva manipulări și să vedem ce se întâmplă? Aceasta a fost geneza editare comunitară.”

Echipa de cercetare a fost condusă de Banfield, profesor UC Berkeley de științe pământului și planetare și de științe de mediu, politici și management, și Jennifer Doudna, profesor de biologie moleculară și celulară UC Berkeley și de chimie, investigator al Institutului Medical Howard Hughes și co-câștigător al Premiului Nobel pentru Chimie în 2020 pentru invenția CRISPR-Cas9 editarea genomului.

Echipa a dezvoltat mai întâi o abordare pentru a determina ce microbi dintr-o comunitate sunt de fapt susceptibili. la editarea genelor. Tehnica de screening dezvoltată de Rubin și Diamond, numită ET-seq (secvențierea transformării mediului), folosește ca sondă un transposon, sau genă de săritură, care se inserează cu ușurință aleatoriu în mulți genomi microbieni. Prin secvențierea ADN-ului comunității înainte și după introducerea transpozonului, aceștia au reușit să identifice speciile de microbi care au putut să încorporeze gena transpozonului. Abordarea s-a bazat pe tehnici dezvoltate de co-autorul Adam Deutschbauer la Laboratorul Național Lawrence Berkeley. Într-un experiment care a implicat o comunitate de nouă microbi diferiți, aceștia au introdus cu succes același transpozon în cinci dintre ei folosind metode de transformare diferite.

Cress a dezvoltat apoi un sistem de livrare țintită numit ARN All-in-one de editare a ADN-ului -CRISPR Cas Transposase (DART) ghidată care utilizează o enzimă CRISPR-Cas similară cu CRISPR-Cas9 pentru a ajunge la o anumită secvență de ADN și pentru a introduce un transpozon cu cod de bare.

Pentru a testa tehnica DART cu un Comunitatea microbiană mai realistă, cercetătorii au luat o probă de scaun de la un copil și l-au cultivat pentru a crea o comunitate stabilă compusă în mare parte din 14 tipuri diferite de microorganisme. Ei au reușit să editeze tulpini individuale de E. coli în cadrul acelei comunități, țintind gene care au fost asociate cu boli.

Cercetătorii speră să folosească tehnica pentru a înțelege comunitățile artificiale, simple, cum ar fi o plantă și ea. microbiomul asociat, într-o cutie închisă. Ei pot apoi manipula genele comunității în cadrul acestui sistem închis și pot urmări efectul asupra microbilor lor codați de bare. Aceste experimente sunt un aspect al unui program de 10 ani finanțat de Departamentul de Energie numit m-CAFEs, pentru analiza comunității microbiene și evaluarea funcțională a solurilor, care urmărește să înțeleagă răspunsul unui microbiom simplu de iarbă la schimbările externe. Banfield, Doudna și Deutschbauer fac parte din proiectul m-CAFEs.

Alți co-autori ai lucrării sunt Alexander Crits-Christoph, Yue Clare Lou, Adair Borges, Haridha Shivram, Christine He, Michael Xu , Zeyi Zhou, Sara Smith, Rachel Rovinsky, Dylan Smock, Kimberly Tang, Netravathi Krishnappa și Rohan Sachdeva de la UC Berkeley; Trenton Owens de la Berkeley Lab; și Rodolphe Barrangou de la Universitatea de Stat din Carolina de Nord.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

PS Ambrozie CRITICĂ ABERAȚIILE MARXISTE ALE LUI IOHANNIS Când un șef de stat îți spune că sistemul de sănătate a eșuat înseamnă că el este vinovatul pentru eșuarea în toate domeniile.El și Greta Trotineta care sunt cu încălzirea de la flatulațiile vacilor

_ Camila Cabello face o oprire noaptea târziu la magazinul sexual Adam și Eva din West Hollywood

76% din populația Statelor Unite e vaccinată. La ce a folosit Vaccinul? LA NIMIC....Iată cifrele

_ Găsirea unei legături între taxele pe emisii și investițiile în cercetare și dezvoltare

_ Sondajul arată că sprijinul scoției pentru independența crește în mijlocul Partygate

_ Jocurile Olimpice de iarnă: Tot ce trebuie să știți despre luge și schelet la Jocurile din 2022 de la Beijing

_ Ar putea acest dispozitiv de fertilitate de 49 de lire sterline să transforme modul în care femeile concep?

_ Paza de coastă italiană a salvat 305 migranţi înghesuiţi într-o ambarcaţiune, aflată în dificultate

_ Nadiya Bychkova, proaspăt singură, prezintă o expoziție cu picioare lungi în LBD

_ Situație SCANDALOASĂ - Profesor cercetat după ce a fost înregistrat la ore făcând afirmaţii jignitoare la adresa femeilor

_ Vaccinat cu 3 doze! M-am infectat. Nu-mi vine să cred! Ce să fac? Mă simt ca şi cum mi se desprinde carnea de pe os,a scris laureatul Nobel pentru Pace din 1983

Un gunoi de țară TOTALITARISTĂ numită AUSTRALIA. Președintele sârb lansează un atac extraordinar asupra Australiei asupra lui Novak Djokovic

_ Doctorul britanic, 31 de ani, este ucis de un glonț rătăcit în Atlanta, în timp ce zăcea în PAT

_ Testele de vehicule cu conducere autonomă din Marea Britanie sunt lansate în Milton Keynes, în timp ce MailOnline testează AutoPod-ul lui Aurrigo

_ Poți rămâne fără actele de identitate dacă nu dovedești că locuiești la adresa din Buletin. ADIO și cu zeci de persoane la aceeași adresă (proiect)

_ Ant și Dec conduc un camion uriaș Britain's Got Talent în timp ce filmează un segment interesant

