19:37
Comentarii Adauga Comentariu

_ Supracalcularea secretelor din interiorul antibioticelor pentru bovine

_ Supercalcularea secretelor din interiorul antibioticelor pentru bovine

Chimiștii au determinat pentru prima dată structura cristalină a unei componente cheie a enzimei monensin și au deblocat mecanismul activității sale de reacție.

„Descoperirea principală a fost primul cristal. structura pentru această familie de enzime”, a spus Chu-Young Kim, profesor de biochimie la Universitatea din Illinois Urbana-Champaign (UIUC), care a condus partea experimentală a studiului. El și colegii săi au rezolvat structura cristalină pentru MonCI, o enzimă cheie în bacteriile din sol care sintetizează în mod natural monensina.

Lela Vukovic, profesor asociat la Universitatea din Texas, la El Paso (UTEP), a efectuat calculul. studii privind cercetarea monensin, publicate în Nature Communications.

Inițiativa University of Texas Research Cyberinfrastructure (UTRC) a acordat alocații de supercomputer Vukovic pe sistemul Lonestar6 la Centrul de calcul avansat din Texas (TACC) pentru a face față acestor provocări. UTRC oferă capabilități de calcul avansate cercetătorilor din toate cele 14 instituții ale sistemului UT.

Lonestar6 de la TACC a ajutat la dezvăluirea secvenței de reacție care produce monensin. Această cercetare deschide ușa pentru proiectarea viitoare a antibioticelor mai sigure și mai eficiente.

„Am descoperit că MonCI este folosit pentru a efectua trei reacții cruciale de epoxidare”, a spus Kim. „Acest lucru este foarte neobișnuit și are implicații asupra modului în care putem proiecta bacteria pentru a produce noi antibiotice.”

Kim, care a părăsit recent UTEP pentru a se alătura UIUC, a consultat laboratorul lui Vukovic cu rezultatele structurii și plin de întrebări noi. . Ceea ce a găsit a fost o reacție secvenţială interesantă în interiorul enzimei. Cu toate acestea, a fost încă imposibil din punct de vedere experimental să se obțină structura cristalină a enzimei cu substratul în interior în modul său activ.

Aceasta a fost momentul în care Kim și Vukovic au decis să modeleze enzima și substarea în simulări când substratul este stabil. . Dacă un substrat este stabil într-o anumită poziție, atunci poate apărea o reacție pentru acea poziție.

Vukovic și studenții ei Tara Nitka și Anju Yadav au dezvoltat modele complete ale sistemului de aproximativ 78.000 de atomi bazate pe structurile cristaline. determinate de experimentaliştii studiului.

„Provocările de calcul au apărut din examinarea mai multor sisteme pentru a determina poziția în care premonensina A și versiunile sale epoxidate sunt cele mai stabile și cel mai probabil să sufere prima, a doua și a treia reacție de epoxidare. ”, a spus Vukovic.

„Supercalculatoarele au fost foarte utile în caracterizarea acestor molecule biologice care produc în mod natural antibiotice”, a adăugat Vukovic. „Nu am fi capabili să realizăm studiile computaționale fără ele. Studiile computaționale ne ajută să descoperim și să înțelegem aceste reacții secvențiale complexe importante pentru societate.”

Vukovic și-a efectuat cercetările postdoctorale la UIUC sub defunctul Klaus Schulten, a cărui moștenire trăiește în software-ul NAMD dezvoltat de grupul său și a fost folosit în acest studiu și în nenumărate altele.

„UIUC depune multă muncă pentru a optimiza NAMD să ruleze pe supercalculatoarele naționale, cum ar fi Lonertar6 și Stampede2 la TACC”, a spus ea. „NAMD ne-a permis să mărim această enzimă și să vedem ce reacții au loc prima, a doua și a treia pentru a genera monensin.”

„Biosinteza monensinului necesită cel puțin 14 enzime diferite, dintre care una este MonCI”, Kim. adăugat. „Trebuie să investigăm, de asemenea, toate celelalte enzime. În viitor, ne așteptăm să generăm versiuni îmbunătățite de monensin pentru a avea grijă mai bine de bovine și păsări de curte. În plus, monensinul este toxic pentru cai și câini, astfel încât aceste animale de fermă sunt uneori otrăvite accidental. și ucis. Prin urmare, este nevoie de un monensin netoxic."

