16:32
Comentarii Adauga Comentariu

_ Noul software simulează rapid structurile glicoproteice pentru a accelera dezvoltarea medicamentelor

_ Noul software simulează rapid structurile glicoproteice pentru a accelera dezvoltarea medicamentelor

Proteinele nu numai că îndeplinesc funcțiile care sunt esențiale pentru supraviețuirea celulelor, ci influențează și dezvoltarea și progresia bolilor. Pentru a înțelege rolul lor în sănătate și boală, cercetătorii studiază structura atomică tridimensională a proteinelor folosind atât metode experimentale, cât și metode computaționale.

Peste 75 la sută din proteinele prezente la suprafața celulelor noastre sunt acoperite de glicani. Aceste molecule asemănătoare zahărului formează scuturi de protecție foarte dinamice în jurul proteinelor. Cu toate acestea, mobilitatea și variabilitatea zaharurilor fac dificilă determinarea modului în care se comportă aceste scuturi sau a modului în care influențează legarea moleculelor de medicamente.

Mateusz Sikora, liderul proiectului și șeful Centrului Dioscuri de Modelare a Modificările posttraducționale și echipa sa din Cracovia și partenerii de la Institutul de Biofizică Max Planck din Frankfurt pe Main, Germania, au abordat această provocare folosind computere, lucrând împreună cu oamenii de știință de la Inserm din Paris, Academia Sinica din Tapei și Universitatea din Bremen. .

Noul lor algoritm puternic, GlycoSHIELD, permite modelarea rapidă, dar realistă a lanțurilor de zahăr prezente pe suprafețele proteinelor. Reducerea orelor de calcul și, prin urmare, a consumului de energie cu mai multe ordine de mărime în comparație cu instrumentele convenționale de simulare, GlycoSHIELD deschide calea către calculul ecologic.

Lucrarea este publicată în revista Cell.

Scuturile de protecție cu glicani influențează puternic modul în care proteinele interacționează cu alte molecule, cum ar fi medicamentele terapeutice. De exemplu, stratul de zahăr de pe proteina de vârf a coronavirusului ascunde virusul de sistemul imunitar, făcând dificilă recunoașterea virusului de către anticorpii naturali sau induși de vaccin.

Scuturile de zahăr, prin urmare, joacă un rol important în dezvoltarea de medicamente și vaccinuri. Cercetarea farmaceutică ar putea beneficia de prezicerea de rutină a morfologiei și dinamicii acestora. Până acum, însă, prognoza structurii straturilor de zahăr folosind simulări pe computer era posibilă doar cu cunoștințe de specialitate ale supercalculatoarelor speciale. În multe cazuri, au fost necesare mii sau chiar milioane de ore de calcul.

Cu GlycoSHIELD, echipa Sikora oferă o alternativă open-source rapidă, ecologică. „Abordarea noastră reduce resursele, timpul de calcul și expertiza tehnică necesară”, spune Sikora.

„Oricine poate calcula acum aranjarea și dinamica moleculelor de zahăr pe proteine ​​pe computerul personal în câteva minute, fără a fi nevoie. pentru cunoștințe de specialitate și computere de înaltă performanță. În plus, acest nou mod de a face calcule este foarte eficient din punct de vedere energetic." Software-ul nu poate fi folosit doar în cercetare, ci ar putea fi și util pentru dezvoltarea de medicamente sau vaccinuri, de exemplu, în imunoterapia pentru cancer.

Cum a reușit echipa să obțină o creștere atât de mare a eficienței ? Autorii au creat și analizat o bibliotecă de mii de poziții 3D cele mai probabile ale celor mai comune forme de lanțuri de zahăr pe proteine ​​găsite la oameni și la microorganisme. Folosind simulări și experimente lungi, ei au descoperit că pentru o predicție fiabilă a scuturilor de glican, este suficient ca zaharurile atașate să nu se ciocnească de membrane sau părți ale proteinei.

Algoritmul se bazează pe aceste constatări. „Utilizatorii GlyoSHIELD trebuie doar să specifice proteina și locațiile în care sunt atașate zaharurile. Apoi, software-ul nostru îi dezvăluie pe suprafața proteinei în aranjamentul cel mai probabil”, explică Sikora. „Am putea reproduce cu exactitate scuturile de zahăr ale proteinei spike: arată exact ca ceea ce vedem în experimente”.

