16:16
Comentarii Adauga Comentariu

_ Abordarea de pionierat avansează studiul proteinei CTCF în biologia transcripției

_ Abordarea de pionierat avansează studiul CTCF proteina în biologia transcripției

CTCF este o proteină critică cunoscută că joacă diverse roluri în procese biologice cheie, cum ar fi transcripția. Oamenii de știință de la Spitalul de Cercetare pentru Copii St. Jude au folosit o tehnologie de degradare a proteinelor de ultimă generație pentru a studia CTCF. Munca lor a dezvăluit superioritatea abordării, în plus față de furnizarea de perspective funcționale asupra modului în care CTCF reglează transcripția. Studiul, publicat astăzi în Genome Biology, deschide calea pentru studii mai clare și nuanțate ale CTCF.

Transcripția este un proces biologic esențial în care ADN-ul este copiat în ARN. Procesul este primul pas necesar într-o celulă pentru a prelua instrucțiunile găzduite în ADN și, în cele din urmă, pentru a traduce acel cod în blocurile de construcție a aminoacizilor sau polipeptidelor care devin proteine ​​active. Transcripția dereglată joacă un rol în multe tipuri de cancer pediatric. Găsirea modalităților de a modifica sau viza aspecte ale mecanismului transcripțional este o nouă frontieră în căutarea vulnerabilităților care pot fi exploatate terapeutic.

În timp ce biologia CTCF a fost studiată pe larg, modul în care diferitele domenii (părți) a funcției CTCF în relație cu reglarea transcripției rămâne neclară.

Una dintre cele mai valoroase moduri de a studia o proteină este de a o degrada (înlătura) dintr-un sistem model. În absența proteinei, cercetătorii pot studia modificările funcționale care apar, oferind o perspectivă asupra modului în care proteina influențează o celulă. Un sistem pentru degradarea proteinelor este sistemul degron 1 inductibil de auxină (AID1). Cu toate acestea, acest sistem limitează investigarea precisă a funcției CTCF, cum ar fi dependența de doză mare a auxinei, care provoacă toxicitate celulară care încurcă rezultatele.

Oamenii de știință de la St. Jude au aplicat sistemul de a doua generație. , degron 2 inductibil de auxină (AID2) la CTCF (sistemul a fost dezvoltat de Masato Kanemaki, Ph.D., la Institutul Național de Genetică). Acest sistem este superior pentru studiile de pierdere a funcției, depășind limitările sistemului AID1 și eliminând efectele în afara țintei observate cu abordările anterioare.

„Am deschis înțelegerea impactului CTCF utilizând un model de degradare, sistemul AID2”, a spus autorul corespondent Chunliang Li, Ph.D., St. Jude Departamentul de Biologie celulară a tumorii. „Folosind acest sistem, am identificat regulile care guvernează reglarea transcripției dependentă de CTCF.”

„Când proteina CTCF dispare, noi și alții am observat că foarte puține gene se schimbă transcripțional”, a spus Li. „Știm că atunci când eliminăm cea mai mare parte a proteinei CTCF din celule, impactul asupra transcripției este minim. Deci, deconectarea dintre epuizarea proteinei și transcripție trebuie să fie urmând un mecanism. Am identificat o parte a mecanismului. Proteina nu se bazează doar pe pe legarea de ADN prin recunoașterea motivului de legare a ADN-ului CTCF, dar se bazează, de asemenea, pe anumite domenii pentru a se lega de secvențe specifice care flanchează motivul. Pentru un subset de gene, transcripția este reglată numai atunci când CTCF se leagă de aceste secvențe specifice."< /p>

Cercetătorii au combinat sistemul AID2 cu tehnici de vârf, cum ar fi screening-ul SLAM-seq și sgRNA pentru a studia modul în care degradarea CTCF modifică transcripția.

„Prin degradare putem crea un curățați fundalul și apoi introduceți un mutant. Această comutare se întâmplă foarte repede, așa că îl numim un sistem de schimb rapid", a spus Li. „Este prima dată când un sistem curat și de schimb rapid a fost folosit pentru a studia mutanții individuali ai CTCF.”

Prin munca lor, oamenii de știință au identificat domeniul deget de zinc (ZF) ca fiind regiunea din CTCF cu cea mai funcțională relevanță, inclusiv ZF1 și ZF10. Eliminarea ZF1 și ZF10 din sistemul model a evidențiat regiuni genomice care necesită în mod independent aceste ZF pentru legarea ADN-ului și reglarea transcripției.

