20:32 2024-02-28
science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu
_ Cercetarea plantelor medicinale dezvăluie modelul genetic al Chaenomeles speciosa
_ Cercetarea plantelor medicinale dezvăluie genetica planul lui Chaenomeles speciosa
Chaenomeles speciosa (2n=34), o specie diploidă din familia Rosaceae, a fost folosită în mod tradițional în medicina chineză pentru diferitele sale beneficii pentru sănătate. Până în prezent, lipsa secvenței genomice și a studiilor genetice a împiedicat eforturile de îmbunătățire a valorii sale medicinale.
Studii recente au identificat fructele C. speciosa ca surse de metaboliți benefici precum triterpenoidele și flavonoidele, subliniind necesitatea de a continua. investigații pentru înțelegerea bazei fitochimice a utilizărilor sale medicinale. Cu toate acestea, în timp ce cercetările genomice asupra altor membri Rosaceae au progresat, C. speciosa rămâne nesecvenționată, limitându-ne înțelegerea componenței sale genetice și biosinteza compușilor săi activi.
Horticulture Research a publicat o cercetare intitulată „A telomer-to”. -Genomul de referință al telomerilor oferă o perspectivă genetică asupra biosintezei triterpenoidelor pentaciclice la Chaenomeles speciosa.” În acest studiu, genomul C. speciosa a fost secvențiat utilizând o abordare hibridă care a combinat citiri scurte, HiFi și tehnici de secvențiere Hi-C, dezvăluind o dimensiune a genomului de aproximativ 650,4 Mb cu o rată de heterozigositate de 2,1%.
Folosind citirile HiFi, procesul de asamblare a dus la un ansamblu primar de 167 de contig cu o lungime N50 semnificativă, care a fost în continuare schelete folosind datele de secvențiere Hi-C pentru a obține un ansamblu la nivel de cromozom de 17 pseudo-cromozomi. Analiza a analizat, de asemenea, ansamblurile specifice haplotipului, dezvăluind diferențe în dimensiunea genomului, valorile contig și a schelei N50 și conținutul GC între cele două haplotipuri identificate, Hap 1 și Hap 2. În plus, cercetarea a descoperit variații genetice semnificative, inclusiv SNP-uri și InDels, între aceste haplotipuri, indicând o bogată diversitate genetică în cadrul C. speciosa.
Analiza familiei de gene a elucidat prezența genelor specifice speciei și a oferit perspective asupra familiilor de gene extinse și contractate, evidențiind genetica unică a plantei. machiajul și implicațiile sale asupra producției de metaboliți secundari. Calitatea genomului a fost validată prin diverse metrici, inclusiv analiza BUSCO, care a confirmat completitatea și acuratețea acestuia.
În plus, studiul a oferit o perspectivă comparativă cu alte specii, dezvăluind relații de sintenie și perspective evolutive, în special în ceea ce privește evenimentele de duplicare a genomului și extinderea elementelor transpozabile, care au fost esențiale în evoluția genomului.
Acest ansamblu facilitează înțelegerea detaliată a bazei genetice pentru biosinteza acizilor oleanolic și ursolic, markeri chimici caracteristici ai C. speciosa cu valoare medicinală. Identificarea și extinderea familiilor de gene legate de acești compuși subliniază potențialul plantei de a produce metaboliți benefici pentru sănătate.
În general, această resursă genomică stabilește o bază pentru viitoarele studii genetice și eforturi de ameliorare care vizează îmbunătățirea proprietăților medicinale. de C. speciosa, marcând un progres semnificativ în cercetarea genetică a acestei plante medicinale și comestibile.
Comentarii:
Adauga Comentariu