19:37
Comentarii Adauga Comentariu

_ Supracalcularea secretelor din interiorul antibioticelor pentru bovine

_ Supercalcularea secretelor din interiorul antibioticelor pentru bovine

Chimiștii au determinat pentru prima dată structura cristalină a unei componente cheie a enzimei monensin și au deblocat mecanismul activității sale de reacție.

„Descoperirea principală a fost primul cristal. structura pentru această familie de enzime”, a spus Chu-Young Kim, profesor de biochimie la Universitatea din Illinois Urbana-Champaign (UIUC), care a condus partea experimentală a studiului. El și colegii săi au rezolvat structura cristalină pentru MonCI, o enzimă cheie în bacteriile din sol care sintetizează în mod natural monensina.

Lela Vukovic, profesor asociat la Universitatea din Texas, la El Paso (UTEP), a efectuat calculul. studii privind cercetarea monensin, publicate în Nature Communications.

Inițiativa University of Texas Research Cyberinfrastructure (UTRC) a acordat alocații de supercomputer Vukovic pe sistemul Lonestar6 la Centrul de calcul avansat din Texas (TACC) pentru a face față acestor provocări. UTRC oferă capabilități de calcul avansate cercetătorilor din toate cele 14 instituții ale sistemului UT.

Lonestar6 de la TACC a ajutat la dezvăluirea secvenței de reacție care produce monensin. Această cercetare deschide ușa pentru proiectarea viitoare a antibioticelor mai sigure și mai eficiente.

„Am descoperit că MonCI este folosit pentru a efectua trei reacții cruciale de epoxidare”, a spus Kim. „Acest lucru este foarte neobișnuit și are implicații asupra modului în care putem proiecta bacteria pentru a produce noi antibiotice.”

Kim, care a părăsit recent UTEP pentru a se alătura UIUC, a consultat laboratorul lui Vukovic cu rezultatele structurii și plin de întrebări noi. . Ceea ce a găsit a fost o reacție secvenţială interesantă în interiorul enzimei. Cu toate acestea, a fost încă imposibil din punct de vedere experimental să se obțină structura cristalină a enzimei cu substratul în interior în modul său activ.

Aceasta a fost momentul în care Kim și Vukovic au decis să modeleze enzima și substarea în simulări când substratul este stabil. . Dacă un substrat este stabil într-o anumită poziție, atunci poate apărea o reacție pentru acea poziție.

Vukovic și studenții ei Tara Nitka și Anju Yadav au dezvoltat modele complete ale sistemului de aproximativ 78.000 de atomi bazate pe structurile cristaline. determinate de experimentaliştii studiului.

„Provocările de calcul au apărut din examinarea mai multor sisteme pentru a determina poziția în care premonensina A și versiunile sale epoxidate sunt cele mai stabile și cel mai probabil să sufere prima, a doua și a treia reacție de epoxidare. ”, a spus Vukovic.

„Supercalculatoarele au fost foarte utile în caracterizarea acestor molecule biologice care produc în mod natural antibiotice”, a adăugat Vukovic. „Nu am fi capabili să realizăm studiile computaționale fără ele. Studiile computaționale ne ajută să descoperim și să înțelegem aceste reacții secvențiale complexe importante pentru societate.”

Vukovic și-a efectuat cercetările postdoctorale la UIUC sub defunctul Klaus Schulten, a cărui moștenire trăiește în software-ul NAMD dezvoltat de grupul său și a fost folosit în acest studiu și în nenumărate altele.

„UIUC depune multă muncă pentru a optimiza NAMD să ruleze pe supercalculatoarele naționale, cum ar fi Lonertar6 și Stampede2 la TACC”, a spus ea. „NAMD ne-a permis să mărim această enzimă și să vedem ce reacții au loc prima, a doua și a treia pentru a genera monensin.”

„Biosinteza monensinului necesită cel puțin 14 enzime diferite, dintre care una este MonCI”, Kim. adăugat. „Trebuie să investigăm, de asemenea, toate celelalte enzime. În viitor, ne așteptăm să generăm versiuni îmbunătățite de monensin pentru a avea grijă mai bine de bovine și păsări de curte. În plus, monensinul este toxic pentru cai și câini, astfel încât aceste animale de fermă sunt uneori otrăvite accidental. și ucis. Prin urmare, este nevoie de un monensin netoxic."

