19:33
Comentarii Adauga Comentariu

_ AI ajută la furnizarea celei mai complete hărți a interacțiunilor cheie pentru supraviețuirea bacteriilor

_ AI ajută la furnizarea celei mai complete hărți a interacțiunilor cheie pentru supraviețuirea bacteriilor

Cercetătorii UAB au produs cea mai completă hartă a interactomului esențial bacterian, adică modul în care proteinele se combină și interacționează pentru a îndeplini funcții esențiale pentru supraviețuirea lor. Cercetarea, publicată în jurnalul eLife, a folosit instrumentul de inteligență artificială AlphaFold pentru a prezice și modela peste 1.400 de interacțiuni. Rezultatele au dezvăluit detalii necunoscute anterior ale acestor mecanisme și oferă ținte potențiale pentru dezvoltarea de noi antibiotice.

Bacterii îndeplinesc multe funcții care sunt cheie pentru supraviețuirea lor, cum ar fi producerea energiei de care au nevoie, Replicarea ADN-ului și diviziunea celulară pentru a se reproduce, sau sinteza membranei lor celulare pentru a se proteja și a interacționa cu mediul, printre altele. Toate aceste procese implică complexe care necesită acțiunea coordonată a unui set de proteine ​​care sunt esențiale: fără ele, procesele nu au loc și bacteriile mor.

De aceea, cunoscând în detaliu cum sunt aceste procese de bază. reglementate, care proteine ​​sunt implicate și modul în care acestea interacționează este esențială pentru înțelegerea mecanismelor de creștere, reproducere și supraviețuire a bacteriilor.

Tehnicile experimentale întreprinse până acum au permis identificarea a milioane de interacțiuni între proteine ​​și mii de structuri. dintre aceste proteine, dar acestea sunt date brute care dau un număr mare de fals pozitive; interacțiuni care, în realitate, nu au nicio valoare.

Cu modelele de inteligență artificială dezvoltate recent, cum ar fi AlphaFold2, a fost posibil să se obțină structuri de proteine ​​cu o acuratețe similară metodelor experimentale și să se facă diferența între proteinele autentice- interacțiunile proteinelor și interacțiunile false (false pozitive).

Cercetătorii de la Departamentul de Biochimie și Biologie Moleculară de la Universitat Autònoma de Barcelona au folosit modelul de inteligență artificială AlphaFold2 pentru a prezice setul de interacțiuni proteină-proteină care sunt esențiale pentru supraviețuirea bacteriilor, un total de 1.402 de interacțiuni posibile care alcătuiesc cea mai completă hartă a ceea ce se numește interactom esențial bacterian.

Toate aceste interacțiuni ne extind cunoștințele despre mecanismele de acțiune de care au nevoie bacteriile. să supraviețuiască și să ne permită să identificăm care interacțiuni proteină-proteină pot fi ținte pentru dezvoltarea de noi antibiotice.

„Am obținut o hartă a interactomului esențial bacterian în care toate interacțiunile care sunt esențiale pentru bacterii. a trăi și a se înmulți sunt adunate. Am caracterizat structural aceste interacțiuni folosind noi instrumente de inteligență artificială, în special AlphaFold", explică lectorul UAB Marc Torrent, directorul cercetării. „Credem că aceste structuri sunt o referință pentru dezvoltarea de noi antibiotice, deoarece moleculele care pot inhiba aceste interacțiuni. s-ar comporta ca antibioticele cu mecanisme de acțiune neobișnuite.”

Activitatea bacteriană implică între 4.000 și 5.000 de proteine. Acest set se numește proteom bacterian, dând naștere unui interatom care ar putea avea până la 20 de milioane de interacțiuni posibile. Dar se estimează că interacțiunile care au loc la o specie, de exemplu, în bacteria Escherichia coli, sunt limitate la aproximativ 12 000. Și nu toate aceste interacțiuni sunt esențiale pentru supraviețuirea bacteriei.

< Pentru a distinge interacțiunile esențiale, cercetătorii au considerat doar acelea în care cele două proteine ​​care interacționează pentru a forma complexul sunt prezente în cel puțin două specii bacteriene diferite. Cu aceste filtre și cu ajutorul modelului de inteligență artificială AlphaFold2, cercetătorii au obținut un set de 1.402 de interacțiuni proteine-proteine ​​esențiale.

Pentru a testa fiabilitatea AlphaFold2, echipa de cercetare a comparat predicțiile sale cu 140 de interacțiuni proteină-proteină care au fost obținute experimental în prealabil. Rezultatul a fost o putere predictivă pe care autorii o descriu drept excelentă, deoarece 113 dintre aceste interacțiuni experimentale (81%) au fost prezise de AI foarte precis.

