13:01
Comentarii Adauga Comentariu

_ Verificarea modului în care proteinele se împerechează în interiorul celulelor

_ Verificarea modului în care proteinele se împerechează în interiorul celulelor

În ciuda dimensiunii sale minuscule, o singură celulă conține miliarde de molecule care se agita și se leagă unele de altele, îndeplinind funcții vitale. Genomul uman codifică aproximativ 20.000 de proteine, dintre care majoritatea interacționează cu proteinele partenere pentru a media peste 400.000 de interacțiuni distincte. Acești parteneri nu se prind unul de altul la întâmplare; se leagă doar de însoțitori foarte specifici pe care trebuie să-i recunoască în interiorul celulei aglomerate. Dacă creează împerecherile greșite – sau chiar împerecherile potrivite la locul sau la momentul nepotrivit – pot apărea cancer sau alte boli. Oamenii de știință lucrează din greu pentru a investiga aceste relații proteină-proteină, pentru a înțelege cum funcționează și pentru a crea potențial medicamente care le perturbă sau le imită pentru a trata boli.

Proteina umană medie este compusă din aproximativ 400 de clădiri. blocuri numite aminoacizi, care sunt înșirate și pliate într-o structură 3D complexă. În acest șir lung de blocuri de construcție, unele proteine ​​conțin întinderi de 4-6 aminoacizi numite motive liniare scurte (SLiMs), care mediază interacțiunile proteină-proteină. În ciuda simplității și dimensiunii lor mici, SLiM-urile și partenerii lor de legare facilitează procesele celulare cheie. Cu toate acestea, din punct de vedere istoric, a fost dificil să se conceapă experimente pentru a investiga modul în care SLiM-urile își recunosc partenerii specifici de legare.

Pentru a aborda această problemă, un grup condus de Theresa Hwang Ph.D. '21 a proiectat o metodă de screening pentru a înțelege modul în care SLiMs se leagă selectiv de anumite proteine ​​și chiar pentru a distinge între cele cu structuri similare. Folosind informațiile detaliate pe care le-au obținut din studierea acestor interacțiuni, cercetătorii și-au creat propria moleculă sintetică capabilă să se lege extrem de strâns de o proteină numită ENAH, care este implicată în metastaza cancerului. Echipa și-a împărtășit concluziile într-o pereche de studii eLife, unul publicat pe 25 ianuarie 2022 și celălalt pe 2 decembrie 2021.

„Abilitatea de a testa sute de mii de potențiale SLiM pentru legare oferă o instrument puternic pentru a explora de ce proteinele preferă partenerii SLiM specifici decât alții”, spune Amy Keating, profesor de biologie și inginerie biologică și autor principal al ambelor studii. „Pe măsură ce înțelegem trucurile pe care o proteină le folosește pentru a-și selecta partenerii, le putem aplica în proiectarea proteinelor pentru a face propriii noștri lianți pentru a modula funcția proteinei în scopuri de cercetare sau terapeutice.”

Cele mai existenți. Ecranele pentru SLiM selectează pur și simplu lianți scurti și strânși, neglijând în același timp SLiM-urile care nu prind proteinele partenere la fel de puternic. Pentru a studia SLiM-uri cu o gamă largă de afinități de legare, Keating, Hwang și colegii lor și-au dezvoltat propriul ecran numit MassTitr.

Cercetătorii au bănuit, de asemenea, că aminoacizii de pe ambele părți ale miezului SLiM 4-6. secvența de aminoacizi ar putea juca un rol subapreciat în legare. Pentru a-și testa teoria, ei au folosit MassTitr pentru a analiza proteomul uman în bucăți mai lungi compuse din 36 de aminoacizi, pentru a vedea care SLiM „extinși” s-ar asocia cu proteina ENAH.

ENAH, denumit uneori. ca Mena, ajută celulele să se miște. Această capacitate de a migra este esențială pentru celulele sănătoase, dar celulele canceroase o pot coapta pentru a se răspândi. Oamenii de știință au descoperit că reducerea cantității de ENAH scade capacitatea celulelor canceroase de a invada alte țesuturi, sugerând că formularea de medicamente pentru a perturba această proteină și interacțiunile ei ar putea trata cancerul.

Datorită lui MassTitr, echipa a identificat 33 de proteine ​​care conțin SLiM care se leagă de ENAH, dintre care 19 sunt potențial parteneri noi de legare. Ei au descoperit, de asemenea, trei modele distincte de aminoacizi care flanchează secvențele de bază SLiM, care au ajutat SLiMs să se lege și mai strâns de ENAH. Dintre aceste SLiM extinse, una găsită într-o proteină numită PCARE legată de ENAH cu cea mai mare afinitate cunoscută dintre orice SLiM până în prezent.

