20:04
Comentarii Adauga Comentariu

_ Genomes OnLine Database introduce noi caracteristici

_ Genomes OnLine Baza de date introduce funcții noi

De la lansarea sa, acum 25 de ani, baza de date Genomes OnLine (GOLD) s-a maturizat de la șase proiecte pe o foaie de calcul într-un depozit de metadate genomice emblematice, făcând disponibile gratuit metadatele microbiomului care urmează standardele comunității. și să permită inițiative de analiză genomică comparativă la scară largă.

GOLD nu numai că organizează proiecte de secvențiere desfășurate la Joint Genome Institute (JGI) al Departamentului de Energie al Statelor Unite ale Americii (DOE), o facilitate pentru utilizatori DOE Office of Science situată la Lawrence Berkeley National Laboratory (Berkeley Lab), dar și cele importate din arhivele publice, precum și datele de proiect introduse de utilizatori externi.

Impact

Una dintre provocările semnificative în maximizarea utilizării datelor genomice înseamnă a avea informațiile contextuale adecvate, sau metadatele, stocate împreună cu acestea. GOLD oferă resurse de metadate selectate manual pentru organisme și mostre de mediu. Baza de date reunește metadate relevante din diverse surse și aplică o schemă de etichetare standardizată pentru a defini mai bine informațiile genomice și ecosistemele.

Aceste date selectate sunt accesibile pe portalurile de date JGI, inclusiv Integrated Microbial Genomes & Microbiomes (IMG/M). ), îmbunătățind adnotările genomului și promovând analizele comparative ale genomului. GOLD își propune să urmeze principiile datelor FAIR pentru a se asigura că activele digitale sunt găsibile, accesibile, interoperabile și reutilizabile.

Rezumat

GOLD preia mostre procesate la JGI, introduse de utilizatori externi și cele importate. din depozitele publice și tratează informațiile prin aplicarea standardelor dezvoltate de comunitate. GOLD sprijină, de asemenea, o gamă largă de activități, de la primirea de propuneri până la publicare. Informațiile sunt, de asemenea, obținute și verificate încrucișat cu resurse publice, inclusiv NCBI Taxonomy și diverse colecții de cultură, cum ar fi Colecția Americană de Cultură de Tip și Institutul Leibniz DSMZ. GOLD își aplică denumirea standardizată pentru toate mostrele de mediu și este singura resursă din lume cu aproape 200.000 de mostre de mediu curate cu nume canonice.

De la lansarea sa în 1997, utilizatorii activi GOLD au stimulat creșterea sa și dezvoltarea continuă de noi componente și capacități. Cele mai recente îmbunătățiri includ funcții noi, cum ar fi un API public și o pagină de destinație a ecosistemului, precum și creșterea diferitelor entități, prezentate în continuare în revista Nucleic Acids Research.

Unul dintre punctele forte ale GOLD a fost implementarea standardelor de metadate. pentru toate entitățile din sistem. Grupul de standarde genomice al JGI, care gestionează GOLD, comunică personal cu cei care au solicitat pentru a rezolva orice neconcordanțe. În timp ce în trecut, GOLD se baza pe câmpuri de text liber, acum folosește vocabulare controlate cu câmpuri bazate pe unități, cum ar fi adâncimea și altitudinea înregistrate în unități fixe de metri, temperatura în centigrade și multe altele.

Cele patru niveluri. Sistemul de organizare a proiectelor implementat în GOLD este alcătuit din: Studii, Bioproba/Organisme, Proiecte de secvențiere și Proiecte de analiză. Fiecare dintre aceste entități este organizată cu o gamă largă de metadate. GOLD aplică o clasificare a ecosistemelor pe cinci niveluri tuturor probelor de mediu și organismelor ale căror informații de izolare sunt disponibile, permițând descoperiri științifice bazate pe metadate. Interfața publică de programare a aplicațiilor GOLD permite utilizatorilor să acceseze metadatele organizate în mod programatic, într-o manieră sigură și fiabilă.