_ Premier Ciuca sits down with education union representatives

_ Un școlar luminos, de 15 ani, câștigă o bursă de 80.000 de lire sterline la Eton

_ Iran, China și Rusia organizează exerciții navale comune în Oceanul Indian, în timp ce Putin se pregătește să înfrunte Ucraina

_ Sute de trupe britanice pregătite pentru luptă ar putea fi trimise la vecinii NATO ai Ucrainei

_ Fugatorul FBI care și-a prefăcut moartea și a fugit din SUA pentru Scoția riscă extrădarea pentru acuzații de agresiune sexuală

_ Helen Skelton împărtășește fotografii adorabile ale fiicei ei nou-născute, Elsie, în timpul unei plimbări de iarnă

_ Florin Cîţu vorbeşte din nou despre criză economică în România

_ Arabella Chi este acuzată de un eșec Photoshop, deoarece fanii observă „sticlă curbată” în jurul posteriorului ei

_ Nicușor Dan îi atacă pe sindicaliștii STB: 'Nu a existat altă solicitare decât demisia domnului Criţ, ceea ce este un gest infantil'

_ Newcastle VA călători în Arabia Saudită pentru o tabără de antrenament pe vreme caldă

_ Agenții federali returnează artefacte vechi de 4.000 de ani guvernului irakian

_ Myleene Klass arată fără efort șic într-o rochie florală vintage și un trenci clasic

_ EnviMin Barna Tanczos: We'll support French presidency to achieve a free of toxic substances environment

_ Prejudecățile de gen în grupurile de laborator nu sunt înrădăcinate în preferințele personale

_ Jocurile Olimpice de iarnă: Tot ce trebuie să știți despre schiul fond la Jocurile din 2022 de la Beijing

_ Data la care începe Postul Paștelui

_ Globaliștii de la Forumul Economic Mondial sunt fericiți că se �nțeleg cu toții � șocați că nimeni nu are �ncredere �n ei

_ Actualizare cu privire la sistemul de comentarii de la The Gateway Pundit

_ Mark Wright sărbătorește 35 de ani de naștere în stil cu o petrecere luxoasă alături de soția sa Michelle Keegan

_ EXCLUSIV „Nu-mi dau la bătaie ce simte prințul Andrew, este un om oribil și urât”: fosta servitoare a lui Duke

_ Liverpool: Jurgen Klopp spune că Alex Oxlade-Chamberlain ar putea juca împotriva Crystal Palace

_ Secretarul general adjunct al NATO a exclus orice posibilitate de negociere a prezenţei militare a NATO pe teritoriul ţărilor membremilitare a NATO pe teritoriu

_ COMENTARIU Sorin Avram: Haideţi să mergem pe mâna preşedintelui CSAT, Klaus Iohannis, acest Leneş Curcanul

_ Farhad Moshiri crește participația la Everton la 94%... în timp ce le scrie fanilor nemulțumiți

_ Former PM Citu, worried about evolution of some economic indicators, rising before economic crisis

_ Băiatul de 19 ani, bolnav de terminal, își dă economiile de 1.000 de lire sterline pentru a-l ajuta pe un copil de șase ani să învingă cancerul

_ A nu te întâlni cu fostul celui mai bun prieten al tău te poate expune unui risc mai mare de apariție a unei ITS

_ Folosind gheața pentru a fierbe apa: un cercetător face o descoperire a transferului de căldură care se extinde pe principiul secolului al XVIII-lea

_ Judy Murray se alătură Cameo: mama starului de tenis Andy este cea mai recentă celebritate care s-a alăturat serviciului de mesaje online

_ Julianne Hough spune că a dus-o pe Nina Dobrev la îngrijiri de urgență „de mai multe ori pot număra”

ODĂ PORNOGRAFIEI NEOMARXISTE, ARIA ROGOJANU. Neomarxistul cu fibrilații de frustrare sexuala, care răspunde la numele de Rogojanu, pripășit acum pe la Libertatea sorosisto-securistoidă de tip Tolontan, laudă o pornografie scârboasă pe care o numește "poem"

_ O coaliţie de organizaţii anti-război şi mii de activişti pentru pace au cerut eliberarea fondatorului WikiLeaks

_ Podcasterul BBC Deborah James, care are cancer incurabil, spune că se simte „fărâmată în bucăți”

_ Naomi Campbell conduce vedetele la show-ul Dior Homme Paris Fashion Week

_ Le-a ajuns cuțitul la os! Transportatorii din România, solidari cu greviștii STB: 'Vom opri transportul public local, urban și metropolitan în toată țara'

_ Sunderlandul lui Jermaine Defoe revine în așteptare, cu Lee Johnson „reticent” să semneze atacantul veteran

_ Prima detectare a particulelor „X” exotice în plasma cuarc-gluon

_ Lottie Moss își etalează silueta incredibilă într-o rochie adâncă în timpul fotografiilor tropicale

_ Vedeta Acasă și în deplasare Ada Nicodemou, în vârstă de 44 de ani, își arată chipul fără vârstă

_ La mulți ani de 18 ani Prințesa Ingrid Alexandra! Moștenitorul tronului sărbătorește ziua de hotar

_ Firma de investiții private Carlisle Capital „face o ofertă oficială administratorilor lui Derby”

_ Sărituri cu schiurile: Tot ce trebuie să știți pentru Jocurile Olimpice de iarnă 2022

_ Mama vorbește despre starea rară a fiului ei, care îl vede mâncând scutece și mobilier

_ Erupție de nivel mediu izbucnește din soare


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20

Nr. de articole la aceasta sectiune: 1193, afisate in 20 pagini.