În continuare, cercetătorii au combinat un program de calculator numit dTERMen cu cristalografia cu raze X pentru înțelegeți cum și de ce PCARE se leagă de ENAH peste cele două proteine ​​surori aproape identice ale ENAH (VASP și EVL). Hwang și colegii ei au văzut că aminoacizii care flanchează miezul SliM al lui PCARE au făcut ca ENAH să își schimbe ușor forma atunci când cei doi au intrat în contact, permițând locurilor de legare să se prindă unul pe celălalt. VASP și EVL, prin contrast, nu au putut suferi această schimbare structurală, așa că PCARE SliM nu s-a legat atât de strâns de niciunul dintre ele.

Inspirată de această interacțiune unică, Hwang și-a proiectat propria proteină care se leagă de ENAH. cu afinitate şi specificitate fără precedent. „A fost interesant că am reușit să venim cu un liant atât de specific”, spune ea. „Această lucrare pune bazele pentru proiectarea moleculelor sintetice cu potențialul de a perturba interacțiunile proteină-proteină care cauzează boli – sau pentru a ajuta oamenii de știință să învețe mai multe despre ENAH și alte proteine ​​care leagă SLiM.”

Ylva Ivarsson, un profesor de biochimie la Universitatea Uppsala, care nu a fost implicat în studiu, spune că înțelegerea modului în care proteinele își găsesc partenerii de legare este o chestiune de importanță fundamentală pentru funcția și reglarea celulelor. Cele două studii eLife, explică ea, arată că SLiM-urile extinse joacă un rol subapreciat în determinarea afinității și specificității acestor interacțiuni de legare.

„Studiile aruncă lumină asupra ideii că contextul contează și oferă un screening. strategie pentru o varietate de interacțiuni legate de context”, spune ea. „Hwang și coautorii au creat instrumente valoroase pentru disecția funcției celulare a proteinelor și a partenerilor lor de legare. Abordarea lor ar putea chiar inspira inhibitori specifici ENAH în scopuri terapeutice.”

Cea mai mare concluzie a lui Hwang din proiect este că lucrurile nu sunt întotdeauna așa cum par: chiar și segmentele de proteine ​​scurte și simple pot juca roluri complexe în celulă. După cum spune ea: „Ar trebui să apreciem cu adevărat SLiM-urile mai mult.”


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Rafael Nadal merge ceas! S-a calificat în turul al treilea al turneului de la Roland Garros

_ Preşedintele Cubei nu va asista `sub nicio formă` la summitul Americilor

_ Mai are timp pentru fani! Chris Hemsworth semnează fericit autografe în timp ce iese cu tatăl

_ O colecţie de peste 200 de săbii şi covoare va fi scoasă la licitaţie, de casa Artmark

_ Reuniuni PNL la Poiana Braşov; joi - Liga Aleşilor Locali, iar vineri - Consiliul Naţional al partidului

_ SUA critică decizia Rusiei de a emite paşapoarte în sudul Ucrainei: Un plan de 'subjugare' a poporului ucrainean

_ Proprietarul își transformă Airbnb din Penzance în închiriere pe termen lung pentru localnici

_ Imagini inedite. Un tânăr a doborât recordul mondial la surf şi a intrat în Cartea Recordurilor pentru cel mai mare val cucerit vreodată

_ 'The special one', după ce AS Roma a câștigat Conference League: Astăzi nu a fost muncă, ci s-a scris istorie

_ În epoca modernă reapare holera: peste 7000 de cazuri, în ultimele luni

_ 'Vocea' lui Zleneski face ochi dulci UE și critică NATO: Stă de-o parte şi care nu face efectiv nimic

_ 'Curajul' de a face politică - Stelian Ion sare în apărarea lui Danileț, judecător exclus tocmai pentru activitate politică în favoarea USR

_ Campionatele Mondiale de schi alpin din anul 2027 se vor desfășura în Crans-Montana, din Elveția

_ Sora lui Meghan Markle își acuză fratele de „neglijență” fără contact cu tatăl înstrăinat Thomas

_ Senegal: 11 nou-născuți mor în incendiul spitalului, spune președintele

_ Falimentul City Insurance: Peste 100.000 de şoferi au rămas cu vehiculele neasigurate

_ Țările în curs de dezvoltare iubesc Metaversul, în timp ce națiunile bogate nu sunt dornice (sobdaj)

_ Biden anunţă că va merge în Texas `în următoarele zile`

_ Ajutor pentru pentru sectorul agroalimentar. Subvenţii directe de până la 120.000 de euro per beneficiar

_ Emma Răducanu este „depășită” de presiunea de a fi câștigătoare de Grand Slam, spune John McEnroe

_ Furios Justin Langer explodează despre „politica taurin**t” a Cricket Australia într-un discurs emoționant

_ Jodi Gordon este concediată din Celebrity Apprentice în urma unei decizii foarte bizare

_ Starul Sea Eagles, Tom Trbojevic, este îndemnat să folosească „medicul vrăjitor” din Fiji pentru a-și recupera după o accidentare la umăr