Echipa JGI care gestionează GOLD lucrează deja îndeaproape cu alte două proiecte finanțate de DOE — National Microbiome Data Collaborative (NMDC) și DOE Systems Biology Knowledgebase (KBase) – și își propune să extindă aceste colaborări în procesul de conservare a metadatelor, stabilirea standardelor de metadate și schimbul de eșantioane de metadate.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_4 Media Info - 27 Jan 2023 07:03:42

_ VIDEO – „Aproape 300.000 de buletine de vot în 2022 nu ar eșua verificarea semnăturii” – Shelby Busch discută peste 1.800 de plicuri pentru buletine de vot goale, alegători morți, semnături incorecte în județul Maricopa în camera de război a lui Bannon

_Gold FM Romania - 27 Jan 2023 11:41:46

_ O t�nără de 29 de ani a fost arestată după ce s-a pozat ca elevă la liceul din New Jersey

_ SUA și NATO par a fi hotărâte să înceapă un război cu Rusia

_Gold FM Romania - 26 Jan 2023 16:47:26

_Stiri Negre - 26 Jan 2023 14:44:32

_Gold FM Romania - 26 Jan 2023 11:38:57

_ Boston Celtics, liderul incontestabil al NBA, la a treia înfrângere consecutivă

_ Poliția lansează vânătoarea de bărbat după ce o femeie de 20 de ani „a fost violată într-un atac înfiorător”

_ WSJ bate joc de sondarea lui Comey �n Rusia: �Prespusul vinovat a fost membru al propriei echipe a domnului Comey�

_Gold FM Romania - 26 Jan 2023 11:19:04

_ RUPTĂ: Consiliul de Supraveghere din județul Shasta, California, votează să rezilieze contractul cu Dominion Voting Systems și să înceteze utilizarea acestuia în alegeri

_ TREBUIE VĂZIT: Jim Hoft de la TGP în War Room - Descrie VIDEO BOMBSHELL cu Ray Epps care scăpa de a doua barieră la Capitoliul SUA (VIDEO)

_ Angajații de la Google cer �Siguranță psihologică� de la șefii lor după concedieri

_ DEZVOLTARE: Proiectul Veritas: Pfizer explorează virusul Covid-19 „mutant” prin „evoluție direcționată” pentru a continua să profite de pe urma vaccinurilor (VIDEO)

_ Hărți fascinante arată că a fi pilot este locul de muncă de vis numărul 1 din lume, din SUA până în Marea Britanie

_ Rusia bombardează o maternitate din Kherson. Nu este prima oară când invadatorii lovesc maternităţi

_ 'Da, sunt căsătorită!': Rita Ora confirmă în sfârșit că s-a căsătorit cu frumoasa Taika Waititi

_ „În perioada mea de director CIA și secretar de stat, știu că a scurs informații clasificate” – Mike Pompeo despre Adam Schiff (VIDEO)

_ �Joe Biden este ca domnul Magoo... la fel de inactiv ca orice președinte pe care l-am văzut vreodată� � Senatorul Ted Cruz indică că Joe Biden are mai multe documente clasificate �n preajmă

_Marius Tucă Show - 26 Jan 2023 20:50:44

_ ACTUALIZARE: Videoclipul cu camera poliției cu atacul lui Paul Pelosi va fi lansat vineri dimineață

_ Dr. Naomi Wolf despre vaccinul împotriva COVID: „O armă biologică – fabricată în concert cu PCC – într-un mod lent pentru a slăbi dacă nu ucide populația din America de Nord și Europa de Vest” (VIDEO)

_Marius Tucă Show - 25 Jan 2023 20:16:54

_ EȘEC EPIC: Nominatul judiciar Biden nu poate răspunde la întrebările de bază despre Constituție (video)

_ John Kirby Fields pune întrebări despre scandalul documentelor clasificate Biden după ce Karine Jean-Pierre nu își face treaba (VIDEO)

_Gold FM Romania - 26 Jan 2023 15:40:23

_Marius Tucă Show - 25 Jan 2023 20:28:35

_Marius Tucă Show - 25 Jan 2023 20:15:35

_ JUST IN: Adam Schiff, mincinos �n serie, anunță oferta pentru locul lui Feinstein la Senat