Cercetătorii cred că multe dintre complexele de interacțiune proteină-proteină. care pot fi găsite în bazele de date experimentale ar putea fi fals pozitive.

Cercetătorii evidențiază descoperirea, folosind această metodă, a unui set de interacțiuni protein-proteină necunoscute anterior care acționează în nouă procese esențiale: biosinteza acizilor grași în membrana celulară, sinteza lipopolizaharidelor în membrana exterioară, transportul lipidelor, transportul proteinelor și lipoproteinelor în membrana externă, diviziunea celulară, menținerea formei alungite în bacili, replicarea ADN-ului pentru reproducerea bacteriană și sinteza ubichinonei.

O înțelegere detaliată a structurii acestor complexe de proteine ​​recent descoperite oferă noi perspective asupra mecanismelor moleculare implicate în aceste procese bacteriene vitale și deschide calea pentru dezvoltarea de noi antibiotice.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Tot ce poate merge prost cu sânii tăi - și ce să faci în privința asta: ghidul definitiv al DR PHILIPPA KAYE

Călin Georgescu are dreptate: O companie din Elveția are cele mai multe nave din Europa, peste 800 de nave

_ Parlamentarii votează PENTRU moartea asistată după cinci ore de dezbatere plină de emoții: Bill va permite adulților cu mai puțin de șase luni de viață să solicite ajutor pentru a muri

_ Câți ani are AI? Scanere faciale robot vor fi folosite în supermarketurile din Marea Britanie pentru a vedea dacă cumpărătorii au vârsta suficientă pentru a cumpăra băutură.

_ Contrabandiştii din canale încă oferă reduceri migranţilor pentru pilotarea navelor „capcană a morţii”

_ Deputatul care a demisionat în februarie din PSD și s-a înscris în AUR a fost exclus acum de George Simion din partid

_ Masacrul cu rachetă „dublă atingere” a ucis cel puțin 14 persoane la Odesa și a mai rănit zeci: atacul rusesc a lovit case, iar a doua grevă este programată pentru a ucide salvatorii

_ Spice Girls Mel B și Geri Horner „au avut o reuniune geroasă la cea de-a 50-a naștere a Victoria Beckham” – după ce au susținut că Ginger Spice a mințit despre vârsta ei

_ FOTO Autoritățile din Israel anunță că nu renunță la operațiunea din apropierea spitalului al Shifa

Primele douăzeci de companii maritime din lume

_ Premieră în România: 'Jurați' aleși din rândul cetățenilor vor înainta recomandări primăriei Râmnicu Vâlcea

_ Cresc preturile caselor in zona DVS.? Instrumentul interactiv dezvăluie că proprietarii de case din Devon au văzut valorile proprietăților crescând cu până la 47.500 de lire sterline... în timp ce cei mai mari perdanți trăiesc în Westminster

_ Revoltele din campusul SUA s-au răspândit în mai multe state după ce noaptea de violență a văzut ciocniri „scăpate de sub control” între protestatarii pro și anti-Israel la UCLA și sute de activiști adunați la Universitatea Columbia

_ Ucraina vrea să schimbe legea privind mobilizarea: blocarea conturilor bancare și interdicția de a conduce mașinile, printre măsurile propuse

_ Bateristul My Chemical Romance, Bob Bryar, a fost găsit mort în casa lui la vârsta de 44 de ani

_ Închiderea decalajului de gen al microcreditelor în Ghana

_ Care femeie regală formidabilă a fost descrisă odată drept „o marshmallow făcută pe un aparat de sudură”?

_ Este blatul meu de lucru din cuarț un pericol pentru sănătate și cum îl pot îndepărta în siguranță?

_ JPY a coborât la noi niveluri minime din 34 de ani, după ce BoJ nu face nimic... din nou

_ Michael Mann � omul de știință din spatele modelului de bast de hochei dezmințit pentru �ncălzirea globală � c�știgă 1 milion de dolari de la Mark Steyn �n cazul defăimării

_ Studiul descrie structura medicamentului antiviral bulevirtide legat de proteina receptorului virusului hepatitei B și D NTCP

_ Unul dintre cei doi frați care au condus cea mai cunoscută bandă de îngrijire sexuală din Marea Britanie care viza fete de până la 13 ani speră să fie eliberat după mai puțin de 12 ani de închisoare

_ Moment îngrozitor, balonul cu aer cald se prăbușește în liniile electrice și explodează, dar în mod miraculos, trei de la bord evadează cu răni ușoare

_ Cum ar putea răspunde Israelul la atacul cu drone și rachete al Iranului

_ Fostul șef al Scotland Yard acuzat că a respins plângerile de viol drept „sex regretabil” nu va fi audiat disciplinar

_ Trucurile secrete ale limbajului corpului pentru a „hack oamenii” și a-i face instantaneu atrași de tine

Sorina Matei despre Lovitura de Stat : Care Putin? Sistemul de la noi se comporta MAI RAU ca Putin

_ Vicepreședintele Parlamentului European, Victor Negrescu: ’Astăzi sper să fie ultima dezbatere despre aderarea completă a României la spațiul Schengen„

_ Cursa primarului Londrei se strânge? Sondajul arată că Sadiq Khan o conduce pe rivala conservatoare Susan Hall cu 13 puncte - cel mai mic diferență de până acum - cu o săptămână înaintea alegerilor crize.