_ Studiu Marea Britanie: Numărul tinerilor care se identifică acum ca fiind homosexuali sau bisexuali s-a dublat în ultimii ani

_ Kate Moss ne împărtășește o privire în interiorul mormanei ei de 10 dormitoare din Cotswolds

_ Acțiunile Nvidia au scăzut după cifrele din primul trimestru, veniturile din plăcile pentru minare cripto sunt 'nominale'

_ Încă o bulă se sparge pe piața auto! Fiat Chrysler recunoaște că a mințit în privința emisiilor diesel: amenda e de 300 de milioane de dolari

_ PSD prezintă bilanţul la şase luni de guvernare

_ Video | Liderul cecen Ramzan Kadîrov amenință Polonia: 'Ucraina este deja o problemă închisă. Pe mine mă interesează Polonia'

_ Variola maimuţei: Peste 200 de cazuri confirmate în lume (ECDC)

_ Pentru francezii de la Auchan sunt mai importanți banii lui Vladimir Putin, decât viețile ucrainenilor: Auchan spune că nu renunță la magazinele din Rusia

_ Petrol iranian sechestrat, proteste ale Teheranului. Iranul acuză SUA și Grecia de piraterie

_ Matt Lodge trece la rugby după ce i-a șocat pe Warriors renunțând brusc și costând clubului 700.000 de dolari

_ Băieții răi din tenis intră în război, în timp ce Nick Kyrgios îl marchează pe Bernard Tomic „cel mai URĂT atlet din Australia”

_ Un medic oftalmolog de top i-a lăsat pe colegii săi necalificați să efectueze operații cu laser pacienților, judecă tribunalul

Cum fură grecii, turiștii ce vin la ei cu sume astronomice. O femeie din SUA vorbește despre tacticile de pradă limită ale unui restaurant din Mykonos

_ Ucrainenii recunosc că situația e foarte gravă în Donbas: Rusia bombardează peste 40 de orașe

_ Sărbătorile zilei de 26 mai

_ Capsula spaţială Starliner a companiei Boeing a revenit pe Pământ

_ Ellen DeGeneres în TEARS în timp ce este susținută de soția Portia de Rossi în ultimul episod al talk-show-ului

_ Antrenorul lui Hawks, Sam Mitchell, ia legătura cu vechiul său coechipier Cyril Rioli înaintea confruntării cu Darwin

_ Joel Kinnaman se atinge jucăuș de limbi cu logodnica Kelly Gale în vacanță

_ Autorul masacrului din Texas i-a mărturisit totul unei fete: îi spunea cum va merge să îi omoare pe toți

_ Ross Lyon spune că colegii de echipă îngrijorați ai lui Sam Fisher din St Kilda au încercat să organizeze o intervenție pentru el

_ Viața la țară a avut șase arhitecți la Palatul Buckingham, ROBERT HARDMAN le inspectează proiectele

_ Încep `manevre de artilerie` la ICCJ în mega-dosarul de corupție al lui Tăriceanu - Cu probele DNA validate definitiv instanța începe, de joi, judecata

_ Dodon, după ce procurorii au cerut 30 de zile de arest: Voi rezista

_ "Apă de foc" la desert? Un brand chinez de băuturi spirtoase lansează îngheţata infuzată cu lichior foarte tare

_ Către lemn personalizabil, cultivat într-un laborator

_ Logodnica lui Braith Anasta, Rachael Lee, își arată cicatricea în timp ce îi îndeamnă pe fani să-și verifice pielea

_ Chris Hemsworth și Elsa Pataky arată îndrăgostiți la premiera Interceptor

_ Poliţia antidrog din Peru a confiscat patru tone de cocaină ce urmau să ajungă în Spania și Germania

_ Rumer Willis se duce fără sutien sub top crop care se agăță și fulgerează cu abdomenul tăiat

_ Zelenski îl atacă violent pe Henry Kissinger: El ne spune să cedăm teritorii Rusiei! Calendarul lui pare din anii 30 (Video)

_ �Tratatul global de pandemie� al Organizației Mondiale a Sănătății include un plan pentru pașaport digital universal și sistem de identificare obligatoriu

_ Reacția furibundă a Ucrainei la pașapoartele rusești emise în regiunile ocupate: 'O nouă dovadă a obiectivului criminal al războiului'

_ Ioana Băsescu participă `solo` la dezbaterile din cazul în care Elena Udrea a primit opt ani - ICCJ continuă judecarea apelurilor DNA și ale celor condamnați

_ Deputatul democrat Eric Swalwell spune că republicanii facilitează �mpușcăturile �n masă �prin proiect� (VIDEO)

_ Mama lui Sam Thompson, Karen, își arată silueta incredibilă într-un bikini gri

_ Diatomeele sunt amenințate cu declinul din cauza acidificării oceanelor, arată studiul


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16

Nr. de articole la aceasta sectiune: 935, afisate in 16 pagini.