18:27 2023-03-28
science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu
_ Screening simplificat a speciilor bacteriene individuale în probele biologice
_ Screening simplificat al speciilor bacteriene individuale în probe biologice
În cercetarea și diagnosticarea medicală, microbiomul, adică colonizarea microbiană a intestinului, câștigă din ce în ce mai mult atenția. O probă de scaun poate fi utilizată pentru a analiza cu precizie ecosistemul microbian complex al intestinului. Practic, există două metode pentru aceasta: cultivarea tradițională pe plăci cu medii de cultură specifice sau analiza ADN-ului destul de costisitoare a probei de scaun.
Ambele metode sunt nesatisfăcătoare atunci când sunt ajunge la detectarea rapidă a unei anumite specii bacteriene din probă. Cercetătorii de la grupul de instruire în cercetare (RTG) Translational Evolutionary Research (TransEvo) de la Universitatea Kiel (CAU) au dezvoltat o metodă de screening rapidă și robustă pentru a detecta și cultiva în mod specific lactobacili, bifidobacteria și Bacteroides în probele de scaun.
Ei au publicat rezultatele în jurnalul Current Microbiology.
„Metoda noastră este mai puțin costisitoare și mai rapidă decât metodele alternative utilizate de obicei pentru a izola și identifica bacteriile în probe microbiologice complexe”, a explicat prima autoare Sofia Borges, un Ph.D. student la Departamentul de Microbiologie și Biotehnologie de la Max Rubner-Institut din Kiel. „Metoda este deosebit de potrivită pentru screening-ul pentru anumite specii bacteriene pentru care nu există un mediu de cultură exclusiv”, a adăugat profesorul Charles Franz, șeful institutului și profesor asociat la Facultatea de Științe Agricole și Nutriționale de la Universitatea Kiel.
„Prin această metodă, economisim proceduri îndelungate pentru a separa speciile bacteriene pure din coloniile potențial nepure și pentru a le identifica.”
Cultura bacteriană este cultivarea microorganismelor pe un mediu de cultură sub condiții controlate, cum ar fi temperatura. Mediul de cultură care este selectat depinde de ce specie bacteriană căutați în probă. Mediile selective de creștere promovează creșterea unor specii specifice, în timp ce creșterea altor specii conținute în probă este inhibată. Dacă specia pe care o căutați se află în eșantion, aceasta va crește într-o colonie.
Acesta este scenariul ideal. Cu toate acestea, mediile de cultură nu sunt adesea exclusiv selective pentru o singură specie, ci permit, de asemenea, să crească alte câteva specii bacteriene.
„În acest studiu, ne-am concentrat pe bifidobacterii, lactobacili și Bacteroides”, a spus Borges. . Bifidobacteriile și lactobacilii au fost alese deoarece sunt relevante pentru sănătatea intestinului, dar de obicei nu se găsesc în număr mare în intestin. Prin urmare, chiar și cu medii parțial selective, uneori nu este posibilă cultivarea acestor bacterii. Bacteroides au fost incluse în studiu ca exemplu de specie gram-negativă care este, de asemenea, relevantă pentru sănătatea intestinului și este studiată în continuare de către coautorii studiului.
Principiul metodei se bazează pe privind cultivarea folosind trei medii selective diferite, extracția ADN-ului, analiza PCR a unei anumite gene și secvențierea. Pentru a testa această metodă au fost folosite șase mostre de scaun de la indivizi sănătoși. Cultivarea a avut loc într-o cameră anaerobă (fără oxigen) timp de 48 de ore la 37 de grade Celsius.
Ulterior, au fost selectate colonii individuale bine separate pentru izolarea bacteriilor. Coloniile individuale au fost examinate conform protocolului de studiu. A fost posibil să se identifice speciile bacteriene conținute în toate cele 180 de colonii. Majoritatea coloniilor ar putea fi atribuite unei singure specii, chiar dacă mediile selective utilizate nu numai că au favorizat creșterea bacteriilor țintă, ci au permis și să crească câteva alte specii.
„Unele dintre coloniile noastre au conținut până la trei specii diferite de bacterii. Cu toate acestea, am fost plăcut surprinși să constatăm că majoritatea coloniilor erau pure, în ciuda cultivării minime și a lipsei purificării prin înlăturarea în mod repetat a coloniilor", a explicat Borges.
Liderul grupului ei de lucru, Charles Franz, a rezumat după cum urmează: „Noua noastră metodă face posibilă înțelegerea purității coloniilor prezente pe plăcile de agar și identificarea cu precizie a bacteriilor pe care le conțin. Prin urmare, poate să fie utilă pentru a oferi o imagine de ansamblu rapidă, rentabilă și robustă a bacteriilor recuperate din probe microbiologice complexe înainte de a le selecta pentru studii ulterioare.”
Comentarii:
Adauga Comentariu