_Marius Tucă Show - 26 Jan 2023 21:02:33

_Marius Tucă Show - 25 Jan 2023 20:35:40

_ Mass-media principală a spus că El Salvador, prietenos cu Bitcoin, și-ar plăti datoria, dar tocmai a plătit înapoi 800 de milioane de dolari

_ Casa Albă frământă industria locuințelor pentru protecția noilor chiriași

_ Fondatorul unei firme financiare se prăbușește la moarte din Manhattan Rooftop Bar

_ SICK: Burberry promovează o agendă radicală pentru transgenderi, celebrează tinerele care își mutilează corpurile

_ Președintele Trump rămâne cel mai bun candidat într-o șansă lungă, care duce la alegerile din 2024

_ Pete Buttigieg: „Fiecare decizie de transport pe care o luăm este o decizie privind clima” (VIDEO)

_Gold FM Romania - 25 Jan 2023 17:51:03

_ Cum a devenit Equifax un IRS privat

_Marius Tucă Show - 25 Jan 2023 20:26:52

_ Intruziile de aer arctic vor veni la Lower 48 săptămâna viitoare

Facebook îl reinstituie pe Trump după doi ani cu „noile balustrade la locul lor”

_ Kremlinul reacționează la apropierea ceasului de apocalipsa de la miezul nopții

_ Jeremy Hunt îi înfruntă pe rebelii conservatori tăiați de taxe, cu jurământul că va reduce mai întâi inflația

_ Soția lui Robbie Williams, Ayda Field, refuză șansa de a deveni o adevărată casnică din Beverly Hills

_ Istoria fascinantă a fotografului Nan Goldin și RĂZBOIUL ei împotriva Sacklers

_ Ce pub-uri Wetherspoons se închid în Marea Britanie?

_Gold FM Romania - 25 Jan 2023 11:51:22

_ �Vaccinurile COVID-19 nu sunt asociate cu moartea subită� � Răspunsul FDA la �ngrijorările unui american cu privire la vaccinurile COVID

_ VEZI: Dr. Jill preia recepția de Anul Nou Lunar la Casa Albă, îl trage pe Joe Biden pe scenă, îl dă jos pe reporter întrebat despre Rehoboth Beach House Search

_ Tânărul ofițer de poliție din Georgia demisionează după ce departamentul l-a pus în concediu pentru că s-a opus căsătoriei gay (VIDEO)

_ EXCLUSIV: Senatorul statului Arizona Wendy Rogers reacționează la verificarea semnăturii recent descoperite și la eșecurile aparatului de vot care au pus sub semnul întrebării peste 500.000 de buletine de vot pentru 2022 (VIDEO)

_ Senatorul Johnson cere Congresului să investigheze producătorii de vaccinuri și procesul de aprobare Covid Vax ca răspuns la expunerea proiectului Veritas pe Pfizer

_ Jim Hoft și Cara Castronuova de la TGP s-au alăturat The War Room împreună cu Julie Kelly în EXPLOSIVE ROSANNE BOYLAND REPORT - VIDEOCLIPURI

_ CHIAR ÎN: 5 foști ofițeri de poliție din Memphis acuzați de uciderea în moartea șoferului negru, Tire Nichols

_ Regimul Biden lucrează cu Big Tech și Academia pentru a adapta inteligența artificială de grad militar folosită împotriva ISIS pentru a viza americanii îngrijorați de siguranța vaccinurilor și de integritatea alegerilor

_ Biden abordează GOP House: „Ne îndreptăm în direcția corectă... Acum trebuie să protejăm acele câștiguri de la republicanii MAGA din casă” (VIDEO)

_ Arhivele Naționale le cere foștilor președinți și vicepreședinților să-și verifice înregistrările pentru documente clasificate


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21

Nr. de articole la aceasta sectiune: 1214, afisate in 21 pagini.



ieri 10:22 _ TREBUIE CITITĂ