_ PROFESOR KAROL SIKORA: Regele vrea să se întoarcă la muncă. Iată lucrurile surprinzătoare pe care l-aș sfătui ca specialist de top în cancer...

_ „Supermembrele” robotizate ar putea ajuta moonwalkers să-și revină după cădere

Scula lui SOROS, Plicușor Ban, laudă Lovitura de Stat exact ca bolșevicii din anii 50

Încă unii care au încălcat grav legea executând o Lovitură de Stat: Biroul Electoral Central (BEC) nu are dreptul de a anula complet alegerile la nivel național.

Căcărău din Isaccea alias Crin Antonescu vorbește de eliminarea stalinistă a candidaților ca și cum ar scuipa guma din gura. Nu ți-e rușine Căcărău?

_ Explosion Rocks Portul din Miami

_ Violența împotriva femeilor este atât o problemă legală, cât și culturală. Ce poate face Australia pentru a o rezolva?

_ Exxon amenință că va scoate miliarde de dolari în investiții climatice din UE

_ „Trebuie să fii în cameră”: președintele RNC se angajează să aibă „mii” de avocați să urmărească când sunt numărate buletinele de vot pentru 2024

_ Elon Musk împinge Tesla spre faliment: Clienții nu mai vor să cumpere mașini din cauza viziunilor sale politice

_ Acuzaţii de "activităţi teroriste" între Rusia şi Ucraina în timpul alegerilor prezidenţiale ruseşti

_ Dezvăluiri. SUA au început din 2022 "să se pregătească riguros" pentru o eventuală lovitură a Rusiei asupra Ucrainei cu o armă nucleară

_ Un salt promițător către computere cu capabilități de viteză a luminii

_ Reacția Kremlinului după interviul lui Putin acordat fostului prezentator de la Fox News, Tucker Carlson

_ Legiuitorii statului Pennsylvania depun un proces cuprinzător �mpotriva regimului Biden, guvernatorului Shapiro și Departamentului de Stat pentru �ncălcarea legii electorale

_ Dale Bowes a murit: Starul de la pachetul de prânz al lui Steph de la Channel 4 a murit la vârsta de 28 de ani, după o luptă cu cancerul pulmonar terminal, în timp ce prietenii aduc un omagiu

_ Webb dezvăluie secretele galaxiei primordiale

_ Foto | El este instructorul de înot de la Dinamo care a violat o fetiță / Reacția CS Dinamo

_ Misiunea NASA zboară deasupra Arcticii pentru a studia cauzele topirii gheții marine

_ Franța „probabil” a ratat ținta de deficit pentru 2023: sursa

_ Vânzarea magnifică

_ Cele mai șocante momente ale furtunii din Dubai surprinse de camerele video: videoclipuri terifiante arată resturi care se prăbușesc prin pasaj subteran, pietre de grindină uriașe, clădiri inundate și mobilier zburător surprins în ochiul furtunii

_ NASA testează un nou indicator pentru propulsorul unei nave spațiale pe aterizatorul lunar

_ Carlos Sainz speră să concureze la Marele Premiu al Australiei

_ Poate Percy Pig să-l învingă pe Leo Leul? TOM PARKER BOWLES pune înșelăciunile cu reduceri de la Aldi ale mărcilor mari la testul suprem, cu rezultate foarte surprinzătoare...

_ Românii pot călători liber în Elveția. Anunț privind eliminarea verificării pașapoartelor

_ Narendra Modi, în vizită în Emirate pentru a inaugura un templu hindus și a întări legăturile comerciale

_ Bucăți de dronă, cu 50 kg de explozibil, căzute în Moldova

_ Guvernul francez prezintă un proiect de lege care permite adulților bolnavi în stadiu terminal să ia medicamente letale

_ O persoană a fost atacată de un urs în apropierea Barajului Vidraru

_ UE critică un proiect de lege din Georgia privind aşa-numiţii ”agenţi străini”


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26 Pag.27 Pag.28

Nr. de articole la aceasta sectiune: 1621, afisate in 28 pagini.