Autorii sunt Qian Wang, Tara A. Nitka, Anju Yadav și Lela Vukovic de la Universitatea Texas din El Paso; Ning Liu, Hongli Xiao, Hui Yang și Xi Chen de la Universitatea Northwest, China; Irimpan I. Mathews de la SLAC National Accelerator Laboratory; și Chu-Young Kim de la Universitatea din Illinois Urbana-Champaign.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ FOTO - O minoră de 14 ani a dispărut din București: Poliţia face apel la cetăţeni

_ Raport Colliers: Stocul de spaţii de retail modern din România a depăşit 4,3 mil. mp, 60% în primele 10 mari oraşe din ţară

_ Agent antibacterian transportat de nanoparticule utilizate pentru tratarea BPOC la șoareci

_ Temerile cu privire la scăderea natalității în Anglia și Țara Galilor sunt deplasate – populația urmează să crească în anii următori

_ Agresorul polițistului care a intervenit după ce și-a înjunghiat părinții reținut pentru 24 de ore - Va fi dus la instanță pentru arestare preventivă

_ Două persoane au fost arestate preventiv după ce au cultivat canabis într-o casă din Buzău

_ Solidaritatea Sanitara Federation continuing protest schedule

_ Sfânta Lumină va fi adusă sâmbătă de la Ierusalim

_ Tenerife îi va pălmui pe turişti cu o taxă turistică: taxele urmează să vină din ianuarie - după ce peste 50.000 de locuitori s-au alăturat protestului masiv de stradă împotriva vizitatorilor străini

_ Bursele pentru elevii din învățământul confesional și privat vor fi plătite de Ministerul Educației, inclusiv sumele restante din anul trecut

_ Senatul SUA promovează proiectul de lege privind ajutorul pentru Ucraina, Israel și Taiwan, în ciuda opoziției lui Trump

_ Prințesa Alexandra este văzută pentru prima dată într-un scaun cu rotile - în timp ce participă la un memorial pentru Regele Constantin al Greciei

_ Incredibila poveste a unui băiat de 9 ani, lăsat singur de mama sa timp de doi ani. A mers la școală în fiecare zi

_ Job-urile următorilor 10 ani. Iată care sunt pariurile sigure

_ Leicester exploatează o lacună imensă în regulile de cheltuieli ale fotbalului pentru a evita pedeapsa în acest sezon, după ce a pretins că este atât un club din Premier League, cât și EFL în ACELAȘI TIMP

_ În interiorul colecției de mașini de 5 milioane de lire sterline a lui James Martin, cu vehicule personalizate, un Ferrari și o mașină de raliu emblematică - găzduite în garaje incredibile pictate manual, la locul său Hampshire

_ Niciun acord comercial cu SUA sub Starmer? Secretarul forței de muncă din umbră elimină speranțele unui acord post-Brexit, chiar dacă Donald Trump va deveni din nou președinte

_ EDEN CONFIDENTIAL: Meghan Markle cheamă un fotograf de top pentru o ședință foto plină de farmec cu Archie și Lilibet

_ Atacul la sala de concerte de la Moscova: ceea ce știm până acum cu privire la numărul morților a crescut la 133 și Putin spune că toți cei patru bărbați înarmați ISIS au fost arestați

_ Zelenski a numit un fost înalt oficial de securitate ambasador în Republica Moldova

_ Pandemic Whisky Boom se transformă în mahmureala

_ Romania - Republic of Moldova Employers' Association for Sustainable Development to be launched on May 16, 2024

_ LIVE TEXT - Iranul a atacat Israelul: Valuri de drone sinucigașe au fost lansate

_ Turist britanic, în vârstă de 30 de ani, este găsit mort într-un apartament de vacanță din Algarve, după ce „prietenul” a sunat la poliție pentru a-i alerta, dar apoi a „dispărut”

_ Protestatarii pro-palestinieni provoacă haos pe Aeroportul Internațional O'Hare

_ IMF revised downwards its Romania 2024 growth estimates

_ Bayern Munchen - Arsenal 1-0 (total 3-2) - Sferturile de finală ale Ligii Campionilor: scor live, știri despre echipă și actualizări, în timp ce Joshua Kimmich îi conduce pe germani în față

