17:52 2023-03-31
science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu
_ Faceți vizibile tipurile de celule rare: Cercetătorii dezvoltă o nouă metodă
_ Crearea unor tipuri de celule rare vizibil: Cercetătorii dezvoltă o nouă metodă
Corpul uman conține mai mult de 30 de trilioane de celule. Până de curând, numărul mare de celule din organism a însemnat că abordările de înțelegere a bolilor umane și a proceselor de dezvoltare bazate pe analiza celulelor individuale erau o viziune futuristă. Dezvoltarea de noi metode de secvențiere revoluționează în prezent înțelegerea noastră a eterogenității celulare. Aceste tehnologii pot detecta tipuri de celule rare sau chiar noi prin extragerea și secvențierea informațiilor genetice din celule pe baza lanțurilor de acid ribonucleic.
În cooperare cu Helmholtz München, profesorul Matthias Meier de la Centrul pentru Biotehnologie și Biomedicină de la Universitatea Leipzig și grupul său de cercetare au dezvoltat o metodă nouă, eficientă și relativ ieftină pentru a face vizibile în țesuturi tipurile de celule rare, tipurile de comunicare celulară și modelele de boli. Cercetătorii și-au publicat acum descoperirile în revista Nature Communications.
Toate metodele de analiză unicelulară necesită ca celulele să fie desprinse din compozitul de țesut, pierzând informații spațiale despre tipurile de celule și, prin urmare, informații despre mediul celular. , căi de comunicare celulară sau funcție. Pentru a obține informații rezolvate spațial despre celulele individuale, tehnicile de imagistică și secvențiere trebuie utilizate în combinație. În ultimii ani, au fost dezvoltate mai multe abordări pentru a unifica îmbinarea imaginilor și a datelor de secvențiere.
În funcție de întrebarea de cercetare, au fost diferiți parametri precum rezoluția spațială, limita de detecție, accesibilitatea acizilor ribonucleici și costul. cântăriți unul împotriva celuilalt. O metodă de analiză anterioară s-a bazat pe ideea de a atașa informații locale la acizii ribonucleici folosind un cod de bare bazat pe secvența bazelor ADN. După extragerea tuturor acizilor ribonucleici și secvențierea în masă ulterioară, codurile de bare pot fi folosite pentru a crea o imagine artificială.
Aici au intervenit lucrările lui Johannes Wirth. În calitate de cercetător doctorat în laboratorul lui Matthias Meier, cercetătorul la Helmholtz München a dezvoltat un flux de lucru avansat care face posibilă achiziționarea de date genomice rezolvate local, asociate cu imagini de microscopie de înaltă calitate. Acest lucru permite vizualizarea tipurilor de celule rare, a tipurilor de comunicare celulară și a tiparelor de boală în țesut. Accentul s-a pus pe dezvoltarea unui nou cip microfluidic care să facă posibilă analizarea lanțurilor de acid ribonucleic în secțiuni mari de țesut la un cost redus.
„Comparativ cu metoda originală, noua abordare a crescut cantitatea de informații despre imagine per pixel cu un factor de șase sau doisprezece. Aceasta înseamnă că putem rezolva aproximativ 5000 de gene per pixel, ceea ce ne permite să vizualizăm tipuri de celule rare din rinichi sau ficat", explică Wirth. Prin comparație, un ecran HD standard poate afișa doar cele trei culori primare cu 256 de niveluri de luminozitate diferite per pixel.
Pe lângă progresele tehnice, echipa a furnizat și o conductă de analiză open source pentru a face metoda cu ușurință. accesibil. Deoarece metoda este potrivită pentru o gamă largă de țesuturi, va facilita studiile bolilor complexe și ale funcțiilor și disfuncțiilor multi-organe.
„Metoda pe care am dezvoltat-o, care combină tehnici de imagistică și secvențiere, a fost un viziunea până de curând. Ne-a revoluționat înțelegerea eterogenității celulare și ne-a permis să găsim noi tipuri de celule în toate organismele", spune profesorul Meier. Odată cu dezvoltarea metodelor de secvențiere unicelulare, acum este posibil să înțelegem mai bine căile de dezvoltare celulară și modul în care progresează bolile.
Comentarii:
Adauga Comentariu