Cu GlycoSHIELD, este acum posibilă completarea structurilor proteinelor noi, precum și a celor existente, cu informații despre zahăr. Oamenii de știință au folosit și GlycoSHIELD pentru a dezvălui modelul zaharurilor de pe receptorul GABAA, o țintă importantă pentru sedative și anestezice.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Dezvăluit: polițistul erou care l-a împușcat pe cuțitarul din Sydney, deja decorat pentru serviciul său exemplar

_ Șoferii și bicicliștii, atât drumul nou-nouț, măsurile de mers cu bicicleta sunt periculoase, deoarece săgețile par să îndrepte împotriva fluxului de trafic

_ Cristian Popescu Piedone șterge pe jos cu Nicușor Dan, după ultimele declarații ale edilului: 'Ești o putoare! Ești un mincinos! Ești cel mai leneș primar'

_ Forțele de apărare israeliene sunt 'pregătite pentru o nouă agresiune' / Iranul primește un mesaj clar: 'Acest lucru pur și simplu nu va merge'

_ Predicții Premiile Oscar 2025. Producțiile care ar putea câștiga anul viitor trofeul

_ Turist, 30 de ani, ucis pe loc într-un accident ciudat, după ce a fost lovit în cap de sunetul clopotului bisericii, în tradiția spaniolă

_ A look at Israel's multilayered air-defence system

_ Liverpool 0-1 Crystal Palace - Premier League în direct: bărbații lui Jurgen Klopp suferă o lovitură uriașă la titlu în timp ce Eagles hotărâți uimesc gazdele pentru a-i lăsa pe Roșii la două puncte în spatele celor de la Manchester City.

_ Iranul amenință bazele militare ale Americii din Orientul Mijlociu dacă SUA sprijină contraatacul israelian

_ Israel says Hamas rejected truce proposal in response to Gaza truce mediators

_ Unirea Slobozia, lider în Liga a II-a, a remizat cu Gloria Buzău

_ Bucureștiul nu e sigur: Un tânăr a fost bătut pe stradă și băgat în spital

_ Sursa Hezbollah spune că Israelul a lovit poziția în estul Libanului

_ 18 persoane au murit în urma unor alunecări de teren în Indonezia

_ Papa Francisc: Destul război, suficientă violenţă!

_ Toate femeile ar trebui să aibă orgasm la mijlocul vârstei și nu numai, și iată cum să o faci... de un profesor de top care dezvăluie beneficiile incredibile pentru sănătate

_ Rusia vrea să pună mâna pe o localitate strategică din Ucraina: Lupte grele la Ceasov Iar

_ Marea Britanie nu mai este destinaţia favorită a investitorilor hotelieri: Spania este noua perlă

_ Cei mai în vârstă gemeni siamezi, Lori şi George Schappell, s-au stins la vârsta de 62 de ani

_ Iran: 'Atacul nostru s-a încheiat și nu dorim să-l continuăm' / Avertisment dur pentru SUA

_ Exercițiile fizice: Remediul surprinzător pentru nopțile albe și insomnie

_ Regimul iranian brutal trimite poliție morală pe străzile Iranului � pentru a ataca cetățenii iranieni și protestatarii după atacurile iraniene asupra Israelului � VIDEO

_ Fostul șef al grupului de lobby trans plănuiește o nouă linie de asistență pentru a sfătui copiii despre cum să obțină medicamente de gen în afara NHS

_ Ce seriale și filme au fost cele mai populare pe Netflix și Disney+ în 2023

_ Un școlar, în vârstă de opt ani, ucis după ce a fost lovit de o mașină într-un accident de groază într-o liniștită cul-de-sac din Wiltshire

_ Urmați drumul cărămizii Goldman Sachs: Banca trebuie să aibă dreptate să încaseze unele dintre acțiunile sale tehnologice, spune HAMISH MCRAE

_ Strategii naturiste pentru o digestie mai bună

_ Familia lui Bondi care a înjunghiat victima Ashlee Good rupe tăcerea - și oferă o actualizare majoră despre fetița care a fost înjunghiată

_ Rebelii conservatori îl îndeamnă pe Rishi Sunak să renunțe la planul controversat de interzicere a fumatului și alte politici „principal neconservatoare”

_ Candidatul AUR la Primăria Sectorului 4 și-a anunțat astăzi candidatura. Avocatul Matei Ștefănescu vrea să reclădească Sudul Capitalei

_ Incendiu într-un bloc: 20 de persoane au evacuate la Ploiești

_ Ultimele știri despre atacul cu drone al Iranului: Israelul se pregătește pentru un asalt aerian uriaș după ce Teheranul a lansat 100 de avioane kamikaze și rachete spre Tel Aviv

_ Patriarhul Daniel, mesaj trimis Patriarhului Ierusalimului după atacul Iranului

_ „China este pe cale să înceapă să liciteze” – ETF-urile Bitcoin din Hong Kong vor declanșa raliul „înjumătățirii”?