Autorii sunt Qian Wang, Tara A. Nitka, Anju Yadav și Lela Vukovic de la Universitatea Texas din El Paso; Ning Liu, Hongli Xiao, Hui Yang și Xi Chen de la Universitatea Northwest, China; Irimpan I. Mathews de la SLAC National Accelerator Laboratory; și Chu-Young Kim de la Universitatea din Illinois Urbana-Champaign.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Ministra Muncii, anunț pentru toți pensionarii - Documentele vor fi transmise în următoarele luni

_ Diplomat rus, expulzat din Moldova din cauza secțiilor de votare deschise în Transnistria

_ STENOGRAME - Înregistrare explozivă: Clotilde Armand, discuție cu un om de afaceri

_ Prințesa Charlene și Prințul Albert li se alătură gemenii lor mini-me Gabriella și Jacques, în vârstă de nouă ani, în timp ce fac cu mâna de la balcon pentru a sărbători Ziua Națională a Monaco

_ Mario Balint, fiul lui Sile Cămătaru, CONDAMNAT după ce a fost prins la volan, fără permis: Ce au stabilit judecătorii

_ Regina Letizia a Spaniei strălucește într-o rochie elegantă din tweed în timp ce se alătură regelui Felipe la Madrid

_ Cum se adună păsările? Cercetătorii fac calculul pentru a dezvălui un fenomen aerodinamic necunoscut anterior

_ Se va confrunta Șarpele cu noi acuzații de crimă pentru decese din „pistă hippie”, după ce a fost eliberat din închisoare în Nepal în 2022 și s-a mutat înapoi în Franța?

_ Gabriela Firea, prima reacție după ce a redevenit candidata PSD la Primăria Capitalei

_ Ascensiunea lui Cătălin Cîrstoiu în preferințele bucureștenilor – Sondaj CURS

_ Fotografii ciudate dezvăluie nave de război ruginite în mormântul epavat al Turciei, în timp ce scafandrii explorează HMS Majestic scufundat, care a fost distrus în bătălia Primului Război Mondial, care a adus 130.000 de morți

_ SUA dau în judecată Apple pentru încălcarea regulilor antitrust

_ GHOST TOWN: Clădirile de birouri din New York au stabilit un nou record pentru goliciune

_ Cum să urmăriți schimbările importante într-o rețea dinamică

_ Turneul european al lui Taylor Swift a provocat o explozie a preţurilor camerelor de hotel

_ Portarul de la Metz și-a „abandonat” partea cu urlată cu călcâiul din spate

_ Întâlnire oficială a ministrului Apărării Naţionale cu omologul din Turcia

_ Un lider în cultivarea algelor din SUA predică, învață și construiește o rețea mai largă

_ Unele comunități sunt mai vulnerabile la întreruperile de curent cauzate de vreme în statul New York

_ Here We Go: Moderna dezvoltă vaccinuri ARNm pentru mai multe boli despre care se spune că sunt legate de vaccinul COVID

_ Împrejmuirea midii tinere pentru refacerea ecosistemului

_ ForMin Odobescu at Restoring Justice for Ukraine conference: There can be no peace without justice

_ Cearta din Cupa Asiei a adus echipa sud-coreeană mai aproape, spune căpitanul Son

_ Povestea filmului 'Libertate', finalul din 'Boss' şi personajul Tata Moşu din romanul 'Hoţul din Curtea Miracolelor', între nominalizările la Premiile Ficţiunea

_ Guvernul Israelului încearcă să preia discret controlul asupra Ierusalimului de Est (Haaretz)

_ Bitcoin a atins astăzi maximul ultimilor 2 ani. Creşterea spectaculoasă vine pe fondul semnelor că marii jucători acordă din ce în ce mai multă încredere criptomonedei

_ „Se simte ca și cum am pierdut un prieten”: ascultătorii devastați de la BBC Radio 2 îi aduc un omagiu legendarului DJ Steve Wright „care și-a pus zâmbetul pe buze când a cântat fără grijă” după moartea sa la vârsta de 69 de ani

