14:16 2024-04-16
science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu
_ Cercetătorii creează o nouă conductă AI pentru identificarea interacțiunilor moleculare
_ Cercetătorii creează o nouă conductă AI pentru identificarea interacțiunilor moleculare< /h3>
Înțelegerea modului în care proteinele interacționează între ele este crucială pentru dezvoltarea de noi tratamente și înțelegerea bolilor. Datorită progreselor computaționale, o echipă de cercetători condusă de profesorul asistent de chimie Alberto Perez a dezvoltat un algoritm pentru a identifica aceste interacțiuni moleculare.
Echipa de cercetare a lui Perez a inclus doi studenți absolvenți de la UF, Arup Mondal și Bhumika Singh, și o mână de cercetători de la Universitatea Rutgers și Institutul Politehnic Rensselaer. Echipa și-a publicat descoperirile în Angewandte Chemie International Edition.
Numit AF-CBA Pipeline, acest instrument inovator oferă o precizie și o viteză de neegalat în identificarea celor mai puternici lianți de peptide la o anumită proteină. Face acest lucru folosind AI pentru a simula interacțiunile moleculare, sortând mii de molecule candidate pentru a identifica molecula care interacționează cel mai bine cu proteina de interes.
Abordarea bazată pe inteligență artificială permite conductei să efectueze aceste acțiuni în o fracțiune din timp ar fi nevoie de oameni sau de abordări tradiționale bazate pe fizică pentru a îndeplini aceeași sarcină.
„Gândește-te la asta ca la un magazin alimentar”, a explicat Perez. „Când vrei să cumperi cel mai bun fruct posibil, trebuie să compari mărimile și aspectele. Sunt prea multe fructe pentru a le încerca pe toate bineînțeles, așa că compari câteva înainte de a face o selecție. Această metodă AI, însă, nu poate doar încercați-le pe toate, dar puteți alege în mod fiabil și pe cea mai bună."
De obicei, proteinele de interes sunt cele care provoacă cele mai multe daune corpului nostru atunci când se comportă greșit. Găsind ce molecule interacționează cu aceste proteine problematice, conducta deschide căi pentru terapii direcționate pentru a combate afecțiuni precum inflamația, dereglarea imunității și cancerul.
„Cunoașterea structurii celui mai puternic liant de peptide ne ajută la rândul său. în proiectarea rațională a noilor medicamente terapeutice”, a spus Perez.
Natura revoluționară a conductei este îmbunătățită de baza sa pe tehnologia preexistentă: un program numit AlphaFold. Dezvoltat de Google Deepmind, AlphaFold folosește învățarea profundă pentru a prezice structurile proteinelor. Această dependență de tehnologia familiară va fi un avantaj pentru accesibilitatea conductei pentru cercetători și va contribui la asigurarea adoptării sale viitoare.
În continuare, Perez și echipa sa își propun să-și extindă conducta pentru a obține mai multe perspective biologice și a inhiba bolile. agenţi. Au în vizor doi virusuri: virusul leucemiei murine și virusul sarcomului Kaposi. Ambii viruși pot provoca probleme grave de sănătate, în special tumori, și interacționează cu proteine necunoscute până acum.
„Vrem să creăm biblioteci noi de peptide”, a spus Perez. „AF-CBA ne va permite să identificăm acele peptide proiectate care se leagă mai puternic decât peptidele virale.”
Comentarii:
Adauga Comentariu