„CTCF în sine este o proteină multifuncțională”, a spus co-autorul principal Judith Hyle, Departamentul de Biologie celulară a tumorii St. Jude. „Are diferite roluri într-o celulă, de la întreținerea arhitecturii cromatinei până la reglarea transcripției, fie ca activator, fie ca represor al transcripției. Interesul nostru este modul în care CTCF este implicat în reglarea transcripțională, iar cu acest nou sistem am reușit să degradăm CTCF mult mai rapid. Am reușit să atribuim o anumită funcție acestor degete de zinc periferice care nu au fost bine înțelese, arătând că anumite regiuni din genom necesită sau erau dependente de aceste legături ale degetelor de zinc pentru reglarea transcripțională. Aceasta a fost prima dată când a fost văzută sau confirmată într-un sistem celular.”

Sistemul superior a permis cercetătorilor să introducă mutații care ar putea fi urmărite prin modelul lor. Oamenii de știință au efectuat apoi studii funcționale pentru a înțelege consecințele unor astfel de mutații în ceea ce privește legarea CTCF și reglarea transcripțională.

Vorbind despre noua abordare, co-primul autor Mohamed Nadhir Djekidel, Ph.D., Centrul St. Jude pentru Applied Bioinformatics, a spus: „Deoarece puteți obține date curate despre mutanți atunci când proteina endogene este degradată, puteți deduce de fapt rețeaua de reglementare a genelor, iar asta deschide ușa pentru diferite analize în aval pentru a înțelege cum funcționează reglementarea.”

Studiul demonstrează superioritatea sistemului AID2 pentru degradarea proteinelor și arată importanța studierii CTCF într-un sistem clar. Aceasta este o verificare importantă pentru alți cercetători din domeniul cercetării reglării transcripționale. Lucrarea a dezvăluit, de asemenea, noi căi de cercetare asupra acestei proteine ​​cheie.

Autorul corespondent al studiului este Beisi Xu, Ph.D., St. Jude Center for Applied Bioinformatics. Alți autori sunt Justin Williams, Shaela Wright și Ying Shao din St. Jude.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

Ce mai pun la cale trădătorii de țară: Este gata planul de jefuire a metalelor rare din România

_ Fecioara lui Rony T20I 50 dă Bangladesh la 207-5 împotriva Irlandei

_ Iraqi basketball dreams: From bomb survivor to national paralympic athlete

_ Faye Winter din Love Island dezvăluie că își îngheață ouăle după despărțirea de Teddy Soares

_ Day of the Union of Bessarabia and Romania/MEP Tomac: Moldovan citizens safe with Romania and EU

_ Situația este extrem de tensionată în Donețk: Avdiivka se află în 'zona roşie'

_ Protest-hit Israel faces 'general strike' call over govt reforms

_ Marquez va rata MotoGP-ul argentinian după operație

_ Elton John, în vârstă de 76 de ani, dezvăluie cum a ajuns în formă pentru ultima etapă a turneului său Farewell Yellow Brick Road

_ Coreea de Sud va depăşi China în ceea ce priveşte cheltuielile pentru producţia de cipuri în 2024

_ Lucy Hale SE REUNIE cu foștii co-staruri ai Pretty Little Liars Ashley Benson și Troian Bellisario

_ Israelul fierbe, Netanyahu este așteptat să facă anunțul care îi poate curma cariera politică - 'Arhitectul' controversatei reforme judiciare, dispus să renunțe

_ Muncii se bucură că prăbușirea SNP va face „mai ușor” ca Keir Starmer să câștige următoarele alegeri

_ Meteorologii au emis prognoza pentru luna viitoare: Ce temperaturi vom avea de Florii și de Paște

_ Starul lui Manchester United, Brendon Williams, a fost surprins „inhalând protoxid de azot dintr-un balon”

_ Jude Bellingham spune că a fi căpitanul Angliei este „cel mai mare vis” al său, dar admite că „își va aștepta rândul”

_ Leonardo DiCaprio păstrează un profil scăzut în timp ce iese cu prietenii în NYC... înainte de promovarea pentru noul film

_ Misiunea comună a NASA oferă primele vederi uluitoare ale apei de suprafață a Pământului

_ Sir Bradley Wiggins spune că a suferit „viol la limită, abuz sexual” timp de trei ani de la 12 ani

_ Sidney Cooke, în vârstă de 96 de ani, ar trebui să fie interogat despre o serie de crime de copii nerezolvate, spune fostul detectiv