_ Arsenal vs Aston Villa - Premier League: scor live, știri ale echipei și actualizări, în timp ce Gunners caută să răspundă la rezultatele rivalilor lor de titlu cu o victorie crucială în urmărirea lor

_ Localnicii furiosi dezvăluie planurile de a construi un zgârie-nori „plutitor” cu 42 de etaje, cu „dureri oculare”, deasupra fostului spital georgian din Birmingham, catalogat de gradul II, folosind piloni uriași de metal

_ Reacții MAE și MApN: Suntem profund îngrijorați de situația de securitate din Orientul Mijlociu

_ Băieți răi: Studiul arată că masculii bonobo agresivi atrag mai mulți parteneri

_ NATO condamnă atacul iranian asupra Israelului și îndeamnă la reținere: 'Este esenţial ca actualul conflict să nu devină incontrolabil'

_ Ottawa Senators a învins-o la limită, într-un meci cu 9 goluri, după șuturile de departajare, pe Montreal Canadiens în NHL

_ Preşedintele lui Lazio Roma îi răspunde lui Luis Alberto, care a anunțat că vrea să plece: 'Dacă vrea să plece, trebuie să găsească o echipă care să îl cumpere'

_ „El mă vede ca vaca lui de bani”: parașutist al cărui soț a încercat să o omoare modificându-i parașuta dezvăluie că ÎNCĂ o urmărește din închisoare... chiar dacă ea se recăsătorește

_ Polițiștii par să fi pierdut strada, în România: Patru tineri au tras cu pistolul de tip airsoft asupra unei mașini

_ 7,6 tone de deşeuri au fost strânse din Parcul Natural Văcăreşti

_ LIVE TEXT - Iranul a atacat Israelul: Valuri de drone și rachete balistice au fost lansate

_ DOUGLAS LUIZ face cumpărături în Tesco cu iubita sa superstar Alisha Lehmann. Întors acasă, a văzut oameni înjunghiați și împușcați: interviul său brutal de sincer

_ Cîrstoiu, ironii la adresa lui Dan: Rolul nostru nu e să spunem că apa caldă va veni a doua zi

_ Țara în care 29 de oameni au murit în urma fulgerelor

_ Atacul Iranului asupra Israelului ÎN DIRECT: piloții RAF desfășurați pentru a intercepta alte drone, în timp ce Iranul avertizează asupra unui răspuns mai mare dacă armata israeliană va riposta

_ Peste 33.000 de persoane verificate în ultima săptămână cu eDAC. A fost găsită o maşină de lux

_ Nike stabilește un record: Cheltuie mai mulți bani pentru Jocurile Olimpice de la Paris decât pentru oricare dintre jocurile anterioare

_ Beşiktaş l-a demis pe antrenorul portughez Fernando Santos

_ Klaus Iohannis și Marcel Ciolacu, primele mesaje după atacul Iranului asupra Israelului

_ VIDEO arată panică �n masă �n interiorul Israelului după atacurile iraniene cu rachete și drone

_ Ucigașul de cuțit din Sydney este demascat: un bărbat, în vârstă de 40 de ani, care suferă de probleme de sănătate mintală, s-a aflat în spatele unui înjunghiere oribil care a dus la moartea a șase persoane - înainte ca polițistul erou să-l împușcă.

_ Dronele Iran Kamikaze trimise într-un val de 135 de rachete în Israel a fost o tactică asemănătoare cu atacul Rusiei asupra Ucrainei, spune președintele Zelensky în timp ce numește bombele drept „instrumente ale terorii”.

_ Adidașii lui Michael Jordan, purtați de joc, din finala NBA din 1996 „s-au vândut cu 482.600 de dolari” la licitație la 28 de ani după ce legenda Chicago Bulls i-a dăruit unei perechi de băieți de la Seattle SuperSonics.

_ Riscul geopolitic – Acoperirea celor care nu pot fi acoperite?

_ Mesajul așteptat de toată lumea! SUA nu vor nici o 'escaladare', nici un 'război' cu Iranul (Casa Albă)

_ Rishi Sunak dezvăluie curtea europeană „depășire” pe net zero pe fondul conflictului conservatorilor privind retragerea din organismul pentru drepturile omului înainte de votul zborurilor din Rwanda


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26 Pag.27 Pag.28 Pag.29 Pag.30 Pag.31
Pag.32 Pag.33

Nr. de articole la aceasta sectiune: 1962, afisate in 33 pagini.