18:41 2022-12-05
science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu
_ Studiul pune în lumină filogenomica și arborele vieții plantelor cu flori
_ Study sheds lumina privind filogenomica și arborele vieții plantelor cu flori
Plantele cu flori (angiosperme) sunt cea mai mare, cea mai diversificată și mai de succes linie majoră de plante verzi, cu ~ 330.000 de specii cunoscute. În ultimul deceniu, dezvoltarea accelerată a tehnologiei de secvențiere cu randament ridicat a oferit un mare impuls pentru studiile filogenetice ale angiospermelor, iar un număr mare de studii filogenetice care adoptă sute până la mii de gene într-o multitudine de clade au apărut și au introdus filogenetica plantelor și evoluția într-o nouă eră — era filogenomică.
Prof. Echipa de cercetare a lui Li Dezhu de la Institutul de Botanică Kunming al Academiei Chineze de Științe (KIB/CAS) s-a angajat de zeci de ani în genomica filogenetică și evolutivă a angiospermei. Pe baza propriei expertize și a unui studiu amplu al literaturii de specialitate, cercetătorii au analizat starea reconstrucției arborelui vieții plantelor cu flori și au discutat despre provocările majore cu care se confruntă studiile filogenomice.
Cercetătorii au subliniat strategiile actuale de secvențiere, inclusiv skimmarea genomului, secvențierea transcriptomului, secvențierea ADN-ului asociată cu site-ul de restricție, secvențierea îmbogățirii țintei, skimmarea profundă a genomului și secvențierea întregului genom și a discutat despre avantajele, deficiențele și aplicațiile potențiale ale fiecăruia. A fost furnizat un flux de lucru pentru analizele filogenomice a plantelor pentru aplicații practice.
Ei au rezumat, de asemenea, evoluțiile recente în utilizarea datelor genomice pentru reconstrucțiile filogenetice ale plantelor cu flori la diferite niveluri taxonomice și evidențiază impactul potențial al acestora asupra tratamentelor taxonomice.
Ei au discutat în continuare provocările majore, cum ar fi impactul negativ asupra inferenței ortologiei și reconstrucției filogenetice cauzate de erori sistematice, duplicarea întregului genom, hibridizare/introgresiune și sortarea incompletă a descendenței și au făcut recomandări practice pentru studiile filogenomice. de linii evolutive complexe.
Conform cercetătorilor, pe măsură ce au apărut din ce în ce mai multe relații nerezolvate între liniile majore de plante cu flori, arborii filogenetici cu ramificații dihotomice, în unele cazuri, ar putea să nu fie cel mai bun model evolutiv pentru arborele de angiosperme. de viață și se speră că dezvoltarea abordărilor bazate pe rețea ne va îmbunătăți capacitatea de reconstrucție ct relațiile filogenetice și deducerea proceselor evolutive.
În plus, secvențierea întregului genom este o tendință inevitabilă în anii următori, iar accesibilitatea tot mai mare a datelor genomice ar continua să ne aprofundeze înțelegerea istoriei evoluției angiospermei;< /p>
Majoritatea studiilor filogenomice se concentrează pe sfere geografice și taxonomice restrânse și este nevoie urgentă de o dezvoltare mai echilibrată prin colaborare globală.
În plus, analiza integrată a datelor omice cuplată cu morfologice, ecologice , iar în cele din urmă dovezile multidisciplinare sunt esențiale pentru o înțelegere mai completă a istoriei evoluției plantelor.
„Phylogenomics and the flowering plant tree of life”, a fost publicat în Journal of Integrative Plant Biology.
p>
Comentarii:
Adauga Comentariu