_Stiri Negre - 27 Mar 2023 05:04:43

_ Oamenii de știință găsesc noi indicatori ai dezghețului permafrostului din Alaska

_ Scotland set for new leader as independence quest stalls

_ Directorii școlii au fost interziși pe viață după ce nu au raportat profesorul care a abuzat un elev

_ Senate, Chamber of Deputies heads on a visit to Republic of Moldova

_ O româncă a murit într-un incendiu în Italia. Soțul și cei doi copii au fost răniți

_ Al cincilea cadavru găsit în explozia fabricii de ciocolată Palmer, echipajele de la West Reading caută trei dispăruți

_ Coreea de Nord trage rachete balistice spre apele estice

_ Noul antrenor principal al lui Broncos, Sean Payton, înlătură speculațiile comerciale Jerry Jeudy și Cortland Sutton

_ Proprietarul de spălătorie Amelia's Home Edit împărtășește cele cinci lucruri pe care toată lumea ar trebui să le aibă acasă

_ Arbitrul care a lăsat meciul să continue după ce luptătorul a fost sufocat a fost judecător în UFC a doua zi

_ Câștigătorul lui Australian Idol, Royston Sagigi-Baira, dezvăluie ce s-a întâmplat în timpul melodiei finale live.

_ Macron holds crisis meeting as more France protests loom

_ France pension reform: Macron holds crisis meeting, new day of strikes planned

_ Israel crisis: Netanyahu announcement on judicial overhaul postponed

_4 Media Info - 27 Mar 2023 10:23:18

_ 'Mega-strike' disrupts travel in Germany

_ Officials Ciolacu and Grosu attend unveiling of Alexandru Marghiloman and Ion Inculet busts in Ialoveni

_Gold FM Romania - 27 Mar 2023 10:48:40

_ President Iohannis: We have the duty to carry on democratic values set by the United Romania's Constitution

_ COMENTARIU ZILNIC DE POSTA: Un plan îndrăzneț pentru a-i alunga pe nebuni de pe străzi

_ Antonio Conte părăsește Tottenham RECUPERAȚI: Următorul antrenor cel mai recent cu Nagelsmann și Pochettino legați

_ Motivele pentru care SUA trimit Ucrainei armament cu capacități limitate

_ Julian Nagelsmann ar putea ajunge în Premier League, la Tottenham Hotspur

_ Italia respinge categoric făina din insecte: a fost interzisă în aluatul de pizza și în paste

_ Viola Davis are o siluetă lejeră în timp ce ea și soțul Julius Tennon își duc câinele la plimbare în LA

_ Kanye West se supune: Zice că renunţă la antisemitism şi că 'îi plac din nou evreii'

_ Membrul Sydney Swans susține că soția a fost interzisă de la jocul Hawthorn la SCG pentru o singură ruptură în blugi

_ Noi mall-uri în România. Craiova, Alba Iulia, Piteşti şi Arad vor completa în acest an lista oraşelor cu noi centre comerciale moderne

_ Maisie Smith se mută din casa familiei pentru a locui cu Max George

_ Iohannis, la 100 de ani de la adoptarea Constituţiei din 1923: Parlamentul are datoria să nu se abată de la valorile constituţionale

_ Acordul UE-Germania privind combustibilii electrici salvează motoarele termice. Italia, Polonia și Bulgaria continuă lupta

_ Prințesa de Wales vizitează un supermarket din Islanda pentru a discuta despre dezvoltarea primilor ani

_ President of European Council Charles Michel on a visit to Romania to be welcomed by president Klaus Iohannis

_ Heather Rae Young prezintă un corp impresionant după naștere în costum de trening în timp ce merge la cursul de yoga fierbinte

_ John Wick a făcut furori în box office-ul nord-american: 73.5 milioane de dolari încasări într-un singur weekend

_ March Madness: Caitlin Clark strălucește cu 41 de PUNCTE în timp ce Iowa învinge Louisville pentru a-și asigura locul în Final Four

_ Cleveland Cavaliers cuceresc locul în playoff, în timp ce dubla-dubla lui Jarrett Allen fură spectacol

_ Osteopatul Brendon Talbot vă spune cum să corectați o cocoașă a gâtului cu o întindere zilnică

_ Șeful Jocurilor Olimpice din Australia, Matt Carroll, spune că NRL și AFL distrug șansele sportivilor de a obține medalii de aur


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17

Nr. de articole la aceasta sectiune: 962, afisate in 17 pagini.



ieri 09:46