_ Supraviețuitorii mutilării genitale feminine cresc la peste 230 de milioane

_ Alex Jones va da în judecată CIA după ce un raport sub acoperire susține că agenția „a mers după el hardcore”

_ Philip Morris International lansează Raportul Integrat pentru anul 2023

_ FEC deschide un comentariu public cu privire la o potențială modificare a regulilor pentru a contracara contribuțiile ilegale la campanie după citații și acuzații de spălare a donațiilor din Ucraina și alții

_ Premieră: Echipă 100% românească, în luptă pentru cea mai mare competiţie de Counter-Strike din lume

_ Tânăr drogat cu 27 de substanţe în acelaşi timp: Avertismentul medicilor

_ Un deputat USR reclamă dezinteresul Ministerului Educaţiei în cazul reintegrării mamelor minore în învăţământ

_ Șoc de stagflație: PIB-ul uimește cu cea mai mică imprimare din ultimii 2 ani, sub cele mai scăzute estimări, deoarece PCE vine în roșu

_ Randamentul crește după o licitație teribilă de 20 de ani, cu cea mai mare coadă înregistrată

_ Republicanii ar trebui să se alieze cu poporul american – nu cu democrații de la Washington: Gingrich

_ Noua Zeelandă renunţă la cele mai restrictive reguli privind comerţul cu ţigări

_ Un olar grec care foloseşte tehnici străvechi de a crea obiecte a primit recunoaşterea UNESCO

_ Mergem în 10 sărbători pe an pentru că nu avem copii - preferăm să cheltuim bani pentru a face amintiri și a fi puțin egoiști

_ Din 14 iunie va circula un tren direct din București spre Istanbul /Halkali, Varna, Sofia și retur

_ Gorghiu vrea mai mulți magistrați anchetați - Procurorul general va avea puterea să aleagă cine va fi numit la noua SIIJ

_ Baie de sânge la animale în timp ce un elev de școală primară sugrumă iepuri și cobai la grădina zoologică olandeză: „Băiatul nu a arătat nicio emoție după”

_ Piraţii somalezi au primit 5 milioane de dolari ca să elibereze o navă

_ Temperaturi de peste 50 de grade Celsius în Pakistan: Avertizare de riscuri medicale pentru femeile însărcinate şi vârstnici

Căratorul de genti al agentului KGB Sikviu Brucan, pe nume Lucian Mîndruță a făcut afirmații șocante într-o emisiune a Digi FM,

_ Rețeaua labirintică a traficanților de droguri și coșmarul noilor opioide

_ În Emiratele Arabe Unite, băncile au limitat decontările cu Federația Rusă și au început să închidă conturi

_ Consiliul Concurenţei, îndemnat de un ministru să ia la puricat lanţurile comerciale

_ A fost prezentat cel mai mare avion din istoria aviaţiei. Mastodontul cu aripi nu va transporta pasageri sau mărfuri

_ „Piatră de referință notabilă”: scorurile de credit FICO americane scad pentru prima dată în deceniu

_ Lordul Sugar ia o lovitură brutală la Simon Cowell, susținând că nu va fi NICIODATĂ operat: „Ce și-a făcut el însuși?”

_ MARȚI: Mike Lindell se alătură în spatele liniilor inamice la Chicago pe 5 martie – ÎNREGISTREAZĂ-TE PENTRU BILETE AICI

_ Perspectivele asupra toxinelor fungice promit o nouă cale de tratament pentru infecțiile cu C. albicans

_ TREBUIE SĂ VEZI… „Froniera deschisă a lui Joe Biden: un coșmar american”, un nou film uimitor de Western Lensman (video)

_ Moment șocant cu cagoule purtând o bandă de biciclete împiedică duba poliției să participe la un apel la 999 la Londra

_ Israelul va invada Rafah „indiferent ce spun SUA”: oficial de rang înalt

_ Simon Harris urmează să devină cel mai tânăr prim-ministru al Irlandei după alegerile de partid

_ Diplomaţii au amânat votul Consiliului de Securitate al ONU privind ultima moţiune de încetare a focului în Gaza

_ De ce au murit mai multe fete decât bărbați în Europa între 1700 și 1950?


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15

Nr. de articole la aceasta sectiune: 845, afisate in 15 pagini.