_ Fasolea verde românească, preț de infarct în piețe: 'Mai bine o vinde la bucată, să își permită oricine 3-4 păstăi, de poftă'

_ ‘I think there is substantial evidence of the alleged crimes’: Trump in NY court for hush-money trial

_ Nu sunt cel mai bun jucător de snooker din toate timpurile, spune modest Ronnie O'Sullivan

_ Regele secret al crimei al Scoției

_ Va funcționa interzicerea telefonului școlar din Noua Zeelandă? Să vedem ce face pentru curiozitatea elevilor

_ Hotelul Intercontinental din București ascunde un secret întunecat: motivele pentru acolo s-au petrecut multe acțiuni tragice nu sunt cunoscute în totalitate

_ Fermierul care a demolat fără permisiune un porumbel din secolul al XVII-lea clasat pe listă este amendat cu 45.000 de lire sterline

_ London mayor Khan wins record third term as Tories trounced in local polls

_ EDEN CONFIDENTIAL: magnatul de depozit David Ross se reuneste cu fosta lui iubita mostenitoare de sticla

_ Simulările cu noul model k−ω oferă perspective asupra proceselor masive de convecție a stelelor

_ Formula 1 - Marele Premiu al Qatarului ar putea decide şi titlul la echipe

_ VIDEO - Guvernul 'curăță' țara de păcănele: Anunțul ferm al premierului

_ A sprijinit Israelul, dar a pierdut o avere: McDonald's are probleme economice mari în țările musulmane

_ Taylor Swift și Travis Kelce „vor petrece ceva timp în privat împreună” după Super Bowl, după ce au fost despărțiți de câteva săptămâni... dar tight end „este încă hotărât să renunțe” la Las Vegas dacă Chiefs câștigă

_ NATO dă 'dezlegare' Ucrainei să atace Moscova: 'Are acest drept!'

_ COMENTARIU Lelia Munteanu: Gaza. The Day After

_ Un şofer inconștient a fost depistat de polițiștii din Târgoviște când conducea cu 109 km/h pe o stradă din oraș

_ Jocul „Puiului” în lumea de azi

_ Secretarul general al ONU avertizează că lumea devine "mai puţin sigură pe zi ce trece"

_ Momentan protestatarii - care cu câteva zile în urmă au declarat că o stradă este „puțin mai sigură” -, în timp ce au devenit bollarzi umani pentru a proteja o schemă de reducere a traficului, sunt împrăștiați după ce șoferi furiați au străbătut

Al treilea război mondial? Macron discută cu partidele din Franța trimiterea de trupe în Ucraina: „Nu ne putem permite să stabilim limite”

_ O nouă despărțire în showbiz! Carmen Grebenișan și Alex Militaru au divorțat - Vedeta a confirmat separarea

_ Tatăl din Missouri spune că „s-a prăbușit” de durere după ce a găsit cadavrul însângerat al fiicei de 24 de ani într-o cadă și copilul ei de 4 ani, bătut fără știință: bărbat, 32 de ani, pledează vinovat de crimă

_ Asley Gonzalez, învins în turul secund la turneul Grand Slam de la Antalya

_ The Regime Review: O satira politică fără mușcătură, puțină inteligență și un total OTT Kate Winslet, scrie CHRISTOPHER STEVENS

_ România de lumea a treia: Peste 11.000 de români, dintre care jumătate sunt copii, stau în case fără curent electric

_ Sărbătorile zilei din 13 aprilie - Sf. Sfinţit Mc. Artemon; Sf. Mc. Elefterie Persul

_ Dezvăluit: De ce ar trebui să iei întotdeauna propriile sandvișuri la aeroport

_ Ion Cristoiu: În chestiunea Rusiei, România beneficiază de expertiza fostei Securităţi

_ Seattle Children�s Hospital Withdraws Business from Texas in Response to Investigation Into �Gen�der Tran�si�tion� Treat�ments for Minors

_ Ana Bogdan, after qualifying in round of 16 at Transylvania Open - Today I fought for every point

_ BREAKING - Migranții au înjunghiat polițiștii de frontieră din România: s-au tras 13 focuri de armă pentru a-i opri

_ Eurostat: Romania has third lowest life expectancy in EU, Spain ranks first


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24

Nr. de articole la aceasta sectiune: 1399, afisate in 24 pagini.